| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-106K20.T7 (MSMg01no106_k20.b1) | MSMg01-106K20.TJ (MSMg01no106_k20.g1) |
|---|
| ACC | AG320694 | AG320695 |
|---|
| length | 1,312 | 1,309 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 564 (71 - 634) | 553 (91 - 643) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_k20.b1 PHD_FILE: MSMg01no106_k20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:07:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_k20.g1 PHD_FILE: MSMg01no106_k20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:07:28 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | ATGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCAGAAGCT
GTTATTCAACCCGTTAATCAAATTGAATAACATTATTAAAAAATGGGGTA
CCCATCTAAGCAAAGAATTCTCAACTGAGGAATGCCAAATGACTGAGAAG
CACCTGAAAAAATATTCAACATCCTCAATCATCAGGGAAATGCAAATCAA
AACAACCCTGAGAGTCCACCTCACAGCAATCAGAATGGCTAAGATCAAAA
ATTCAAATGACAGCAGATGCTGATGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTC
CTCCATTGCTAATGGGATTGCAAGCTGGTACAAACACTCTGGAAACCAGT
TTGGGGGTTCCTCAGAAAATTGGACAAGTATTACAAGAAGATCCAGCAAT
ACATCTCTTGGGTGTATACCCAGAAGATGTTCAATAAGACTTGCAATAAG
GACACATGCTTTCACTATGATCACAGAAGCCTTATTTATAATAGCCAGAA
GCTGGAAAGAAACCAGATGTACCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATG
TGGTACATTTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAACAATGAACT
TATGAAATTTTTAGGCAAATGGATGGATCTGGAGGATATCATCCTGAGTG
AGGTAACCCAATCACAAAAGAACACTCAGGATATCCACTCACTGATAAGT
GAACATTGGCCCAGAAACTTATAATACCCAAGATACCATTTGCAATACAC
TTAATAACTCAATAATAAGGAAGACCAATGTGCGGATACTTCCTTACCTT
TTTAGAAAGTGAAAACAAAATACCTCTTGTAAAGAGTAACTAATTCAAAG
TTCCGTACCATATCCTGAAGGTAAGAACCTTCCATAGACGGTCCCATTTG
GGGAATCTGCCTCATTAACAACCACCAAACCCAATTCCCTATGCTAGAAT
GCCCATTAAAACCTCCCTGGACAAAGCTTTCCTCCTGGTTAGGCCCTTGC
CATTGTCTGGTTAAAAATCAAAATGGGAATGTCCCACTACTTTCCCATTC
TTAATGAATCAAAATGTTTCCCTATATAATGGTTCCCTTAACAATACCCC
CCTTTAATTTAAAGGTTATCCCGACACCCCTCTTTGTAATAAATCCTCCT
ACGTGTAAATTTATAATTGTTCCCCCCTAGATGTTCCTCCTTGAAACTCT
TTTCTCCCCCATTTCCATAATAACAACTGTGTGTGTATAAAATCTGGGCG
TGCCCTCACAACTATAATTTCACACAATACATATGTGCATCTAATTTAAT
AATTTCAAGGCG
| NCCAATTTTTTTTNTATACATGTGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTAAAATTCAATTCCCA
ACAATCACATGAAGGCTCACAACCCTCTATACAGCTACAGTGTACTCATA
TATACATTAAATAAATAAATCTTTTTAAAAAAAGAACAAAGTCCCAATAA
TATAAATTGGATAAAAGATAACTGACAAACAAAATCACCAAGAGTGGATA
TATGTGAAGAGTTGAGTAAAAATAATTCCTATTCTGGAATGGGTCAGAAA
ATACAGTGACACAAGAAAAATGGGGAATAATCCTTAAAAAAAGAGATGCT
CAAGTATTTTTAAGTGTGTTGTTTATGAGCTGGAAAAGCCAAGAGTTAGG
GGGTTTCCTGTAAGTCACCAGAATAGTGAGTGCCACCAGCTTCCCTTCAT
CTGACCAGTTCCTGACATTGTATTTAGAACAGGGCCATAGAGACAAAACT
ACAGCAAACACATATACTATTGCATAAGTTGCTGTTTAATGTGTAAGGCA
TGGTTCATTTGCGAGTTGTAATAATTATGAACCTGAATGCATTTCAAAGT
ATATTAGTGTCTTAAAATAGCAAATGTTGGCAGCATTGCCAGTTGTCCAG
