BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-049I10.T7 (MSMg01no049_i10.b1) | MSMg01-049I10.TJ (MSMg01no049_i10.g1) |
ACC | AG278946 | AG278947 |
length | 1,286 | 1,246 |
length of high quality (start - end) | 324 (78 - 401) | 522 (86 - 607) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_i10.b1 PHD_FILE: MSMg01no049_i10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:38 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_i10.g1 PHD_FILE: MSMg01no049_i10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:38 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NGGCCACCTTTGGGCGCTAAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCTGTAGGCTTCTTGGATGCTCTTGGGCATCTCTTTCTTTAGATTTGGGA
AGTTTTCTTCACTAATTTTGTTGAAGATGTTTGCTGGTCCTTTGAGTTGA
AAATCTTCATTCTCATCCACTTCTATTATGCGTAGGTTTGGTCTTCTCAT
TGTGTCCTGGATTTCCTGGATGTTTTGAGTTAGGATCTTTTTGCATTTTC
CATTTTCCTTGATTGTTGTCCCGAAGTTCTCTATGGAATCTTCTGCACCT
GAGATTCTCTCTTCCATCTCTTGTATTCTGCTGCTGATGCTGGCATCTAT
GGTTCCAGATTTCTTTCCTAGGGTTTCTATCTCCAGCGTTGCCTCACTTT
GTGTTTTCTTCATTGTGTCTACTTCCCTTTCTAGGTCTAGTATGGTTTTG
TTCATTTCTATCACCTGTTTAGATGTGTTTTCCTGTTTTTCTATAAGGAC
TTCTACCTCGTTTGGTTGTGTTTTCCTGTCTTTCTTTAAGGACTTGTAAC
TCTTTACCAGTGTTCTCCTGTATTTCTTTATGTGATTTATTAAATTCCTT
CTTTATGTCCTCTACCATCATCACGAGAAATGCCTTTATATCCAGGTCTA
CCTTTTCAGGTGTGTTAAGATGCCCTTGACTGGTCTAAGTGTAAGTGCTC
TTTTCTGATCCTGTTGACTGCTCTCTCTTCCTGTTAATAACTATCTTACA
TTTATCTTTCTCTATATTGTACTTCCTCCGTATTTACATGTTTATACTTG
TCTTTCTATTAAATTCTTATATCTTTGTAGCTTCTTTTTATTTATCTTTT
TCTATATATTTTAATACTATTTACTTTCCTATATATTATTTTCTTACATC
TTTTACCATATTTATATTCTAATTACACTTTCTCTATCATTTTTATATAT
ATTTTTATAATTATTACTTCACTATTTTATATATATCTTCTATATAAGAT
ATATATAATCTACTTCTTTCTTCATATTATCTTTCTATCTACTTTTAACT
TTATTTTTTTCTTTAATTCATATCTTTCTACTATCATTTACTCAATTTCA
TCAAATATTCTTGATTCTATTATTTGTTTTTCTCCTATTTTTCTCTCACT
TACATATCTTATTTCCTTAGTGTACTCTATTATTTTTAGCTCTTCTTATA
TTTTNACTTTATTATATATTTTACTTATAAATAAACTTAACTCTCCTACC
TATTGTACAGTACCTCTTTTNATCATATATTTTATG
| TTTTTTGAAACATGTGAGCCGGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTAAGCTTTGTTCTTTAAATGAATTGT
GAGTGACAAACCTTTGATACCCCTTTCAGCAAGAGAAAACCATAAAGATG
ATAGTAAGGGAGGGATGACATTTCTGGAGACCAGAATTCGTCCTAGCTAG
AGAACCAAAATAGGTCACACTTCTTCTTCTAATAGAATTTGAATACACAG
GGTCATATTTAATAAGGATGCAGTTCTATGTCATCTTAATTTTTGAAGAT
TGATGTCATCAACTACCAAACACTGATTGGCTTACTCCAGTGCAATTTTT
CTCTCCCAGACTGGAGGGTTGAAATCCATGACTGAAGTTCTTGTAGAGTC
TTACTCTCTAGAAAGAACATCAGGCTTCTCCCTAGCTTTCAGTGGCTGTC
GATAATCCATTTCCTAGTTCATCAACATGTGGACTCCATCATTTCGTCTG
AACATCTCTGCTTTTTCTTTGTGTAAAAATAACAATTATAGGATTATTTC
CTCCTCTACTTTGGTATGCTCATATTTTAACTTAGCACCTATCCTCCTAT
TTCCAAATTTGACTTTATTTTGAGGTTTCATGTGGGCCTGGATTTTGTGA
ACTATTTAACCTAGTTGATTGCCAATTGGTAAGATGCCAGATATGTTTCT
