BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-326K05
Chromosome2 (Build37)
Map Location 128,489,324 - 128,623,511
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAnapc1, Mertk
Upstream geneLOC668892, Mall, Nphp1, 1500011K16Rik, Bub1, Acoxl, Bcl2l11, LOC100043424, LOC100043729, LOC383791, LOC100043730, Gm355
Downstream geneTmem87b, 1600015H20Rik, Zc3h8, LOC100043735, LOC100043736, Zc3h6, LOC668894, Ttl, LOC100043738, Rpo1-2, Chchd5, LOC545461, LOC100043431, Slc20a1, A730036I17Rik, LOC671466, Ckap2l, Il1a, Il1b, OTTMUSG00000015529, LOC668896, F830045P16Rik, Sirpa, Pdyn, Ppia-ps2_1620.1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-326K05.bB6Ng01-326K05.g
ACCGA114398GA114399
length1,199729
definitionB6Ng01-326K05.b B6Ng01-326K05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,489,324 - 128,490,537)(128,622,784 - 128,623,511)
sequence
gaattcaagaccagcctgggctacgtacacagcaagaccttgactttaaa
aaagacaaaaagaaaagaaaaaaaggtaaattgtgcttaaacagattttt
aaataaagactcaaaacctactaagtatttgattcatgctatataggaca
acaggccttagtattatcccgacatattctaaggcttacctattattaag
tttgtcaggttctctcagttatatagccagttatacaagcactgcatttc
taacaggataatgaagaaaacaactgtagttacttacacttcgggtccat
gctaagcggtctgtgttataacccatcatgttcaagagacaaatcacaaa
taaactccactctgagtgacagctgggtcctcctggagcactgtgcacat
tgtaccacttgacgagcacctgaatggctacttcttttggcaggatgaac
ttaattgcttgcagacacgtttgtactattaaaagcaaatactgatttta
gtatgtactgcctgcctcctttcaaatgggaaggttcaaattgctaccat
gtccaggccagccaggaaaaacagaaactatcactaaggacactgggcac
aaacattacctcaacattatcaatcacgttaaactaactactgaattcaa
cagggctcacagaaaatctgaagattagctgtcagatccctaattcggga
ctagaaataaagtgagcatatagcccagttcaccagaaataaccactgct
ccaggaaataactgttcccttttcactctcaaaactgtcctactttgaac
aatcaagcttacttcataaaaaatatctaatttcaaaaaaaaaaaaagaa
aagaaaacaaagccgggcgtggtggcgcacgcctttaatcccagcacaga
ggcagaggcaggcagatttctgagttcgaggccagcctggtctgtagagt
gacttccaggacagccagggctacacagagaaaccctgtctcgaaaaacc
aaaaactaacacacacaacaaaaatctatttctacacaaataatttatat
aaaatgtggataaatccttcagtagattcacatgcagcacagcccctact
aacaggatgcctaggatgctacaagctattctcatgagtgaacatcctgt
caactaaaccctgccactcgtattctacactgtcttcctccaccatgcc
gaattctcaatgctggagagtacctgctggccaacagggccctgtggggg
aataaaactgccctatcagagggtgaaggatggctcttcatgccatggag
gaccactgtggacagctggtagggaagattctgagggtgccagggagact
ttaaagagctcagctagggagatgtcccatagatgttgattcatacacca
cagaaggtggcatcctgggcagtaggaagcaagactgacagtctggtcac
tccatggtagaactccgtgatttatatatgtgtatccttttctctgtttc
tccttccttccctgtgtccttccctcactcccttagccctttgctctaca
gtagtggagactgaacatacaactttgtgcaggctagacaagttcccact
actgagctacattcccaactgacattgccacatttcagacagttagctta
cagcagccaaaaagaatcacccataaggagtgcactcttcctagccatgt
ttggactccgagacactcagaatagtcagtgtgcatgtgtctgtgatttt
gtgttcatgattgtgtctgtgtgtgtgagagtatgtgtgtgcgagtgagt
gtgtttgtgtgtctgaatgtgtgtggatttgtgggtgcaagtatgtgtta
gtgtctgtatatgtgtctgtgagtgtgtgctgggtgttactctgtgtgtg
agtgtgtgttttgtgtgtataagtatgcg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_128489324_128490537
seq2: B6Ng01-326K05.b_52_1250

