BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-334D24
Chromosome2 (Build37)
Map Location 145,184,760 - 145,291,988
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSlc24a3
Upstream geneLOC635097, Csrp2bp, LOC100043552, 6330439K17Rik, Polr3f, Rbbp9, Sec23b, Gm561, Dtd1, 1700010M22Rik
Downstream geneLOC627312, OTTMUSG00000015643, LOC433482, LOC100043810, Rin2, Nat5, Crnkl1, 4930529M08Rik, LOC100043563, Insm1, A230067G21Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-334D24.bB6Ng01-334D24.g
ACCGA119800GA119801
length1,0111,141
definitionB6Ng01-334D24.b B6Ng01-334D24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(145,291,266 - 145,291,988)(145,184,760 - 145,185,900)
sequence
gaattcatactagtatactatgaatactcctgtgcaattagcaaccgaag
tagcagaacatgggcaatgactctatattagttattaacacctgaggtct
gccatcttcttaactgctctgtttagctccaggatgtctcctaaagtgcc
catgttaaaggcttggtcctcatcttagtgctaccagagggatgatggga
ggtggacttagtgacctatcttcttttttttttaatattttttattacat
attttcctcaattacatttccaatgctatcccaaaagtcccccatacccc
ccccacttccctacccacccattcccattttttggccctggcgttcccct
gtactggggcatatacagtttgcgtgtccaatgggcctctctttccagtg
atggccgactaggccatcttttgatacatatgcagctagagtcaagagct
ccggggtactggttagttcataatgttgttccacctatagggttgcagat
ccctttagttccttgggtactttctctatctcctccattgggagccctgt
gatccatccaatagctgactgtgagcatccacttctgtgtttgctaggcc
ccggcatagtctcacaagagacagctacatctgggtcctttcaacaaaat
cttgctagtgtatgcaatggtgtcagtgtttggaagctgattatggggtg
gatccctggatatggcagtctctagatggtgacctatcttctaatcactg
aggacatactctcaaaggaagctgtggggtcctgacatattctgaacatt
aggtatagaacatgcccccaccagagtgtattgtattccatgggtctatt
aatctcagaatgaaacctccaaaactatgagttgagacaagtcttttaac
tttgcaagttgtttcaactctcatagttacagaatagtgacaactgtgat
gccttctgccactgctctaagttctgcctgtttgtgtgtgtgttactgta
gcccgaatcat
gaattcacaggcaagcctcaatttggaaaagttttgagacaaacatgatg
gaataaaaatatgaatagccctaatagatccagtattcctacaaatcaat
aagaaaaacattaagacacacaatacatatctacacaagaagccacaaat
ctctaaagaataaatgcccaatggaaaaaccagcacagcttagacgctcc
agtctcactagttttgaaaaatacagattaaaaaatgacagaggactcac
atcctttgtggacttagcaacaattcagaaatgatgctctagaggaaggt
ggagtatcctgtgctgctcagaagctcagaatgtctgcaaaataacacag
cagtatggatcaaaagccttacagcatgtagatgccttctgacccaggaa
ttcagcttcttgaataggtcatcaggcattgaaatcccatgtatgtacca
gaatgctcatgaaagatgtgcgatttatttaattggaccaaagtgcacca
aatgataagtcagcaaatacggtccacccatcctctgaactgtagagctg
ctaactatgatagtgggtgggcagttgttcctgacatgggaaactcagca
aaaaaccaagagactagtacagtagactgtttcatggtttttaatggaga
gaaactggtagaggattctccaaatcctcatatcagtttcctcaggacaa
caagatcatagggagttatgtttgcttttcaaatattttattcagtcctc
ccagaagagatagtctttcttcttaaaccagaagaagaataacaatcctc
ctagatgttcttttctagatcagtggcttcttgatttaacatctcatata
tcccatattcagataactcataaatgacacagcatatcagagcgtttcca
tttcctttttggatgccaaagagctaagattaaatacattacttgtatca
aaaaatgattattttcacttttgagcatatttatatcccttataggttaa
cagtatctatttttagttaagatcatacctgtgttagctgaaaatccaaa
tataaaactttcctaacatcatctcatggccaataatgttaaactatatt
agcagatggtgttgcaataatatattcctagaagaatctgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_145291266_145291988
seq2: B6Ng01-334D24.b_47_769 (reverse)

