BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-107C12.T7 (MSMg01no107_c12.b1) | MSMg01-107C12.TJ (MSMg01no107_c12.g1) |
ACC | AG321048 | AG321049 |
length | 1,320 | 1,356 |
length of high quality (start - end) | 91 (186 - 276) | 131 (145 - 275) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_c12.b1 PHD_FILE: MSMg01no107_c12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:37 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_c12.g1 PHD_FILE: MSMg01no107_c12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:38 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCAGACATTNNTTTGACATTGTGCCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCTTCTACCCACCATAACCCCTTTTAACAGCTGTCCTAAAGA
GGTTAACTGCTCAGAATCCCTTAAAAGACCCCGCAGAGAGGTATATAAAC
ATTTCAGAAGCATGTATTAGCATACTCAAGTCATTCTTTACTCCTCCCTG
GAGATACACTGCAAATGAAATCCTTTTGTAGCAATGGGAGCAAGGTTGGA
CTGACTTTAAATTCTAGCTCTGTCACTCACAAGTTGTGAGAACTGGAGGA
AATTGCCTCATCGCTCTGAACCTCAGCTGACATCTCTGGAGCGACCTTCA
TCATGTGGCTTTATAGTCTTGCTGTGTCACTGAAAGGTTAACCATATATA
GAGAACACTTTTTCATCAAGGTCTCTGCCCCACATCTAGATGGAAAATAA
AACAAGACTTTTTTTTTTCCCCCCCCACTTGTTCTGGAGAACATTATCAC
AAAAAGAGGTGTTTGAACATGCACACACCGATATAAGTAAACAACCTGAT
ATTCTTAGTCTAAAGAGATACCTGACTGAGTAATGCGTTTAATACATTCA
TGCAGTCCTGAATTCTGATTTTCCCAGATTCTTACTAATATCTGACTCTT
GTTGTGCTAGTCTGTGTCCCCATTGTTGTGGCATAGAACCTGATATGTGC
TCCTCCCCGCTTACACAGCTTTACTTTCTGTTAAAAATTACAATCATTCC
CTAAAATTTATTTTTTTTCCGAATTTCATTATAATACACCTCTTAATCCA
TTCTCCTTTCTTTAGTTAACCCTACTGCACCAATCACCCTACCCTCTCTA
TCCATGTCTCTCCTTTGCCTCTTGTACCCTCTTAATTAATAATAAATTAT
CCACGTTATCTTTTTTTTTGTCGTTTTTGCTTCTTTTTTTTTATTCTCTT
CTCCTTCTCCTTTATTACATTTTTCTCCTCGACTTCTACCAATTCTCTTT
CCCTAATCCCTCTATTTTCCTTTCTCTCTTTTTTCGATATATTCCCCCCC
TTTTTTTTATTTTTTTTTTCCCTCCCCCCCCCCCCCCCTTTTCTACACTA
ATTTCCTTCTTTCTTCACTCTTACCTTTTTTTATTTCTTTTGTTCATCTA
AACTCTTTACTTACGTATATTTTGTTCTTTTACTATTATTATTCCATCCC
TCTATCACACCACTTCTCCATTCTAGTTCCTTACCAGTTGCTACTTACCC
TCTATCACTCCGAACATATATCGTATCTTTGTCGCTTCTATCATCCTTAT
CGATTATCTTCTATCATTTA
| NCCAGAATTATNTNNCGAACATGTTAGNCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCCTTTTAAGGTCTTCATA
AAAATATCCGGTTGCAGAAATATTCCCTTTAAAATGAACTAAGAGGCAAG
AAATTAAGAATTCATTGGTCTCTGCTAATTCATGTAATTGTATATTTTGG
AGGTAAGCACAACAGCATAGGTTTGCTGTAATGGAACTGATTGGAAAATG
ATCTCCTGAAGCAAATTTATTGCTGGTCATAAGATTACAAAACTGCTGGG
TTTGGTAAAGTCTCCAGTACCAACTGAAAGTCTACTTTAATAAAAAATGT
GGCTCTGAGAATTGAGGCTTTTTTCCCCCCTGAAGAGGACATTTGATCCA
GTAGAATTGCATTGTTTTTTTCTCCATGCTGACCTTTCCTAAAATCTATC
AGGTTGTTGTGTATATTTATTTTTTGCCCCCCATTACTCTAGTAATGCAA
AAAAAAAAAAAGAGGAGGTCCTTAATATTAATCTGACTTGTTCCTACATA
GGATTCTCATGATGAAAAGGTTACAGCTTCGTTTGAATTTTGTTGAATAA
GGCAAGACTGTTATTTTTCTGACTCTAAATGTGTTTGGCATAACTGAGTC
TTTTATGCTAGGAAAAACTACTTCAGAAATTATATTAAGTAATTTGCTTG
TTCACTATATTGCTTTGAATTCTTTTTTTTATAACTTTACTATAGTTCTG
TTTTCAATTAAATTGGTATAGTATTCTTAATGTTAGATTAATTTAATAGT