GACATATCTCATGAATTTGAATATTATCACACACAACTGTCATTGCTTAG
TGAGAACTTGAGCATCCAAGTCAGGATGGCTCAGAGGAGGCATGTTTCAA
AGTGACACGCCCTCTTGAGGGTCACTTTGCAGAGTCTGATGCCCCTACCC
TCGGTAGATTCTGAAATTCAGGGACCAATTCCTCAGGGGAATTAGAGCCC
CATAACTGGAAAAAAAATGCTTTCATATCCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTT
ATTATAAACGGAAATGGAATTAGAAATAAAACTCCAGTTTCCAAAAAACC
ACTTTGAAAAAGTTATAACTTTTTATAGCCCTCAAAAAGGTACATGGTTT
GGTAATTCAAAAGAAATAAGTTCCCATTTAGGTATGCTTCCTTTGTTTAA
CTCTCCTCACAGGAAACTTTGTGTGGACCCTATCTTGGTACCCTTGGTTT
TTAATTTCAAACATATACCCCTTTTAATTCCCATCCATCTTACACATTCG
TAAAATTTTTCTCTCCGCATTTTGTGGGGCTCTTACCTATCCGTTTCTTA
TCCTATTCTCTACCTCTTCCTATTCTTATCCTATACATCATCATCTATAT
CATTAATCACTTATATTAACAACACCTCTCCATCTCCTGTCACCTATCTC
ACATATTAT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 9 9 10 10 10 15 25 21 12 8 8 8 8 15 19 10 9 9 10 12 12 19 19 28 32 28 32 32 32 33 37 41 41 41 37 37 30 18 16 15 19 14 9 12 19 19 37 33 31 36
31 31 31 31 33 28 25 13 11 11 12 12 10 10 17 10 12 12 16 10 21 21 33 33 33 41 47 47 53 38 42 50 53 53 43 43 43 43 47 47 59 59 57 48 48 43 43 36 21 21
17 14 12 9 9 9 12 23 28 42 43 43 43 37 43 43 48 57 57 57 57 57 48 48 48 46 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 59 35 35 35 43 43
43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 54 54 54 57 57 59 59 57 57 52 52 52 52 52 52 43 50 43 57 52 52 52 57 57 59 59 52 52 52 57 57 57 52 52
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 45 57 57 59 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 44 44 26 26 26 43 44 57 57 57 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 62 39 39 39 39 39 43 43 43 52 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 54 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 39 39 39 62 62 62 52 43 43 39 41 39 39 27 31 29 39 39 52 52 62 52 52 62 62 62 52 52 52 62 62 43 43 39 62 62
62 62 62 52 52 52 52 52 62 62 62 44 43 35 39 31 43 43 52 52 62 62 62 52 52 52 43 43 35 35 43 43 43 52 52 52 43 43 52 43 43 43 43 43 41 27 27 26 26 16
26 14 14 38 38 62 62 62 59 43 35 35 35 35 35 39 43 62 62 62 43 39 39 39 35 35 35 43 47 62 62 52 52 52 43 43 20 20 20 43 43 52 43 43 57 43 43 43 43 35
35 43 43 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 42 35 43 43 37 35 35 38 41 43 42 35 50 50 52 52 52 44 38 38 20 20 32 38 36 36 32
23 23 32 38 38 38 43 43 43 32 42 42 38 32 25 23 23 43 43 37 37 37 43 43 32 23 23 23 20 28 27 32 32 32 36 36 28 23 23 28 32 27 36 36 42 39 39 42 38 36
19 19 15 21 25 40 37 47 48 43 43 32 32 23 20 18 22 22 22 28 19 19 24 24 28 40 32 32 32 15 14 14 21 28 28 37 37 43 39 43 34 31 23 23 23 32 37 43 39 37
33 33 30 37 37 32 27 26 25 27 20 19 13 13 13 18 22 25 34 34 23 23 23 34 34 39 39 39 37 37 23 23 20 25 12 15 15 15 15 23 12 12 12 24 21 19 9 9 9 16
13 25 28 29 22 30 29 33 31 32 30 28 22 23 23 23 19 24 16 16 11 13 13 18 12 12 12 12 12 12 18 15 15 15 21 13 15 10 13 8 8 8 10 22 19 16 22 15 14 14
24 23 28 13 13 12 20 12 10 10 10 12 10 11 9 9 12 10 9 9 9 9 9 10 10 12 11 11 8 8 8 10 10 10 10 9 9 10 12 20 15 9 9 9 10 13 13 10 10 10
13 8 8 6 6 6 7 10 10 10 9 9 9 15 21 20 17 11 11 11 15 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 18 9 12 9 12 12 16 17 10 9 9 8 8 9 9 8 11 9
9 10 19 16 16 9 9 10 9 9 9 10 15 11 12 10 10 10 9 12 13 10 13 8 8 6 6 6 8 6 6 6 8 10 8 8 8 10 8 10 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8
8 15 10 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 9 13 15 15 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 9 11 13 11 11 9 12 8 8
8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 9 15 10 8 8 8 8 10 10 10 13 10 10 10 19 9 10 10 10 10 8 10 10 10 11 11 13 11 12 10
10 8 8 8 8 8 13 14 19 10 11 13 11 11 10 10 11 15 12 9 9 10 11 13 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 9 9 7 8 8 10 8
8 8 8 8 14 9 9 9 10 8 10 8 10 9 9 11 9 9 10 8 10 8 8 7 7 7 8 10 12 9 10 11 8 9 9 9 9 9 9 11 8 8 8 8 8 10 13 11 8 8
8 10 8 8 8 9 9 8 11 11 10 10 8 8 8 6 8 8 8 10 10 8 8 8 9 7 8 6 8 6 6 6 6 8 8 11 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 10 10
8 8 8 8 8 8 6 6 10 11 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 10 15 15 10 16 11 11 12 12 11 12 12 17 14 12 9 10 8 6 8 6
6 8 6 9 9 9 8 8 7 7 12 12 9 9 10 8 10 8 8 9 12 13 12 10 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 11 13 9 9 9 6 10 9 9 9 9 10 8 9 9 8
10 13 11 8 8 8 11 8 9 9 8 8 8 10 8 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 9 7 7 10 8 10 10 10 10 9 14 12 7 6 6
6 6 6 6 10 11 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 7 7 7 8 8 8 8 12 12 11 11 11 8 8 8
8 8 8 9 9 9 9 9 9 10 10 10 | Open.Hide. 0 3 9 10 10 10 10 10 10 10 10 10 3 0 3 9 9 9 9 8 8 7 7 7 7 6 11 8 6 6 6 8 8 10 13 7 6 6 6 8 7 12 15 10 11 12 13 19 15 16
15 15 10 12 17 24 24 24 24 24 33 30 25 21 24 24 35 36 36 41 44 39 37 40 37 37 25 13 8 8 6 8 8 10 11 12 10 18 12 13 19 22 30 37 53 53 53 53 57 59
59 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 36 53 33 33 33 32 27 37 30 25 22 14 14 10 10 10 19 19 33 30 28 26 28 35 35 30 28 28 28 33 33 37 47 50 47 47 47 47
47 47 47 47 68 68 68 68 68 43 47 47 47 50 50 54 54 54 50 57 57 57 57 50 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 57
57 57 57 57 54 54 57 59 50 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 52 52 52 52 54 59 59 52 52 52 52 57 57 54 52 52 52 52 52 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 45 45 45 62 62
62 62 52 52 62 62 43 43 43 43 52 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 54 54 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62
62 52 52 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 36 62 25 22 22 35 43 43 43 43 45 45 43 43 52 52 52 43 62 62 62 52 52 52 62 52 52 52
62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 47 38 34 16 15 13 11 11 11 13 33 38 62 52 52 62 62 62 62 52 52 52 52 52 52 52 52 62 57 57 57 57 57 59 43 39 39
43 44 44 57 57 57 57 57 59 59 52 57 57 57 52 52 52 52 57 52 52 52 57 57 57 52 42 42 43 43 43 43 41 33 32 32 38 38 32 21 21 24 24 27 38 20 27 21 43 32
50 42 42 35 38 38 33 33 35 35 35 43 44 44 42 33 33 44 44 59 59 57 54 54 50 57 48 48 48 59 59 59 57 57 57 44 47 46 48 57 47 48 48 57 57 42 42 35 37 37
59 59 57 27 27 12 12 21 32 34 43 43 43 43 43 39 44 44 47 39 37 37 43 43 43 47 47 54 48 46 42 42 42 43 48 43 39 39 35 35 39 40 43 43 43 41 39 33 34 25
25 21 25 21 25 18 23 23 34 34 41 41 39 29 24 28 30 27 15 15 15 21 26 37 32 28 23 28 21 22 18 22 20 23 20 24 32 25 25 24 25 12 14 12 19 16 21 18 26 19
19 17 22 22 28 37 28 30 28 28 25 34 34 30 30 30 37 37 29 20 20 22 30 34 41 33 30 22 22 22 22 31 28 20 20 15 22 11 11 11 11 11 21 22 19 12 11 15 12 12
17 25 24 24 24 19 19 25 28 28 17 17 15 21 24 28 24 16 10 10 10 11 10 10 15 19 18 10 10 10 11 11 11 11 12 13 9 10 9 8 8 8 10 8 8 11 13 16 17 20
20 23 23 23 19 19 16 19 15 15 16 19 18 19 19 15 15 11 17 11 12 16 17 10 20 18 22 27 18 13 10 8 8 8 8 8 11 21 26 28 19 17 12 15 8 9 9 9 8 8
8 6 8 8 8 12 8 11 15 10 9 9 13 12 13 8 8 7 8 8 9 9 10 13 21 15 15 10 10 10 12 12 16 12 11 12 12 16 10 8 8 8 8 8 10 10 11 11 12 12
12 14 15 14 14 15 15 9 8 8 8 10 8 8 9 13 13 15 12 12 8 13 7 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 14 15 32 37 24 15 11 11 9 9 10 10 17 9
7 6 10 10 10 12 15 15 14 12 12 18 19 15 10 8 8 8 8 10 8 7 7 8 13 12 10 9 9 9 6 8 6 7 10 8 10 9 9 9 13 10 16 10 11 10 10 11 17 16
11 11 10 10 10 13 13 10 10 10 10 10 9 8 8 7 6 11 8 12 12 15 13 10 10 10 9 8 8 8 8 8 10 10 11 8 9 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10
10 10 12 12 11 13 11 11 11 10 10 9 9 9 9 11 11 10 13 8 8 6 6 6 6 10 9 10 13 10 6 6 6 6 11 8 8 8 8 11 13 14 7 10 6 6 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 15 10 8 6 8 8 10 10 10 8 8 8 8 6 6 9 8 8 6 6 8 8 8 8 7 6 6 8 10 12 13 13 15 12 12 12 9 8
8 6 6 6 7 11 6 9 9 10 10 13 10 10 9 10 10 10 8 10 13 15 15 11 10 10 10 9 9 8 8 10 10 10 10 16 15 15 10 10 8 8 8 8 10 10 10 10 9 9
9 16 16 18 16 11 11 17 15 10 8 8 8 10 8 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 10 10 9 9 9 9 11 8 17 16 11 12 12 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7
10 10 10 8 8 8 10 11 6 6 6 6 6 6 6 8 6 9 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10 9
11 8 12 6 6 8 8 8 8 11 13 8 8 6 6 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 10 12 10 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 7 6 8 8 6 |
|---|
