BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-049F14.T7 (MSMg01no049_f14.b1) | MSMg01-049F14.TJ (MSMg01no049_f14.g1) |
ACC | AG278838 | AG278839 |
length | 1,345 | 1,314 |
length of high quality (start - end) | 279 (72 - 350) | 403 (77 - 479) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_f14.b1 PHD_FILE: MSMg01no049_f14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:16 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_f14.g1 PHD_FILE: MSMg01no049_f14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:16 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TATGGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCATAAA
TCTAAGTTTTACCCTATACATTGAATACTGATTTAATAAACTAGTGAATT
TACCTTATTATGAATCATTTCTACATTTCACCAGAGCTTCTTTAAAGTCT
CCTTTTCTTCACCTTTTCGTAGCCTTAAGTTGTGTTTTTTACTATAGCAG
GCATCTTGAAAGGGCCAAAAGCGCAAGGAGGCTCTACTATCAGGAGAGCA
GAGTGATAAACAGGAAGTAAGCCTCCTCCGGTGACAAAGGAAGAGAAAGA
TGAAGAGGAAGAAGAGGGGGGGAGGGAGGGACAGAGGGAGGAGAGGTATT
TTTTCTTCTCTATTCTTCATATTCATACATATATATAATACTTCTTTTTT
CTTTTTCTCTCACAAATATTAATTTCTTTTTTACATAATAAATATTTATC
ACTTCTTTCTTACTTTTATCATTTTTTAACTTCTATTATTTTATGTATTT
TCCTGCTTCTTTTTTCTTATACCTCTCCCTTTATTACATATTTTAATACT
TCAATTAACTTTTCTTCATACTTTTTTCATTCATAATCTTAATTCTCTAT
ATATCCTTATATTATTTTAAATATTTTCTTATCTATACTATTAATTTAAT
CTAACTTATTTCTTTTTCTTTTAGCTTAATATAAAATATAATTCTCTTTT
ATATCTTTCTACTATTCCCTTTCTTATGTACTTATCTATTTCTATTCTAT
ATTTATAATAAATTTAATATTCTTATTTATACTCTTATATTATATAATAA
ACTATTCTTATATATAATTCCTAATATCTATAATATATCTTCTATTCTAT
TTTTACTTTTACAAATTCTCTTCATTTTCCGACATAATTTTTTATTCTCT
TCTTAAATTGAATATTTTAATTATTATATTAAATTGTTATCTTTTTATTT
TCATATCTCTTATTTTACTTTCTTTTATTATTTCACCCCTTTTTTTTATT
CTATTGTTCATTATTATTTAATCATATTGTATATCTCTCTAACTTTATAT
TTATTATTTTTTTAAGTCAATTTTCTATACTAAATATAATCGACTCTTCT
CATTCTCTATTTTGATATACATTTTTCTTATACTATCATACTTATTATTA
TACTTCTGTACTTTACATATATCTTTTAACTTGCAATTAATCATACCATT
TTTCATTACTTGTATCTTCTTTATGCTACTTTCTCCTTTAATTATACTTT
TTACTTATATTTACTTATCTATACTTATTCATATTTTATATATATACTCT
CATATAAATCCTTTATTGTTATTCTATTTAATATTCATTCCTATG
| NNTTAAGTATGGAGCCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXCCTCTTTAACCTATTTGGTTGTGTTCTCCTGCAAT
TCTTTACCGTATTTTTGTGCTTCCTCTTTAATATCTTCTACCTGTTTAGC
AGTGTTCTCCTGTATTTCTTTAATTGAGTTATTAAAGTTCTTCTTGATGT
CCTCTACCATCATCATAAAATATGCTTTTAAATCCGGGTCTAGGTTTTCA
GGTGTGTTGGGGTGCCCTGGACTGGGTGAAGTGGGAGTGCTGGGTTCTGA
TGATGGTGATTGGTCTTGGTTTATGTTAGTAATTCTTTTGTTTACCTTTC
GCCATCTGGTAATCTCTGGAGTTAGTTGTTATAGTTGTTCCTGTTTAGAT
ATTGTTCCTCTGGTGATTCTGTTACCCTCTATCAGCAGTCCTGGGAGACT
TGCTCTCTCCTCTGAGTTTCAGTGGTCAGAGCACTCTCTGCAGGCCAGCT
CTCCTCTTACAGGGAAGGTGTACAGATATCTGGCGTTTGGACCCCCCCTC
TGCTCGAACATGAAGGCCCAAAACAGGACCTTTCCCAAAAACTGCGTTGC
TTTGGCCTGTCCCATAAGCTGTTATCTTCTGTGTGCACACTCTCATCTGT
