BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-095M08.T7 (MSMg01no095_m08.b1) | MSMg01-095M08.TJ (MSMg01no095_m08.g1) |
ACC | AG312606 | AG312607 |
length | 703 | 695 |
length of high quality (start - end) | 414 (44 - 457) | 284 (75 - 358) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no095_m08.b1 PHD_FILE: MSMg01no095_m08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:51:54 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no095_m08.g1 PHD_FILE: MSMg01no095_m08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:51:54 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TTCTTCCACATGACAAAGTGTTACCCAAACATCTATGAGGTGCCTTAGAG
CATCAGCAAACACTTCAAAACAGCCAGCACTCCAAATTATCCCTCTTCCC
AGGATCCCATCCCATCTTGTCTTCTGAGGATCCAGATGGGAGAGCAAGGG
GAAGACAGCAAACAGACCACCCAAGCAGCCTGGCATACACCTGTCACCCT
AGCACTTGGGGGGAGGTGGAGGCAGGAGGATCAAGAGTTTGAGGGCAGCC
TGGGCTACATAAAGCTCTGTAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAACAAAA
ACAAAAACAAAAACAAAGCCAAGTAAAGCCATAGTTAAATTACAAAGTGC
CAGGGAGGGAGCTGCCATTTGCAACAAAGCAGGTGGAGGAGGAGGGTGGG
GTGGGGTGCCTCTTCTTCTCCCCTCCCCGCTTTTCCCCTCGGCTATTTAT
TTCCTCCTCCTATTTACTTTTCTCCTTCTGGCCTCCTCTCCTGTTTCTCC
CCCACCATTCATATCCCCCTACCAAACTACCTCCCCCCCATCTATCATCA
TTACTACCTCGCAACACTAATATTTTTTCTCCCCCTATTTTTACTCGTCT
ATTTCATTTATTCCTCATTTTTTACTTTCTACCTTTTATAACCCCACCCC
TTA
| CGATGATGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAGGCTCTGCCTGGGGTTTTTAGTTT
TGGACTTGTGCTGGCTTAGTTTTATGTCAACTTGACACAAACGAGAGTAG
TGGGAAGAGGGAACTTCAACTGAGAAAAACCCTCACCAGATTGGTCTGTG
GGCAAGTCTGTGGTATGTTTTCTTGATTGCTAACTGATATGAGAGGGCCC
AGCCCACTGTGGTGGGACCACCCCTGGGCTGGGATCCTTGGTGCTATAAG
AAAGCAGACTGAGCAAGCCACGAGGAGCAAGCCAGTAAGCAGCACCCCTC
CATGGCCTGTGCTTCAGCTCCTGCTCCAGGTTTCTGCCCTGTGTGAGTTC
CTAAGGTTGCTTTTGGCCATGACGTTCTATCACAGTAATACAAACCCTGC
CTGGGACAGGACCCCTTGCTCATCTGCCTCACTGATGGCTACAGGGCATT
TCCTAGGCCACACAGCAGGTTACTGTCACTACAGGTCCAGGTTGGAGTCA
CCTATTCACACCAGTTATGGGTGCTTTCGATTAAATAAAGATTCCTGGGC
CCAGTGATAACCTCTAGGATAAGTCTGGATACCCCTTTTAGATCCAGACA
CCCTCATTTCTAATCCTACTGTCTCTTACTCTTGAACGTTTATAT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 7 9 24 37 37 20 19 18 17 17 31 32 30 30 33 28 33 33 33 27 23 10 11 11 24 26 16 13 13 12 12 27 32 57 42 37 36 33 33 37 44 57 57 36 36 36
50 36 36 50 31 31 31 26 20 19 15 15 10 10 9 15 21 20 24 24 24 30 33 44 53 57 57 50 50 38 42 42 42 53 53 53 57 42 42 36 36 36 42 54 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 50 50 50 50 50 50 50 50 48 41 46 46 46 50 50 50 50 68 68 51 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 50 50 51 51 50 68 68 68 51 51 50 50 50 50 57 57 54 57 57 68 57 68 68 68 68 46 46 46 46 46 46 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 57
57 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 57 52 57 57 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68
68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 54 54 57 57 52 43 43 33 42 42 42 31 35 35 43 44 44 32 29 29 32 33 33 32 35 42 42 50 50 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 48 57 48 57 54 48 48 48
