BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-062H05.T7 (MSMg01no062_h05.b1) | MSMg01-062H05.TJ (MSMg01no062_h05.g1) |
ACC | AG288422 | AG288423 |
length | 1,187 | 1,203 |
length of high quality (start - end) | 656 (139 - 794) | 494 (126 - 619) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no062_h05.b1 PHD_FILE: MSMg01no062_h05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:06:03 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no062_h05.g1 PHD_FILE: MSMg01no062_h05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:06:03 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CAATCTTTTNTNNAACCAATGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGAT
CCGCGGAATTCTCACCTGAGGAATACCCCATAAAAGACCCGCACTTGAAA
AAAGGNTCAANATCCTTCCTTTAAAAGCACATGCCCCCCAAAACAACCCT
GAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTG
ACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGT
TGGTGGGAGTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTT
CCTCAGAAAACTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCC
TGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACAGGTAAGAAGGACACATGCTCC
ACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACC
TAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATCTACA
CAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTA
GCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACATTC
ACAAAGAAATTCACACAATATGTATTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCC
AAACCTAGGATACCCAAGATATAAGATATAATTTGCTAAACACATGAAAC
TCAAGAAGAATGAAGACTGAAGTGTGGACACTATGCCCCTCCTTAGATTT
GGGAACAAAACACCCATGGAAGGAGTTACAGAGACGGAGTTTGGAGCTGA
GATGAAAGGAAGGACCATGTAGAGACTGCCATATCCAGGGATCCACCCCA
TATTCAGCATCCAAACGCTTGACCCCTTGCATACACTAGCCAGATTTTAT
TGAAAGGACGCAAATGTAACTGTCTCTTGTGAGACTATGCCGGGGCCCCA
CAAACCCAGAAGTGAATGCTCACCGTCCGCTAATGGATGGATTATAGGGC
TCCCAATGGAGGAGCTAGAAAAAAGAGCCAAGGGATCTAAAGGGATTTGC
AACCCCTATAGTGGGAACAAATTTATGAACTTATCCGGTACCCCGGAAAC
TTTTGAACCTTGCTTGGCTATATATTCACAAAAAGGCCCCTATACGGCCT
TTCCCTGGTAAAAAAATGGCCTTTTGGATTTGTGTAT
| CGATTTTTNNNTAAACAAGGNAGGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCATCAAGGACCAGGCTTCAAGGAC
AGCTGTGGCTTACCCCCTTAAAATTGTTATCACCCCCAGGTAAGGCTTTG
TATATGTGACCTTATATATGTGGCTTGGTGCCTGCAGGTGTCAGTGCTAA
GGACCCATCTGGGTCATAGAGCGTGGTGTGGTGCCTGTCTCCTGTACACC
TTGCCTCAGTGTGCAGAGTTAAAGCTGCAGAGAGATGAGGAACATCCAAC
CTTCACTTTGCTGTGGAGGGGACAGCGGTTCCAGCAAGCATGTGTTTGCC
CTTACTCAGCTCCAGTCTCAAAGACTGTAATTCCTTAAGGTCTATAAGGA
GTTTAGTATTCAACTAGCCCATAGTACAGAAACTACTCTTACTGGTTTTA
GGGTCTTTCTAGTTTGGGAAACATTAGTACAATGCATACACATAGAAACT
TACAAATATAAGTTTGACTCGATTAACTTCAACCAGACAGTTGATGGTAT
AAAGGTGAAGTCTGACTATTTCTTGCACTGAACGGAATGTGGTTTCTAAC
TGAGGGAGACCAGGCCTGCAGACTACCAAGCACAGGTTGCCAGCCTACCT
TGTGCAACACAAAATCTGAAATCTCTTCTGAGGCTATGAGGCCTATCTTG
GGAAGTGAGGCACATCTGCACGAGCTCAGGGTACAAATAGCTGCTGGTGG
TAGAGGCAGAAGAAAAAGGCAGCCTGTTTTCTATTTAGATGGTGGGTACA
GGGTGTGTTGTTTCAGATCTCAAATGCCTCACTTTTTCTCTTGTTCACCC
AATGGAGATAATAATTACTTGACCTACCTCAGGGTTGTTTTGGATATAGA
ATAATAATTTATTCCTTTTGAATCTCCTATAAATAAAATTAACTCTTCTT
ATAATATAATCCATTTTGTATGCCTTGTTCCTTGTCCTTTGAATTTTCCT
ATTTTGTAATCTTAAATAAATTGTTTGTTTACGTGGTTTNTTTGAAAGTA
CTATATTGATACTGTTTTCTCTGATGGCAATCAAAAATTTTTTTTGTTCC
CCTTAAGTATATAATTTTCATTTCCTCCTGTTAATATTGTGTGGATATTT
CTCATTTTTTTCTCTTTGGTCTCTCTAGTGGATTTTATAAATCATCTCTT
TTA
|
quality values | Open.Hide.10 10 10 10 11 11 13 10 3 0 3 0 0 3 7 7 7 8 8 7 8 9 12 14 10 8 8 8 8 8 8 15 17 8 8 8 8 12 15 19 24 35 28 24 28 28 33 34 34 47
47 50 43 50 50 50 50 37 37 36 36 36 36 53 53 36 31 31 31 29 28 33 37 31 18 16 12 12 9 9 9 10 13 16 9 9 8 8 8 7 9 10 21 21 30 33 33 33 33 37
24 24 7 7 3 0 3 23 21 3 0 3 21 21 21 9 9 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 25 12 11 11 12 14 20 18 23 33 31 59 59 59 41 53 53 53
53 50 57 57 59 57 57 57 50 50 50 53 53 53 59 57 68 50 50 50 50 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 59 59 43 47 47 57 59 57 57 68 68 68 68
68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62
39 39 15 39 13 13 13 26 23 23 28 39 43 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62
62 39 39 43 41 39 45 45 52 43 43 43 43 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59
59 59 52 52 52 59 59 52 52 52 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 50 50 43 43 43 50 52 57 57 57 59 59
52 52 52 52 52 52 57 52 52 52 57 57 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 59 59 54 54 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 48 57 59 59
59 48 48 48 57 57 48 48 48 48 48 54 57 48 43 46 59 43 43 46 59 41 39 35 39 59 59 59 57 57 57 57 57 57 48 48 48 59 48 48 48 48 48 57 57 57 34 34 25 30
29 41 31 40 37 37 28 28 22 25 30 34 31 22 22 11 21 21 28 22 28 32 32 33 33 33 39 36 39 39 43 43 57 57 57 59 59 37 37 29 20 17 20 20 16 19 30 43 43 36
29 25 34 33 23 23 13 12 10 23 20 31 26 30 22 21 21 24 22 33 31 22 24 17 17 17 18 28 28 34 30 28 29 28 28 28 33 39 39 37 37 30 19 12 15 11 12 12 17 10
10 10 17 17 22 24 28 15 15 8 8 8 9 8 8 8 10 10 14 15 10 14 10 19 13 16 16 12 19 10 12 12 18 15 15 20 19 24 10 10 10 11 11 19 23 30 25 23 19 13
15 11 10 10 10 9 9 8 10 14 13 11 15 12 12 15 16 17 16 16 14 12 11 8 8 8 8 8 10 15 9 11 15 13 15 13 20 9 8 8 8 8 19 15 22 15 21 10 12 10
19 15 12 18 22 19 9 12 8 8 8 12 9 12 17 25 10 8 8 8 8 15 16 12 11 15 18 24 18 21 21 15 9 9 8 8 6 6 8 15 13 9 9 10 13 15 15 9 9 12
11 15 11 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 15 11 11 11 10 10 10 9 8 8 9 8 10 9 9 10 10 10 10 13 14 15 11 13 9
9 9 12 12 11 12 21 13 14 16 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 10 11 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 9 10 10 10 11 15 15 11 12 12 12 12 9 9 9 10 9
9 9 9 6 8 6 6 8 8 8 8 10 8 9 9 17 17 12 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 9 9 9 10 8 12 8 8 8 8 8 8 8 9 12 11 16 12 8 8 8 8
8 10 11 16 13 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 9 9 9 9 10 6 8 6 7 8 8 8 6 6 8 8 10 13 12 11 10 9 9 8 8 8 8 9 8 8 12 8 8 6
6 8 11 11 10 10 8 8 8 12 15 13 14 14 18 13 13 10 9 12 9 9 9 9 10 9 9 10 10 10 9 9 7 8 8 8 8 | Open.Hide. 9 9 9 9 9 9 13 3 0 0 0 3 8 7 7 6 8 8 6 3 0 3 6 6 8 7 7 8 8 11 13 13 7 8 8 6 8 7 12 20 21 22 9 9 10 17 19 24 12 12
18 26 33 28 34 34 34 34 33 29 29 29 36 36 31 41 37 50 41 41 23 23 8 7 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 21 27 33 33 44 31 36 36 38 50
50 50 50 36 36 36 31 31 31 29 28 25 21 21 11 11 11 12 9 11 11 12 12 11 18 19 28 30 25 25 25 28 15 15 14 11 11 15 15 23 30 33 33 33 50 50 47 53 53 50