GTATACTACTTTTCGGTGTCTTCCTGTAACCAAGACGCCTCCCGCATATT
CTGATGCTTTAGCCTCTGGTTTTGAGCTGACCCATGTCCTCTGGCCTTTT
AAGTGTACATATTTCTTTAACCTCTAAAATGATGTTCTCTTCTAAAATTT
TTTTTCCTCCTGCCCTATTCAAATAATTCTTATTTTTTTGTTGTTTAACT
TTTTAATCAATTATTTTTTTCCAATTTATACCTTTTTATGATATACTTTT
AATTTTTATATTTTTATTCTATACTTATTATTGTATATTTCTAATATTCC
TATTTGAAATCCTTTTTAATTTGTATTTTTAAATTATCTTATATTATTAA
AAACATACTTTATTATTTTATTAGTATTTCTATGACTTTTTATTTGCCAT
ATACTTTTCTATCTATTAATTTCATACATTCCCCAAACTTCTTACTATTT
CTTATACGATTTTTATGTTCTATTTCTTATTTTATTTTGCTTATATAGTA
TAATATATTTATCTCCCCCCTTTAATTTTTATAATAATTATTATTAAGTA
TATAATTATATTATCTTAAATCTAGTATTCTATTAGCTTTCTNTTNACAC
ATCTGACTTCCAAATTATGTATAATTGTATTATATGTACTATATATAANT
ATCTCTATTTTTTA
|
quality values | Open.Hide. 9 9 10 8 11 11 19 17 16 15 8 8 8 8 8 13 15 24 20 20 17 24 24 29 28 35 34 33 36 36 36 33 33 33 33 37 37 39 37 37 32 27 23 15 10 10 19 19 37 37
37 47 37 33 33 33 40 17 19 11 10 9 8 8 8 8 8 8 9 9 12 16 28 24 26 32 37 36 38 57 48 53 53 57 57 57 48 48 42 36 36 29 29 19 19 24 34 34 41 39
30 30 25 25 24 30 30 28 28 28 33 33 43 37 33 32 28 28 28 22 25 30 36 43 43 57 50 50 48 48 50 50 57 57 48 48 48 48 57 57 68 54 54 54 54 54 54 47 47 48
48 50 53 50 57 57 57 57 57 57 47 47 57 57 57 57 57 47 57 57 47 42 42 37 42 42 35 35 39 42 44 43 43 43 44 44 50 50 50 57 50 47 47 57 57 57 57 57 50 52
52 57 57 59 57 57 57 57 57 54 54 52 52 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 59 59 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 52 52 52 50 50 38
38 38 59 50 54 57 57 57 52 48 48 50 48 50 50 50 50 57 48 48 48 50 59 59 57 57 57 54 46 46 43 46 42 46 43 43 47 44 46 48 57 57 57 43 43 43 43 43 43 47
57 47 44 43 43 43 43 43 43 43 41 41 41 41 28 41 30 30 41 41 30 30 22 30 18 18 18 32 26 39 39 43 24 27 12 12 11 22 22 39 39 39 32 32 22 15 12 15 15 11
22 11 8 8 6 6 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 7 7 10 11 15 13 8
8 6 8 11 10 6 6 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 12 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 11 8 9 9 9 9 9 9 9 8 10 8 8 8 8
8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 10 9 9 9 8 8 10 8 8 8 8 12 12 12 8 10 6 6 8 6 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 9 9 10 10 10
10 10 10 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 10 10 11 12 11 8 8 6 6 8 8 8 10 8 7 8 8 8 6 6 6 8 8
10 8 8 8 10 10 8 8 8 13 10 10 10 12 10 8 8 8 10 8 8 9 9 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 7 6 8 8 6 6 8 10 15 18 8 10 10
10 10 8 8 8 6 6 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 10 10
10 10 10 10 10 11 11 12 12 12 11 8 10 9 9 8 10 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 6 7 10 8 10 10 12 11 11 11 12 9 9 10 10 10 9 10 10 13 10 10