seq1  GAATTCAAGACCAGCCTGGGCTACGTACACAGCAAGACCTTGACTTTAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGACCAGCCTGGGCTACGTACACAGCAAGACCTTGACTTTAAA  50

seq1  AAAGACAAAAAGAAAAGAAAAAAAGGTAAATTGTGCTTAAACAGATTTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGACAAAAAGAAAAGAAAAAAAGGTAAATTGTGCTTAAACAGATTTTT  100

seq1  AAATAAAGACTCAAAACCTACTAAGTATTTGATTCATGCTATATAGGACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAAGACTCAAAACCTACTAAGTATTTGATTCATGCTATATAGGACA  150

seq1  ACAGGCCTTAGTATTATCCCGACATATTCTAAGGCTTACCTATTATTAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGCCTTAGTATTATCCCGACATATTCTAAGGCTTACCTATTATTAAG  200

seq1  TTTGTCAGGTTCTCTCAGTTATATAGCCAGTTATACAAGCACTGCATTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCAGGTTCTCTCAGTTATATAGCCAGTTATACAAGCACTGCATTTC  250

seq1  TAACAGGATAATGAAGAAAACAACTGTAGTTACTTACACTTCGGGTCCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAGGATAATGAAGAAAACAACTGTAGTTACTTACACTTCGGGTCCAT  300

seq1  GCTAAGCGGTCTGTGTTATAACCCATCATGTTCAAGAGACAAATCACAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAGCGGTCTGTGTTATAACCCATCATGTTCAAGAGACAAATCACAAA  350

seq1  TAAACTCCACTCTGAGTGACAGCTGGGTCCTCCTGGAGCACTGTGCACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACTCCACTCTGAGTGACAGCTGGGTCCTCCTGGAGCACTGTGCACAT  400

seq1  TGTACCACTTGACGAGCACCTGAATGGCTACTTCTTTTGGCAGGATGAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACCACTTGACGAGCACCTGAATGGCTACTTCTTTTGGCAGGATGAAC  450

seq1  TTAATTGCTTGCAGACACGTTTGTACTATTAAAAGCAAATACTGATTTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTGCTTGCAGACACGTTTGTACTATTAAAAGCAAATACTGATTTTA  500

seq1  GTATGTACTGCCTGCCTCCTTTCAAATGGGAAGGTTCAAATTGCTACCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGTACTGCCTGCCTCCTTTCAAATGGGAAGGTTCAAATTGCTACCAT  550

seq1  GTCCAGGCCAGCCAGGAAAAACAGAAACTATCACTAAGGACACTGGGCAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAGGCCAGCCAGGAAAAACAGAAACTATCACTAAGGACACTGGGCAC  600

seq1  AAACATTACCTCAACATTATCAATCACGTTAAACTAACTACTGAATTCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATTACCTCAACATTATCAATCACGTTAAACTAACTACTGAATTCAA  650

seq1  CAGGGCTCACAGAAAATCTGAAGATTAGCTGTCAGATCCCTAATTCGGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGCTCACAGAAAATCTGAAGATTAGCTGTCAGATCCCTAATTCGGGA  700

seq1  CTAGAAATAAAGTGAGCATATAGCCCAGTTCACCAGAAATAACCACTGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAAATAAAGTGAGCATATAGCCCAGTTCACCAGAAATAACCACTGCT  750

seq1  CCAGGAAATAACTGTTCCCTTTTCACTCTCAAAACTGTCCTACTTTGAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGAAATAACTGTTCCCTTTTCACTCTCAAAACTGTCCTACTTTGAAC  800

seq1  AATCAAGCTTACTTCATAAAAAATATCTAATTTCAAAAAAAAAAAAAAGA  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AATCAAGCTTACTTCATAAAAAATATCTAATTTC-AAAAAAAAAAAAAGA  849

seq1  AAAGAAAACAAAGCCGGGCGTGGTGGCGCACGCCTTTAATCCCAGCACAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAAACAAAGCCGGGCGTGGTGGCGCACGCCTTTAATCCCAGCACAG  899

seq1  AGGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTGTAGAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTGTAGAG  949

seq1  TGACTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TGACTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAA-  998

seq1  CCAAAAAACTAACAACAACAACAACAAAAATCTAATTTCTACACAAATAA  1050
       | |||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||||| |
seq2  -CCAAAAACTAAC-ACA--CACAACAAAAATCT-ATTTCTACACAAAT-A  1042

