BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-340O15
Chromosome2 (Build37)
Map Location 125,716,553 - 125,840,872
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGalk2
Upstream geneSlc24a5, Myef2, LOC100043375, Slc12a1, Dut, A530010F05Rik, LOC100043698, Fbn1, Cep152, Shc4, Eid1, 3110001I20Rik, Cops2
Downstream geneFgf7, Dtwd1, Atp8b4, Slc27a2, Hdc, Gabpb1, Usp8, LOC100043714, Usp50, Trpm7, 2010106G01Rik, Ap4e1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-340O15.bB6Ng01-340O15.g
ACCGA124460GA124461
length1,2211,020
definitionB6Ng01-340O15.b B6Ng01-340O15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(125,839,651 - 125,840,872)(125,716,553 - 125,717,556)
sequence
gaattcttaaatgacagtgagtaagaggcattgctttcagcatcctgtaa
cccaccacgctacctttttcctttgccgggcagtctctggggaatgaaac
tcgggacgatctgagacgattagatccattaacaactctattgcttcagg
ggtaaatccacatcactcagagcatttgttcagcaactatagcatttaaa
taaattcataatcacccaccaatttttctcagtcacccttgaggatttga
attcaatgcattatttcctgacacattttaaaaatcttctgacactagcc
caaccactcgcattaatgttctttgctcttctttttcttcacatccttaa
agacattaccaaaggaacccttggctacatccagggtggtcttacactcc
tggtcaaatgcctgatcaccctgcctcgctcctatataaactcctctgac
ttaattgtttccatgtctgaacccttgaaagtctaaccaaatcgttaagt
gaaatttctctaattaccgcatcctacaaatatccatcccctttctcatc
ttaaaaattcatttctgatgcaaccaacttattcttttatgtcttgttaa
ttttgaagtaaaggctgaatttctcacaagtataacctgtatgagtgtca
atagtagctgaccactaaaatttatatactttttcctgagtgcagtccca
aaaagagatgaacatgtttatgtctttttgaaatgtcaggatttattgaa
taaataaatatatttgtatgtggtttatgttaggtctcaaaacctgggat
tgaggtacctattaacataaaggttttcccagcatccctgagtccctacc
tgtttcagggtcctcctgacagacataccccgccccataccctaaacatt
tcaaccctgtgggctgacctgggctctccttcccagctgcattcctgtat
ataacacagccattttggctatgccagccctttttcctttggtctgctga
cttcttctggcttcttgactcttggctctctctcttcccaacccctatac
tcacatagtctggctcatcatgtctactctagacccttccagatgccttc
tggctatattctcccctcctatctaacaattaacctccttctcacaatta
ctaagggagccagttacgtctctaagtcttaatgcctagtttacagtcca
atataactatataggggtgaa
gaattcaccttagggtcttggaagaacaagaacaagccccatcaaaaatc
agtagattgaaagaaataattacaatcaaggaaggaattaatgaaataaa
aatttaaaaatataatgagtttgtgaaacaaagtgtcaattctttgaaac
aatgaacaagatcaataaactcttagccaaactagccaaaagaaagagaa
caaaggcccaaattaatgaagtaagagatgaaaagggagatatggcagta
gatactagtgaaattcaggaaatagttgtgatatattttagaactcttac
attctatgatgttggaaaatctgaaaggaatgaatgaatatgtaggtgca
tataatctactcatattaaatctggatgagattaacagtttatagagatt
aataaacaaacaatgagattcaagcaacaactaaaaacaaaacaacaaca
acagaaaaacctcaactaaacaaacaacattttcaattaataaagtccag
actttggtaaggcctgttgctgaagatactacatacttgtcacaagacat
agaaatagcattggttctgaccaggaaccttcctccctgttggctcactt
tcacagtggcaggaggtgctgcgtaggatgctaggggagagctttcatca
gcagtcttacccagctgggaaccctgtgcacgactggtatgggaagagat
acccgtgggtagaatagtggcataaatagtataggggtaaccacagcggc
tccctgagattatctgtggataatgcagaaactcacagctgatccacggg
cagagaatagtgccagtggatagtacaaatgggacttttgcatcacactt
ccctacccaaggaccatggcagaagagagagcagggagattggaagagcc
agatgctgaagaggactggagtgaaatgggatcgtcttctggatgtgaca
ggactgctgtgctcagagcacgaagtagctgtacttgcctgcatagggca
aagctagtaacattctagta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_125839651_125840872
seq2: B6Ng01-340O15.b_45_1265 (reverse)

seq1  TTCACC----TATAGT--TATTTGACTGTAAACTAGACAATAAAAAGAAA  44
      ||||||    ||||||  |||| ||||||||||||| || |   ||||  
seq2  TTCACCCCTATATAGTTATATTGGACTGTAAACTAGGCATT---AAGACT  47

seq1  TAAAAAGAGGACGTAACT-GCTCC--TAGGTATGGTGAAGGAGGAGGTTT  91
      || |     ||||||||| |||||  |||  || ||| || |||||||| 
seq2  TAGA-----GACGTAACTGGCTCCCTTAGTAATTGTG-AGAAGGAGGTTA  91

