BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-337L18
Chromosome2 (Build37)
Map Location 167,525,951 - 167,647,512
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneBC067047, Trp53rk, Arfgef2, LOC670802, Cse1l, Stau1, LOC383774, Ddx27, AI481105, 1500012F01Rik, LOC668950, Kcnb1, Ptgis, LOC668951, B4galt5, Slc9a8, Spata2, Zfp313, Snai1, Ube2v1, AI840826, Cebpb
Downstream geneLOC100043728, Ptpn1, 2310033K02Rik, Pard6b, Adnp, Dpm1, Mocs3, LOC100043908, Kcng1, LOC668952, Nfatc2, Atp9a, Sall4
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-337L18.bB6Ng01-337L18.g
ACCGA122268GA122269
length1,0541,016
definitionB6Ng01-337L18.b B6Ng01-337L18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(167,646,453 - 167,647,512)(167,525,951 - 167,526,966)
sequence
gaattctttgcctgtgtgaagtatatatgcaccggtgcgtgcttgttgga
tgccctcgaactggagttacagatggtgtgagccaccgtgcagatgctgg
gactcgaacccaggtcctctgccagagcaccagaggctcttaacctctga
gccatctctccagccctacagaacatgcgagtctgggtatgggattcagg
ttttcaggcttggtgggcattggacttgacatgttactcagactggcctg
gaactcacgacaatcctcctgcttcagcctcccaagtgctgaccccaaag
gaatactatactaaatgttttccatctttaaatccctttgcatacagttg
gacaccactgaggtaggtggggtctctttaaacctcagagaatgttgtgg
ggtctgagtctctacccactagatgccagcggcaccctgtccccaacata
accccaaatgtccccagacactgctcctccagggaccaaaccactctggg
ttggagccactgtttaaatgcttctctgagatattggaggtggtttaaca
ataagcataccattgtcaccacaatcagaaaaacaaacactttaaaggga
ctgttggcagcatcccctgtggctgggcaactctaccccggtggagcccg
ccctgcacatccagccttcagcgctccattctggctttgcctcacatcag
cgagcttctcccctcgagactctgaggcagaggctgggagtggtagtgtt
gattctctcaccaccttctcctccttggtgactacttggatttcagagtg
agccacacagctctctttttggaaagaccctgtagttccccccacagcta
agcagatcttctaaagatcccctccagctacaggaaacccgttctgtctc
tggacttcggaccactcagtgttttggagtttagaagtttatttgcatag
tgccgggcatccacgggtttcctcaggctttgctgtgctcagtggaaggc
agtgcgccactgagaaaaacactcacacgagatccgagaagagtcggaga
gagg
gaattcaaaccaaggaatgccctacagaacagctggctgggaccctcagt
catctggaggtcatgaaaattgaggcaatgccgggaaggaagtactttag
acagttagaccccaaacacaatgaaagggacttatgtcactctggaccag
acaaatgtcagaagacccacaggggaacaattgtgatgttgacttgaact
cagttttagtactgtgtgtgattgcacacatgtgaatgtgtatatgctgg
tgtgtacacacatgtgcatgagatgaaagtcaggagatactggatggggg
tgatgtcatgtttacaactcattctcaaatgcagatggaagggtaatgct
aagctggctcgggcagcatgtgcccagattactggctcttaggggggtgt
cttggttcaggccatcgtaggctgcacaatgatttgagactgtcacaaaa
attaaaaaaaaaatcacaagaaaagagggccaaagtgcagggaagctgtg
ggaagagcagcctagggagacagcctggagcctcacacgagagtcttccc
atttctctgcaggatacgaagagaaactctgacctccaatgcacccaaga
gaaagaaaacacttgcaaaaggcttgtgggcccacagcagttacagccct
cacagtctcaaaccaaagccgaggaatagtcccgaggacagcaaaaccac
agatgagctgcagatctgagcacctggctggtgaatcttggaggtgttca
ctgtgcgaggatgctagacacaaagggccactctgtgtgctaagtcttcc
actccaaaactgaagggaggtcccagtcaccctggcagtttgctctgtgg
gcaggagagttactgccctcggtaggggcatcaggaagcctccctgaaca
gctaagagttgtctggatctttatgggaaggtggtccttagatacatcca
aacccacttatagaactgtatacatgggccaaggctcgatttgtagagca
ttgctaatgtcaagag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_167646453_167647512
seq2: B6Ng01-337L18.b_49_1102 (reverse)

seq1  CCTCTCTCCCGCTCTTCTCGGGTCTTCGTGTTGGTGTTTTTCTCAGTTGG  50
      |||||||||  |||||||||| || ||||||  ||||||||||||| |||
seq2  CCTCTCTCCGACTCTTCTCGGATC-TCGTGTGAGTGTTTTTCTCAG-TGG  48