CTCATTTTAAAAAATAAATAGTTGAAACTTAACAGTAATCCAATGCACGA
TGGGTTTTCACCATGAATCATTGACCATTTTCAAGTTCCTGCCACGCCAG
GGGTCCTGAGCCTTCCTAATACTGGGATACTTTCCTCATATTGCGGCAAG
ATAAATCATAAAATCATTGCTTTGCTACTTCATTACCGGGACACTTTTCT
ACTGTTAAGAATTATAACAGCAAAGGTCTGAAATGCAAGGATATCTGAAA
TGTGAAAACCTGGGAAAAAGTCCAGAAGATCCCCCAAAATGTCCAGGACC
CTCCTGTTTGGAAATGGGGGGGTTTAACCCTATGGGTCTGCGTTTCCATT
AACAGGGTATTATCTACCTCTCTAAACAATAGGACCCTTGTGCTCTTGGT
TAAAACCCTTTGTTTCCCAAATTTTTGGGCCTAACATTCTTTTGAAACTC
TTTGTATCTCTGGGAAATAGATTATCTTTCTATACCCTTTTTCCTGGAAG
GACTCCGTCCATTATTTTCTTTTTATAGGTAAATATTTTAGACAAT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 8 9 6 6 7 9 7 10 11 10 12 10 8 8 10 8 8 9 12 15 17 12 12 9 9 9 23 23 13 13 8 12 12 14 16 22 33 33 42 32 32 16 14 14 21 21
34 24 24 14 10 10 10 11 30 32 37 30 17 19 10 10 9 10 10 10 10 10 12 12 11 11 12 12 17 30 32 36 40 37 33 33 33 36 31 31 25 28 21 25 21 24 15 18 18 23
32 20 20 20 31 25 37 24 24 14 14 14 19 19 25 37 37 37 37 37 37 39 43 39 39 39 39 36 29 23 23 31 23 28 33 32 31 25 25 29 33 43 39 43 42 43 35 39 37 41
30 44 44 46 44 44 43 37 37 35 39 39 44 57 57 47 44 44 37 37 37 42 41 42 48 41 41 37 42 32 35 28 28 24 22 23 32 36 42 37 35 35 35 44 44 50 37 37 43 44
43 23 23 32 32 32 24 24 13 21 26 38 30 43 39 44 44 52 52 52 52 43 43 35 43 43 47 47 52 57 44 43 32 32 33 42 42 57 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 43
35 35 35 43 28 34 17 17 17 28 38 52 52 52 57 43 52 43 43 31 42 35 43 33 33 29 38 38 52 44 57 52 43 43 32 32 43 50 50 59 59 59 52 52 43 52 52 52 52 43
44 42 39 38 44 43 54 54 57 57 57 57 57 48 48 48 50 50 48 48 40 40 32 35 44 44 44 47 38 38 33 33 38 41 57 57 44 42 35 30 30 28 37 37 48 46 59 47 47 47
44 43 43 43 43 43 43 43 48 47 48 47 47 48 48 59 59 37 37 20 20 20 20 20 28 34 43 43 43 43 43 43 43 43 39 39 39 39 39 36 43 43 47 47 46 46 43 47 28 25
12 11 11 11 23 27 28 12 12 11 15 12 27 23 30 30 30 34 35 43 43 48 48 47 47 48 48 28 25 12 12 12 18 18 30 40 40 46 46 46 46 43 43 43 43 36 36 37 37 37
37 43 43 46 43 46 46 43 43 37 42 42 40 44 44 42 35 30 24 27 22 24 33 44 44 42 42 42 37 43 43 43 43 44 57 57 43 44 44 48 57 57 57 44 38 28 23 23 37 34
57 43 42 39 37 32 32 26 26 26 37 29 37 30 30 24 19 15 15 15 18 19 37 37 27 24 11 9 9 10 10 21 32 43 39 32 32 26 24 20 20 26 28 32 39 37 39 39 37 39
39 37 35 35 37 37 28 11 10 6 6 8 8 10 22 22 28 28 28 21 21 31 31 37 43 43 46 48 48 43 40 28 21 10 10 9 9 13 25 28 32 23 20 20 21 21 33 37 43 46
43 47 39 23 22 11 11 9 16 16 20 32 23 23 23 20 31 25 25 19 12 10 9 9 10 10 11 11 15 15 9 9 8 8 8 19 19 8 8 8 14 10 16 11 13 13 24 29 34 39
40 40 43 43 30 29 14 14 14 10 10 10 8 8 8 8 15 15 15 15 21 19 17 12 12 11 10 15 10 16 17 13 13 13 10 10 13 11 9 10 16 16 16 11 11 11 12 10 8 8