48 54 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 59 59 59 59 57 47 47 47 47 47 47 48 48 46 46 43 43 46 46 48 48 48 54 54 48 48 48 48 48 57 48 48 48 48 39
39 34 33 25 30 21 21 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 9 10 15 13 15 10 10 10 6 8 6 7 8 8 8 8 11 11 9 9 11 11 11 10 10 10 13 10 8 8 9 6
8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 8 6 8 8 8 16 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 6 6 8 8 16 13 10 10 8 8 8 9 10 10 16 12 8 8 8 10
11 8 8 7 6 8 8 9 9 9 10 10 10 8 8 9 8 10 10 8 8 8 8 9 9 9 11 11 12 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 9 9 9 9 9 9 10 10 11 11
11 11 10 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 10 12 15 15 15 20 23 11 10 6 6 8 8 9 10 12 10 8 8 6 6 8 6 6 6
6 6 8 8 8 6 6 8 8 10 10 9 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 11 11 12 13 12 14 7 10 12 8 8 8 10 10 10 11 11 13 9 9 10 12 12 10 9 8
8 8 8 | Open.Hide. 7 7 7 11 8 8 8 8 19 19 8 8 11 17 26 36 36 36 47 53 36 36 33 33 33 42 42 41 34 34 28 24 24 30 33 34 33 33 31 31 31 30 35 35 35 35 35 36 36 37
50 37 47 47 47 47 47 42 42 48 42 48 40 42 42 48 50 50 42 42 42 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 54 57 57 57 57 50 50 57 57 68 68 68 48 48 48 48 48 50
68 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 44 32 36 43 50 50 57 50 50 50 50 50 50 57 57 50 51 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50
57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 43 57 27 21 10 10 10 28 36 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 52 52 57 57 59 59 57 57 57 57 52 57 57 52 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 52 52 52 52 47 47 57 57 57 59 59 59 57 59 50 43 42 35 35 35 42 42 43 57 57 57 57 57 44 57 48 54 57 57 57 57 57 48 57
44 44 42 42 39 44 39 48 57 57 46 43 43 43 39 39 37 39 28 24 20 22 18 18 18 22 32 32 43 43 47 43 37 37 39 42 43 48 48 48 48 48 57 57 57 59 59 59 57 48
48 43 37 32 32 20 20 23 27 16 11 11 12 16 12 11 11 11 18 20 18 18 18 18 18 18 15 15 17 22 30 43 57 48 48 48 48 43 43 43 39 39 43 43 59 59 68 59 59 43
48 43 47 43 48 46 46 43 40 43 43 59 41 37 28 36 36 36 28 24 32 19 19 16 19 19 28 28 36 36 37 48 44 46 37 37 24 24 15 25 15 17 17 19 20 28 32 41 41 35
37 38 38 33 33 33 43 43 47 43 43 43 39 44 44 44 44 42 39 35 37 37 43 44 48 48 48 47 57 47 48 47 57 57 40 25 19 12 12 11 16 11 21 21 19 19 11 11 11 23
24 47 32 32 20 20 20 41 24 31 31 21 19 21 19 21 16 16 12 15 15 12 12 12 23 21 13 13 13 18 21 12 13 13 15 15 31 24 28 23 23 19 18 15 13 12 12 10 11 11
12 16 22 25 21 11 10 10 12 17 15 12 12 12 22 25 31 28 12 7 8 6 6 8 10 16 18 12 12 10 10 10 10 10 12 12 12 10 9 8 8 8 8 12 12 9 8 8 8 8
10 14 15 12 8 8 8 8 12 12 13 9 9 9 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 8 8 8 8 8 10 16 18 12 9 9 9 11 11 13 8 10 8 9 9
9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 13 10 8 8 8 8 8 15 15 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 |