BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-106L05.T7 (MSMg01no106_l05.b1) | MSMg01-106L05.TJ (MSMg01no106_l05.g1) |
ACC | AG320711 | AG320712 |
length | 1,296 | 1,323 |
length of high quality (start - end) | 601 (127 - 727) | 561 (131 - 691) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_l05.b1 PHD_FILE: MSMg01no106_l05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:07:31 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_l05.g1 PHD_FILE: MSMg01no106_l05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:07:31 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCCGTTCTTTTTNNTTACACTGGGCGCTAAGACTCCTAAGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCCACAGCACCCTCCCTCCCCCTTTAAAGCTCTCTTGAGACA
CAGAATCCTATTCCTGGCCCATGGAGTGTACTCTGGCATGGAAGGATATT
TCCCAATGCAGTAGTCACTTGCACACATCCGTGAAAAGTGTGTGAACAAA
GGAACTGCTGTCCGGCTTCTTCCACTGCCTACTACAATGCCTTGCCCTGA
GCAGTCCCACTACTAAAACATATTATTTAAAGAACTCTGTGGGTTAAGAA
GAGCAATCAATAGCTAAAAATTTCAGTTGGAAGCCTATTGATTTTCCCCC
ATTTTAGAAAGATCACAAGCCTGGAAGAACAATAGACAGTTTCTTCTGGT
GACTATTCTGATTTCTGACTGTGACGCTTTCCCAAGGGCACTTGTCTGAA
GTTCACCTCTCGTCACTCCAACCGACATGTCCCCCGTAAAGAGCAAAGCA
ACTTCAGCTCCCTTCAGATGGATTTCATAATTCATCTCCAATAGTTCATG
CGGATGTCTAGTGAGACTAGCATGGCTATGTGTTGCTATCTGTGTCAGAT
TTCATGTGTGTTCTTCTGTTTAAAGATGCCAAGAAGCCCCTTAAAATTTT
TAGGGAACAGAACCATGTCTTCAAAAAGATCTTTTCATTCTCACCAGGAA
AAATAATTCACTTGATTTCTGTTCCTTTTCCAAAATGGCTTGTTTCCTCC
TTGCTGGCAACGTGTCACCTCTTCTGAGCAGATTCACTCACAGGCACAAG
GATAGTGTTGCCGTTCCCTTAAAGAATGGCGATCTTGAAGTAGTCTCAAA
CAATGAATCCCAGAACATGATTTTCAGATGTTGCCCACTTTAATAAAACC
CTAGTAATTTTTTTTGTTGCCAGGTTACCTCCATGGCTCATTTTTAAGCT
TTTCCTTAAGTTACCATTTTATTTGCCCCAAAACCCTGGCCTTAAGGTAA
TTTTCCCCAATTTCAATTTGCCCAAAATTTCTTGATAAACAATTCCTAAA
ACTCTCAAAAATCTTTTAAACCCCTTTTTGAAAAAATATTCCTCTTATTT
ATATAAAAAATCTTTTTAAAAGTCCCCTGGGGCTTACTTGTTTTCCTGGT
AAATAAAAATAAAAATTTCTTTTTTGGACTTTCAAAATAAATATAAACAT
TTTGTGTAGAAAATTTTAAATCTTTGTTTCCACTATTATATCCTCTGTAT
AAAATTCTTCTTATTTAACATTGTGTTCTTCTCTCTTTNATAATAA
| CCAAAATTTTTTTNTAAGATTGTGATGCGTGXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTAATGAGGAATACCG
AATGGCAGAGAAGCACTTGAACCCCTGTAAAACATCCTTAATCATCAGGG
AAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATG
GCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGA
AAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGAGTGCAGGCTTGTACAACCAC
TCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAACTGGACATAGTACTACCG
GAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATTTATCCAGAAGATGCCCCAAC
TGGTAAGAAGGACACATGTTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAA
TAGCCAGAAGCTGGAAAGAATCTAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATA
CAGAAAATGTGGTACATCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAA
GAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCA
TCCTGAGTGAGGTAACACACTCACAAAGAAACTCACACAATATGTATTCA
CTGATAAGTGGATATTAGCCCCAAACCTAGGATACCCAAGATATAAGATC
TAATTTGCTAAACCCATGAAACTCATGAAGAATGAAGACTGCAGTGTGGA
CACTATGCCCCTCCTTAAATCTGGGAACAAAATACCCATGGAAGGATTTA
CAGCAACCGAGTTTTGGAGTTGAGATGAAAGGATTGGACCATTGTAAATC
CTGCCTTATTCAGGTGATCCACCCCTTAATTCTGCATTCAAACGGTTTGA
CACCATTGCATAATACTAGTAATAATTTTTATTGAAAGGACCCCAAAGTT
ATTCTGTCTTTTGGTGAAAATAAGGCCGGGTTCCCAGACAAACACATTAA
TTGAATGCTCCCACTCTCACCTAAGGGAATGGATTCAAATGGCCTTCTCA
AGGGAAGGAATCTTAAATAAAGTTCCCCAGGTAATCTATAAGGCAATCTG
GCAACCCTATTATGTCGAAACAATTTATTTGGAAGTCTAACCTGGTAACC
CCGCAAACTTCTGTGACTTTATAGTGGCTTATATTTCTAAAGTAATGGTC
TTTATTTTCTCCCTTTCATCGGTTAATAAAGAAGGCCTTTGTGTAACTTT
CTCAATTCTTTATTGGCCTCCTTATATAGAGGGTAATACTATCTCTGTTG
AATATAAATCGTATATATCGTCT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 9 9 10 10 12 11 10 15 12 3 0 0 3 9 9 7 7 7 7 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 19 19 8 8 8 8 8 8 15 21 28 23 24 24 24 24 29 39 39
43 43 50 50 47 47 43 43 57 57 57 57 42 38 47 47 53 50 50 50 50 37 33 21 21 8 8 8 9 9 9 9 9 7 7 8 8 17 17 28 30 31 31 31 36 48 50 50 53 53
53 57 57 50 53 50 36 36 31 31 31 33 33 33 33 23 23 11 12 12 12 12 11 11 11 13 18 24 29 29 32 32 33 36 33 47 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 59 57 46 42 42 33 35 35 42 47 59 59 59 59
59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 48 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 52
52 52 57 57 57 52 57 57 57 57 68 68 68 57 68 57 57 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 43 43 35 50 50 57 57 57 57 52 52
52 52 52 52 52 57 57 52 52 43 44 43 52 52 57 57 44 44 43 50 50 57 57 57 48 48 57 59 57 57 57 57 48 48 57 57 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 68 59 59 59 47 39 47 47 59 59 48 48 48 43 43 59 43 43 39 44 35 32 32 36 42 46 57 57 57 57 59 40 40 30 37 37 43 43 59 59 59 59 59 59 59 59 43 40
40 43 43 48 50 59 59 43 32 28 15 12 11 12 12 12 25 25 37 37 41 41 47 47 50 57 59 59 59 59 43 43 43 43 37 37 35 28 28 23 31 33 44 43 54 54 59 57 48 48
48 48 57 57 54 54 54 54 59 59 54 48 48 48 48 44 47 44 43 43 47 44 54 54 54 57 57 68 59 59 48 48 46 44 42 32 32 35 42 35 37 35 42 42 44 43 43 43 43 57
50 59 44 50 43 43 43 43 57 57 57 57 57 44 43 35 35 43 44 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50
43 37 37 37 57 57 57 59 50 43 38 38 44 43 28 32 43 44 43 52 43 43 43 33 33 43 44 57 57 59 57 57 57 48 48 48 50 59 59 44 36 20 20 38 30 37 32 32 37 43
43 57 47 47 47 57 47 48 48 48 44 44 37 37 37 44 44 54 54 47 57 47 48 47 31 31 24 21 21 30 30 36 30 19 14 14 14 21 24 42 40 28 17 17 17 24 26 37 37 34
34 33 37 30 19 19 19 19 12 16 22 31 31 33 33 37 37 40 39 34 37 22 17 18 19 21 14 19 19 24 32 37 48 43 37 39 39 39 39 39 39 32 32 24 27 18 19 32 19 23
23 28 25 25 36 36 43 43 43 43 48 48 48 48 37 36 18 18 16 22 21 37 31 30 25 18 17 16 16 17 17 16 23 20 17 26 15 15 17 17 30 23 19 22 22 22 19 15 15 23
16 22 24 29 25 18 20 23 28 21 24 11 11 13 13 10 10 9 10 10 19 14 12 16 17 23 10 10 10 10 10 10 15 9 9 8 8 8 10 10 12 12 12 10 9 10 10 15 13 13
13 13 13 11 9 9 9 9 9 10 16 13 11 15 13 8 8 8 10 19 11 8 8 8 8 6 6 6 6 10 10 10 11 15 13 15 13 8 8 8 8 7 8 9 10 10 12 12 12 10
10 10 10 14 14 26 26 33 28 13 12 9 9 9 11 9 9 10 10 10 10 10 10 10 10 9 10 10 13 15 15 18 17 14 12 11 8 8 8 13 12 10 10 10 8 8 10 10 8 10
6 6 8 8 12 11 11 11 12 13 14 15 19 24 28 16 16 11 10 10 12 9 8 8 8 8 8 8 10 13 15 13 10 8 8 9 12 9 9 9 11 8 8 8 18 18 8 9 11 13
11 15 16 15 10 10 8 8 8 8 10 10 10 15 14 10 10 19 11 8 8 8 15 10 14 14 28 25 16 10 8 8 8 8 8 10 10 9 9 11 10 10 8 8 8 8 8 8 10 13
17 19 19 15 14 6 6 6 6 8 13 13 10 8 9 9 12 10 10 10 10 9 15 10 10 9 9 12 15 13 7 7 8 8 8 8 8 9 9 11 9 13 10 8 8 8 8 8 8 11
11 11 19 26 20 20 20 21 10 8 8 8 8 8 13 11 9 9 9 10 12 15 15 15 15 18 14 15 9 11 11 13 16 8 8 6 6 10 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10
8 8 8 10 8 8 8 9 13 10 10 10 11 15 15 19 13 10 9 11 11 12 12 11 11 11 11 11 11 9 9 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 13 13 8 8 8 8 10
8 8 9 9 8 7 7 9 9 9 9 11 12 20 18 12 10 8 8 8 12 9 11 9 6 8 6 6 6 6 8 8 11 11 15 22 12 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8
11 11 14 12 12 10 8 8 6 6 8 8 6 7 10 10 11 8 8 8 8 8 8 10 10 8 10 10 12 8 7 6 8 12 12 14 18 13 13 8 8 8 12 9 9 9 10 10 12 10
10 14 13 12 10 10 9 6 6 6 6 6 6 8 11 8 8 8 10 10 8 8 8 10 10 14 10 10 8 7 6 8 6 8 8 8 8 3 0 3 6 7 6 6 6 6 | Open.Hide.11 11 10 10 10 9 9 10 10 13 23 21 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 8 6 6 6 7 10 11 11 13 11 8 6 6 8 6 3 0 3 8 11 15 15 22
10 10 8 8 10 15 18 24 28 28 32 37 37 29 28 28 30 36 36 53 44 48 41 46 40 41 23 19 8 8 8 8 11 9 9 8 7 6 8 11 11 13 17 28 33 33 48 36 36 50
36 36 36 42 43 34 40 40 43 44 47 53 44 33 33 30 28 25 22 19 10 10 9 9 7 10 7 6 8 8 13 22 26 36 36 33 33 33 33 38 48 47 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 59 59 59 54 54 50 50 50 50 54 54 57 57 57 54 53 50 50 50 50 47 47 54 57 48 57 57 57 47 57 57 57 57 57 57 57 50 57 57 57 32 24 12 11 15 15 12
19 32 36 57 44 48 48 57 57 57 57 59 54 54 54 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 43 43 43 57 57 57 57 57 52 52 52 50 50 54 52 57 52 52 52 52 54 57 57
59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 45 43 43 43 52 52 57 57 57
52 43 43 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 43 43 26 35 35 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 39 31 43 43 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52
52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 43 26 29 12 13 13 13 13 13 16 32 43 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 35 35 35 57 57 57 57 52 52 45 57 52 43 43 43 38 32 15 13 12 10 13 11 11 11 16 16 43 44 57 57 43 43 43 43 52 52 52 43 57 39 39 43 43 43 52 52 57 57
43 43 35 37 43 32 38 13 13 12 15 12 13 18 28 32 43 47 52 52 52 52 52 52 43 43 35 35 43 43 37 43 43 57 48 48 43 43 33 33 35 43 50 32 32 17 17 14 32 28
24 26 19 19 24 40 40 46 57 44 43 43 46 44 48 57 57 57 48 42 42 32 28 28 25 28 28 36 36 39 39 39 42 33 31 31 28 28 29 25 25 28 37 29 36 39 43 43 32 32
28 28 28 23 28 26 35 35 39 39 36 36 36 36 37 37 21 20 11 11 12 12 11 19 15 20 23 28 28 34 22 28 28 33 33 37 39 35 30 20 20 11 15 11 18 21 21 21 11 11
11 18 23 36 38 34 33 28 28 30 37 39 39 37 30 30 22 16 15 10 10 10 16 19 30 33 28 22 21 13 13 15 23 24 28 28 31 26 24 15 15 18 18 9 9 9 14 14 11 11
11 22 22 39 37 31 12 10 9 9 9 13 11 18 18 23 23 28 22 25 31 30 15 10 10 10 10 13 10 13 10 13 16 16 12 10 10 10 13 11 13 10 10 10 10 11 12 15 12 13
16 15 16 21 28 23 24 19 15 16 13 17 22 20 19 21 15 11 10 8 8 8 9 8 12 11 13 12 13 15 17 15 17 10 12 8 8 8 10 11 12 12 16 14 12 15 12 15 17 14
13 9 9 9 9 10 8 8 8 10 10 22 25 19 13 10 9 9 8 8 8 11 10 10 10 10 10 10 14 13 15 11 11 10 11 11 12 12 19 13 10 8 8 8 10 8 9 10 9 8
8 8 8 8 9 13 10 15 10 6 6 11 7 6 6 6 8 13 11 9 9 8 10 10 8 10 8 8 8 10 8 8 9 9 9 12 11 11 9 9 8 8 8 12 10 13 10 9 8 8
10 8 8 8 10 10 15 10 10 9 9 9 10 11 10 10 8 8 8 8 10 10 6 6 6 6 8 19 16 11 11 11 17 15 19 19 13 10 10 11 11 11 11 11 12 11 11 10 8 8
8 8 8 9 11 8 8 6 6 8 8 11 10 9 9 8 8 9 9 14 9 9 9 10 11 13 13 10 9 9 9 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 11 11 11 16 11 10 9 9 9 9 10 8 8 8 8 6 7 8 8 15 10 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8
8 10 12 13 15 12 10 11 11 15 12 10 10 11 8 10 10 10 8 8 8 8 10 10 12 12 11 11 11 10 8 8 8 10 7 6 8 6 7 9 10 13 9 9 9 8 11 8 8 6
6 6 6 8 10 11 12 10 9 8 8 8 10 10 8 9 10 10 10 10 10 11 11 8 9 10 13 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 13 8 8 8 8 8 8 10 10 9 10
10 8 8 8 10 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 12 12 10 10 7 6 6 6 8 8 7 8 8 8 10 10 11 10 12 8 8 8 12 11 8 9 9 8 8 8 8 8 11 8
8 8 8 9 9 9 10 10 12 13 8 8 6 6 10 10 16 14 11 8 8 6 6 8 10 10 11 10 12 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 11 11
11 10 10 10 10 11 6 6 6 13 7 8 10 8 13 10 13 12 12 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 9 9 9 8 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 6 7 8 8 6
6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 |