CCTTTTGAATAAAAAATTCTTAGTATAATATTTTAATATTATTGTTAATA
ATATTTGCTAATTATTTTTTTTATTACTGATCAATTATTTAAAATTATTC
TTGTTTTTAATATTATTATTGATTTTATGAATTAATTATTTTGTGTTAAT
TTATTATCACATTAATAAATATTGTTCTTATATTTAATTGTAATAAAAAA
TATATTTATAAATAAATTTTATTAAAAACATATTTTGTAAATATTTTTTT
TTGAATTATTATATTCACCATTAATTAAATAGTTATTTATATATTAATAT
TCTTATCTCAATTAATTATATGATATAATACATATATTATTTTTTCAATA
ATAACATATAGTAGATATTATTTGTATATTATATTGCATTTACTAATTAT
TATCATATAATTAATTTTACTTAGTTAATCATTGATTTTATACTAACTTT
TGGATATATAAATATTCTATAATTTATTCTATATTAATATGTGTATCTCT
AACTGTCTAATTATTATTTTCAGATCATTTANGTTCTACTATAATATTTA
GTTGTA
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 8 6 6 6 6 3 0 0 3 9 9 9 6 8 8 7 7 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 15 10 10 10 10 13 10 14 14 30 28 24 28 28 36 36 36 40 40
43 37 37 37 31 31 26 21 28 21 29 24 24 19 18 18 15 15 11 13 13 15 22 8 9 14 22 21 20 17 11 11 10 10 9 8 8 8 8 12 9 10 14 15 18 23 32 30 36 31
32 22 23 23 23 23 19 19 12 11 11 11 11 17 17 13 9 9 12 11 11 11 10 10 10 8 11 10 8 8 8 11 12 15 18 32 34 48 23 23 27 9 9 23 23 25 25 23 23 20
20 25 36 28 28 24 31 24 27 16 14 14 12 16 21 26 36 36 39 39 25 25 20 21 25 28 23 20 20 17 17 17 17 15 24 21 25 25 28 31 36 40 40 43 40 40 40 33 20 13
8 8 8 13 16 33 28 28 24 30 24 12 11 12 12 28 28 37 37 39 39 39 43 43 40 32 28 20 20 23 23 29 29 29 29 28 28 28 27 27 23 23 21 13 13 13 13 15 24 25
32 32 39 42 57 37 37 30 33 33 25 25 32 32 32 28 41 27 27 27 28 20 24 15 12 12 18 24 22 30 23 15 11 11 11 12 12 15 24 32 44 43 38 32 15 15 18 18 13 18
18 18 18 20 38 38 37 43 37 35 32 43 27 27 29 33 33 44 43 37 37 32 32 32 32 29 32 22 17 14 14 14 14 19 32 36 37 32 24 24 14 14 14 26 26 39 33 36 28 36
32 32 19 20 18 24 12 18 18 28 22 22 12 12 12 18 19 36 30 30 32 28 27 19 17 11 11 11 11 11 19 19 14 14 15 15 18 14 15 26 29 28 28 22 22 23 28 28 28 28
28 32 34 33 22 21 11 11 15 15 18 15 12 9 9 16 22 23 23 28 30 30 35 37 37 39 39 39 39 39 30 24 24 13 10 9 9 9 10 18 24 17 19 17 24 19 24 24 16 16
24 15 13 12 12 12 16 15 14 14 22 22 25 30 17 9 9 9 9 9 8 18 16 14 11 10 9 10 9 9 8 8 10 13 10 9 14 14 15 18 16 15 15 16 16 16 8 8 8 8
8 6 8 8 12 9 10 9 9 9 9 10 10 19 19 12 12 11 11 11 17 11 12 13 15 10 12 8 8 8 8 13 12 17 18 17 17 17 15 18 15 11 11 10 10 10 16 13 17 22
30 12 13 9 9 8 12 8 8 8 11 9 12 12 12 11 15 15 12 8 8 8 10 19 16 28 19 22 12 12 11 11 11 11 11 11 14 14 21 10 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8
8 15 13 10 11 9 9 12 10 12 10 12 10 11 11 13 13 13 17 13 15 19 19 18 16 15 12 9 8 8 8 8 8 8 12 10 10 12 11 12 11 12 12 12 9 9 9 9 9 9
12 12 10 10 9 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 9 9 11 11 12 12 12 16 13 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 13 16 10 10 10 9 9 8 10 10 10 8 6
6 8 8 12 9 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 16 15 13 10 8 8 6 6 8 8 9 9 11 12 11 11 10 10 10 10 10 10 10 7 8
9 9 9 8 8 10 10 10 10 11 12 12 15 15 10 10 10 8 8 6 6 8 8 9 8 10 10 10 8 8 11 18 11 11 11 11 11 12 11 15 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 10 10 12 13 13 10 10 10 8 8 11 8 8 10 13 16 11 10 9 10 10 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 21 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 7 9 8 8 6 6 8 8 11 9 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10 11 10 8 6 6
8 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 13 12 8 8 8 8 6 6 8 8 12 10 11 8 8 6 6 8 15 15 20 20 21 19 13 19 18 11 8 8 8 8 8 8 8 8
6 6 6 6 6 8 10 9 9 9 10 14 9 10 10 9 9 11 10 10 10 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 10 8 10 8 8
7 8 8 8 9 10 10 10 8 8 8 8 8 9 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 15 15 10 10 8 8 8 8 8 8 10 13 10 12 15 16 21 20 19 19 20
17 18 37 41 44 19 19 10 10 10 14 11 12 18 11 17 19 17 26 17 11 8 10 10 11 12 20 20 13 18 19 19 24 25 29 14 14 19 19 17 15 9 10 9 9 9 9 10 8 8
8 8 8 8 10 11 11 10 19 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 9 10 10 10 11 13 15 19 13 10 11 8 8 7 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9
8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 10 8 8 8 8 9 10 10 13 10 10 9 6 8 6 6 8 8 9 11 17 9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 10 10 12
8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 13 10 8 9 9 9 9 9 9 14 12 12 12 11 11 11 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 10 10 10 8 9
10 9 9 8 10 9 10 10 10 10 9 8 8 6 6 8 8 8 9 9 10 8 8 8 7 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 6 10 8 8 8 8 8
8 10 8 8 7 6 8 12 10 13 14 16 13 9 9 10 10 12 9 9 | Open.Hide. 0 3 6 6 8 8 8 9 9 9 3 0 3 0 0 3 9 10 9 10 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 7 7 9 11 19 16 13 13 8 6 6 8 8 8 13 15 12 11 8 8
10 10 13 10 8 8 11 15 20 20 28 22 23 23 26 26 33 32 32 30 27 29 32 19 15 15 11 13 13 17 9 9 12 15 9 9 9 9 9 8 9 6 6 6 6 6 8 9 15 22
33 30 30 14 12 12 22 18 30 37 33 35 28 24 24 24 43 39 33 33 37 23 23 11 11 11 14 14 11 8 8 8 8 8 12 12 15 9 12 15 15 9 11 11 20 15 22 30 41 30
40 43 43 48 48 43 43 43 43 43 43 34 34 31 31 31 29 25 31 25 29 33 37 29 32 33 42 43 46 39 36 33 42 30 30 30 41 41 39 39 32 37 43 44 57 57 44 41 27 27
27 36 33 39 39 39 35 35 37 42 42 33 27 27 20 20 20 34 34 33 33 42 42 42 35 35 32 43 43 43 43 43 35 35 35 42 33 33 43 43 42 42 33 42 43 57 57 52 52 52
52 37 38 28 22 22 30 32 19 12 11 15 15 41 38 52 57 52 52 38 38 16 16 14 28 21 24 24 24 24 24 24 13 14 18 38 28 33 33 42 43 35 27 27 23 28 20 36 24 32
32 43 28 28 23 23 23 43 43 43 42 43 36 21 21 14 21 21 18 18 18 23 20 20 20 32 38 23 23 23 43 32 43 28 28 28 37 42 40 32 32 18 18 17 32 24 27 27 28 24
19 11 11 15 24 19 24 14 15 15 29 23 25 20 15 15 13 13 14 30 30 43 41 41 41 32 30 30 28 28 28 32 27 19 19 19 21 21 14 14 14 21 24 30 24 26 26 19 19 15
15 15 15 16 16 32 22 23 11 11 11 17 16 25 25 16 15 21 20 16 14 14 24 20 18 15 18 14 14 24 27 24 21 12 12 15 15 15 14 15 23 28 28 28 28 28 23 32 23 16
16 12 12 12 28 26 28 28 19 19 15 15 10 17 10 13 11 7 9 7 8 15 23 10 8 8 8 8 13 9 10 10 10 10 13 11 19 13 18 12 10 10 10 10 10 11 11 11 11 11
13 23 18 10 11 8 9 10 6 6 6 6 6 6 9 9 9 11 10 11 10 13 13 13 10 15 13 10 9 8 8 12 12 8 10 11 11 11 18 12 8 8 8 10 13 11 11 11 11 10
8 8 14 12 10 10 10 9 9 13 18 17 27 17 20 20 20 15 15 10 9 9 9 9 9 11 11 17 16 12 10 10 10 10 11 10 10 10 19 10 11 11 16 14 13 10 10 10 10 10
10 9 11 12 10 15 12 9 8 8 8 12 17 17 19 10 10 10 10 10 10 9 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 9 11 12 12 8 8 8 8 8 8 8 12 14 10 9 9 12 10
8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 16 12 11 11 9 11 9 11 11 10 10 12 16 16 10 8 8 8 8 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 7 6 10 8
8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 8 9 9 13 13 13 10 12 12 8 8 8 10 12 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 7 6 10 8 8 8 8
8 14 11 8 8 8 10 13 10 9 9 9 9 9 8 8 6 7 6 6 8 8 8 12 10 8 8 6 6 8 8 6 7 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 6 9 9 8
8 6 6 8 8 9 9 9 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 10 10
8 10 10 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 10 10 10 13 8 8 6 6 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 12 12 11 11 11 18 16 10
10 7 7 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 12 9 10 11 10 13 10 11 11 11 11 8 8 8 8 10 11 13 10
8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 9 9 9 9 10 9 9 10 11 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 7 10 8 10 10 10
10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 13 21 16 14 14 12 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8 10 13 13 12 13 15 11 10 10 19 21 15 15 12 15 11 11 11
12 9 11 9 8 8 6 6 10 10 8 7 7 10 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 12 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 7 7 12 11 10 8 8 8 8 11
8 8 9 10 8 8 6 6 8 8 9 11 8 8 7 6 8 8 9 9 9 8 8 8 13 10 8 8 6 6 6 6 8 8 15 15 15 8 9 9 11 12 12 10 9 8 8 6 6 10
8 8 8 10 7 9 10 8 10 8 7 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 6 6 8 10 10 10 8 8 9 8 8 8 10 10 11 10 9 8 8 8 8 8 8 10
10 11 10 9 10 12 9 8 8 6 6 8 8 8 8 15 9 9 9 10 8 8 7 6 8 6 6 6 8 11 8 10 8 8 9 10 10 8 8 8 6 7 6 6 8 8 8 8 13 12
8 8 8 8 8 8 8 13 12 10 8 10 10 17 15 13 12 9 10 8 10 10 10 8 8 7 6 8 6 8 8 8 10 10 10 8 8 11 13 10 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8
12 8 8 9 9 12 10 8 10 8 8 8 8 9 9 17 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 3 0 3 8 8 8 6 6 6 6 10 8 8 8 8 6 7 8 6 7
7 8 6 6 6 6 |