10 8 8 8 8 9 8 9 8 10 7 7 7 6 8 8 11 11 11 11 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 10 11 10 10 10 8 8 8
8 8 8 8 8 6 7 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 9 9 10 10 10 11 11 12 12 10 12 6 9 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 10 11 8 8 6 6 8 6 6 10 6 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 12 13 11 14 14 14 13
16 16 11 9 10 10 10 8 8 8 12 8 8 8 10 9 8 6 6 6 6 8 8 11 11 13 10 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 10 10 10 11 13 13 12
10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 8 8 8 8 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 12
10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 9 8 8 10 6 6 6 6 8 15 11 9 8 8 6 6 8 6 6 6 6 9 9 10 6 7 6 7 7 13 15 30 18 13 10 9 9 9 11
8 7 6 8 6 9 8 8 10 8 8 8 13 10 11 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 9 9 8 12 11 11 11 10 10
8 13 8 8 8 9 10 10 11 16 11 11 8 9 8 7 7 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 10 13 10 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 13 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 12 13 9 9 9 9 9 8 9 9 8 8 8 12 8 10 6 7 8 8 8 10 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 8 9 9 8 8 8 8 10 8 8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 8 7 7 8 8 8 10 8 8 10 9 12 8 8 8 8 6 7 10 10
8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 10 9 8 11 11 10 9 9 9 12 10 12 7 7 8 8 8
6 6 7 7 7 8 8 8 6 6 8 8 6 7 8 10 8 8 6 6 8 8 8 11 9 11 11 9 10 8 8 7 7 10 7 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 11 9
8 8 8 8 8 10 8 8 10 11 11 8 8 8 8 8 6 9 9 15 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 9 8 10 9 9 10 9 9 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 7 6 6 8 8 8 9 9 7 7 8 10 10 17 9 11 17 16 15 12 10 14 13 15 9 9 13 16 21 23 10 10 10 19 13 13 15 24 26 34 39
36 33 34 32 31 37 43 44 41 50 47 27 21 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 13 13 25 25 28 25 32 44 36 33 33 33 34 32 33 33 38 38 42 38 38 47 47 50 50 50
50 47 37 28 28 12 9 9 9 9 9 21 30 37 40 40 36 37 39 39 35 32 28 28 28 28 37 26 37 42 37 34 40 42 42 48 48 48 54 50 48 48 57 54 43 42 42 35 42 42
43 43 48 48 48 48 50 50 50 48 57 47 47 57 57 57 57 57 47 47 41 50 41 41 57 57 47 43 43 47 57 57 57 54 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 52 52 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57
57 57 57 52 43 43 43 43 35 43 35 35 35 43 43 52 43 44 26 26 26 44 44 35 31 31 35 43 44 52 57 43 43 26 26 26 44 35 39 43 44 43 43 43 35 43 43 62 62 62
62 62 62 62 45 62 45 52 62 62 62 52 52 52 62 62 62 41 29 29 14 26 26 27 21 15 33 33 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 43 47 35
