BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-319B14
Chromosome2 (Build37)
Map Location 150,656,097 - 150,851,493
singlet/doubletdoublet
Overlap genePygb, Abhd12, Gins1, LOC668925, 4930519N13Rik, LOC668926
Upstream geneC530025M09Rik, OTTMUSG00000015750, LOC279056, Zfp120, EG245174, 3300002I08Rik, LOC100043832, OTTMUSG00000015730, LOC668924, OTTMUSG00000015743, LOC545472, Cst7, 2310001A20Rik, Acss1, Vsx1, Entpd6, LOC100043605
Downstream geneNanp, LOC433486, LOC381390, 4930442J19Rik, LOC100043839, LOC100043840, 4921509C19Rik, Nsfl1c, Fkbp1a, Sdcbp2, Snph, LOC668929, BC052486, 5430405G05Rik, Psmf1, Rspo4, Angpt4, 5430432M24Rik, 2310046K01Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-319B14.bB6Ng01-319B14.g
ACCGA108819GA108820
length748937
definitionB6Ng01-319B14.b B6Ng01-319B14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(150,850,746 - 150,851,493)(150,656,097 - 150,657,022)
sequence
gaattctgcccaggaccagttcgtcagtagccagggggatgtcagcttgc
ttgagcaatgggatcttcatgagaactggtgaaataaaatttgcacagtg
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtaatagtatgcatactgaaatttt
ggttacccaatgtgaaaagcagttctagtgtcctgtggctaagggtgcag
aggtgtgtgtcccatgaagttgtatgtggcatttttatggatccatggga
tggttcatttatgcagtggaagtttgctagaggtacatgcatgtacttga
ctttgtagcctcattccccaagagtatgtttaatgctaaatgggtctaaa
agcaccaagactggcccttctgaatggatcttagtgctgcatttgcatcc
ccatttgccagtgctcttggggacaccctctgactacaaccttaggtgca
caaactgaggactcttaggagactgagaacctgcctgcccacatactgca
aagctaagtggccaaaagttcctgatacacagagaaagaattctcctaaa
gggagaacaacagtgggcatccgacacagatgatggccactccccctcgc
cactcctcctcttaactaagagaccctaagtttagaagccaagagaggaa
tttctcctgcatgtcatcttcttgtgtctaaggcttacagaggcttttct
ttattctcttggtagctgtttttggtggtggtgatggttgtggtggtt
gaattccaaggagtggactaaaaaggtgatcaggaatatagcctgctctg
gcaagttctccagtgaccggaccatcactgaatacgcccgggagatctgg
ggtgtggagccctctgacctgcagatcccaccccccaacctccccaagga
ctaattaattatcccacacagtgagagcagtggcttgcttagctgactgt
gcccacgccagtcttcaggcactgcaagcagccgctggtccctgctatcc
gaagtgccatgcttccaggaaggaccatgggaatggttttgaggacctgg
atgaggaagaaggcgtggcatcctcctggcttcttacagaagaactgttg
cagagttcacagcacagatgggcagagatggtccccacagcttcagccca
tcatcatccccagaggccgagcagggagggagtggagctgagcccctgaa
atcctgcacgtagctgagtgagcttaagcctttagtttggggtgtgaata
gggatctgtggtagccagtgttcctatgttctgctagtacctgggtcacc
agccatagggtacagccagccccagtgtgtggtcttgttggcctgctggg
tagaacctttgcttcaggcttcatgctcacagcttcctgtcctttgccct
tgactgtactgagtatgtgggtggttgacccatataggccatgcctctag
ccatctgtggaaccctgtgggtgtcaggtagaacccagaacccctggaga
ggagcactgaagagagagagaacctttatcccgtatactgagactctggg
ttgaggactggacattttatagagggttgggtttagttctttgctttttt
caacagggatataacaccttcaaggaggaactgaaactatctaaagccct
ccttttttagtcagtaaaccctgaactttggtcagtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_150850746_150851493
seq2: B6Ng01-319B14.b_46_793 (reverse)

