BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-345B10
Chromosome2 (Build37)
Map Location 93,618,180 - 93,767,796
singlet/doubletdoublet
Overlap geneExt2, 2610203E10Rik, Gm1967
Upstream geneSyt13, LOC100042784, Trp53i11, C230071H18Rik, Tspan18, LOC100042789, LOC639658, Cd82, Alx4
Downstream geneGm1335, LOC620695, Alkbh3, Hsd17b12, E530001K10Rik, Ttc17, Itpa-ps1, Api5, LOC100043259
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-345B10.bB6Ng01-345B10.g
ACCGA127398GA127399
length1,1581,027
definitionB6Ng01-345B10.b B6Ng01-345B10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(93,618,180 - 93,619,339)(93,766,932 - 93,767,796)
sequence
gaattcacaaatcctacaatgacatttcctataaggaattctcaggaact
taataaatagtctcaccctatgggacatcagctcaaagactaagacaatt
cttacacaggctacaaattaatgtttaataccttttattagagaggccat
ttccggaagtcgggcctcatgttggggacccattatgaaggattaacctg
tggttagctttagacaagtttttctgctgatgcccaagaaggaaacagtg
gcacatggtccttcctgaacccctaaagaggcccaaccacttatttacga
cttcacacttgcatcactcagtttggtcagaattacagtgtaagcggggc
tggaaaggacgcgcgtgcactgcctcatagcacttgatgcacttgcagag
gacctgagtttgttcctagcacccacagggcggctcacaaccatctgtaa
ctctgttcctagggaattcaataccttctctggctgccgaaggcaccagg
cagtcatatgttatgcaaacagacatgcaggcaaattatccatacacata
aaataaaatgatgactctaaaaatgttaaaagcatggtataagatatatc
cacttcattattttaaatcacagaatatgaacttgtcagatggaacagtg
agaaggtaagtctaccatttcggagtctgggatactctggtttagttgtc
ctttagtttctgactatcacgacactcccttagaaggtgtatgaatagta
acaggaccagtgtcttcaccgtttgctcaactctgcatgacagctgcatg
tgtcagcctggctgccacaccacaaacaccctttgcttttgtctcaatct
caagctaaatggctgctttaaactgaacatggttgcaaaactgttcatat
tcaaaactcctagaaaaaggaaaaataatgtctatgacagaaggagtaca
gagcatgtatatgtatatgtgtgtatgtacgcgtatgtatgtgcatatat
gtccactgacttgacttatcatcaccatgcccctcctaaagccctcagca
gagcaggggacagaaggacatcccttcaccctcacacacacattacacat
acacacatacacaatgggcaagctggaactgaaggtagaaagggaggagc
tcaaaatg
gaattcctgcaccctagaggtggaggcaggaagatcagaagggtcatccc
cagccacccagagagtttgaggtcagcttgagctacatgagactcctttg
aaaaactaaagcaagcagaaacaaggagatgaagaaaatttaaatccaga
taaacactgactacataaaatcattatgtactacctctgaactctttgga
tggtcacacaaacaagcagatggtatgtaactgggaaattgacaaaaggg
agtttaaatagctcaggtccttgtgtggcctagtgtagaattagggattg
aaattgcactaggctccggcaagtttaggattcgtaacacagcttccagg
gtaacaatttcaagaatacacaaagtacatatgagtccagtgctaatgac
ggggaaggaaaatggaagatgtgacttgagagatgagccagcagttacaa
gcactggcttgctcttgcagaggacccagtgtggttcccagcactcacag
acagctcacaattgtctctgctactccagcttctgggaatctctggtctg
tgtgcaccagacacacatgtggcatatatatatatatatttctggtctgt
gtgcaccacacaccacacatgcacgcacaaatgaatagaaagaaattggg
agaaatggaagtatgcacctcttcttgtcatcaagggtaataactaacta
actaactaagcattgatggctagactaagcagaaaacgcaacacaatgtg
gtagatttgaaccaaattatatgggtaaattaaatcaaaattgacacagt
aattaattaaatagtagataaagtcaaaatagatttcaaatatcaaactc
tacactctttagaagagatgaatccaaaacagtggctctcaacctttcct
aaagccgtggcctttcaatacagttcctcgagttgttcaacccccaacca
taaaaattacttctgttgctgcttcataactgtagtttgctactgttatg
aaacattgtgtgtgtacctctgttttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr2_93618180_93619339
seq2: B6Ng01-345B10.b_47_1204

seq1  GAATTCACAAATCCTACAATGACATTTCCTATAAGGAATTCTCAGGAACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAAATCCTACAATGACATTTCCTATAAGGAATTCTCAGGAACT  50

