BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-123C02.T7 (MSMg01no123_c02.b1) | MSMg01-123C02.TJ (MSMg01no123_c02.g1) |
ACC | AG332816 | AG332817 |
length | 1,302 | 1,247 |
length of high quality (start - end) | 120 (137 - 256) | 276 (132 - 407) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_c02.b1 PHD_FILE: MSMg01no123_c02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:32:25 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_c02.g1 PHD_FILE: MSMg01no123_c02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:32:26 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NAAACTCACTNCNAACTATTGCGCCCTATACACTACTAAGGGAGAGGATC
CGCGCAATTCTCCCTGAGAAATANCCCATTTAAGACAAGCACCTAAAAAA
ATGTTCCCCATCTTTAATCTTTCAAGGACCCCGCAAATCAAAACAACACT
GACATTCCACCTCACTCCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCATTTG
ACAGCAGATGCTGGCAAGGATGTGAAGAAAGAGGAATTCTCCTCCATTGC
TGGTGGGATTTCCAGCTGATACAACCAATCTGGAAATCCGTTTGGCAGTT
CCTCAGAAAACTGGACATAGTACTACTGGAAAACCCAGCTATACCACTCC
TGGATATATAGCCAGAAGATGCTCCCACTTTTAATAAGGAACATGCACCA
CTATGTTCATATCATTCTTATTTATAATAGCCCGAAGCTGTAAAGAACCC
AGATGTCCCTCATTTTTTTAACGCACACCGAAACTGTGCCACCTTTACAC
AAAGAAGAACTACGCAGCTATTAAAATCAACGACTTTATGAAATTCCTAC
ACCAATACATGGATCTGGAGGATATCCCCCCAAGCGAGGTAACCCAATCC
CCCATAACCCACATGATATGTACTCACTGCACACCGCATATCAGCCCCTA
CCCTTACACTACCCCACACTGCCTTCGCCCCACCCCTGCCCCACCCACGA
ACCAATACCCACCCGCCACATCCCTTCCACCCCCCCCACAACCCCTTCCC
CAAATACCCCACGCCCCGACTTCCCCCCACCAATTTCCCCACCCCTACTC
CCGACATCCTCCCCCTCCCCTACACCCGCCCCCCTCTGCTCATACCTTCC
CCCATCCCACCCCCCCCACCCCCCGCCCCTCATCCCCCACATTCCCCCCA
CTAACCCCCCCCCACCCTCCCCCCCACTCTACCCCTCCCCCCCAACATGC
CCCTACCCCCCCCCCCTCCCCCACTCCCAACCCCTCTCACCCCCCCCTCC
CCCCACTCCCCCGGCTACCCACCTCCCCCCTCCCCTGAAACCCCCCTCCC
CACCCACCACCCCCCCCCCTTCTCTCCTCCCCCTCACTACCCTCCCTCCA
TTCACAACCCATCCTCTCCGTCCCTCTTCCCCCCAACTCCCCACCCCTCT
CCACTCCCCCCTACCCCACCCACTTCCTCCCCACCTCCCCCTCTCCCCTT
CCTCCTCACCCCCTTCCTCCCTCTCTCTCCTCCTCTCATCCACCTCCTTC
TTCCACTCCCTCCTTCCTACACTCCTTCCACTCTACACCTCTCAACCTCG
TC
| ATATTACTTTNNCCCACACGCAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTCTTATTTCCTGTAAAATAGGTT
CTAGGGTTCGATGAGTCCTTTCAATACCCCGGCAACCAAGTTCTTCAGCA
TGCAAATTAGTGACAATTGAGAGTGTGGAGGAAACTCATTAAACCTCAAG
AACATGATAGAGATTAAAACACAGCATTAAAACGGGCTAATAATCCTATT
TGAGAAAGTAATTCATTGTGGAGAATAGAAATAAACAGTGTGAGCATATT
TGGGGCCTCTAGATATCCCAGCTAAGAAAGAACCCAGTTGTCTTCTTTTT
CCAATTGTTTTTTTCTAGATGAGTTATCAAGTGGGTAGTCTCAGATATGT
GAATACTTTTCCTCAAAACTGTACCAGAATTAGGAATATTCATGTGACTA
CTTTGGTATGCCTTTTCATTTAACTTTCTTGATTTTCTAAAGTGAATAAA
AATATTTTCAAAGCTTTTAAATCATATTTTTAATTTGTAGTGTCCCACAA
ACACATTCTTAGTCAGGCTTAATGTGGCCCACATCAAGCAATGGAAGTCA
GTGGACAACTTGAGGGAGTTGAATCTTCTTGTTTTTGTAATAAACGTTAT