53 53 53 50 50 50 57 57 57 57 50 50 47 47 47 47 47 42 42 42 50 50 48 54 57 57 48 48 48 50 50 54 57 57 57 54 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48
48 57 48 47 46 43 43 43 57 44 57 43 44 37 43 44 44 44 43 48 57 57 57 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 52 52 50
50 50 47 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 52 52 52 57 52 57 57 59 59 52 43 43 52 57 57 57 57 52 52 52 57 57
57 59 59 59 54 54 54 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 47 43 43 43 59 59 44 36 36 33 32 30 30 42 42 57 42 42 42 42 43 59 59 59 46 43 43 57
59 57 57 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 54 54 54 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 50 59 59 59 59 59 34 23 16 11
11 11 14 16 9 9 9 27 27 59 59 47 47 47 48 59 59 59 59 59 59 57 57 57 43 43 40 43 43 36 43 39 43 43 48 57 43 43 37 37 30 40 43 43 43 43 43 46 46 43
43 43 43 43 43 47 59 59 59 59 59 59 57 57 59 48 48 59 57 44 42 43 43 37 44 23 20 20 28 31 41 43 47 47 47 44 42 42 35 35 42 43 44 37 37 37 50 43 48 50
57 44 52 52 57 59 52 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 54 54 43 59 43 43 43 52 59 59 52 52 52 43 43 52 52 52 52 45 47 47 57 57 57 57 52 52 52 57 57
57 52 52 52 57 57 59 57 52 52 52 43 44 43 38 37 43 57 52 57 57 68 59 59 57 57 52 52 52 57 57 52 52 43 43 35 43 43 43 43 33 33 33 44 44 57 57 44 43 43
43 47 35 43 42 43 24 28 15 16 15 26 24 33 29 21 32 12 12 11 15 12 18 15 30 18 22 19 21 25 25 25 42 42 44 44 44 40 36 25 25 25 23 23 37 44 39 43 43 43
59 47 47 43 30 30 18 18 18 26 28 41 20 20 20 34 34 48 48 48 59 59 59 59 59 59 48 48 43 32 30 18 13 13 12 21 18 23 15 20 20 18 18 32 32 37 37 30 28 15
17 17 11 17 13 18 18 19 29 19 20 20 20 20 24 41 24 18 12 15 21 24 23 24 24 21 22 12 12 12 12 19 28 32 30 28 26 23 14 14 28 28 28 32 28 24 19 28 22 22
13 13 13 13 21 24 28 28 12 12 11 11 14 15 12 13 11 12 12 12 12 16 14 15 25 30 29 31 37 37 37 37 33 26 19 19 10 14 21 21 12 14 24 12 10 9 9 10 16 16
15 8 8 14 19 20 20 33 28 28 22 22 8 8 11 11 11 15 13 17 15 15 10 10 10 11 13 6 6 6 8 10 15 21 9 8 8 8 8 13 13 28 28 28 28 29 33 25 28 23
19 13 13 11 11 12 10 8 11 11 14 20 17 25 16 11 14 11 11 11 23 21 9 9 8 7 6 8 8 10 17 14 11 12 16 19 20 19 15 9 8 8 8 8 10 11 8 8 8 10
9 11 9 8 8 8 9 12 10 8 8 8 10 8 8 9 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 10 10 10 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8
8 8 8 7 7 10 8 8 8 6 6 8 8 11 18 16 12 11 8 8 8 12 8 8 8 13 7 8 8 8 8 8 11 9 7 8 8 8 9 9 13 17 12 14 12 12 9 9 12 10
9 10 13 11 13 8 8 8 7 10 7 6 8 8 11 10 9 9 9 9 10 10 10 10 8 9 9 7 10 8 8 8 8 10 10 10 10 12 3 0 3 12 9 10 12 8 9 9 9 7
7 8 6 7 6 8 6 6 8 8 8 8 10 24 16 15 13 9 9 7 7 10 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 12 15 13 10 10 10 10 9 11 11 11 13 11 10
11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 7 6 8 8 15 11 11 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 11 12 11 11 8 8 8 8 8 10 12
8 8 8 10 8 17 15 25 16 18 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 12 15 10 11 9 10 6 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 8 9 9 9 13
13 6 6 |