BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-326A10
Chromosome2 (Build37)
Map Location 107,452,113 - 107,569,922
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneC130023O10Rik, LOC677260, 2700007P21Rik, LOC383739, Fshb, Kcna4
Downstream geneLOC100043078, LOC668790
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-326A10.bB6Ng01-326A10.g
ACCGA113937GA113938
length1,2101,116
definitionB6Ng01-326A10.b B6Ng01-326A10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(107,452,113 - 107,453,331)(107,568,807 - 107,569,922)
sequence
gaattccttgaactgagcttgttgaatgaggctgcattttggctgctaca
caatgggaactcatagatgtgggctcctgtataacaaagctgtgaatttc
ctttgaactgtggatggtgcagagtacaggatgttcttcccacaaggtgg
ctttctagaatggtaagtgaatgcacttgaaagaaaggatatgaaggatg
ccttggcatatccagattatctctccgagaaaggcaaaggtcttgaaggc
atgttcctgtctcttttcacacaagagcaaagattgtaagataaaacagc
aagtgtattccctctctgtatttgtatttgcttatgccaactataaacac
aacctcgtgctttgtttgctttaataataaaaacaaaaagtgctttgatt
gcactattcatgagcttagaatccacatatcccctggtgtgcccactgaa
atctttggaatgtatctttgttggccatggggtgggcccataatgaaagc
tttgtaaggaaccacatgatgtccttcccttaggaatgacttaacctaga
tgtgtaagctaatgttatgcaaaatggatttgttgatggaaagaatgctt
aagcatgccaacttaaaggagttttaacgtgaatctagggagagacagta
aaaaagtggagctgattcaatcttacttccttgggtttacgtttccatag
atagatatttacttgcttatcatgtctccagatcaaaatggagttttgta
attgcttaacatgtgacaagcagtatacacacacacacacacacacacac
acacacacacacatacacacacaagcacatgtgtgcacagacacacacac
acacacacaatcacatgtgtgcacagacacacagacacacacatacacac
acacacacacacacacacaccataacatgtattaaaactcaaatgataaa
agtctaaaaatataaaagagagaatacaagagacatgaaagaaacaagga
actgtgaataaaaaggagttccataaaacctaaatgattgaacaaagtga
gtcaaaagattggctacaaatcctggtggttgcctagagccaaaccacaa
tcaattcttgggagtcatggatccattaaaaaaaaatgccctgaaaatct
ctttagtcagagaaacttttttttttctttttggccacgccccttgtttg
gaaggaagta
gaattccaaaggaaaagcatgtctggttagagaagaagacggtgtactgg
tttcatatgctaaagcaaactgcgcaagggaaggagcagttaacaaagga
aggcttgtctgatcagggcagatgcatgctttagccatgtctttcctcta
agcaaagtgagaagccgcatggcttctgagcagcggagactgagaaaggg
caaaccatatttttgctattattacagtcttctttttcttaaggaaaaaa
gacaagcctgtaactggtctctctctctctctctctctctctctctctct
ctctctctctcacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacacaaacaaaaaacgtttttgctttttttaactagcagagagacctag
atcacagtctgtcacataattatgtgaccataaacagcacacgtgatcta
aatgccagcactctcctctgatggccactggaagcaataatcatgctaag
ctttctggagtcctgctataattaaaaaggctttgtgcagaaactcacaa
ctttagacacccattgatggcttcttttctttgctcctctatcctctcag
gcttatcttaaaggctttgctccctctacttggagttgttttaggcatgg
ttgacagagttgatttaggtgacaattttctactttctaagattgtgtga
tgttcttttctcaggatccatgctattcacacagctgttctctgaccatg
tttcatccgttaaactcaccacgtagtgctcagagtctttcctccctctt
gtattggagaagctgaatgtggatgaggtcttccttactttagtcttctt
ctgtaaaaccattcttgtacatttaactgtcatttgcagtatattctttt
tgacatagctaccaacgtaccaaggggtaatcactcccttgagtccatga
ttcagactgaaagtctaaagattaaattaaaagtcatgcactatctaaaa
taaacctatgatttttgtatagtaacactaggtacttaggccatggaatg
aagaacttagaaagaaatttattcaggaaaaaaggcttggccttaccagg
attttcactggaccag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_107452113_107453331
seq2: B6Ng01-326A10.b_50_1259

seq1  GAATTCCTTGAACTGAGCTTGTTGAATGAGGCTGCATTTTGGCTGCTACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTGAACTGAGCTTGTTGAATGAGGCTGCATTTTGGCTGCTACA  50

seq1  CAATGGGAACTCATAGATGTGGGCTCCTGTATAACAAAGCTGTGAATTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGGGAACTCATAGATGTGGGCTCCTGTATAACAAAGCTGTGAATTTC  100

seq1  CTTTGAACTGTGGATGGTGCAGAGTACAGGATGTTCTTCCCACAAGGTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGAACTGTGGATGGTGCAGAGTACAGGATGTTCTTCCCACAAGGTGG  150