seq1  TAATAAATAGTCTCACCCTATGGGACATCAGCTCAAAGACTAAGACAATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAAATAGTCTCACCCTATGGGACATCAGCTCAAAGACTAAGACAATT  100

seq1  CTTACACAGGCTACAAATTAATGTTTAATACCTTTTATTAGAGAGGCCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACACAGGCTACAAATTAATGTTTAATACCTTTTATTAGAGAGGCCAT  150

seq1  TTCCGGAAGTCGGGCCTCATGTTGGGGACCCATTATGAAGGATTAACCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCGGAAGTCGGGCCTCATGTTGGGGACCCATTATGAAGGATTAACCTG  200

seq1  TGGTTAGCTTTAGACAAGTTTTTCTGCTGATGCCCAAGAAGGAAACAGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTAGCTTTAGACAAGTTTTTCTGCTGATGCCCAAGAAGGAAACAGTG  250

seq1  GCACATGGTCCTTCCTGAACCCCTAAAGAGGCCCAACCACTTATTTACGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATGGTCCTTCCTGAACCCCTAAAGAGGCCCAACCACTTATTTACGA  300

seq1  CTTCACACTTGCATCACTCAGTTTGGTCAGAATTACAGTGTAAGCGGGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCACACTTGCATCACTCAGTTTGGTCAGAATTACAGTGTAAGCGGGGC  350

seq1  TGGAAAGGACGCGCGTGCACTGCCTCATAGCACTTGATGCACTTGCAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAAGGACGCGCGTGCACTGCCTCATAGCACTTGATGCACTTGCAGAG  400

seq1  GACCTGAGTTTGTTCCTAGCACCCACAGGGCGGCTCACAACCATCTGTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTGAGTTTGTTCCTAGCACCCACAGGGCGGCTCACAACCATCTGTAA  450

seq1  CTCTGTTCCTAGGGAATTCAATACCTTCTCTGGCTGCCGAAGGCACCAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTTCCTAGGGAATTCAATACCTTCTCTGGCTGCCGAAGGCACCAGG  500

seq1  CAGTCATATGTTATGCAAACAGACATGCAGGCAAATTATCCATACACATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCATATGTTATGCAAACAGACATGCAGGCAAATTATCCATACACATA  550

seq1  AAATAAAATGATGACTCTAAAAATGTTAAAAGCATGGTATAAGATATATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAAATGATGACTCTAAAAATGTTAAAAGCATGGTATAAGATATATC  600

seq1  CACTTCATTATTTTAAATCACAGAATATGAACTTGTCAGATGGAACAGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTCATTATTTTAAATCACAGAATATGAACTTGTCAGATGGAACAGTG  650

seq1  AGAAGGTAAGTCTACCATTTCGGAGTCTGGGATACTCTGGTTTAGTTGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGTAAGTCTACCATTTCGGAGTCTGGGATACTCTGGTTTAGTTGTC  700

seq1  CTTTAGTTTCTGACTATCACGACACTCCCTTAGAAGGTGTATGAATAGTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAGTTTCTGACTATCACGACACTCCCTTAGAAGGTGTATGAATAGTA  750

seq1  ACAGGACCAGTGTCTTCACCGTTTGCTCAACTCTGCATGACAGCTGCATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGACCAGTGTCTTCACCGTTTGCTCAACTCTGCATGACAGCTGCATG  800

seq1  TGTCAGCCTGGCTGCCACACCACAAACACCCTTTGCTTTTGTCTCAATCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAGCCTGGCTGCCACACCACAAACACCCTTTGCTTTTGTCTCAATCT  850

seq1  CAAGCTAAATGGCTGCTTTAAACTGAACATGGTTGCAAAACTGTTCATAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTAAATGGCTGCTTTAAACTGAACATGGTTGCAAAACTGTTCATAT  900

seq1  TCAAAACTCCTAGAAAAAGGAAAAATAATGTCTATGACAGAAAGGAGTAC  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TCAAAACTCCTAGAAAAAGGAAAAATAATGTCTATGACAG-AAGGAGTAC  949

seq1  AGAGCATGTATATGTATATGTGTGTATGTACGCGTATTGTATGTGCATAT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AGAGCATGTATATGTATATGTGTGTATGTACGCGTA-TGTATGTGCATAT  998

seq1  ATGTCCACTGACTTGACTTATCATCACCATGCCCCTCCTAAAGCCCTCAG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCCACTGACTTGACTTATCATCACCATGCCCCTCCTAAAGCCCTCAG  1048

seq1  CAGAGCAGGGGGACAGAA-GACA--CCCTCACCCTCACACACACA-CACA  1096
      ||||||| |||||||||| ||||  || |||||||||||||||||  |||
seq2  CAGAGCA-GGGGACAGAAGGACATCCCTTCACCCTCACACACACATTACA  1097