seq1  ATTG-TAGATAGGA-GGGAGAATATAGCCAGAA-GCATCTGGAAGGGTCT  138
      |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  ATTGTTAGATAGGAGGGGAGAATATAGCCAGAAGGCATCTGGAAGGGTCT  141

seq1  AGAGTAGACATGAATGAGCCAGACTATGTGAGTATAGGGGTTGGGAAGAG  188
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AGAGTAGACATG-ATGAGCCAGACTATGTGAGTATAGGGGTTGGGAAGA-  189

seq1  GAGAGAGCCAAGAGTCAAGAAGCCAGAAGAAAGTCAGCAGACCAAAAGGA  238
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||
seq2  GAGAGAGCCAAGAGTCAAGAAGCCAGAAG-AAGTCAGCAGACC-AAAGGA  237

seq1  AAAAGGGCTGGCATAGCCAAAATGGCTGTGTTATATACAGGAATGCAGCT  288
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGGGCTGGCATAGCCAAAATGGCTGTGTTATATACAGGAATGCAGCT  287

seq1  GGGAAGGAGAGCCCAGGTCAGCCCACAGGGTTGAAATGTTTAGGGTATGG  338
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAGGAGAGCCCAGGTCAGCCCACAGGGTTGAAATGTTTAGGGTATGG  337

seq1  GGCGGGGTATGTCTGTCAGGAGGACCCTGAAACAGGTAGGGACTCAGGGA  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGGGGTATGTCTGTCAGGAGGACCCTGAAACAGGTAGGGACTCAGGGA  387

seq1  TGCTGGGAAAACCTTTATGTTAATAGGTACCTCAATCCCAGGTTTTGAGA  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGGAAAACCTTTATGTTAATAGGTACCTCAATCCCAGGTTTTGAGA  437

seq1  CCTAACATAAACCACATACAAATATATTTATTTATTCAATAAATCCTGAC  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAACATAAACCACATACAAATATATTTATTTATTCAATAAATCCTGAC  487

seq1  ATTTCAAAAAGACATAAACATGTTCATCTCTTTTTGGGACTGCACTCAGG  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCAAAAAGACATAAACATGTTCATCTCTTTTTGGGACTGCACTCAGG  537

seq1  AAAAAGTATATAAATTTTAGTGGTCAGCTACTATTGACACTCATACAGGT  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGTATATAAATTTTAGTGGTCAGCTACTATTGACACTCATACAGGT  587

seq1  TATACTTGTGAGAAATTCAGCCTTTACTTCAAAATTAACAAGACATAAAA  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACTTGTGAGAAATTCAGCCTTTACTTCAAAATTAACAAGACATAAAA  637

seq1  GAATAAGTTGGTTGCATCAGAAATGAATTTTTAAGATGAGAAAGGGGATG  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAAGTTGGTTGCATCAGAAATGAATTTTTAAGATGAGAAAGGGGATG  687

seq1  GATATTTGTAGGATGCGGTAATTAGAGAAATTTCACTTAACGATTTGGTT  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTTGTAGGATGCGGTAATTAGAGAAATTTCACTTAACGATTTGGTT  737

seq1  AGACTTTCAAGGGTTCAGACATGGAAACAATTAAGTCAGAGGAGTTTATA  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTTCAAGGGTTCAGACATGGAAACAATTAAGTCAGAGGAGTTTATA  787

seq1  TAGGAGCGAGGCAGGGTGATCAGGCATTTGACCAGGAGTGTAAGACCACC  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAGCGAGGCAGGGTGATCAGGCATTTGACCAGGAGTGTAAGACCACC  837

seq1  CTGGATGTAGCCAAGGGTTCCTTTGGTAATGTCTTTAAGGATGTGAAGAA  888
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATGTAGCCAAGGGTTCCTTTGGTAATGTCTTTAAGGATGTGAAGAA  887

seq1  AAAGAAGAGCAAAGAACATTAATGCGAGTGGTTGGGCTAGTGTCAGAAGA  938
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAGAGCAAAGAACATTAATGCGAGTGGTTGGGCTAGTGTCAGAAGA  937

seq1  TTTTTAAAATGTGTCAGGAAATAATGCATTGAATTCAAATCCTCAAGGGT  988
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAAAATGTGTCAGGAAATAATGCATTGAATTCAAATCCTCAAGGGT  987

seq1  GACTGAGAAAAATTGGTGGGTGATTATGAATTTATTTAAATGCTATAGTT  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGAGAAAAATTGGTGGGTGATTATGAATTTATTTAAATGCTATAGTT  1037

seq1  GCTGAACAAATGCTCTGAGTGATGTGGATTTACCCCTGAAGCAATAGAGT  1088
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAACAAATGCTCTGAGTGATGTGGATTTACCCCTGAAGCAATAGAGT  1087

seq1  TGTTAATGGATCTAATCGTCTCAGATCGTCCCGAGTTTCATTCCCCAGAG  1138
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAATGGATCTAATCGTCTCAGATCGTCCCGAGTTTCATTCCCCAGAG  1137