seq1  AGAGACTGCCATATCCAGGGATCCACCCCATAATCAGCTTCCAAACACTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACTGCCATATCCAGGGATCCACCCCATAATCAGCTTCCAAACACTG  50

seq1  ACACCATTGCATACACTAGCAAGATTTTGTTGAAAGGACCCAGATGTAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCATTGCATACACTAGCAAGATTTTGTTGAAAGGACCCAGATGTAGC  100

seq1  TGTCTCTTGTGAGACTATGCCGGGGCCTAGCAAACACAGAAGTGGATGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCTTGTGAGACTATGCCGGGGCCTAGCAAACACAGAAGTGGATGCT  150

seq1  CACAGTCAGCTATTGGATGGATCACAGGGCTCCCAATGGAGGAGATAGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTCAGCTATTGGATGGATCACAGGGCTCCCAATGGAGGAGATAGAG  200

seq1  AAAGTACCCAAGGAACTAAAGGGATCTGCAACCCTATAGGTGGAACAACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTACCCAAGGAACTAAAGGGATCTGCAACCCTATAGGTGGAACAACA  250

seq1  TTATGAACTAACCAGTACCCCGGAGCTCTTGACTCTAGCTGCATATGTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGAACTAACCAGTACCCCGGAGCTCTTGACTCTAGCTGCATATGTAT  300

seq1  CAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGGAAAGAGAGGCCCATTGGACAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGGAAAGAGAGGCCCATTGGACAC  350

seq1  GCAAACTGTATATGCCCCAGTACAGGGGAACGCCAGGGCCAAAAAATGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAACTGTATATGCCCCAGTACAGGGGAACGCCAGGGCCAAAAAATGGG  400

seq1  AATGGGTGGGTAGGGAAGTGGGGGGGGTATGGGGGACTTTTGGGATAGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGGTGGGTAGGGAAGTGGGGGGGGTATGGGGGACTTTTGGGATAGCA  450

seq1  TTGGAAATGTAATTGAGGAAAATATGTAATAAAAAATATTAAAAAAAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAAATGTAATTGAGGAAAATATGTAATAAAAAATATTAAAAAAAAAA  500

seq1  GAAGATAGGTCACTAAGTCCACCTCCCATCATCCCTCTGGTAGCACTAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATAGGTCACTAAGTCCACCTCCCATCATCCCTCTGGTAGCACTAAG  550

seq1  ATGAGGACCAAGCCTTTAACATGGGCACTTTAGGAGACATCCTGGAGCTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGGACCAAGCCTTTAACATGGGCACTTTAGGAGACATCCTGGAGCTA  600

seq1  AACAGAGCAGTTAAGAAGATGGCAGACCTCAGGTGTTAATAACTAATATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAGCAGTTAAGAAGATGGCAGACCTCAGGTGTTAATAACTAATATA  650

seq1  GAGTCATTGCCCATGTTCTGCTACTTCGGTTGCTAATTGCACAGGAGTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCATTGCCCATGTTCTGCTACTTCGGTTGCTAATTGCACAGGAGTAT  700

seq1  TCATAGTATACTAGTATGAATTC  723
      |||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAGTATACTAGTATGAATTC  723

seq1: chr2_145184760_145185900
seq2: B6Ng01-334D24.g_69_1209

seq1  GAATTCACAGGCAAGCCTCAATTTGGAAAAGTTTTGAGACAAACATGATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAGGCAAGCCTCAATTTGGAAAAGTTTTGAGACAAACATGATG  50

seq1  GAATAAAAATATGAATAGCCCTAATAGATCCAGTATTCCTACAAATCAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAAAAATATGAATAGCCCTAATAGATCCAGTATTCCTACAAATCAAT  100

seq1  AAGAAAAACATTAAGACACACAATACATATCTACACAAGAAGCCACAAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAAACATTAAGACACACAATACATATCTACACAAGAAGCCACAAAT  150

seq1  CTCTAAAGAATAAATGCCCAATGGAAAAACCAGCACAGCTTAGACGCTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAAAGAATAAATGCCCAATGGAAAAACCAGCACAGCTTAGACGCTCC  200

seq1  AGTCTCACTAGTTTTGAAAAATACAGATTAAAAAATGACAGAGGACTCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTCACTAGTTTTGAAAAATACAGATTAAAAAATGACAGAGGACTCAC  250