seq1  CTTCCACTGCCTTCCACTGAGCACAGCAAAGGCCTGAGGAAACCCGTGGA  100
      |   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  C--GCACTGCCTTCCACTGAGCACAGCAAA-GCCTGAGGAAACCCGTGGA  95

seq1  TGGCCGGCACTATGCAAATAAACTTTCTAAACTCCAAAACACTGAGTGGT  150
      || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCGGCACTATGCAAATAAAC-TTCTAAACTCCAAAACACTGAGTGGT  144

seq1  CCGAAGTCCAGAGACAGAACGGGTTTCCTGTAGCTGGAGGGGATCTTTAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGAAGTCCAGAGACAGAACGGGTTTCCTGTAGCTGGAGGGGATCTTTAG  194

seq1  AAGATCTGCTTAGCTGTGGGGGGAACTACAGGGTCTTTCCAAAAAGAGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATCTGCTTAGCTGTGGGGGGAACTACAGGGTCTTTCCAAAAAGAGAG  244

seq1  CTGTGTGGCTCACTCTGAAATCCAAGTAGTCACCAAGGAGGAGAAGGTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTGGCTCACTCTGAAATCCAAGTAGTCACCAAGGAGGAGAAGGTGG  294

seq1  TGAGAGAATCAACACTACCACTCCCAGCCTCTGCCTCAGAGTCTCGAGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGAATCAACACTACCACTCCCAGCCTCTGCCTCAGAGTCTCGAGGG  344

seq1  GAGAAGCTCGCTGATGTGAGGCAAAGCCAGAATGGAGCGCTGAAGGCTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGCTCGCTGATGTGAGGCAAAGCCAGAATGGAGCGCTGAAGGCTGG  394

seq1  ATGTGCAGGGCGGGCTCCACCGGGGTAGAGTTGCCCAGCCACAGGGGATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCAGGGCGGGCTCCACCGGGGTAGAGTTGCCCAGCCACAGGGGATG  444

seq1  CTGCCAACAGTCCCTTTAAAGTGTTTGTTTTTCTGATTGTGGTGACAATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCAACAGTCCCTTTAAAGTGTTTGTTTTTCTGATTGTGGTGACAATG  494

seq1  GTATGCTTATTGTTAAACCACCTCCAATATCTCAGAGAAGCATTTAAACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGCTTATTGTTAAACCACCTCCAATATCTCAGAGAAGCATTTAAACA  544

seq1  GTGGCTCCAACCCAGAGTGGTTTGGTCCCTGGAGGAGCAGTGTCTGGGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCTCCAACCCAGAGTGGTTTGGTCCCTGGAGGAGCAGTGTCTGGGGA  594

seq1  CATTTGGGGTTATGTTGGGGACAGGGTGCCGCTGGCATCTAGTGGGTAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGGGGTTATGTTGGGGACAGGGTGCCGCTGGCATCTAGTGGGTAGA  644

seq1  GACTCAGACCCCACAACATTCTCTGAGGTTTAAAGAGACCCCACCTACCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCAGACCCCACAACATTCTCTGAGGTTTAAAGAGACCCCACCTACCT  694

seq1  CAGTGGTGTCCAACTGTATGCAAAGGGATTTAAAGATGGAAAACATTTAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGTGTCCAACTGTATGCAAAGGGATTTAAAGATGGAAAACATTTAG  744

seq1  TATAGTATTCCTTTGGGGTCAGCACTTGGGAGGCTGAAGCAGGAGGATTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGTATTCCTTTGGGGTCAGCACTTGGGAGGCTGAAGCAGGAGGATTG  794

seq1  TCGTGAGTTCCAGGCCAGTCTGAGTAACATGTCAAGTCCAATGCCCACCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTGAGTTCCAGGCCAGTCTGAGTAACATGTCAAGTCCAATGCCCACCA  844

seq1  AGCCTGAAAACCTGAATCCCATACCCAGACTCGCATGTTCTGTAGGGCTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGAAAACCTGAATCCCATACCCAGACTCGCATGTTCTGTAGGGCTG  894

seq1  GAGAGATGGCTCAGAGGTTAAGAGCCTCTGGTGCTCTGGCAGAGGACCTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGATGGCTCAGAGGTTAAGAGCCTCTGGTGCTCTGGCAGAGGACCTG  944

seq1  GGTTCGAGTCCCAGCATCTGCACGGTGGCTCACACCATCTGTAACTCCAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCGAGTCCCAGCATCTGCACGGTGGCTCACACCATCTGTAACTCCAG  994

seq1  TTCGAGGGCATCCAACAAGCACGCACCGGTGCATATATACTTCACACAGG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGAGGGCATCCAACAAGCACGCACCGGTGCATATATACTTCACACAGG  1044

