BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-322E10
Chromosome2 (Build37)
Map Location 133,964,115 - 133,965,222
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043785, A430048G15Rik, Bmp2
Downstream geneHao1, Txndc13, LOC627897, LOC433478, Plcb1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-322E10.g
ACCGA111159
length1,097
definitionB6Ng01-322E10.g
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattcctaataaataaggaagaggagctaaattaagtaacaagtgaaaa
tatcttggaaatggacccacatggggaataatgcatgcatgtgttgcatt
tatataaaaacattttaagtttaacttggagaattttagtgtctggttga
aagaggtaaacctgaactagttacaaaatttatggcacacacacacaaaa
ttcaagtcacacctgaacacatggagaaccattcccttttggaacagaca
agtagaaactccctccaaaaatgaataaaaccaaatactgacatatggga
gttatcttattgtgggaaacatttgaaataaaattatacagtatgactgt
ttgaaaagatatttttactaaaatcaaaccaaaaagaccagaatttttat
tattatagataaacacctagaaacaaataaactgaccttaaaaattaaaa
atgcaatatgatagattaaactagaagaaaacaaattccaaagacaagag
gaagaatgaacttgagtaaggtttcctggacatgtatgtacatttacatt
tacaagagttaaaggcagacagacaaacagacacatgtacacacacaaac
acacgtgtacacacatgtatatgcacatatacacacagtcatacatgatc
acacatatacacacacgtatatgcacaaacatacgcacatgcacacataa
atgcatgcatacatacatatacatagacacctgtgcacacatgcatacat
atacacagacataaactcatatatacatgtacacacatacacacagatgt
gtacacacaaatacatacatgaacacacatgcatacacacatatccacac
aaaaagcaagaaccttcttcaaacgtcaaagcatagtatattatacatat
atgaaaataggaatatctgaaaattttgattaaatatgcagatacaatac
ttacaaatattattgcaagctactatttttctagaaaatgtcttcctaca
taagatttatattaagtactatcaacatgattcagtaagatgtgtatttc
aaactatgagctgagcagacccagtacgacgcacctctcatgacaca
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_133964115_133965222
seq2: B6Ng01-322E10.g_64_1160

seq1  GAATTCATAATAAATAAGGAAGAGGAGCTAAATTAAGTAACAAGTGAAAA  50
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTAATAAATAAGGAAGAGGAGCTAAATTAAGTAACAAGTGAAAA  50

seq1  TATCTTGGAAATGGAGCCACATGGTGAATAATGCATGCATGTGTTGCATT  100
      ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTGGAAATGGACCCACATGGGGAATAATGCATGCATGTGTTGCATT  100

seq1  TATATAAAAACATTTTAAGTTTAACTTGGAGAATTTTAGTGTCTGGTTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAAAAACATTTTAAGTTTAACTTGGAGAATTTTAGTGTCTGGTTGA  150

seq1  AAGAGGTAAACCTGAACTAGTTACAAAATTTATGGCACACACACACAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGTAAACCTGAACTAGTTACAAAATTTATGGCACACACACACAAAA  200

seq1  TTCAAGTCACACCTGAACACATGGAGAACCATTCCCTTTTGGAACAGACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGTCACACCTGAACACATGGAGAACCATTCCCTTTTGGAACAGACA  250

seq1  AGTAGAAACTCCCTCCAAAAATGAATAAAACCAAATACTGACATATGGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGAAACTCCCTCCAAAAATGAATAAAACCAAATACTGACATATGGGA  300

seq1  GTTATCTTATTGTGGGAAACATTTGAAATAAAATTATACAGTATGACTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATCTTATTGTGGGAAACATTTGAAATAAAATTATACAGTATGACTGT  350

seq1  TTGAAAAGATATTTTTACTAAAATCAAACCAATAAGACCAGAATTTTTAT  400
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTGAAAAGATATTTTTACTAAAATCAAACCAAAAAGACCAGAATTTTTAT  400

seq1  TATTATAGATAAACACCTAGAAACAAATAAACTGACCTTAAAAATTAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTATAGATAAACACCTAGAAACAAATAAACTGACCTTAAAAATTAAAA  450

seq1  ATGCAATATGATAGATTAAACTAAAAGAAAACAAATTCCAAAGACAAGAG  500
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAATATGATAGATTAAACTAGAAGAAAACAAATTCCAAAGACAAGAG  500

seq1  GAAGAATGAACTTGAGTAAGGTTTCCTGGACATGTATGTACATTTACATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAATGAACTTGAGTAAGGTTTCCTGGACATGTATGTACATTTACATT  550

seq1  TACAAGAGTTAAAGGCAGACAGACAAACAGACACATGTACACACACAAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAGAGTTAAAGGCAGACAGACAAACAGACACATGTACACACACAAAC  600

seq1  ACACGTGTACACACATGTATATGCACATATACACACAGTCATACATGATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACGTGTACACACATGTATATGCACATATACACACAGTCATACATGATC  650

seq1  ACACATATACACACACGTATATGCACAAACATACGCACATGCACACATAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATATACACACACGTATATGCACAAACATACGCACATGCACACATAA  700

seq1  ATGCATGCATACATACATATACATAGACACCTGTGCACACATGCATACAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATGCATACATACATATACATAGACACCTGTGCACACATGCATACAT  750

seq1  ATACACAGACATAAACTCATATATACATGTACACACATACACACAGATGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACACAGACATAAACTCATATATACATGTACACACATACACACAGATGT  800

seq1  GTACACACAAATACATACATGAACACACATGCATACACACATATCCACAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACACACAAATACATACATGAACACACATGCATACACACATATCCACAC  850

seq1  AAAGAGCAAGAACCTTCTTCAAACGT-AAAGCATAGTATATTATACATAT  899
      ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGCAAGAACCTTCTTCAAACGTCAAAGCATAGTATATTATACATAT  900

seq1  AT-AAAAAAGGAATATCTGAAAATTTTGATTAAAATATGGAGATAAAATA  948
      || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||
seq2  ATGAAAATAGGAATATCTGAAAATTTTGATT-AAATATGCAGATACAATA  949

seq1  CTTACAAATATTATTGCAAGCTACTAATTTTTCTAAGGAAAAATGTCTTT  998
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||| ||
seq2  CTTACAAATATTATTGCAAGCTACT-ATTTTTCTA---GAAAATGTC-TT  994

seq1  CTTACATAAGTTTTAAGATTTAAGTGGTATCAACATAATTCAGTAAAATG  1048
      | |||||||| ||||    ||||||  ||||||||| ||||||||| |||
seq2  CCTACATAAGATTTA--TATTAAGTACTATCAACATGATTCAGTAAGATG  1042

seq1  TGTATTTTCCAAACTATTAGCCTGAGCCTGACCCGGACAGACACACCTCT  1098
      |||||||  |||||||| || ||||| | ||||| |   ||| |||||||
seq2  TGTATTT--CAAACTATGAG-CTGAG-CAGACCCAGTACGACGCACCTCT  1088

seq1  CATGGACACA  1108
      ||| ||||||
seq2  CAT-GACACA  1097