8 8 11 12 21 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 13 10 8 8 8 6 6 8 10 8 10 10 10 12 10 10 10 10 8 8 8 9 8 8 6 6 8 6 6 12 8 8 8
8 15 15 18 15 15 10 10 9 11 9 10 11 11 11 11 9 9 8 10 7 6 8 8 8 8 8 10 8 8 10 12 17 10 10 9 10 9 8 10 8 8 10 10 8 10 10 8 10 8
10 10 13 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 9 9 8 8 8 10 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 12 8 8 8 8 8 8 9 9 15 15 14 8 8
6 7 8 8 6 6 8 8 9 10 10 9 9 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 6 6 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6
6 8 8 10 10 9 11 8 8 8 10 8 8 10 7 6 8 8 11 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 10 13 9 8 8 8 8 10 8 9 8 8 8 8 8 8
9 9 9 8 8 8 6 6 6 6 10 11 11 11 9 9 10 8 8 8 8 8 8 9 11 14 10 9 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 6 6 8 8
8 8 9 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 11 11 10 8 8 6 6 7 8 8 10 9 9 15 10 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 11 11 10 10 10 10 9 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 12 8 8 8 6 8 8 10 8 10 10 10 10 10 11
9 9 9 9 8 8 7 7 10 8 8 7 7 8 8 8 6 8 7 7 10 10 9 10 9 9 11 11 12 10 8 8 6 6 6 6 8 8 9 6 8 7 6 8 8 8 8 6 6 6
6 8 8 10 8 9 10 8 8 10 10 10 10 12 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 9 9 12 8 10 8 8 8 8 8 7 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10
12 12 12 3 0 3 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 12 10 10 9 9 9 8 8 6 6 6 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 7 6 8
8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 3 0 3 8 6 6 8 8 8 8 6 7 6 6 8 8 6 | Open.Hide. 9 9 9 9 9 15 8 7 7 7 7 8 6 6 6 6 6 8 12 10 9 7 11 8 8 8 13 15 8 9 9 15 13 15 10 10 8 9 10 9 15 15 24 24 33 19 19 10 10 12
19 19 28 28 31 33 37 37 43 40 40 37 39 33 34 18 18 9 9 9 12 12 18 12 10 11 11 11 11 20 15 17 14 15 20 22 29 23 25 31 36 39 43 57 57 57 47 50 47 39
37 33 33 33 33 33 40 28 20 10 12 9 9 10 21 21 28 28 28 37 22 40 43 33 33 29 32 20 18 18 22 22 33 43 43 35 35 35 42 42 32 32 29 33 29 30 30 41 41 48
48 44 43 32 32 30 36 36 41 41 41 47 43 57 57 48 48 48 57 57 46 57 44 43 43 46 46 48 57 59 59 57 47 43 43 44 42 42 39 35 35 42 42 50 50 50 50 57 57 57
48 48 48 57 57 48 48 48 52 52 59 59 59 50 50 39 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 52 57 52 52 52 57 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57
57 39 39 39 43 43 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 57 57 43 39 47 47 57 57 38 43 43 43 31 43 44 33 33 18 18 18 33 33 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52