seq1  ATTTATATAAAATGTGGATTAAATCCTTCAGTAGATTCAACATGCAGCAC  1100
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  ATTTATATAAAATGTGGA-TAAATCCTTCAGTAGATTC-ACATGCAGCAC  1090

seq1  AGGCACCTACTAACAGGAATGCTTAGGGATGCTACAAGCTATTCTCAATG  1150
      | || |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||
seq2  A-GCCCCTACTAACAGG-ATGCCTA-GGATGCTACAAGCTATTCTC-ATG  1136

seq1  AGTGAACATTCCTGTCAACT-AACACTGCAACTCGTAATTTCTACACTGT  1199
      |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||
seq2  AGTGAACA-TCCTGTCAACTAAACCCTGCCACTCGTA--TTCTACACTGT  1183

seq1  CTTCCT-CACCATGCC  1214
      |||||| |||||||||
seq2  CTTCCTCCACCATGCC  1199

seq1: chr2_128622784_128623511
seq2: B6Ng01-326K05.g_67_795 (reverse)

seq1  CACATACTTATACACAC-AAACACACACTCACACACAGAGTAACACCCAG  49
      | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCATACTTATACACACAAAACACACACTCACACACAGAGTAACACCCAG  50

seq1  CACACACTCACAGACACATATACAGACACTAACACATACTTGCACCCACA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACTCACAGACACATATACAGACACTAACACATACTTGCACCCACA  100

seq1  AATCCACACACATTCAGACACACAAACACACTCACTCGCACACACATACT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCACACACATTCAGACACACAAACACACTCACTCGCACACACATACT  150

seq1  CTCACACACACAGACACAATCATGAACACAAAATCACAGACACATGCACA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACACACACAGACACAATCATGAACACAAAATCACAGACACATGCACA  200

seq1  CTGACTATTCTGAGTGTCTCGGAGTCCAAACATGGCTAGGAAGAGTGCAC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTATTCTGAGTGTCTCGGAGTCCAAACATGGCTAGGAAGAGTGCAC  250

seq1  TCCTTATGGGTGATTCTTTTTGGCTGCTGTAAGCTAACTGTCTGAAATGT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTATGGGTGATTCTTTTTGGCTGCTGTAAGCTAACTGTCTGAAATGT  300

seq1  GGCAATGTCAGTTGGGAATGTAGCTCAGTAGTGGGAACTTGTCTAGCCTG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAATGTCAGTTGGGAATGTAGCTCAGTAGTGGGAACTTGTCTAGCCTG  350

seq1  CACAAAGTTGTATGTTCAGTCTCCACTACTGTAGAGCAAAGGGCTAAGGG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAAGTTGTATGTTCAGTCTCCACTACTGTAGAGCAAAGGGCTAAGGG  400

seq1  AGTGAGGGAAGGACACAGGGAAGGAAGGAGAAACAGAGAAAAGGATACAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGGGAAGGACACAGGGAAGGAAGGAGAAACAGAGAAAAGGATACAC  450

seq1  ATATATAAATCACGGAGTTCTACCATGGAGTGACCAGACTGTCAGTCTTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATAAATCACGGAGTTCTACCATGGAGTGACCAGACTGTCAGTCTTG  500

seq1  CTTCCTACTGCCCAGGATGCCACCTTCTGTGGTGTATGAATCAACATCTA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTACTGCCCAGGATGCCACCTTCTGTGGTGTATGAATCAACATCTA  550

seq1  TGGGACATCTCCCTAGCTGAGCTCTTTAAAGTCTCCCTGGCACCCTCAGA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGACATCTCCCTAGCTGAGCTCTTTAAAGTCTCCCTGGCACCCTCAGA  600

seq1  ATCTTCCCTACCAGCTGTCCACAGTGGTCCTCCATGGCATGAAGAGCCAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTCCCTACCAGCTGTCCACAGTGGTCCTCCATGGCATGAAGAGCCAT  650

seq1  CCTTCACCCTCTGATAGGGCAGTTTTATTCCCCCACAGGGCCCTGTTGGC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCACCCTCTGATAGGGCAGTTTTATTCCCCCACAGGGCCCTGTTGGC  700

seq1  CAGCAGGTACTCTCCAGCATTGAGAATTC  728
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGGTACTCTCCAGCATTGAGAATTC  729