seq1  ATCCTTTGTGGACTTAGCAACAATTCAGAAATGATGCTCTAGAGGAAGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTTTGTGGACTTAGCAACAATTCAGAAATGATGCTCTAGAGGAAGGT  300

seq1  GGAGTATCCTGTGCTGCTCAGAAGCTCAGAATGTCTGCAAAATAACACAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTATCCTGTGCTGCTCAGAAGCTCAGAATGTCTGCAAAATAACACAG  350

seq1  CAGTATGGATCAAAAGCCTTACAGCATGTAGATGCCTTCTGACCCAGGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTATGGATCAAAAGCCTTACAGCATGTAGATGCCTTCTGACCCAGGAA  400

seq1  TTCAGCTTCTTGAATAGGTCATCAGGCATTGAAATCCCATGTATGTACCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGCTTCTTGAATAGGTCATCAGGCATTGAAATCCCATGTATGTACCA  450

seq1  GAATGCTCATGAAAGATGTGCGATTTATTTAATTGGACCAAAGTGCACCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGCTCATGAAAGATGTGCGATTTATTTAATTGGACCAAAGTGCACCA  500

seq1  AATGATAAGTCAGCAAATACGGTCCACCCATCCTCTGAACTGTAGAGCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGATAAGTCAGCAAATACGGTCCACCCATCCTCTGAACTGTAGAGCTG  550

seq1  CTAACTATGATAGTGGGTGGGCAGTTGTTCCTGACATGGGAAACTCAGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTATGATAGTGGGTGGGCAGTTGTTCCTGACATGGGAAACTCAGCA  600

seq1  AAAAACCAAGAGACTAGTACAGTAGACTGTTTCATGGTTTTTAATGGAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACCAAGAGACTAGTACAGTAGACTGTTTCATGGTTTTTAATGGAGA  650

seq1  GAAACTGGTAGAGGATTCTCCAAATCCTCATATCAGTTTCCTCAGGACAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACTGGTAGAGGATTCTCCAAATCCTCATATCAGTTTCCTCAGGACAA  700

seq1  CAAGATCATAGGGAGTTATGTTTGCTTTTCAAATATTTTATTCAGTCCTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGATCATAGGGAGTTATGTTTGCTTTTCAAATATTTTATTCAGTCCTC  750

seq1  CCAGAAGAGATAGTCTTTCTTCTTAAACCAGAAGAAGAATAACAATCCTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAAGAGATAGTCTTTCTTCTTAAACCAGAAGAAGAATAACAATCCTC  800

seq1  CTAGATGTTCTTTTCTAGATCAGTGGCTTCTTGATTTAACATCTCATATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGATGTTCTTTTCTAGATCAGTGGCTTCTTGATTTAACATCTCATATA  850

seq1  TCCCATATTCAGATAACTCATAAATGACACAGCATATCAGAGCGTTTCCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATATTCAGATAACTCATAAATGACACAGCATATCAGAGCGTTTCCA  900

seq1  TTTCCTTTTTGGATGCCAAAGAGCTAAGATTAAATACATTACTTGTATCA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTTTTTGGATGCCAAAGAGCTAAGATTAAATACATTACTTGTATCA  950

seq1  AAAAATGATTATTTTCACTTTTGAGCATATTTTATAT-CCTTATAGGTTA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
seq2  AAAAATGATTATTTTCACTTTTGAGCATA-TTTATATCCCTTATAGGTTA  999

seq1  ACAGTATCTATTTTTAGTTAAGATCATACCTGTGTTAAGCTGAAAAATCC  1049
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
seq2  ACAGTATCTATTTTTAGTTAAGATCATACCTGTGTT-AGCTG-AAAATCC  1047

seq1  AAATATATA--CTTCCTAACATCATCTTCCATGGCAAATTAATGTTAACT  1097
      ||||||| |   |||||||||||||||  |||||| || |||||||||  
seq2  AAATATAAAACTTTCCTAACATCATCT--CATGGCCAA-TAATGTTAAAC  1094

seq1  TATA-TAGCAGATGGTG-TGC-ATAATATAATCCTAGAAGAATCTGG  1141
      |||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||
seq2  TATATTAGCAGATGGTGTTGCAATAATATATTCCTAGAAGAATCTGG  1141