BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-321M13
Chromosome2 (Build37)
Map Location 7,736,485 - 7,897,858
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneCugbp2, LOC100040648
Downstream geneLOC672230
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-321M13.bB6Ng01-321M13.g
ACCGA110801GA110802
length1,0091,113
definitionB6Ng01-321M13.b B6Ng01-321M13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(7,736,485 - 7,737,446)(7,896,744 - 7,897,858)
sequence
gaattctgtgagtatcattactgaaatattcaagtaaaactgatggatta
gagtgtcttgagcatccatggctacagagacacggtgtctaaaaagtaaa
accaaacaaaaaacaaaaagcaactaaaatatcaggtggcatcatgtgta
ctaataatttgagtggcactatctcatggcatccctcagaagatggcact
gtctatgcttcccatccactatgtgagtcaagttacttgatcactctttc
tgtttagttgaataatataaaaaccatgacatgacaaataaaatttgcca
tgcttttatgcccataatcatatgggtgagaactctaagaaaataaatta
ttgtacacaaaacctcattcgttttaagttgcaaatgtacacatacatat
gcacatgcacatatatatgtgtatgcacaagcccgtacatatatttgtat
aataaagaatacctaggatagggaaatggtttaaccagtaaagtactact
tatcccacaaagcatacctgtaaggacctatgctggttcctcagtagctg
ggtaaaaagttgaggactcttggttgcttctgagaacttgaaggtaatag
cctactgctgaaggtaataaccatcgcatcttttggatggagcagctgag
ctggagctgaactgtaagtctcttccctgagaacaaatgcttagtatcag
atggtactatgtaagcttatgacctatagaagcaatcaataatctcaata
gtgaccgggtggcaaaatatttcaacggtacaatagttgtacttttatct
tagaggtaagtaacagctatctaattgcaccgaagatgatctcagttgga
gggaattcatgacctgattttgcaaagctagccaactacccatggctgga
agggtaatagatgctagaggagaacctactccttccattttcctaaggtt
atagtaatttctaactatattctaagtattcatccatatacccacagata
catgtagcc

gaattcatttatgcttcttggcttattaaggagaactgccatcttccctt
acccagatcccaaacatctaacatctgcaaaacaactccgtttatgtttg
aaaacgcaatacctgcaataccagttctttatcgctgctgtcagcctttc
agcaattattattattcaaatgtgtttcccagagggtcatataacatgtt
aaattaaaactaaagaaattcattaaaataaactaaattaaactagcaaa
tatcagagaaaacactaaaggttcacaaataatagtaattatcctttcag
atcataatagagttaaaatatcaatatataatacaactaccactgctaga
aagtcttaaaatgtttgaaaaccaacacatatagttctaaataaattata
aagaaaaaaatcaagaaaatagaaaatagctacaaaaataaataatcaaa
actcaagaaaagagaaagcaaatataagaaatagagaaaaatagtacaaa
tgcaaacctttgtcttaaaatattgataaaaataataaatcctggaccag
taaggtaaagacactttgtgccaagcttaatgagacatacttgttaggag
agaactgactcctgcaagttgtcctttgaccagcacacacacacacacac
acacacacacacacacagagagagacagacagacagagacagagagacag
acagagagtctctatggtcccatgcctgcctttcttctggaggtgtctag
gcatggccaatacatcagctcagggaggacagggcaaaatcctgaactag
gctctgcagtcctcatctcccttcagggaaacagagcagtgctgtatgcc
aggctggaagcggggagcacgaggcctggaatgagcagaatcctgctctg
gttgggaccaagtgctgtgagtgccagaggggccttcttctggagtctta
gtgttaaaggctcatttagacaaaggccttctccttggcagtatttaaag
cagtaactctctgagaccatctagctgttcttatttcttaatatttatgg
catatcaagttcttctgcagagtaggcacatctctcccactaagccagga
cagccagccctgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_7736485_7737446
seq2: B6Ng01-321M13.b_45_1006

seq1  GAATTCTGTGAGTATCATTACTGAAATATTCAAGTAAAACTGATGGATTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTGAGTATCATTACTGAAATATTCAAGTAAAACTGATGGATTA  50

seq1  GAGTGTCTTGAGCATCCATGGCTACAGAGACACGGTGTCTAAAAAGTAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGTCTTGAGCATCCATGGCTACAGAGACACGGTGTCTAAAAAGTAAA  100

seq1  ACCAAACAAAAAACAAAAAGCAACTAAAATATCAGGTGGCATCATGTGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAACAAAAAACAAAAAGCAACTAAAATATCAGGTGGCATCATGTGTA  150