seq1  CAAAGAATTC  1060
      ||||||||||
seq2  CAAAGAATTC  1054

seq1: chr2_167525951_167526966
seq2: B6Ng01-337L18.g_66_1081

seq1  GAATTCAAACCAAGGAATGCCCTACAGAACAGCTGGCTGGGACCCTCAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAACCAAGGAATGCCCTACAGAACAGCTGGCTGGGACCCTCAGT  50

seq1  CATCTGGAGGTCATGAAAATTGAGGCAATGCCGGGAAGGAAGTACTTTAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGGAGGTCATGAAAATTGAGGCAATGCCGGGAAGGAAGTACTTTAG  100

seq1  ACAGTTAGACCCCAAACACAATGAAAGGGACTTATGTCACTCTGGACCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTTAGACCCCAAACACAATGAAAGGGACTTATGTCACTCTGGACCAG  150

seq1  ACAAATGTCAGAAGACCCACAGGGGAACAATTGTGATGTTGACTTGAACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATGTCAGAAGACCCACAGGGGAACAATTGTGATGTTGACTTGAACT  200

seq1  CAGTTTTAGTACTGTGTGTGATTGCACACATGTGAATGTGTATATGCTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTTTAGTACTGTGTGTGATTGCACACATGTGAATGTGTATATGCTGG  250

seq1  TGTGTACACACATGTGCATGAGATGAAAGTCAGGAGATACTGGATGGGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTACACACATGTGCATGAGATGAAAGTCAGGAGATACTGGATGGGGG  300

seq1  TGATGTCATGTTTACAACTCATTCTCAAATGCAGATGGAAGGGTAATGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTCATGTTTACAACTCATTCTCAAATGCAGATGGAAGGGTAATGCT  350

seq1  AAGCTGGCTCGGGCAGCATGTGCCCAGATTACTGGCTCTTAGGGGGGTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGGCTCGGGCAGCATGTGCCCAGATTACTGGCTCTTAGGGGGGTGT  400

seq1  CTTGGTTCAGGCCATCGTAGGCTGCACAATGATTTGAGACTGTCACAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGTTCAGGCCATCGTAGGCTGCACAATGATTTGAGACTGTCACAAAA  450

seq1  ATTAAAAAAAAAATCACAAGAAAAGAGGGCCAAAGTGCAGGGAAGCTGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAAAAAAAATCACAAGAAAAGAGGGCCAAAGTGCAGGGAAGCTGTG  500

seq1  GGAAGAGCAGCCTAGGGAGACAGCCTGGAGCCTCACACGAGAGTCTTCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAGCAGCCTAGGGAGACAGCCTGGAGCCTCACACGAGAGTCTTCCC  550

seq1  ATTTCTCTGCAGGATACGAAGAGAAACTCTGACCTCCAATGCACCCAAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTCTGCAGGATACGAAGAGAAACTCTGACCTCCAATGCACCCAAGA  600

seq1  GAAAGAAAACACTTGCAAAAGGCTTGTGGGCCCACAGCAGTTACAGCCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAAAACACTTGCAAAAGGCTTGTGGGCCCACAGCAGTTACAGCCCT  650

seq1  CACAGTCTCAAACCAAAGCCGAGGAATAGTCCCGAGGACAGCAAAACCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTCTCAAACCAAAGCCGAGGAATAGTCCCGAGGACAGCAAAACCAC  700

seq1  AGATGAGCTGCAGATCTGAGCACCTGGCTGGTGAATCTTGGAGGTGTTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGAGCTGCAGATCTGAGCACCTGGCTGGTGAATCTTGGAGGTGTTCA  750

seq1  CTGTGCGAGGATGCTAGACACAAAGGGCCACTCTGTGTGCTAAGTCTTCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCGAGGATGCTAGACACAAAGGGCCACTCTGTGTGCTAAGTCTTCC  800

seq1  ACTCCAAAACTGAAGGGAGGTCCCAGTCACCCTGGCAGTTTGCTCTGTGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCAAAACTGAAGGGAGGTCCCAGTCACCCTGGCAGTTTGCTCTGTGG  850

seq1  GCAGGAGAGTTACTG-CCTCGGTAGGGGCATCAGGAAGCC-CCCTGAACA  898
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GCAGGAGAGTTACTGCCCTCGGTAGGGGCATCAGGAAGCCTCCCTGAACA  900

seq1  GCTAAGAGGTGTCTGGATC-TTATGGGAAGGTGGTCCTTTAGATACATCC  947
      |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GCTAAGAGTTGTCTGGATCTTTATGGGAAGGTGGTCC-TTAGATACATCC  949

seq1  AAACCCACTTATAGAACTGTATACAATGGGCC-AGGCTCGATTGGTAGAG  996
      |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||
seq2  AAACCCACTTATAGAACTGTATAC-ATGGGCCAAGGCTCGATTTGTAGAG  998

seq1  CATTTGCCTAATGTCAAGAG  1016
      ||||   |||||||||||||
seq2  CATT--GCTAATGTCAAGAG  1016