TTTACTATTTTTTAACAAAATAAAATATGAGATGACTAAAGAGAAACCTA
TCCCATTGACCTTAGACAAGGCAAACAAACCGAAGAAAATGAGCCCCAAG
AGTAGTCCCTAACTATCAGAGACCCACTCATTCCCACCTTCTGGAATCCT
TATAAAATACCTCCATGAAAAGCTTTTTCCTAAGTGCAAAGGACCTGTTG
CAGACCTGAATCCACCTTGACCTATGTAACCCATATGGGCCTTTGTTTCA
TTTGAATTGGAAGGGGGCCTGGTTCCTCCCAGTGTACCTTCCCTTCATTC
CCTTCCTAACTTTTTACCTTCCCCTTCCTGTCCTTCCTCCTTCTGGGGGG
GGTTTCCCCCCGAATCCTCCCGAATGCGGCTAGAAAGTTCTTGAATGAAA
CCACTTATTCTCCTTGGGTCAAAGCCTTTTATTACTTTTTCCAAAGTGCC
CCCCCCCTGTTTTTTGCACATAATCGGCCCTGTGGCCCTGGGTGCGGCCC
CTCCCTCTTAATTTGGACTTCTCTCCTCTGTGGGCCTCTCCCAAGAAAGT
AACATGTTGTCTCCTCCTCCCCAATCCTATCTCCCCTATGGTACCTA
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 6 6 8 3 0 3 0 3 9 6 6 6 6 8 8 9 9 9 8 8 6 6 7 7 10 10 8 8 8 13 8 9 10 10 22 22 24 28 24 20 28 22 21 21
13 11 9 10 10 16 23 27 34 19 13 10 9 9 14 15 14 14 21 25 19 21 3 0 3 10 10 11 9 11 12 12 8 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 19 25 33 48 48 39 36
21 21 21 29 36 50 34 36 37 30 30 37 28 28 23 19 8 8 8 8 8 8 12 13 12 11 10 10 12 13 16 12 12 11 11 12 24 25 33 30 33 43 37 28 28 28 34 40 20 19
13 12 12 13 16 24 40 25 25 25 43 34 32 32 32 36 40 42 39 24 30 16 15 17 30 22 25 23 29 19 15 22 16 16 12 23 14 20 20 30 42 47 32 31 30 31 31 37 37 31
30 18 15 12 12 11 11 12 19 21 28 26 24 23 23 30 36 42 43 43 37 32 23 23 32 28 28 30 32 34 32 30 30 37 28 23 25 25 25 25 25 15 15 15 12 12 12 25 25 37
25 24 12 11 11 12 12 17 25 18 23 15 15 13 12 14 13 26 22 26 30 15 15 11 12 19 19 17 21 17 19 18 28 28 31 21 18 12 10 10 16 16 19 11 11 13 19 14 15 13
21 21 18 16 11 11 12 23 28 43 40 40 25 16 16 24 19 19 17 13 12 12 21 16 21 16 16 14 15 24 32 37 37 24 20 15 10 9 9 10 17 23 30 28 16 16 12 12 12 12
12 12 21 21 24 20 28 28 28 20 28 34 30 30 30 32 25 30 28 21 19 15 10 12 9 9 12 13 15 15 14 18 16 15 12 21 15 15 14 20 20 15 14 13 26 13 13 13 25 25
33 39 28 28 23 14 14 16 14 12 12 10 10 10 11 12 12 12 12 12 19 18 14 14 14 14 15 19 12 15 13 13 10 12 12 12 12 14 28 24 18 18 18 18 24 24 39 39 37 28
18 18 13 19 12 12 12 24 12 10 9 9 9 9 12 11 13 11 10 8 8 8 8 8 8 8 10 12 14 15 24 10 10 9 10 9 8 9 9 9 10 13 12 12 11 8 8 8 8 8
13 15 11 11 8 7 6 6 8 6 9 11 12 15 15 11 11 12 16 28 31 34 25 24 15 20 12 10 9 9 9 10 9 9 9 9 12 13 12 12 11 12 15 10 8 8 8 8 8 8
8 10 10 8 8 10 13 18 13 15 15 15 11 12 12 12 11 11 12 11 11 11 12 11 9 9 9 9 11 10 15 12 11 11 11 18 15 15 12 12 11 12 12 12 9 9 10 8 8 8
10 8 8 8 9 9 10 8 10 8 12 10 10 10 11 16 14 10 8 8 6 6 8 10 9 9 8 8 8 12 8 8 9 9 9 9 10 12 10 9 12 12 9 9 10 17 12 9 9 9
11 11 13 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 11 10 10 8 10 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 9 10 9 10 10 10 10 10 9 8 7