seq1  CTAATAATTTGAGTGGCACTATCTCATGGCATCCCTCAGAAGATGGCACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATAATTTGAGTGGCACTATCTCATGGCATCCCTCAGAAGATGGCACT  200

seq1  GTCTATGCTTCCCATCCACTATGTGAGTCAAGTTACTTGATCACTCTTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATGCTTCCCATCCACTATGTGAGTCAAGTTACTTGATCACTCTTTC  250

seq1  TGTTTAGTTGAATAATATAAAAACCATGACATGACAAATAAAATTTGCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTAGTTGAATAATATAAAAACCATGACATGACAAATAAAATTTGCCA  300

seq1  TGCTTTTATGCCCATAATCATATGGGTGAGAACTCTAAGAAAATAAATTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTTATGCCCATAATCATATGGGTGAGAACTCTAAGAAAATAAATTA  350

seq1  TTGTACACAAAACCTCATTCGTTTTAAGTTGCAAATGTACACATACATAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTACACAAAACCTCATTCGTTTTAAGTTGCAAATGTACACATACATAT  400

seq1  GCACATGCACATATATATGTGTATGCACAAGCCCGTACATATATTTGTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATGCACATATATATGTGTATGCACAAGCCCGTACATATATTTGTAT  450

seq1  AATAAAGAATACCTAGGATAGGGAAATGGTTTAACCAGTAAAGTACTACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAGAATACCTAGGATAGGGAAATGGTTTAACCAGTAAAGTACTACT  500

seq1  TATCCCACAAAGCATACCTGTAAGGACCTATGCTGGTTCCTCAGTAGCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCCACAAAGCATACCTGTAAGGACCTATGCTGGTTCCTCAGTAGCTG  550

seq1  GGTAAAAAGTTGAGGACTCTTGGTTGCTTCTGAGAACTTGAAGGTAATAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAAAAGTTGAGGACTCTTGGTTGCTTCTGAGAACTTGAAGGTAATAG  600

seq1  CCTACTGCTGAAGGTAATAACCATCGCATCTTTTGGATGGAGCAGCTGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACTGCTGAAGGTAATAACCATCGCATCTTTTGGATGGAGCAGCTGAG  650

seq1  CTGGAGCTGAACTGTAAGTCTCTTCCCTGAGAACAAATGCTTAGTATCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGCTGAACTGTAAGTCTCTTCCCTGAGAACAAATGCTTAGTATCAG  700

seq1  ATGGTACTATGTAAGCTTATGACCTATAGAAGCAATCAATAATCTCAATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTACTATGTAAGCTTATGACCTATAGAAGCAATCAATAATCTCAATA  750

seq1  GTGACCGGGTGGCAAAATATTTCAACGGTACAATAGTTGTACTTTTATCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACCGGGTGGCAAAATATTTCAACGGTACAATAGTTGTACTTTTATCT  800

seq1  TAGAGGTAAGTAACAGCTATCTAATTGCACCGAAGATGATCTCAGTTGGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGTAAGTAACAGCTATCTAATTGCACCGAAGATGATCTCAGTTGGA  850

seq1  GGGAATTCATGACCTGATTTTGCAAAGCTAGCCAACTACCCATGGCTGGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAATTCATGACCTGATTTTGCAAAGCTAGCCAACTACCCATGGCTGGA  900

seq1  AGGGTAATAGATGCTAGAGGAGAACCTACTCCTTCCATTTTCCTAAGGTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTAATAGATGCTAGAGGAGAACCTACTCCTTCCATTTTCCTAAGGTT  950

seq1  ATAGTAATTTCT  962
      ||||||||||||
seq2  ATAGTAATTTCT  962


seq1: chr2_7896744_7897858
seq2: B6Ng01-321M13.g_67_1179 (reverse)

seq1  ACAGGGCTGCCTTGTCTGGCCTAGTGGGAGAGGATGTGCCTAACTCTGCA  50
      ||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||
seq2  ACAGGGCTGGCTGTCCTGGCTTAGTGGGAGA-GATGTGCCT-ACTCTGCA  48

seq1  GA--GACTTGATATGCCATAAATAATTAAGAAATAAGAACAAGCTAAGAT  98
      ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||
seq2  GAAGAACTTGATATGCCATAAAT-ATTAAGAAATAAGAAC-AGCT-AGAT  95