seq1  CTTTCTAGAATGGTAAGTGAATGCACTTGAAAGAAAGGATATGAAGGATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTAGAATGGTAAGTGAATGCACTTGAAAGAAAGGATATGAAGGATG  200

seq1  CCTTGGCATATCCAGATTATCTCTCCGAGAAAGGCAAAGGTCTTGAAGGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGCATATCCAGATTATCTCTCCGAGAAAGGCAAAGGTCTTGAAGGC  250

seq1  ATGTTCCTGTCTCTTTTCACACAAGAGCAAAGATTGTAAGATAAAACAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTCCTGTCTCTTTTCACACAAGAGCAAAGATTGTAAGATAAAACAGC  300

seq1  AAGTGTATTCCCTCTCTGTATTTGTATTTGCTTATGCCAACTATAAACAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTATTCCCTCTCTGTATTTGTATTTGCTTATGCCAACTATAAACAC  350

seq1  AACCTCGTGCTTTGTTTGCTTTAATAATAAAAACAAAAAGTGCTTTGATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTCGTGCTTTGTTTGCTTTAATAATAAAAACAAAAAGTGCTTTGATT  400

seq1  GCACTATTCATGAGCTTAGAATCCACATATCCCCTGGTGTGCCCACTGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTATTCATGAGCTTAGAATCCACATATCCCCTGGTGTGCCCACTGAA  450

seq1  ATCTTTGGAATGTATCTTTGTTGGCCATGGGGTGGGCCCATAATGAAAGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTGGAATGTATCTTTGTTGGCCATGGGGTGGGCCCATAATGAAAGC  500

seq1  TTTGTAAGGAACCACATGATGTCCTTCCCTTAGGAATGACTTAACCTAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTAAGGAACCACATGATGTCCTTCCCTTAGGAATGACTTAACCTAGA  550

seq1  TGTGTAAGCTAATGTTATGCAAAATGGATTTGTTGATGGAAAGAATGCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTAAGCTAATGTTATGCAAAATGGATTTGTTGATGGAAAGAATGCTT  600

seq1  AAGCATGCCAACTTAAAGGAGTTTTAACGTGAATCTAGGGAGAGACAGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCATGCCAACTTAAAGGAGTTTTAACGTGAATCTAGGGAGAGACAGTA  650

seq1  AAAAAGTGGAGCTGATTCAATCTTACTTCCTTGGGTTTACGTTTCCATAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGTGGAGCTGATTCAATCTTACTTCCTTGGGTTTACGTTTCCATAG  700

seq1  ATAGATATTTACTTGCTTATCATGTCTCCAGATCAAAATGGAGTTTTGTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATATTTACTTGCTTATCATGTCTCCAGATCAAAATGGAGTTTTGTA  750

seq1  ATTGCTTAACATGTGACAAGCAGTATACACACACACACACACACACACAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCTTAACATGTGACAAGCAGTATACACACACACACACACACACACAC  800

seq1  ACACACACACACATACACACACAAGCACATGTGTGCACAGACACACACAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACATACACACACAAGCACATGTGTGCACAGACACACACAC  850

seq1  ACACACACAATCACATGTGTGCACAGACACACAGACACACACATACACAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACAATCACATGTGTGCACAGACACACAGACACACACATACACAC  900

seq1  ACACACACACACACACACACCATAACATGTATTAAAACTCAAATGATAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACCATAACATGTATTAAAACTCAAATGATAAA  950

seq1  AGTCTAAAAATATAAAAGAGAGAATACAAGAGACATGAGAGAAACAAGGA  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AGTCTAAAAATATAAAAGAGAGAATACAAGAGACATGAAAGAAACAAGGA  1000

seq1  ACTGTGAATACAAAGGAGTTCCAT-AAACCTAAATGATTG-ACAAAGTGA  1048
      |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||
seq2  ACTGTGAATAAAAAGGAGTTCCATAAAACCTAAATGATTGAACAAAGTGA  1050

seq1  GTCAAAAGATTGGCTACAAAT-CTTGTGGTTG-CTAGAGCCAAA-CACAA  1095
      ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||
seq2  GTCAAAAGATTGGCTACAAATCCTGGTGGTTGCCTAGAGCCAAACCACAA  1100

seq1  TCAATTC-TGGGAGTCATGGGTTCCATTAAAAAAAAAAATGCCTGGAAAA  1144
      ||||||| |||||||||| || ||||||  |||||||||||||  |||||
seq2  TCAATTCTTGGGAGTCAT-GGATCCATT--AAAAAAAAATGCCCTGAAAA  1147

seq1  TCCTTCTTTTAGGGTTTCAGAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG  1194
      ||  || |||||    |||||||          |||||||||| ||||||
seq2  TC--TC-TTTAG----TCAGAGA-------AACTTTTTTTTTTCTTTTTG  1183

seq1  G---CAGCCCTTGTTTGGAAAGGAAGTA  1219
      |   |  ||||||||||| |||||||||
seq2  GCCACGCCCCTTGTTTGG-AAGGAAGTA  1210

seq1: chr2_107568807_107569922
seq2: B6Ng01-326A10.g_64_1179 (reverse)