seq1  ACTGCCCGGCAAAGGAAAAAGGTAGCGTGGTGGGTTACAGGATGCTGAAA  1188
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCCCGGCAAAGGAAAAAGGTAGCGTGGTGGGTTACAGGATGCTGAAA  1187

seq1  GCAATGCCTCTTACTCACTGTCATTTAAGAATTC  1222
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATGCCTCTTACTCACTGTCATTTAAGAATTC  1221

seq1: chr2_125716553_125717556
seq2: B6Ng01-340O15.g_69_1071

seq1  GAATTCACCTTAGGGTCTTGGAAGAACAAGAACAAGCCCCATCAAAAATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCTTAGGGTCTTGGAAGAACAAGAACAAGCCCCATCAAAAATC  50

seq1  AGTAGATTGAAAGAAATAATTACAATCAAGGAAGGAATTAATGAAATAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGATTGAAAGAAATAATTACAATCAAGGAAGGAATTAATGAAATAAA  100

seq1  AATTTAAAAATATAATGAGTTTGTGAAACAAAGTGTCAATTCTTTGAAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTAAAAATATAATGAGTTTGTGAAACAAAGTGTCAATTCTTTGAAAC  150

seq1  AATGAACAAGATCAATAAACTCTTAGCCAAACTAGCCAAAAGAAAGAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAACAAGATCAATAAACTCTTAGCCAAACTAGCCAAAAGAAAGAGAA  200

seq1  CAAAGGCCCAAATTAATGAAGTAAGAGATGAAAAGGGAGATATGGCAGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGCCCAAATTAATGAAGTAAGAGATGAAAAGGGAGATATGGCAGTA  250

seq1  GATACTAGTGAAATTCAGGAAATAGTTGTGATATATTTTAGAACTCTTAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACTAGTGAAATTCAGGAAATAGTTGTGATATATTTTAGAACTCTTAC  300

seq1  ATTCTATGATGTTGGAAAATCTGAAAGGAATGAATGAATATGTAGGTGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTATGATGTTGGAAAATCTGAAAGGAATGAATGAATATGTAGGTGCA  350

seq1  TATAATCTACTCATATTAAATCTGGATGAGATTAACAGTTTATAGAGATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATCTACTCATATTAAATCTGGATGAGATTAACAGTTTATAGAGATT  400

seq1  AATAAACAAACAATGAGATTCAAGCAACAACTAAAAACAAAACAACAACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAACAAACAATGAGATTCAAGCAACAACTAAAAACAAAACAACAACA  450

seq1  ACAGAAAAACCTCAACTAAACAAACAACATTTTCAATTAATAAAGTCCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAAAACCTCAACTAAACAAACAACATTTTCAATTAATAAAGTCCAG  500

seq1  ACTTTGGTAAGGCCTGTTGCTGAAGATACTACATACTTGTCACAAGACAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTGGTAAGGCCTGTTGCTGAAGATACTACATACTTGTCACAAGACAT  550

seq1  AGAAATAGCATTGGTTCTGACCAGGAACCTTCCTCCCTGTTGGCTCACTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATAGCATTGGTTCTGACCAGGAACCTTCCTCCCTGTTGGCTCACTT  600

seq1  TCACAGTGGCAGGAGGTGCTGCGTAGGATGCTAGGGGAGAGCTTTCATCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGTGGCAGGAGGTGCTGCGTAGGATGCTAGGGGAGAGCTTTCATCA  650

seq1  GCAGTCTTACCCAGCTGGGAACCCTGTGCACGACTGGTATGGGAAGAGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTCTTACCCAGCTGGGAACCCTGTGCACGACTGGTATGGGAAGAGAT  700

seq1  ACCCGTGGGTAGAATAGTGGCATAAATAGTATAGGGGTAACCACAGCGGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCGTGGGTAGAATAGTGGCATAAATAGTATAGGGGTAACCACAGCGGC  750

seq1  TCCCTGAGATTATCTGTGGATAATGCAGAAACTCACAGCTGATCCACGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGAGATTATCTGTGGATAATGCAGAAACTCACAGCTGATCCACGGG  800

seq1  CAGAGAATAGTGCCAGTGGATAGTACAAATGGGACTTTTGCATCACACTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAATAGTGCCAGTGGATAGTACAAATGGGACTTTTGCATCACACTT  850

seq1  CCCTACCCAAGGACCATGGCAGAAGAGAGAGCAGGGAGATTGGAAGAGCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTACCCAAGGACCATGGCAGAAGAGAGAGCAGGGAGATTGGAAGAGCC  900

seq1  AGATGCTGAAGAGGACTGGAGTGAAATGGGATCGTCTTCTGGATGTGACA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGCTGAAGAGGACTGGAGTGAAATGGGATCGTCTTCTGGATGTGACA  950

seq1  GGACTGCTGTGCTCAGGAGCACGAAGTAGCTGTACTTGCCTGCATAGGGC  1000
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTGCTGTGCTCA-GAGCACGAAGTAGCTGTACTTGCCTGCATAGGGC  999

seq1  AAAG  1004
      ||||
seq2  AAAG  1003