62 62 62 62 54 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 39 33 11 11 11 33 39 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 43 62 62 43 44 62 62 62 45 45 45
62 62 44 44 35 43 35 24 21 18 18 29 33 13 14 18 38 43 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 57 43 43 39 39 43 59 59 59 59 59 52 52 52 52 57 57 52
57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 34 28 16 15 15 28 28 52 57 57 59 59 59 35 35 35 57 43 52 52 52 52 54 57 59 68 59 44 44 29 29 19 34 11 11 11 12 12 19 27
32 10 10 14 27 43 52 59 57 54 54 57 59 26 27 11 11 11 21 27 54 54 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 29 32 12 12 12 34 34 57 57 57 59 59 59
68 68 68 68 57 36 27 10 10 10 23 22 47 47 19 19 9 9 9 19 11 12 14 34 34 57 57 59 57 57 57 59 57 43 39 39 39 39 47 47 41 30 19 17 17 41 30 47 47 59
59 37 32 27 27 15 21 12 12 9 19 10 8 8 10 15 34 34 48 48 57 57 43 23 23 11 11 12 25 23 39 39 30 28 24 40 40 27 27 23 23 23 34 34 34 34 33 28 28 33
37 43 46 59 46 37 37 18 17 14 16 18 37 41 41 40 39 39 27 27 12 12 12 15 15 19 20 19 20 20 23 25 22 18 11 11 11 10 23 23 43 43 39 43 37 28 15 9 10 9
9 9 15 15 30 27 27 30 32 37 39 40 37 39 32 32 30 37 28 28 19 19 11 13 11 10 8 8 8 19 13 30 22 25 18 13 8 8 8 8 8 8 15 15 32 18 13 9 9 9
13 13 10 11 14 22 19 12 10 10 10 10 10 22 23 15 8 8 8 8 8 15 12 12 13 13 19 21 27 25 16 11 9 9 9 12 13 12 11 19 13 8 10 8 8 8 8 8 15 8
8 8 8 15 9 17 15 17 10 10 12 15 12 11 11 11 15 13 19 10 10 12 10 9 8 10 10 10 10 17 11 11 11 15 10 10 8 10 10 10 17 13 9 9 9 14 10 9 9 9
9 10 8 8 8 8 8 8 8 9 14 14 17 14 10 10 11 17 13 10 10 10 15 13 11 10 12 9 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 10 10 13 8 8 8 10 14 11 11 11 11
12 11 11 11 11 10 8 10 8 7 8 8 8 9 8 10 7 6 8 8 8 8 10 8 6 7 7 10 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
10 10 10 9 9 10 11 10 11 11 9 9 9 10 10 10 9 9 9 9 10 8 10 10 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 11 11 13 11 11 8 8 8 8 8 8 10 13 12 12 10
10 10 10 11 11 11 11 11 11 8 8 8 10 11 11 10 13 11 14 15 14 15 12 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 7 7 6 8 6 6 6 8 9 9 9 9 8 8 6
6 8 8 10 12 12 11 13 8 8 10 12 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 10 8 8 10 9 9 9 8 8 6 6 8 10 13 10 12 10 10 8 8 6 6 8 6 10 10
12 12 12 15 10 8 8 6 6 8 8 12 13 15 10 10 10 10 9 9 11 12 11 12 12 12 11 12 12 12 12 13 12 9 9 7 7 8 10 12 8 8 6 6 10 10 8 8 8 8
9 11 12 13 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 14 17 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 7 7 12 10 10 6 6 6 6 8 8 8 6 6
6 6 6 6 8 8 11 11 11 10 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 7 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 7 8 8 10 10 10 10 |