seq1  CACACACACACACACACATGGCAAGGCTGGGAAACTG-AGGGAGGAGGGG  1145
      || ||||||| ||||| ||||  | |||||  ||||| ||| || | |||
seq2  CATACACACATACACA-ATGGGCAAGCTGG--AACTGAAGGTAGAAAGGG  1144

seq1  AGGAGGCTCAAAATG  1160
      |||| ||||||||||
seq2  AGGA-GCTCAAAATG  1158

seq1: chr2_93766932_93767796
seq2: B6Ng01-345B10.g_227_1091 (reverse)

seq1  GAAAACAGAGGTACACACACAATGTTTCATAACAGTAGCAAAACTACAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GAAAACAGAGGTACACACACAATGTTTCATAACAGTAGC-AAACTACAGT  49

seq1  TATGAAGCAGCAACAGAAGTAA-TTTTATGGTTGGGGGTTGAAACAACTC  99
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TATGAAGCAGCAACAGAAGTAATTTTTATGGTTGGGGGTTG-AACAACTC  98

seq1  GAGGAACTGTATTGAAAGGCCACGGCTTTAGG-AAGGTTGAGAGCCACTG  148
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GAGGAACTGTATTGAAAGGCCACGGCTTTAGGAAAGGTTGAGAGCCACTG  148

seq1  TTTTGGATTCATCTCTTCTAAAGAGTGTAGAGTTTGATATTTGAAATCTA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGGATTCATCTCTTCTAAAGAGTGTAGAGTTTGATATTTGAAATCTA  198

seq1  TTTTGACTTTATCTACTATTTAATTAATTACTGTGTCAATTTTGATTTAA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGACTTTATCTACTATTTAATTAATTACTGTGTCAATTTTGATTTAA  248

seq1  TTTACCCATATAATTTGGTTCAAATCTACCACATTGTGTTGCGTTTTCTG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACCCATATAATTTGGTTCAAATCTACCACATTGTGTTGCGTTTTCTG  298

seq1  CTTAGTCTAGCCATCAATGCTTAGTTAGTTAGTTAGTTATTACCCTTGAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGTCTAGCCATCAATGCTTAGTTAGTTAGTTAGTTATTACCCTTGAT  348

seq1  GACAAGAAGAGGTGCATACTTCCATTTCTCCCAATTTCTTTCTATTCATT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAGAAGAGGTGCATACTTCCATTTCTCCCAATTTCTTTCTATTCATT  398

seq1  TGTGCGTGCATGTGTGGTGTGTGGTGCACACAGACCAGAAATATATATAT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCGTGCATGTGTGGTGTGTGGTGCACACAGACCAGAAATATATATAT  448

seq1  ATATATGCCACATGTGTGTCTGGTGCACACAGACCAGAGATTCCCAGAAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATGCCACATGTGTGTCTGGTGCACACAGACCAGAGATTCCCAGAAG  498

seq1  CTGGAGTAGCAGAGACAATTGTGAGCTGTCTGTGAGTGCTGGGAACCACA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGTAGCAGAGACAATTGTGAGCTGTCTGTGAGTGCTGGGAACCACA  548

seq1  CTGGGTCCTCTGCAAGAGCAAGCCAGTGCTTGTAACTGCTGGCTCATCTC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTCCTCTGCAAGAGCAAGCCAGTGCTTGTAACTGCTGGCTCATCTC  598

seq1  TCAAGTCACATCTTCCATTTTCCTTCCCCGTCATTAGCACTGGACTCATA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGTCACATCTTCCATTTTCCTTCCCCGTCATTAGCACTGGACTCATA  648

seq1  TGTACTTTGTGTATTCTTGAAATTGTTACCCTGGAAGCTGTGTTACGAAT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACTTTGTGTATTCTTGAAATTGTTACCCTGGAAGCTGTGTTACGAAT  698

seq1  CCTAAACTTGCCGGAGCCTAGTGCAATTTCAATCCCTAATTCTACACTAG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAACTTGCCGGAGCCTAGTGCAATTTCAATCCCTAATTCTACACTAG  748

seq1  GCCACACAAGGACCTGAGCTATTTAAACTCCCTTTTGTCAATTTCCCAGT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACACAAGGACCTGAGCTATTTAAACTCCCTTTTGTCAATTTCCCAGT  798

seq1  TACATACCATCTGCTTGTTTGTGTGACCATCCAAAGAGTTCAGAGGTAGT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATACCATCTGCTTGTTTGTGTGACCATCCAAAGAGTTCAGAGGTAGT  848

seq1  ACATAATGATTTTATGT  865
      |||||||||||||||||
seq2  ACATAATGATTTTATGT  865