seq1  AACCACCACAACCATCACCACCACCAAAAACAGCTACCAAGAGAATAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCACCACAACCATCACCACCACCAAAAACAGCTACCAAGAGAATAAAG  50

seq1  AAAAGCCTCTGTAAGCCTTAGACACAAGAAGATGACATGCAGGAGAAATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCCTCTGTAAGCCTTAGACACAAGAAGATGACATGCAGGAGAAATT  100

seq1  CCTCTCTTGGCTTCTAAACTTAGGGTCTCTTAGTTAAGAGGAGGAGTGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCTTGGCTTCTAAACTTAGGGTCTCTTAGTTAAGAGGAGGAGTGGC  150

seq1  GAGGGGGAGTGGCCATCATCTGTGTCGGATGCCCACTGTTGTTCTCCCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGGGAGTGGCCATCATCTGTGTCGGATGCCCACTGTTGTTCTCCCTT  200

seq1  TAGGAGAATTCTTTCTCTGTGTATCAGGAACTTTTGGCCACTTAGCTTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAGAATTCTTTCTCTGTGTATCAGGAACTTTTGGCCACTTAGCTTTG  250

seq1  CAGTATGTGGGCAGGCAGGTTCTCAGTCTCCTAAGAGTCCTCAGTTTGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTATGTGGGCAGGCAGGTTCTCAGTCTCCTAAGAGTCCTCAGTTTGTG  300

seq1  CACCTAAGGTTGTAGTCAGAGGGTGTCCCCAAGAGCACTGGCAAATGGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTAAGGTTGTAGTCAGAGGGTGTCCCCAAGAGCACTGGCAAATGGGG  350

seq1  ATGCAAATGCAGCACTAAGATCCATTCAGAAGGGCCAGTCTTGGTGCTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAAATGCAGCACTAAGATCCATTCAGAAGGGCCAGTCTTGGTGCTTT  400

seq1  TAGACCCATTTAGCATTAAACATACTCTTGGGGAATGAGGCTACAAAGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACCCATTTAGCATTAAACATACTCTTGGGGAATGAGGCTACAAAGTC  450

seq1  AAGTACATGCATGTACCTCTAGCAAACTTCCACTGCATAAATGAACCATC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTACATGCATGTACCTCTAGCAAACTTCCACTGCATAAATGAACCATC  500

seq1  CCATGGATCCATAAAAATGCCACATACAACTTCATGGGACACACACCTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGATCCATAAAAATGCCACATACAACTTCATGGGACACACACCTCT  550

seq1  GCACCCTTAGCCACAGGACACTAGAACTGCTTTTCACATTGGGTAACCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCCTTAGCCACAGGACACTAGAACTGCTTTTCACATTGGGTAACCAA  600

seq1  AATTTCAGTATGCATACTATTACACACACACACACACACACACACACACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCAGTATGCATACTATTACACACACACACACACACACACACACACA  650

seq1  CTGTGCAAATTTTATTTCACCAGTTCTCATGAAGATCCCATTGCTCAAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCAAATTTTATTTCACCAGTTCTCATGAAGATCCCATTGCTCAAGC  700

seq1  AAGCTGACATCCCCCTGGCTACTGACGAACTGGTCCTGGGCAGAATTC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGACATCCCCCTGGCTACTGACGAACTGGTCCTGGGCAGAATTC  748

seq1: chr2_150656097_150657022
seq2: B6Ng01-319B14.g_69_1005

seq1  GAATTCCAAGGAGTGGACTAAAAAGGTGATCAGGAATATAGCCTGCTCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAGGAGTGGACTAAAAAGGTGATCAGGAATATAGCCTGCTCTG  50

seq1  GCAAGTTCTCCAGTGACCGGACCATCACTGAATACGCCCGGGAGATCTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGTTCTCCAGTGACCGGACCATCACTGAATACGCCCGGGAGATCTGG  100

seq1  GGTGTGGAGCCCTCTGACCTGCAGATCCCACCCCCCAACCTCCCCAAGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGGAGCCCTCTGACCTGCAGATCCCACCCCCCAACCTCCCCAAGGA  150

seq1  CTAATTAATTATCCCACACAGTGAGAGCAGTGGCTTGCTTAGCTGACTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATTAATTATCCCACACAGTGAGAGCAGTGGCTTGCTTAGCTGACTGT  200

seq1  GCCCACGCCAGTCTTCAGGCACTGCAAGCAGCCGCTGGTCCCTGCTATCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCACGCCAGTCTTCAGGCACTGCAAGCAGCCGCTGGTCCCTGCTATCC  250

seq1  GAAGTGCCATGCTTCCAGGAAGGACCATGGGAATGGTTTTGAGGACCTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGCCATGCTTCCAGGAAGGACCATGGGAATGGTTTTGAGGACCTGG  300

seq1  ATGAGGAAGAAGGCGTGGCATCCTCCTGGCTTCTTACAGAAGAACTGTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGGAAGAAGGCGTGGCATCCTCCTGGCTTCTTACAGAAGAACTGTTG  350

seq1  CAGAGTTCACAGCACAGATGGGCAGAGATGGTCCCCACAGCTTCAGCCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTTCACAGCACAGATGGGCAGAGATGGTCCCCACAGCTTCAGCCCA  400

seq1  TCATCATCCCCAGAGGCCGAGCAGGGAGGGAGTGGAGCTGAGCCCCTGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCATCCCCAGAGGCCGAGCAGGGAGGGAGTGGAGCTGAGCCCCTGAA  450

seq1  ATCCTGCACGTAGCTGAGTGAGCTTAAGCCTTTAGTTTGGGGTGTGAATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGCACGTAGCTGAGTGAGCTTAAGCCTTTAGTTTGGGGTGTGAATA  500

seq1  GGGATCTGTGGTAGCCAGTGTTCCTATGTTCTGCTAGTACCTGGGTCACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATCTGTGGTAGCCAGTGTTCCTATGTTCTGCTAGTACCTGGGTCACC  550

seq1  AGCCATAGGGTACAGCCAGCCCCAGTGTGTGGTCTTGTTGGCCTGCTGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCATAGGGTACAGCCAGCCCCAGTGTGTGGTCTTGTTGGCCTGCTGGG  600

seq1  TAGAACCTTTGCTTCAGGCTTCATGCTCACAGCTTCCTGTCCTTTGCCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAACCTTTGCTTCAGGCTTCATGCTCACAGCTTCCTGTCCTTTGCCCT  650

seq1  TGACTGTACTGAGTATGTGGGTGGTTGACCCATATAGGCCATGCCTCTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTGTACTGAGTATGTGGGTGGTTGACCCATATAGGCCATGCCTCTAG  700

seq1  CCATCTGTGGAACCCTGTGGGTGTCAAGTAGAACCCAGAACCCCTGGAGA  750
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTGTGGAACCCTGTGGGTGTCAGGTAGAACCCAGAACCCCTGGAGA  750

seq1  GGAGCACTGAAGAGAGAGAG-ACCTTTATCCCGTA-ACTGAGAC-CTTGG  797
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||
seq2  GGAGCACTGAAGAGAGAGAGAACCTTTATCCCGTATACTGAGACTCTGGG  800

seq1  TTGAGGACTGGCAATTTTATAGAGGGTT-GGTTTAGTTCTTTGC-TTTTT  845
      |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
seq2  TTGAGGACTGGACATTTTATAGAGGGTTGGGTTTAGTTCTTTGCTTTTTT  850

seq1  CAACA-GGAAATAACA-CTTC-AGGAGGAACTGAAACTAGCT-AAGCCTT  891
      ||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| |
seq2  CAACAGGGATATAACACCTTCAAGGAGGAACTGAAACTATCTAAAGCCCT  900

seq1  CC-TTTTTAGCAAGTAAACCTTGAAC-TTGGTCAGTG  926
      || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||
seq2  CCTTTTTTAGTCAGTAAACCCTGAACTTTGGTCAGTG  937