8 10 8 9 9 9 9 17 15 9 9 8 8 8 10 10 10 10 10 11 11 11 16 11 12 8 8 7 7 11 7 8 10 10 9 9 10 10 9 9 10 10 10 10 8 8 8 8 10 10
9 9 9 9 10 10 18 15 13 9 8 8 8 8 8 10 11 11 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 9 12 16 12 12 12 10 10 8 8 8 10 6 6 6 6
8 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 10 10 12 9 9 9 13 15 9 9 7 9 9 10 8 8 10 14 15 14 14 9 9 9 10 10 11 11 11 11 10 9 9 9 8 8 10 10 15
10 10 9 9 8 10 10 10 8 8 11 18 16 13 12 14 9 9 8 10 13 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 15 12 12 12 12 12 17 10 10 10 10 12 10 10 7 6
8 8 8 8 10 10 13 13 12 10 11 10 16 10 8 10 6 6 8 8 10 11 11 11 7 7 8 6 8 8 10 10 10 11 11 11 14 23 24 26 15 15 8 8 6 8 6 6 8 8
10 15 10 8 8 8 13 14 13 10 10 10 8 9 10 8 9 9 9 8 10 7 7 6 6 9 9 9 9 9 9 11 11 11 8 8 10 7 9 9 18 21 25 28 10 12 9 8 8 8
9 9 13 8 8 8 8 8 10 13 13 8 6 6 6 8 6 8 12 8 8 8 8 8 8 15 10 10 10 11 10 8 11 9 9 9 9 8 8 8 8 11 11 12 13 7 7 8 8 8
8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 15 21 18 16 16 17 16 13 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 9 12 16 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 10 10 12 10 9 12
11 12 8 10 7 9 10 8 9 9 8 8 8 13 10 8 8 8 9 9 9 10 10 8 8 8 8 7 7 11 8 8 8 6 6 6 6 8 8 7 11 6 6 8 8 8 10 14 11 11
12 7 6 6 8 8 10 13 16 12 12 10 10 11 17 15 8 6 6 12 8 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 6 6 8 8 8 12 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 15 12 13 9 7 8 6 6 10 11 12 10 11 17 11 13 11 10 10 10 10 10 10 8 10 10 10 14 12 14 14 10 10 8 8 8 8 10 8 8 10 10 10 9 10 10 10 11 11
11 11 11 10 9 9 12 16 12 10 7 6 6 6 8 10 10 10 10 10 9 8 8 8 7 7 6 6 8 6 6 11 8 6 6 6 10 10 6 6 8 8 10 10 10 10 10 11 9 9
9 9 | Open.Hide. 9 9 9 9 8 8 10 10 10 3 0 0 3 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 7 7 7 11 11 11 13 8 7 3 0 3 13 10 10 10 8 10 10 17 17 14 18 12
18 18 33 28 36 36 37 28 24 28 34 38 38 36 53 50 50 50 50 37 25 23 10 10 8 8 9 10 8 8 10 10 10 10 16 14 10 10 10 10 10 16 30 37 48 48 48 48 34 32
28 28 28 27 27 37 30 30 37 37 37 37 20 19 8 8 7 8 8 12 12 12 12 11 10 10 9 9 9 12 9 10 22 28 32 47 47 47 47 50 36 36 33 39 37 37 28 28 34 28
28 30 34 33 43 43 34 43 28 28 28 32 41 37 43 36 46 34 46 43 37 37 37 37 37 46 44 48 48 57 57 68 57 57 57 57 43 39 30 30 19 20 20 32 32 32 24 17 17 32
32 32 29 28 28 40 32 44 57 44 47 50 57 57 57 57 57 44 43 32 32 32 43 43 52 52 52 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57
59 59 59 59 57 57 57 52 52 43 57 39 43 39 43 43 59 35 35 35 43 43 52 52 57 57 57 35 35 43 43 57 57 43 43 29 29 29 43 43 52 52 37 37 37 50 50 57 52 52
