BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-307E18
Chromosome2 (Build37)
Map Location 151,724,565 - 151,735,515
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneGins1, LOC668925, 4930519N13Rik, LOC668926, Nanp, LOC433486, LOC381390, 4930442J19Rik, LOC100043839, LOC100043840, 4921509C19Rik, Nsfl1c, Fkbp1a, Sdcbp2, Snph, LOC668929, BC052486, 5430405G05Rik, Psmf1, Rspo4
Downstream geneAngpt4, 5430432M24Rik, 2310046K01Rik, Scrt2, Srxn1, Tcf15, LOC100043843, Csnk2a1, Tbc1d20, Rbck1, Trib3, LOC628060, Nrsn2, Sox12, Zcchc3, 6820408C15Rik, EG629114, LOC668930, 9230107O10Rik, 9230002F21Rik, EG654457, OTTMUSG00000015852, Defb29, 4930525K10Rik, Defb19, OTTMUSG00000015859, Defb36, OTTMUSG00000015862, Rem1, H13, Mcts2, Id1, LOC629170, Cox4i2, Bcl2l1, Tpx2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-307E18.bB6Ng01-307E18.g
ACCGA100104GA100105
length1,0481,045
definitionB6Ng01-307E18.b B6Ng01-307E18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,734,472 - 151,735,515)(151,724,565 - 151,725,617)
sequence
gaattcagaacagcagtgcagctccgtgtatgccctgtgcctgacacaca
ggagtgtaggctaaagggcgccatcctcatggctattggctaacatgctt
cttgataccaatgaggcctgtgggattcctctccattttactacagagaa
aaccaaacctggcccagagcagctgagttaatctgctaaaagacacacag
tctgaaaggccttacactggatgggagaggagatggagagagcatggaag
actcagcagccattcagcccaattcccaccagagctctctgcttcttacc
catggcagtgtgggcaccctcagccctcccaggtcctgtctgcagccgac
ataggaaatagtcctcacacctcctgtggggtgtgatgtggcctccagat
gacagtggaaagcctcttgcacaggagagatggagagaacaaatgaatga
gtgaatgaatgaagcacggctttgttccccgcacaaggtttgtcaaatag
acacggaactatgtgaacagctctcagcacaaagaggagactgtcatact
ttaaagaagaacaccagcaagaccaatagaagagctgggtctccagtgga
catgttgggatggctacccatgggccccactgccttcagcactgccctcc
tcccagggcctttgcacatgggcacacacagcattctttgtccagagcac
tgttgctcacctactctgcctctccatttatcacagcacccacaagtcat
cccagtgcttggtggctttaggtgcagtggccaactatcatctcttaggt
caggagcatggacgttccctgcggctctgctcatcctccccactgaagca
tgatggttgctctgactttatttgaaaggtttcctctctctgtcagcagc
tgaccttccctaggtctcttcagagatgtcaccaacacagtggcttcatt
tagcctgggtttctcacagaggcacacagatcttgagagctagaggaatg
ctgtgtcttataaaacagagcgggatatgtttttgtagagctaggtat
gaattctgctcctgtggcttgaatctgccttcccaaagtccatggatcct
gttctgcccagattgctgcatctgcctgtggactgtggggccactctgta
gccggtggggtctagtgcaggaggtgggtgactctcctggtttcactcgt
ctgggaaacagggatgtacctaggccatgggagcccaaagcctgaagcgt
gttactgtcggcagccagcacggtgtgtagagatatgatcgtgcagacag
agtctgttatatggaccagtttggcaatgagacttagtctgcagtggaga
ccatttgagccagcattgtggactgaatgggtgctgcacctcgggctcag
tgtggctccatcaggccatccctgctgttacccagattaactgccttgca
ctgtcctcagtcatggagtgaatgacctgtctctgcgtctctagtctatg
ggaagtccttggtaaatgttctagtagccacagaaaagtgatatcaatgc
ccataatgtgagtctggccaacccttgctgcaagcactgatggcgtcgaa
tgctgatctagtaacatacacctgaaatgatttaaggttggtgaatacag
gactagacccattttacaggcaaggaaagtgaggctcgtggacaacagac
ccaatcagccgaggaactgttctcctaatctttcaatctctccctgtcac
cattgctgtctgtgcccatcactgactatgggaggatggcagataccaac
ctcaagtgccaacacctaggatgccatctgagggcctgaagctggaaaat
gtcatgcctctcaaccccttggcactgctgtactgcccccaaggagctaa
gcagcagtcttgtgggagagaaatgggctagccagtgagaacaaagtaca
taccaccgttccgtgggcaggtacagaagctccagcacccggaagcatga
caaaccaagcctttcactgggacagccagagcccaggatggactaccgga
aggaagatctcaatagatagtcaaacttctgtctctgtttttttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_151734472_151735515
seq2: B6Ng01-307E18.b_45_1092 (reverse)

seq1  ATACCTAGCTCTAC-AAAACATATCCCGCTCTG-TTTATAAGACACAGCC  48
      |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| 
seq2  ATACCTAGCTCTACAAAAACATATCCCGCTCTGTTTTATAAGACACAGCA  50

seq1  TTCCTCTAGCTCTCAAGATCTGTGTGCCTCTGTGAGAAA-CCAGGCTAAA  97
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TTCCTCTAGCTCTCAAGATCTGTGTGCCTCTGTGAGAAACCCAGGCTAAA  100

seq1  TGAAGCCACTGTGTTGGTGACATCTCTGAAGAGACCTAGGGAAGGTCAGC  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCCACTGTGTTGGTGACATCTCTGAAGAGACCTAGGGAAGGTCAGC  150

seq1  TGCTGACAGAGAGAGGAAACC-TTCAAATAAAGTCAGAGCAACCATCATG  196
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGACAGAGAGAGGAAACCTTTCAAATAAAGTCAGAGCAACCATCATG  200

seq1  CTTCAGTGGGGAGGATGAGCAGAGCCGCAGGGAACGTCCATGCTCCTGAC  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGTGGGGAGGATGAGCAGAGCCGCAGGGAACGTCCATGCTCCTGAC  250

seq1  CTAAGAGATGATAGTTGGCCACTGCACCTAAAGCCACCAAGCACTGGGAT  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGAGATGATAGTTGGCCACTGCACCTAAAGCCACCAAGCACTGGGAT  300

seq1  GACTTGTGGGTGCTGTGATAAATGGAGAGGCAGAGTAGGTGAGCAACAGT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTGTGGGTGCTGTGATAAATGGAGAGGCAGAGTAGGTGAGCAACAGT  350

seq1  GCTCTGGACAAAGAATGCTGTGTGTGCCCATGTGCAAAGGCCCTGGGAGG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGGACAAAGAATGCTGTGTGTGCCCATGTGCAAAGGCCCTGGGAGG  400

seq1  AGGGCAGTGCTGAAGGCAGTGGGGCCCATGGGTAGCCATCCCAACATGTC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCAGTGCTGAAGGCAGTGGGGCCCATGGGTAGCCATCCCAACATGTC  450

seq1  CACTGGAGACCCAGCTCTTCTATTGGTCTTGCTGGTGTTCTTCTTTAAAG  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGAGACCCAGCTCTTCTATTGGTCTTGCTGGTGTTCTTCTTTAAAG  500

seq1  TATGACAGTCTCCTCTTTGTGCTGAGAGCTGTTCACATAGTTCCGTGTCT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGACAGTCTCCTCTTTGTGCTGAGAGCTGTTCACATAGTTCCGTGTCT  550

seq1  ATTTGACAAACCTTGTGCGGGGAACAAAGCCGTGCTTCATTCATTCACTC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGACAAACCTTGTGCGGGGAACAAAGCCGTGCTTCATTCATTCACTC  600

seq1  ATTCATTTGTTCTCTCCATCTCTCCTGTGCAAGAGGCTTTCCACTGTCAT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATTTGTTCTCTCCATCTCTCCTGTGCAAGAGGCTTTCCACTGTCAT  650

seq1  CTGGAGGCCACATCACACCCCACAGGAGGTGTGAGGACTATTTCCTATGT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGGCCACATCACACCCCACAGGAGGTGTGAGGACTATTTCCTATGT  700

seq1  CGGCTGCAGACAGGACCTGGGAGGGCTGAGGGTGCCCACACTGCCATGGG  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCTGCAGACAGGACCTGGGAGGGCTGAGGGTGCCCACACTGCCATGGG  750

seq1  TAAGAAGCAGAGAGCTCTGGTGGGAATTGGGCTGAATGGCTGCTGAGTCT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAGCAGAGAGCTCTGGTGGGAATTGGGCTGAATGGCTGCTGAGTCT  800

seq1  TCCATGCTCTCTCCATCTCCTCTCCCATCCAGTGTAAGGCCTTTCAGACT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGCTCTCTCCATCTCCTCTCCCATCCAGTGTAAGGCCTTTCAGACT  850

seq1  GTGTGTCTTTTAGCAGATTAACTCAGCTGCTCTGGGCCAGGTTTGGTTTT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTCTTTTAGCAGATTAACTCAGCTGCTCTGGGCCAGGTTTGGTTTT  900

seq1  CTCTGTAGTAAAATGGAGAGGAATCCCACAGGCCTCATTGGTATCAAGAA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTAGTAAAATGGAGAGGAATCCCACAGGCCTCATTGGTATCAAGAA  950

seq1  GCATGTTAGCCAATAGCCATGAGGATGGCGCCCTTTAGCCTACACTCCTG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTTAGCCAATAGCCATGAGGATGGCGCCCTTTAGCCTACACTCCTG  1000

seq1  TGTGTCAGGCACAGGGCATACACGGAGCTGCACTGCTGTTCTGAATTC  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCAGGCACAGGGCATACACGGAGCTGCACTGCTGTTCTGAATTC  1048