seq1  CTGGT-CAGTGAAAAATCCTGGTAAAG-CAAACTCTTTCTCCTGAATAAA  48
      ||||| ||||| ||||||||||||| | ||| |  ||| |||||||||||
seq2  CTGGTCCAGTG-AAAATCCTGGTAAGGCCAAGCCTTTTTTCCTGAATAAA  49

seq1  TTTCTTTCTAAGTTCTTCATCCCATGG-CTTAGTACCTAGTGTTACTATA  97
      |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTCTAAGTTCTTCATTCCATGGCCTAAGTACCTAGTGTTACTATA  99

seq1  CAAATATCATAGGTTTTATTTTAGATAGTGCATGACTTTTAATTTTATCT  147
      |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CAAAAATCATAGG-TTTATTTTAGATAGTGCATGACTTTTAATTTAATCT  148

seq1  TTAGACTTTCAGTCTGAATCATGGGACTCAA-GGAGTGATTACCCCTTGG  196
      |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTAGACTTTCAGTCTGAATCAT-GGACTCAAGGGAGTGATTACCCCTTGG  197

seq1  TACGTTGGTAGCTATTGTCAAAAAGAATATACTGCAAATGACAGTTAAAT  246
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGTTGGTAGCTA-TGTCAAAAAGAATATACTGCAAATGACAGTTAAAT  246

seq1  GTACAAGAATGGTTTTACAGAAGAAGACTAAAGTAAGGAAGACCTCATCC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAAGAATGGTTTTACAGAAGAAGACTAAAGTAAGGAAGACCTCATCC  296

seq1  ACATTCAGCTTCTCCAATACAAGAGGGAGGAAAGACTCTGAGCACTACGT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCAGCTTCTCCAATACAAGAGGGAGGAAAGACTCTGAGCACTACGT  346

seq1  GGTGAGTTTAACGGATGAAACATGGTCAGAGAACAGCTGTGTGAATAGCA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGTTTAACGGATGAAACATGGTCAGAGAACAGCTGTGTGAATAGCA  396

seq1  TGGATCCTGAGAAAAGAACATCACACAATCTTAGAAAGTAGAAAATTGTC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATCCTGAGAAAAGAACATCACACAATCTTAGAAAGTAGAAAATTGTC  446

seq1  ACCTAAATCAACTCTGTCAACCATGCCTAAAACAACTCCAAGTAGAGGGA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTAAATCAACTCTGTCAACCATGCCTAAAACAACTCCAAGTAGAGGGA  496

seq1  GCAAAGCCTTTAAGATAAGCCTGAGAGGATAGAGGAGCAAAGAAAAGAAG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGCCTTTAAGATAAGCCTGAGAGGATAGAGGAGCAAAGAAAAGAAG  546

seq1  CCATCAATGGGTGTCTAAAGTTGTGAGTTTCTGCACAAAGCCTTTTTAAT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCAATGGGTGTCTAAAGTTGTGAGTTTCTGCACAAAGCCTTTTTAAT  596

seq1  TATAGCAGGACTCCAGAAAGCTTAGCATGATTATTGCTTCCAGTGGCCAT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGCAGGACTCCAGAAAGCTTAGCATGATTATTGCTTCCAGTGGCCAT  646

seq1  CAGAGGAGAGTGCTGGCATTTAGATCACGTGTGCTGTTTATGGTCACATA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGAGAGTGCTGGCATTTAGATCACGTGTGCTGTTTATGGTCACATA  696

seq1  ATTATGTGACAGACTGTGATCTAGGTCTCTCTGCTAGTTAAAAAAAGCAA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGTGACAGACTGTGATCTAGGTCTCTCTGCTAGTTAAAAAAAGCAA  746

seq1  AAACGTTTTTTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACGTTTTTTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  796

seq1  TGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  846

seq1  AGACCAGTTACAGGCTTGTCTTTTTTCCTTAAGAAAAAGAAGACTGTAAT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCAGTTACAGGCTTGTCTTTTTTCCTTAAGAAAAAGAAGACTGTAAT  896

seq1  AATAGCAAAAATATGGTTTGCCCTTTCTCAGTCTCCGCTGCTCAGAAGCC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGCAAAAATATGGTTTGCCCTTTCTCAGTCTCCGCTGCTCAGAAGCC  946

seq1  ATGCGGCTTCTCACTTTGCTTAGAGGAAAGACATGGCTAAAGCATGCATC  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCGGCTTCTCACTTTGCTTAGAGGAAAGACATGGCTAAAGCATGCATC  996

seq1  TGCCCTGATCAGACAAGCCTTCCTTTGTTAACTGCTCCTTCCCTTGCGCA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTGATCAGACAAGCCTTCCTTTGTTAACTGCTCCTTCCCTTGCGCA  1046

seq1  GTTTGCTTTAGCATATGAAACCAGTACACCGTCTTCTTCTCTAACCAGAC  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGCTTTAGCATATGAAACCAGTACACCGTCTTCTTCTCTAACCAGAC  1096

seq1  ATGCTTTTCCTTTGGAATTC  1116
      ||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTTTCCTTTGGAATTC  1116