BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-065E15.T7 (MSMg01no065_e15.b1) | MSMg01-065E15.TJ (MSMg01no065_e15.g1) |
ACC | AG290535 | AG290536 |
length | 678 | 672 |
length of high quality (start - end) | 516 (44 - 559) | 514 (68 - 581) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no065_e15.b1 PHD_FILE: MSMg01no065_e15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:10:45 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no065_e15.g1 PHD_FILE: MSMg01no065_e15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:10:45 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TTCAACACGCCTTTCTGAGTCTATATCCTTTGTTTGAGGGTGTGTTGCAG
CTACTCCAAGAGGTTAACTCCATTTCCCATCTCTTGAATCTGGATTGGCC
ATAGAACTTGCTTTGCCCTATGTGACAGAAGTGACAGCTTGCCAGAGTCA
GGGCTTCTTAATGACTCTCCTGAACGCTGGTCCAGCTGTCATGGGAATCG
GCCAGGATTAGCCTGCTGGAGGACAAGAGGCATGGTGAATAGTGATGATT
TATCCCAGTTGGAGCTGTTCTAGTCTTACCAGCCTCTAGTTGACCTGTGG
CTGATGGCAAATTGCTGAGCAATCCTAGCAACATCATTGAAAGCTGGCCC
AAAGCAGAAGGATCAGTCCCCATAGCCAAGTCTGTACTGCTCACTCCCAT
AACAGTAAGTTGAAAATTGGTCATTATTACAACCCACTCAATTGTGTGGA
GCCTTGTCACACAGCACTAGATAACTACTTGGATGCTGTAGATTGAGAAT
CCAGATTAAGATACATAAGGCTCAAGGATTAGCTGCAATATTACTGAGTG
AATGTGAAACCCCATTCTGGAAAGAATGATCTATCTTCCTTGCCTACCTT
TGCTTCTGTAGCTTTCCGCTGCCAATGC
| ATGATAGGGTAGCCTGGCGCCGCCTTCCAACAACXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXACTTGAACTACAAGGTGAGAGATGCAGTAATTC
TTTGGGGGGGGGTACCAAAATGATGAAGGGGGGATACCTACTAATTCCAT
CTAACTAGGCAAACATATAACTCATAACCCCTTTGACAATGAGGCACCTT
GCTCTACTCAAACATTTTTGCTAGAAAGGAATTTGCCATAAGACAGGAGA
GATGTTTTCAGAATCTTGAGCTGTTCATATTCCTTTCAATAGCTGTAGTA
TCCATACAGAAACAGACATTTGTAAACATATGATAGAGTAGTCATTTATA
TTCACTTTTGGAAATTTCACTTGGAGTTAAGCTCTGTCTTTCAGTAAACT
TGGCTTCTCTTGGTTTAAAATTTTCCAAACATTAGGTGAATAGAGAGATG
CCCTGACACAATTTATGCCCTTAAGGAAGCTGAAAGGAAAAGGAGACAAT
TTGAACATAAATATACATGGGAAAGGGCAGATAGAAGATAAAATGTGAGG
GGTACAATGCCTTCCTAGAATATAAATGTGTGTTTTATGGCGCACATTAA
TGAAAAAGGTAGAACCAACGGGATATCTCCTTAGACATGTAGATATGAGC
ATCTCAGGATCCCTGCAAATGA
|
quality values | Open.Hide. 6 8 8 6 6 15 22 29 30 30 22 19 19 17 15 21 12 3 0 3 10 19 22 27 21 10 10 10 9 9 9 9 9 9 10 12 23 25 28 29 31 27 28 35 36 50 50 36 36 36
30 30 30 28 17 13 13 10 10 14 18 20 23 34 27 31 31 31 31 33 47 48 57 57 57 57 57 57 57 50 50 47 50 50 50 50 50 37 37 40 40 40 40 48 50 48 42 42 47 51
53 53 57 57 50 50 48 47 47 48 57 57 57 57 57 57 57 68 50 51 50 50 50 51 68 51 51 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 51 50 50 46 46 46 50 50 50 57 57 57
57 57 50 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 57 57 57 54 57 52 57 57 52 41 41 41 41 50 57 52 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 45 43
43 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 57 57 59 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 39 35 62 43 62 52
52 52 43 62 43 45 45 62 62 45 52 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 52 52 52 62 62 68 68 68 68 62 62 52 52 52 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 39 39 16 12 12 13 13 20 39 39 62 44 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 44 44 35 31 31 31 43 43 52 52 52 62 62 62 52 52 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 57 57 52 52 52 57 44 43 35 35 35 43
43 35 35 20 20 18 34 30 15 12 12 15 15 27 24 28 33 39 43 43 45 43 43 42 42 42 42 39 45 57 57 57 57 43 38 33 43 43 38 38 50 50 57 59 59 57 57 52 57 52
52 52 59 43 39 39 50 50 54 54 57 50 50 52 52 43 43 43 43 43 35 35 43 43 48 50 50 50 50 35 35 35 42 47 48 54 44 46 43 39 37 37 37 30 30 40 40 40 40 39
42 37 37 42 37 28 32 16 15 15 28 29 31 27 27 15 16 18 23 23 31 44 34 43 43 46 46 54 43 43 43 43 43 43 43 42 32 14 14 11 12 15 32 29 39 39 39 39 39 37
43 33 33 39 29 28 25 22 18 18 13 17 17 34 24 23 20 18 18 18 29 30 33 31 16 15 8 6 8 8 8 8 14 28 28 30 20 22 30 28 37 32 32 32 28 15 8 8 8 8
11 15 21 18 17 20 11 15 10 9 9 12 19 22 22 30 32 28 23 23 28 28 14 14 14 15 16 18 11 11 11 13 12 16 18 24 25 25 23 11 8 8 8 8 13 21 26 17 24 21
26 14 14 14 30 30 27 10 10 10 13 13 13 17 14 9 9 9 20 20 15 13 8 8 8 10 11 8 | Open.Hide. 7 10 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 15 26 28 23 20 12 10 10 22 17 15 10 10 12 11 9 9 9 9 9 9 9 16 19 22 26 35 36 36 36 33 33 33 33 27 21 11
9 9 6 6 6 6 8 19 17 30 28 33 33 33 31 36 36 36 30 35 57 57 50 50 50 40 40 40 40 42 42 57 57 57 57 54 42 40 42 42 42 41 42 42 47 47 57 57 57 57
68 57 57 48 48 48 48 48 48 48 48 57 54 57 57 57 57 57 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 50 47 48 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50
50 68 68 68 68 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 52 43 43 43 43 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 52 52 47
62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 35 35 43 44 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52
62 62 57 57 44 32 18 12 12 12 12 13 15 18 27 43 44 57 57 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 47 47 57 57 57 57 57
57 57 57 57 52 52 52 52 38 38 20 20 38 41 43 52 57 52 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 50 57 57 43 44 43 57 57 50 50 47 47 47 59 59 57 57 48
42 24 24 12 12 15 18 36 36 44 42 33 30 37 42 42 37 37 37 43 43 46 57 42 37 32 32 37 42 43 48 44 47 39 37 39 41 39 47 43 43 35 35 35 41 39 43 43 57 43
48 48 43 43 40 35 35 35 37 37 43 44 59 46 46 48 48 47 47 47 47 39 37 31 24 22 32 28 30 31 34 34 28 28 28 28 28 39 39 48 48 34 37 23 23 23 23 23 28 40
42 48 48 48 39 42 30 32 28 37 37 39 39 43 43 43 43 36 37 23 30 30 40 41 47 43 33 31 28 20 20 31 27 33 30 25 19 19 15 13 18 19 20 21 31 33 39 37 33 28
28 23 20 23 32 32 32 30 31 28 28 36 41 37 37 37 37 37 36 43 43 47 43 39 36 30 26 16 16 11 10 10 10 10 10 19 22 15 12 8 8 8 12 18 33 37 39 46 43 43
39 37 37 30 30 30 19 13 8 8 8 10 10 19 19 22 25 30 24 21 10 10 10 10 10 14 23 21 20 19 17 19 11 11 11 13 15 12 13 17 19 19 15 19 19 26 21 10 10 9
9 9 9 13 15 11 12 11 15 11 11 15 18 15 12 9 10 10 11 11 11 10 |