50 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 52 57 57 57 57 57 46 43 43 43 43 43 43 43 43 59 44 48 47 48 47 47 44 44 43 44 57 43 43 43 59 57 57 57 48 57 48 57
57 54 54 54 57 57 57 59 54 54 47 59 47 47 41 59 37 37 37 39 37 32 30 30 32 43 40 41 39 35 35 33 32 32 33 29 30 18 20 20 30 30 43 43 39 39 39 48 48 48
48 46 34 34 24 18 13 11 12 12 16 11 12 15 15 23 32 34 48 48 48 48 48 43 43 40 40 40 43 40 47 35 32 30 29 30 30 35 34 40 28 35 35 39 39 46 46 57 48 57
57 57 43 43 43 30 25 15 18 8 8 8 8 7 7 10 10 10 12 21 12 10 10 10 10 10 12 18 28 29 39 39 39 39 34 34 28 24 18 28 24 17 18 16 16 16 19 20 23 23
31 19 19 11 12 12 15 18 18 20 19 22 19 28 32 43 59 59 48 48 43 59 39 39 43 47 39 43 39 39 39 43 43 48 30 30 14 14 14 28 28 15 18 12 16 12 12 12 25 25
39 39 40 40 39 39 39 39 37 41 28 28 24 25 25 31 37 43 37 39 35 28 28 24 24 12 25 12 12 12 21 21 30 25 25 20 20 24 28 33 28 25 15 11 11 11 18 19 20 22
19 19 15 12 13 18 26 28 30 34 31 28 18 19 18 24 24 32 32 37 39 34 28 18 14 21 21 32 25 23 16 12 17 21 22 37 41 37 37 24 24 20 23 21 28 14 14 12 20 23
29 28 28 28 28 23 28 28 37 40 42 39 39 31 24 23 23 23 22 24 24 19 15 15 12 16 21 22 24 13 12 12 13 12 9 9 9 15 13 17 17 21 24 16 16 15 14 14 23 20
15 10 10 12 13 19 34 28 28 20 20 13 16 11 11 13 18 15 22 24 21 22 12 12 9 9 9 9 13 10 10 10 10 10 10 10 13 10 12 16 13 8 10 11 8 8 8 8 13 10
11 11 11 11 11 12 19 19 11 14 14 26 26 28 24 13 17 10 10 10 11 13 20 17 10 10 10 10 10 10 10 19 15 10 8 12 8 8 8 8 10 17 9 10 9 9 8 11 9 9
10 10 13 13 16 16 17 19 20 28 16 15 8 7 7 13 14 30 24 28 24 14 8 8 8 8 8 8 8 11 8 9 9 10 10 10 12 14 22 24 14 14 14 14 14 14 9 9 9 9
10 10 9 9 13 13 13 12 9 9 12 10 12 14 15 13 12 10 10 10 12 8 8 8 8 10 10 8 8 8 9 10 11 11 12 11 9 9 8 8 8 8 12 12 7 6 8 8 8 8
8 8 8 10 8 11 8 10 8 10 10 10 14 17 9 8 8 10 10 8 8 8 13 10 8 8 8 8 9 9 10 10 9 9 9 10 10 11 12 10 10 15 17 17 12 10 10 9 11 11
19 10 12 7 7 8 8 8 8 8 11 19 17 10 8 8 8 8 8 12 15 19 16 14 14 9 10 8 8 7 7 10 8 9 10 8 8 8 8 12 10 14 12 15 11 14 8 8 8 8
8 8 8 8 8 11 8 8 12 11 11 12 12 13 8 8 8 8 8 8 10 10 13 10 10 12 10 8 8 8 8 8 8 8 13 9 9 10 8 8 8 8 9 10 10 10 12 11 12 13
17 10 9 8 8 8 8 8 10 6 6 6 8 8 8 9 8 8 10 8 10 10 10 11 11 13 10 11 8 8 8 6 8 6 6 10 7 9 10 9 13 10 10 8 8 6 7 10 8 9
14 15 14 19 15 8 8 10 8 8 8 13 12 15 11 10 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 9 13 14 9 8 8 10 10 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 11 13 13 12 13 10 9 8 8 8 8 8 6 6 8 6 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 9 10 12 11 11 10 10 10 10 10
8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 8 7 6 9 8 13 6 6 6 6 7 8 8 6 6 13 8 11 10 10 11 11 10 8 8 8 8 8 8 7 7 7 |