35 35 62 43 52 43 43 43 45 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 31 31 31 38 34 27 27 26 44 43 43 43 43 43 39 39 43 43 43 52 62 52 52 52 43 33 22 11 8 8 10
10 23 23 39 45 52 52 52 52 43 44 44 35 35 35 44 44 57 57 57 52 52 52 57 59 59 59 59 52 52 52 38 38 12 12 9 9 9 24 27 12 12 11 19 13 17 18 23 38 38
44 29 29 29 44 44 52 52 52 52 37 37 27 27 12 19 21 42 42 44 43 35 35 33 35 33 32 19 14 10 12 10 10 12 24 34 22 19 19 24 16 15 12 11 11 11 19 12 17 18
29 27 41 41 41 36 38 29 19 18 24 18 14 14 15 21 22 23 28 21 28 19 23 13 17 19 30 31 41 37 33 24 22 17 17 22 28 25 17 12 12 18 15 20 19 19 13 12 12 11
8 8 10 10 8 9 10 16 16 22 18 13 11 10 10 10 15 15 18 21 18 12 12 11 15 12 15 13 18 16 26 30 31 23 17 12 12 12 11 11 11 14 12 8 8 8 8 8 8 10
23 15 10 8 8 8 8 13 12 12 15 9 10 10 8 8 8 8 8 8 15 25 23 19 14 14 17 17 9 9 9 14 12 10 11 11 18 18 18 20 18 15 12 9 9 8 8 8 12 12
8 8 8 8 8 8 11 11 11 19 12 10 8 8 8 8 8 8 7 8 8 9 13 10 11 8 8 8 8 9 11 11 10 10 9 10 10 11 13 12 12 11 11 11 11 8 8 8 11 8
8 8 15 15 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 6 6 6 6 10 6 8 8 6 6 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8
8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 12 14 11 9 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 10 10 8 10 7 7 8 8 10 10 13 11 8 8 8 8
10 8 10 12 12 11 12 12 10 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 10 11 22 16 10 10 10 9 9 9 9 15 11 10 8 8 8
8 8 8 8 10 10 10 12 12 8 6 6 6 8 9 9 9 10 8 11 10 8 10 8 8 8 12 8 10 10 10 10 11 13 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 12 14 13 15
14 14 14 14 13 13 9 8 8 8 8 8 10 12 12 13 11 10 10 6 6 6 6 8 6 7 8 8 10 10 10 8 6 6 8 8 10 8 8 11 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8
10 10 8 8 9 9 12 11 12 11 11 11 11 13 16 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 10 10 10 9 9 9 13 10 10 9 8 8 8 8 8 8 9 11 9 13 16 16 12
12 12 11 11 11 11 11 11 8 10 7 9 8 10 7 7 6 6 10 10 8 6 6 8 6 6 8 8 6 6 6 7 6 6 8 8 8 8 8 8 7 8 12 12 9 9 10 8 8 8
8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 9 10 10 10 11 11 18 13 19 15 11 12 11 11 11 11 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
9 10 10 8 8 8 8 8 9 10 9 8 6 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 12 7 9 9 9 12 10 10 8 8 8 10 13 11 11 9 9 11 12 9 9 9 6 6 8 12
8 8 9 9 8 8 8 8 11 10 8 6 7 11 9 11 12 12 11 11 9 9 6 8 6 7 8 8 8 8 8 19 10 8 8 8 9 10 8 6 6 10 8 10 10 12 8 8 8 8
8 8 6 6 8 10 10 8 8 8 8 9 12 12 11 10 9 8 8 6 8 8 8 7 7 9 9 8 8 8 8 8 10 10 8 8 9 9 10 10 10 3 0 3 3 0 3 6 7 8
11 9 9 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 7 11 7 7 8 6 8 6 6 12 12 12 13 11 10 8 8 3 0 3
7 8 8 8 11 8 9 8 13 8 8 10 8 8 |