BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-323G15
Chromosome2 (Build37)
Map Location 128,789,767 - 128,910,811
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043736, Zc3h6, LOC668894, Ttl
Upstream geneAcoxl, Bcl2l11, LOC100043424, LOC100043729, LOC383791, LOC100043730, Gm355, Anapc1, Mertk, Tmem87b, 1600015H20Rik, Zc3h8, LOC100043735
Downstream geneLOC100043738, Rpo1-2, Chchd5, LOC545461, LOC100043431, Slc20a1, A730036I17Rik, LOC671466, Ckap2l, Il1a, Il1b, OTTMUSG00000015529, LOC668896, F830045P16Rik, Sirpa, Pdyn, Ppia-ps2_1620.1, Stk35, Tgm3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-323G15.bB6Ng01-323G15.g
ACCGA111996GA111997
length1481,067
definitionB6Ng01-323G15.b B6Ng01-323G15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,910,664 - 128,910,811)(128,789,767 - 128,790,835)
sequence
gaattctaaccatcctataattaccagacctataactaaatctataacta
aagtataggtctgaaacgtaagaaacaagaaggaaaacaaaatgaaagat
gagcaaaaataggtggtggttgttgttgttgttgttgttgttgttgtt
gaattcatagtaaattactggaagaaaacatgtttctctaaagagaaaac
tttgtcatcccgtagaaacctgggaaacaggacaggaccatcctcctgga
ctgtgtctattaatgtcgcactgggtgccctagttcaaggatctctggga
ccaccatagccaggagagtgatgatccaagataggcgagaaggtagttca
gctccacatgactaagtagccagtgtccaagccttgagagtctaagccca
gggagtttattttaggcatatttaagcacaccagaatttggtgaaaactt
tactggtgataattaattcaatcccatgtgtacaataaagcttaaatcat
gactacactgaactctttgtaaagtacatatgatatcttccataaagtta
ggttctatagattgactatatgtgacatcttccataaatacactttctat
agattgacaagcctatggtaaggtcttgggagaggagaatctggtatgat
cttggccatacagttagctcaaaggtaaccagactgactgactattaacc
tcatctaattccagctttttgggcagataacaggttatgcacccttccct
tttaagggacaaccctgtgtgtttaacattcctgctttccctagtgctta
tctgagagctcaaagacctctgtggttcccacacactagtactggaaatc
tcagtgagtgtagaatgagaacctagaatccaaggattagactgggaaaa
caaacaaacaccccaaacccttgtgttgggagtttagctcttgttagagc
atgggttgaatatgtgtaggattctggaaatgtttcctattccaaactat
agttaaaacagtgtattattatagcttgttacacagcaatgaaagcagaa
gtatccgattgtgagagtctatcaaaggtgtaacgtatctatagggaaag
tcattaaagttctattacgataatcagttcctgggctgctgaaaacccga
gtgctgctgcaaccaagctctgaatggtcttgaggtcatcaccagaatgt
tgactgctcctgcctgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_128910664_128910811
seq2: B6Ng01-323G15.b_47_194 (reverse)

seq1  AACAACAACAACAACAACAACAACAACAACCACCACCTATTTTTGCTCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACAACAACAACAACAACAACAACAACCACCACCTATTTTTGCTCAT  50

seq1  CTTTCATTTTGTTTTCCTTCTTGTTTCTTACGTTTCAGACCTATACTTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCATTTTGTTTTCCTTCTTGTTTCTTACGTTTCAGACCTATACTTTA  100

seq1  GTTATAGATTTAGTTATAGGTCTGGTAATTATAGGATGGTTAGAATTC  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATAGATTTAGTTATAGGTCTGGTAATTATAGGATGGTTAGAATTC  148

seq1: chr2_128789767_128790835
seq2: B6Ng01-323G15.g_66_1132

seq1  GAATTCATAGTAAATTACTGGAAGAAAACATGTTTCTCTAAAGAGAAAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATAGTAAATTACTGGAAGAAAACATGTTTCTCTAAAGAGAAAAC  50

seq1  TTTGTCATCCCGTAGAAACCTGGGAAACAGGACAGGACCATCCTCCTGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCATCCCGTAGAAACCTGGGAAACAGGACAGGACCATCCTCCTGGA  100

seq1  CTGTGTCTATTAATGTCGCACTGGGTGCCCTAGTTCAAGGATCTCTGGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTCTATTAATGTCGCACTGGGTGCCCTAGTTCAAGGATCTCTGGGA  150

seq1  CCACCATAGCCAGGAGAGTGATGATCCAAGATAGGCGAGAAGGTAGTTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCATAGCCAGGAGAGTGATGATCCAAGATAGGCGAGAAGGTAGTTCA  200

seq1  GCTCCACATGACTAAGTAGCCAGTGTCCAAGCCTTGAGAGTCTAAGCCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCACATGACTAAGTAGCCAGTGTCCAAGCCTTGAGAGTCTAAGCCCA  250

seq1  GGGAGTTTATTTTAGGCATATTTAAGCACACCAGAATTTGGTGAAAACTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGTTTATTTTAGGCATATTTAAGCACACCAGAATTTGGTGAAAACTT  300

seq1  TACTGGTGATAATTAATTCAATCCCATGTGTACAATAAAGCTTAAATCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGGTGATAATTAATTCAATCCCATGTGTACAATAAAGCTTAAATCAT  350

seq1  GACTACACTGAACTCTTTGTAAAGTACATATGATATCTTCCATAAAGTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTACACTGAACTCTTTGTAAAGTACATATGATATCTTCCATAAAGTTA  400

seq1  GGTTCTATAGATTGACTATATGTGACATCTTCCATAAATACACTTTCTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCTATAGATTGACTATATGTGACATCTTCCATAAATACACTTTCTAT  450

seq1  AGATTGACAAGCCTATGGTAAGGTCTTGGGAGAGGAGAATCTGGTATGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTGACAAGCCTATGGTAAGGTCTTGGGAGAGGAGAATCTGGTATGAT  500

seq1  CTTGGCCATACAGTTAGCTCAAAGGTAACCAGACTGACTGACTATTAACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCCATACAGTTAGCTCAAAGGTAACCAGACTGACTGACTATTAACC  550

seq1  TCATCTAATTCCAGCTTTTTGGGCAGATAACAGGTTATGCACCCTTCCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTAATTCCAGCTTTTTGGGCAGATAACAGGTTATGCACCCTTCCCT  600

seq1  TTTAAGGGACAACCCTGTGTGTTTAACATTCCTGCTTTCCCTAGTGCTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGGGACAACCCTGTGTGTTTAACATTCCTGCTTTCCCTAGTGCTTA  650

seq1  TCTGAGAGCTCAAAGACCTCTGTGGTTCCCACACACTAGTACTGGAAATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGAGCTCAAAGACCTCTGTGGTTCCCACACACTAGTACTGGAAATC  700

seq1  TCAGTGAGTGTAGAATGAGAACCTAGAATCCAAGGATTAGACTGGGAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTGAGTGTAGAATGAGAACCTAGAATCCAAGGATTAGACTGGGAAAA  750

seq1  CAAACAAACACCCCAAACCCTTGTGTTGGGAGTTTAGCTCTTGTTAGAGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACAAACACCCCAAACCCTTGTGTTGGGAGTTTAGCTCTTGTTAGAGC  800

seq1  ATGGGTTGAATATGTGTAGGATTCTGGAAATGTTTCCTATTCCAAACTAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGTTGAATATGTGTAGGATTCTGGAAATGTTTCCTATTCCAAACTAT  850

seq1  AAGTTAAAACAGTGTATTATTATAGCTTGTTACACAGCAATGAAAGCAGA  900
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -AGTTAAAACAGTGTATTATTATAGCTTGTTACACAGCAATGAAAGCAGA  899

seq1  AGTATCCGATTGTGAGGAGTCTATCAAAGGTGTAAGGTATCTATAGGGAA  950
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AGTATCCGATTGTGA-GAGTCTATCAAAGGTGTAACGTATCTATAGGGAA  948

seq1  AGTCA-TAAAGTTCTATTACGAT-ATCAGTTCCGGGGCTGCTGAGAACCC  998
      ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||
seq2  AGTCATTAAAGTTCTATTACGATAATCAGTTCCTGGGCTGCTGAAAACCC  998

seq1  GAGTGCTGCCTGCCACCAAGCTCTGAAT-GTCTTGAGGTCAATCACCCAG  1047
      |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||
seq2  GAGTGCTG-CTGCAACCAAGCTCTGAATGGTCTTGAGGTC-ATCA-CCAG  1045

seq1  AAGGGTGGCTGCCTCTGCCTGG  1069
      || | || ||||  ||||||||
seq2  AATGTTGACTGCTCCTGCCTGG  1067