seq1  GGTCTCAGAGAGTTACTGCTTTAAATACTGCCAAGGAGAAGGCCTTTGTC  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTCAGAGAGTTACTGCTTTAAATACTGCCAAGGAGAAGGCCTTTGTC  145

seq1  TAAATGAGCC-TTAACACTAAGACTCCAGAAGAAGGCCCCTCTGGCACTC  197
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGAGCCTTTAACACTAAGACTCCAGAAGAAGGCCCCTCTGGCACTC  195

seq1  ACAGCACTTGGTCCCAACCAGAGCAGGATTCTGCTCATTCCAGGCCTCGT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCACTTGGTCCCAACCAGAGCAGGATTCTGCTCATTCCAGGCCTCGT  245

seq1  GCTCCCCGCTTCCAGCCTGGCATACAGCACTGCTCTGTTTCCCTGAAGGG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCCCGCTTCCAGCCTGGCATACAGCACTGCTCTGTTTCCCTGAAGGG  295

seq1  AGATGAGGACTGCAGAGCCTAGTTCAGGATTTTGCCCTGTCCTCCCTGAG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGAGGACTGCAGAGCCTAGTTCAGGATTTTGCCCTGTCCTCCCTGAG  345

seq1  CTGATGTATTGGCCATGCCTAGACACCTCCAGAAGAAAGGCAGGCATGGG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGTATTGGCCATGCCTAGACACCTCCAGAAGAAAGGCAGGCATGGG  395

seq1  ACCATAGAGACTCTCTGTCTGTCTCTCTGTCTCTGTCTGTCTGTCTCTCT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATAGAGACTCTCTGTCTGTCTCTCTGTCTCTGTCTGTCTGTCTCTCT  445

seq1  CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGGTCAAAGGACAA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGGTCAAAGGACAA  495

seq1  CTTGCAGGAGTCAGTTCTCTCCTAACAAGTATGTCTCATTAAGCTTGGCA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCAGGAGTCAGTTCTCTCCTAACAAGTATGTCTCATTAAGCTTGGCA  545

seq1  CAAAGTGTCTTTACCTTACTGGTCCAGGATTTATTATTTTTATCAATATT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTGTCTTTACCTTACTGGTCCAGGATTTATTATTTTTATCAATATT  595

seq1  TTAAGACAAAGGTTTGCATTTGTACTATTTTTCTCTATTTCTTATATTTG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGACAAAGGTTTGCATTTGTACTATTTTTCTCTATTTCTTATATTTG  645

seq1  CTTTCTCTTTTCTTGAGTTTTGATTATTTATTTTTGTAGCTATTTTCTAT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTCTTTTCTTGAGTTTTGATTATTTATTTTTGTAGCTATTTTCTAT  695

seq1  TTTCTTGATTTTTTTCTTTATAATTTATTTAGAACTATATGTGTTGGTTT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTGATTTTTTTCTTTATAATTTATTTAGAACTATATGTGTTGGTTT  745

seq1  TCAAACATTTTAAGACTTTCTAGCAGTGGTAGTTGTATTATATATTGATA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAACATTTTAAGACTTTCTAGCAGTGGTAGTTGTATTATATATTGATA  795

seq1  TTTTAACTCTATTATGATCTGAAAGGATAATTACTATTATTTGTGAACCT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAACTCTATTATGATCTGAAAGGATAATTACTATTATTTGTGAACCT  845

seq1  TTAGTGTTTTCTCTGATATTTGCTAGTTTAATTTAGTTTATTTTAATGAA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTGTTTTCTCTGATATTTGCTAGTTTAATTTAGTTTATTTTAATGAA  895

seq1  TTTCTTTAGTTTTAATTTAACATGTTATATGACCCTCTGGGAAACACATT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTAGTTTTAATTTAACATGTTATATGACCCTCTGGGAAACACATT  945

seq1  TGAATAATAATAATTGCTGAAAGGCTGACAGCAGCGATAAAGAACTGGTA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATAATAATAATTGCTGAAAGGCTGACAGCAGCGATAAAGAACTGGTA  995

seq1  TTGCAGGTATTGCGTTTTCAAACATAAACGGAGTTGTTTTGCAGATGTTA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGGTATTGCGTTTTCAAACATAAACGGAGTTGTTTTGCAGATGTTA  1045

seq1  GATGTTTGGGATCTGGGTAAGGGAAGATGGCAGTTCTCCTTAATAAGCCA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTTTGGGATCTGGGTAAGGGAAGATGGCAGTTCTCCTTAATAAGCCA  1095

seq1  AGAAGCATAAATGAATTC  1115
      ||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCATAAATGAATTC  1113


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |