BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-085H09.T7 (MSMg01no085_h09.b1) | MSMg01-085H09.TJ (MSMg01no085_h09.g1) |
ACC | AG305037 | AG305038 |
length | 1,150 | 1,211 |
length of high quality (start - end) | 141 (121 - 261) | 540 (123 - 662) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no085_h09.b1 PHD_FILE: MSMg01no085_h09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:36:16 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no085_h09.g1 PHD_FILE: MSMg01no085_h09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:36:16 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | AGACCCTGAGGGTCCCCAGNGGNNGGGNANGNCCGNAANNAANCCGTCTA
GGTCGCCCAGGAGGNANANCNNGCCAGCAANNAAGAGGAGGAGCTTNCAA
GGNCGGGAGCNGGGCACCTCACTGATGTCTTTTCTCCCTCAGCAGCTTAC
ACAGCATGTTCTAGCACTATATCTCAGGGAGAATGTTTTCTGGTCATTTC
AAGGTGAATTTCACAATGCCCCATAATTGAAGTGAGCATTGCCTTCAGCA
ATAGGGTTTTTTTTTTTACTTATGGAGGGGAGTCAATAACTGCTAGGGAA
TTATCTATATTATGCACAGAACTGAGACGAATTATTTTTTTAGCCCGCGC
NGCNCCGGGAGCCAGAGGGGAAACACAAACCCCCCCCCNNNAGGGAACCA
CGCGCACCGCGCAGCAGAAAGCGGAAACAGAACCAACCAAAAACGCCAGC
GCCAGGGAACCAGCGACAAAACCAGGCCCAAGCAGGCACCGCACGCACGA
GCCACACAAGAGAAACAAACAAACCCCCCCCCACCCGACACGGAAAAACA
AACCAACCCACGACAACCGCAAACCACGCCACACCCAAGCAGAAAACCCG
CGCCCAAACACCCCCCCAAAAAAAGACCCAAAGCCCACCCCAAACACCAA
CAAACCACCAGAACACCACGAAGAACCCACCNCAAACCCCACCACGAAAA
ACACCATTTTTTTTTTTTTTCCGCCCCCCCCACTTCACTTAATGTCTCCT
TCATTCTTTCGTCCTCTCCAATCCCACGAACACAACCTTTTTATTTTTTT
CTTTATTCTCCAAACCCTTCTCACTGTACTATATTTTATTTTTTCTTCCC
TTATTAAATTTATTAATTATTTATTTTTATATAATATATATTATTTTTGT
TATATTTATATTTATTGTCTTTTTTTTTTTTGATTTCTTATACTATTCCT
TATCTTTCTTCCACACTCTTCTATTCTTCACTTCTCTATCATTTCTAATG
TCTTAGTTAATTTTTTTTCTACTGCCTTTCATTCATCTTACACTCTTCTC
ATTCACTTCCACCACTCCTTGTATTCCTTATATTTCTTCTTATTTCCTAC
CATTACTTCTTTTCATTCATCTCCTTATTCTAATATCTTTCTATAATTTT
| TTTTTAACATGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAAAGTCTGTGAGTCTAAATTGTTCAGCTGC
CTCATACCCTTTTAATAAAGCTTAAATATCCATAAACAGATACACAGGAG
AACAACAACAACAAAAAAGCTGCTTGCTTTTTTTTCTTCAAAAGGTCACA
CATTTTTCCGTGACATAACAGTAAATAGCATGATAAATGGTTCAGTTTTA
TCATAAATACTAGGAAATAACCATTGACCTTTCACGATAGTTTAAAATAT
AAATGTTTTGGGATTGAAGTTATAGATGCTTTTCAAACCTGAGCAAGAAA
TATTGCCAAACTCTTAAGTGTCAATAAATAGCAAATGTGACAGAAATTTA
TTAATTAGAATGGCATTAGCCATGCTTACGAATATGTATGTTCTTAGAAT
CATACAGTTTACTCATAACATACATCATGTTGAAAATTCACAAATCTGAA
AACAATTCACAGTGGGTCCTGAACTGTTATGAAAATATCTGAAATCTGCT
TGATCTTGCTCTAAGTGATATTGATTTCCTGGCTCAGTGAGCCACCTCAT
AGATTCACAAAATCCCTCAGACTCCAAAGTGCCCTAATTATGTTTAGATT
TTTAACATAGGTAACATTTAACACAAACAATGCTGCGCAAGCTACTTCTG
AGTACTCAACACCGGTGTCCCCCTTCATCTTGCAGAATATCAATCCTTCA
GTCTGCTTCTCTATCCACATGCCATAAAACTCCTTTCCTATGTGAATTTC
AGCAACATACCTCCAGCTGAATTCCTCTTAGTATCTCACTCATCATACAC
TATATCTCGCTCCATCTATTGCCCACATCTACATCTACCCATCCAACCTC
TTGTGAAATTAAAATTCCAATGAAAATCAACTACGTCAATCATTTATGCA
TCACCTCTATTCTTTCCTGCATAACTTGTATTATTTTCATTTATACTCCT
TATTTCCCCTAAGGCACTATATTTTCCCATTATCATGCCTTTCCTCAAAA
AATATTTTATCATCCCATTTATAAACCCCAAAATAAACCTTTAGAAAATG
GTTCCCTTCCTATCCAAATACAAATAAGTCCTTGTTCCTCCCTTTTTATT
CTTCACACTTGTCCACCACAATATCTTTACCTCTCAAAGTCTTCCATAAT
CCTCCATTAAT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 6 6 9 9 3 3 3 6 6 6 6 6 6 11 9 9 3 0 3 3 0 0 3 23 3 0 3 0 3 0 3 25 3 0 3 3 0 0 3 3 0 3 6 6 6 6 9 9
10 11 10 11 11 11 15 12 11 11 19 23 27 3 0 3 0 3 0 3 0 0 3 23 23 37 37 23 25 3 0 0 3 7 6 6 6 6 6 6 8 8 15 7 7 3 0 3 8 6
6 3 0 3 7 7 6 6 6 3 0 3 15 12 9 9 9 9 10 10 10 18 30 40 39 39 43 37 33 37 37 43 43 43 48 53 57 48 43 43 43 43 48 57 57 50 53 68 68 68
57 48 42 39 20 20 12 16 15 27 23 48 33 36 25 29 31 42 48 51 51 51 50 57 48 44 31 30 30 30 42 42 47 47 59 59 68 68 68 68 59 59 57 47 47 57 57 57 57 57
57 57 57 46 41 41 57 57 59 68 59 57 57 57 54 57 57 59 48 48 48 59 59 48 48 48 48 48 57 48 43 43 39 33 32 32 35 47 34 37 32 32 32 37 39 47 59 35 35 37
59 59 59 47 37 31 31 23 23 9 12 11 17 17 11 12 8 15 15 19 34 39 23 23 11 11 11 20 18 28 28 28 37 33 43 43 47 47 57 59 43 43 43 43 39 39 43 43 43 43
47 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 48 48 48 43 43 43 43 40 40 34 34 22 19 8 8 8 11 8 8 8 8 8 12 23 32 26 18 11 12 12 8 8 7 8 8 7 3
0 3 3 0 3 9 13 15 12 12 12 16 9 9 9 9 9 9 12 15 15 15 8 8 8 8 8 10 18 14 22 22 25 27 19 14 12 3 0 0 0 3 11 21 25 15 13 8 8 8
8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 10 8 9 9 18 15 20 32 26 23 8 8 8 8 8 8 9 9 11 11 11 23 19 11 9 9 9 22 9 9 9 9 9 9 9 9 11 8 8 8
8 8 15 17 30 19 17 11 11 11 16 16 8 8 6 6 6 6 9 9 9 12 9 9 9 20 24 34 39 35 30 28 31 22 20 20 15 15 8 6 6 11 8 8 9 13 7 7 7 8
8 8 8 7 7 9 10 10 10 10 12 12 17 14 14 9 9 9 9 10 14 19 22 16 12 12 13 23 31 48 46 39 37 35 21 15 8 8 8 8 6 7 7 8 15 12 11 11 9 9
9 9 10 11 11 18 18 18 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 10 10 8 10 10 8 8 8 12 8 8 8 6 6 10 12 17 13 6 6 6 6 8 8 11 8 9 10 8 13 8
8 8 10 10 14 15 16 16 11 19 15 13 10 8 10 10 10 10 8 8 11 11 11 10 11 11 9 9 10 10 12 12 10 8 8 9 9 9 10 10 10 12 6 6 6 6 8 8 9 9
9 12 15 11 11 11 11 11 11 9 9 6 6 6 6 8 8 9 9 11 13 12 9 9 9 10 8 8 8 8 3 0 3 7 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 6 6 6 6 10
8 8 6 6 6 6 6 8 10 10 12 10 10 11 17 17 21 17 8 6 6 8 6 6 6 6 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 9 8 11 10 10
10 8 10 10 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 11 11 13 10 10 10 11 11 10 10 10 10 10 10 13 15 15 20 19 19 15 18 10
10 10 11 10 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 12 18 11 10 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 13 12 11 10 9 9 11 9 9 7
7 8 8 8 7 6 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 11 11 12 12 8 8 10 10 17 16 15 22 8 10 6 9 10 8 11 11 11 11 10 10 9 9 9 9
10 10 9 9 10 10 8 8 6 8 12 10 10 6 7 8 8 8 7 7 10 10 10 10 10 10 10 11 11 11 9 9 9 10 10 11 16 9 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10
8 10 11 11 11 9 9 8 8 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 6 6 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 7 9
9 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 10 13 13 10 10 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 8 11 10 10 9 9 9 10 15 13 11 12 9 11
8 12 10 8 8 8 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 12 10 10 10 10 10 10 17 11 9 8 8
6 6 6 8 8 8 8 7 7 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 7 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 10
| Open.Hide. 9 9 9 13 19 8 7 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 14 10 9 9 9 16 13 24 19 19 10 10 10 19 19 29 21 29 29 33 35 36 42 43 37 37 42 42
42 36 47 48 48 48 50 50 59 59 47 27 27 9 9 12 17 13 13 14 11 10 9 9 10 14 13 10 10 19 23 30 31 35 35 36 38 53 57 57 57 53 53 53 53 47 47 44 44 39
37 37 33 23 19 11 8 8 8 15 13 10 11 11 11 18 19 30 16 25 15 12 12 12 27 30 48 53 53 53 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 59 48
48 57 48 59 54 54 54 57 54 54 57 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 59 59 57 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 21 21 21 43 43 62 62 43 52 52 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 39 44 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 68 68 43 43 27 18
15 13 13 13 16 39 12 14 39 39 44 52 52 52 62 44 62 35 35 35 44 44 62 62 62 44 44 26 26 23 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 23 23 20 38 38
39 62 62 43 38 24 18 18 38 38 62 62 62 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 45 38 38 27 27 29 44 38 57 57 57
57 57 59 38 26 11 11 11 26 32 27 20 9 9 9 12 15 26 38 43 57 52 52 43 44 43 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 50 57 57 43 43 43 57 59 59
57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 54 46 41 31 20 20 20 31 37 44 34 34 28 27 15 14 15 15 29 26 48 48 48 44 44 22 22 10 11 11 12 18 25 36 39 43 43 43 28 29
15 11 11 16 21 31 43 43 43 47 47 48 48 48 48 48 28 28 13 13 13 28 28 43 43 43 37 43 36 36 39 37 37 37 32 31 25 30 19 17 20 32 32 40 37 37 30 30 32 23
19 14 14 19 19 33 39 39 20 20 12 12 8 10 13 20 23 21 21 11 11 11 12 23 19 23 26 15 15 15 28 31 39 42 32 26 25 18 20 15 10 14 21 23 19 17 11 9 9 9
8 8 8 8 17 23 28 17 16 11 11 11 16 16 20 19 23 14 14 10 9 9 9 19 21 23 23 15 19 17 26 22 22 14 15 14 13 12 10 10 10 10 8 10 9 9 10 19 14 8
8 8 8 10 10 16 13 19 14 22 22 24 16 19 15 21 21 30 29 24 28 28 28 33 39 35 28 20 17 17 17 17 17 8 8 8 10 8 9 8 9 8 8 10 8 10 15 28 24 24
13 13 10 12 8 10 8 12 16 17 15 19 17 18 12 11 11 13 11 8 8 8 8 6 8 8 9 8 11 8 8 8 15 16 22 21 10 10 10 10 10 15 15 10 10 10 11 8 8 11
11 11 12 9 9 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 13 11 13 10 10 10 10 10 11 11 11 10 10
15 13 16 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 13 11 11 12 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 9 10 10 12 11 13 13 16 11 12 12 12 12 15 16 12 12 15 12 11 9
8 8 8 8 8 8 8 10 18 13 10 8 10 10 10 8 8 10 12 8 8 8 8 8 11 14 15 13 12 11 11 12 12 12 12 9 11 9 9 8 8 7 6 6 6 8 10 12 10 10
10 10 11 11 11 11 11 9 9 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 13 12 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 19 14 16 13 10 8 8 6 6 8 8 9
9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 12 11 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 11 11 11 12 16 10 10
10 10 11 9 9 9 9 9 9 10 8 8 8 10 7 7 8 10 8 8 6 7 8 11 10 10 9 9 10 10 10 10 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 12 13 12 8 8 6 8
6 6 6 6 6 6 8 8 10 9 9 9 8 6 6 6 8 8 6 6 8 6 6 8 6 8 8 9 10 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 6 6 10 8 8 6
7 8 8 10 10 10 10 9 9 9 9 |