seq1: chr2_151724565_151725617
seq2: B6Ng01-307E18.g_64_1108

seq1  GAATTCTGCTCCTGTGGCTTGAATCTGCCTTCCCAAAGTCCATGGATCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCTCCTGTGGCTTGAATCTGCCTTCCCAAAGTCCATGGATCCT  50

seq1  GTTCTGCCCAGATTGCTGCATCTGCCTGTGGACTGTGGGGCCACTCTGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTGCCCAGATTGCTGCATCTGCCTGTGGACTGTGGGGCCACTCTGTA  100

seq1  GCCGGTGGGGTCTAGTGCAGGAGGTGGGTGACTCTCCTGGTTTCACTCGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGGTGGGGTCTAGTGCAGGAGGTGGGTGACTCTCCTGGTTTCACTCGT  150

seq1  CTGGGAAACAGGGATGTACCTAGGCCATGGGAGCCCAAAGCCTGAAGCGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGAAACAGGGATGTACCTAGGCCATGGGAGCCCAAAGCCTGAAGCGT  200

seq1  GTTACTGTCGGCAGCCAGCACGGTGTGTAGAGATATGATCGTGCAGACAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACTGTCGGCAGCCAGCACGGTGTGTAGAGATATGATCGTGCAGACAG  250

seq1  AGTCTGTTATATGGACCAGTTTGGCAATGAGACTTAGTCTGCAGTGGAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGTTATATGGACCAGTTTGGCAATGAGACTTAGTCTGCAGTGGAGA  300

seq1  CCATTTGAGCCAGCATTGTGGACTGAATGGGTGCTGCACCTCGGGCTCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTGAGCCAGCATTGTGGACTGAATGGGTGCTGCACCTCGGGCTCAG  350

seq1  TGTGGCTCCATCAGGCCATCCCTGCTGTTACCCAGATTAACTGCCTTGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCTCCATCAGGCCATCCCTGCTGTTACCCAGATTAACTGCCTTGCA  400

seq1  CTGTCCTCAGTCATGGAGTGAATGACCTGTCTCTGCGTCTCTAGTCTATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCTCAGTCATGGAGTGAATGACCTGTCTCTGCGTCTCTAGTCTATG  450

seq1  GGAAGTCCTTGGTAAATGTTCTAGTAGCCACAGAAAAGTGATATCAATGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGTCCTTGGTAAATGTTCTAGTAGCCACAGAAAAGTGATATCAATGC  500

seq1  CCATAATGTGAGTCTGGCCAACCCTTGCTGCAAGCACTGATGGCGTCGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAATGTGAGTCTGGCCAACCCTTGCTGCAAGCACTGATGGCGTCGAA  550

seq1  TGCTGATCTAGTAACATACACCTGAAATGATTTAAGGTTGGTGAATACAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGATCTAGTAACATACACCTGAAATGATTTAAGGTTGGTGAATACAG  600

seq1  GACTAGACCCATTTTACAGGCAAGGAAAGTGAGGCTCGTGGACAACAGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAGACCCATTTTACAGGCAAGGAAAGTGAGGCTCGTGGACAACAGAC  650

seq1  CCAATCAGCCGAGGAACTGTTCTCCTAATCTTTCAATCTCTCCCTGTCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATCAGCCGAGGAACTGTTCTCCTAATCTTTCAATCTCTCCCTGTCAC  700

seq1  CATTGCTGTCTGTGCCCATCACTGACTATGGGAGGATGGCAGATACCAAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGCTGTCTGTGCCCATCACTGACTATGGGAGGATGGCAGATACCAAC  750

seq1  CTCAAGTGCCAACACCTAGGATGCCATCTGAGGGCCTGAAGCTGGAAAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGTGCCAACACCTAGGATGCCATCTGAGGGCCTGAAGCTGGAAAAT  800

seq1  GTCATGCCTCTCAACCCCTTGGCACTGCTGTACTGCCCCCAAGGAGCTAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATGCCTCTCAACCCCTTGGCACTGCTGTACTGCCCCCAAGGAGCTAA  850

seq1  GCAGCAGTCTTGTGGGAGAGAAATGGGCTAGCCAGTGAGAACAAAGTACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCAGTCTTGTGGGAGAGAAATGGGCTAGCCAGTGAGAACAAAGTACA  900

seq1  TACCACCGTTCCGTGGGCAGGTACAGAAGGCTCCAGCACCCGGAAGCATG  950
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TACCACCGTTCCGTGGGCAGGTACAGAA-GCTCCAGCACCCGGAAGCATG  949

seq1  ACAAAACCAAAGCCTTCACTGGGACAGCCAGAGCCCAGGATGGACTACCG  1000
      || |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AC-AAACCAAGCCTTTCACTGGGACAGCCAGAGCCCAGGATGGACTACCG  998

seq1  GGAAGGGAAGATCTCAATAGATAGTTCAAAACTTTCTTGTCTCTGTTTTT  1050
      |  | ||||||||||||||||||||   ||||||   |||||||||||||
seq2  G--AAGGAAGATCTCAATAGATAGT--CAAACTT--CTGTCTCTGTTTTT  1042

seq1  TTT  1053
      |||
seq2  TTT  1045