| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-123I08.T7 (MSMg01no123_i08.b1) | MSMg01-123I08.TJ (MSMg01no123_i08.g1) |
|---|
| ACC | AG333103 | AG333104 |
|---|
| length | 1,309 | 1,214 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 460 (39 - 498) | 679 (90 - 768) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_i08.b1 PHD_FILE: MSMg01no123_i08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:33:22 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_i08.g1 PHD_FILE: MSMg01no123_i08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:33:22 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | CAGTTTTNNNNNGGTCACTGGGCGCTAAGACTCACTAAGGGAGAGGATCC
GCGGAATTCACAGTCATCTATTCTCTGTATTTTGACCAGTTACGAATCCC
TCTGGTCATTGCTGATCTTTACAAGAATGGTGTTTCTGATCAAAGTCTCA
CCACATTGCTCTGGGGTGTGCATGTGGTCACGAGGAAAGGAGCTGGACTC
TTTTCAGTGGACCTGGGGAAGTCACGTCCCTCTTCATTCCATCCCATTGC
AAGACACTGGAAGTGGCTAGAGAAGACGTTCAAGGCAAGAACACAAAGCA
AAGGTGAGGACCAGATCATGCATGTCTGCATCTCAGCCTACAAGATGGCA
CCAAGCCAGTGCAAAGCTGAACACACAGCAGAAGAAATGCTTTAACTCTG
GAAAACACCTGTGGGGTTATTATCCTCTCTTTGTATTGAGTATATTACCT
GCCGAACTATTATTACTGCTTTGAATGAGGTGACAGAGGAAAATTCTAGA
ATTTAAAATGATCAGAGGAGGAGCAGAAATAGCACCAGGCTTGTGGGAGA
TTCCAACCCACTGAGATGCAGAGCCCCGCAGAGGTGCACGGAACATCTGG
GCGGGCTGATAACACACTCCTTTGCTAGTTTGACACGATCCATACTGCTG
GCTTTAATATACCAGCACATCCTTTTAAAAGGAGAGGAGGGTGTGGGAGG
AGACAAGTGTACAAAGAGTCCAGCTTCTCCTTCTGCTTTCCCGAATGTGT
TTGATTGGCTTTGTTCTACCCCCCTGCTTAATGCTCCCTTTCCCCTTGTT
CGTTTTGATGCTTCTTCCTTCTCCTCCTATCATTTTTCTCTCTTTTCTTT
TCTCTCCATCCTTTTTTTCTTTTCTAATTTCCCTTTTTCATCTCTTTTTC
TTCTCCTCCTTCTTTTCCCCTTCCCTTTTCTTTTTATTCTTTTTCTTTTT
TCTCTTCTCTCTTCACTTCCTCTTCTCTCTCTTTCCTTACTTCTCCCTTA
TCTCTCCGTCTCTTCCCCCTCTTCTCCTTTTCTCTCCCCTTCCTTCGTCT
TCTTCTCCTTCCTCCTTTTCGTTCTCTATCCCTGCTCTCTTTCTTTCTTC
CTCTTTCCTCCCTCNCTTCTCTCTTTCCACTCTCTTCTACTCCATTTCTC
TTCCTTCCTATTCTCTCTGTCTTTATCCTCTCTTTCTCTTCTCCTCTTTT
CTCCACTCTCCTTTCTTCCTCTCCTTCCCGACTTCTCTCCCTCCTCTCCT
TCGTTTTCTTCACTCCTCTTTTCCGATCACTCTCCCTGTTTCCCTTCTCT
TTCTCCTCG
| NAAACACTTTNNNNNCATGCATGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAA
TGGCTGAGAAGCATCTGACATAATATTCAGCATCCTTAATCATCAGAGAA
ATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGC
TAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAA
GAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAAGCTTGTACAACCACTC
TGGAAATCAGTCTGGCAGTTCCTCAGAAAACTGGATATAGTACTACCGGA
GGATCCTGCAATACCTCTGAGCATATATCCAGAAGATGTTCCAACCGGTA
AGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCC
AGAAGCTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAAGAATGGATACAGAA
AATGTGGTACATTTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATG
AATTTATGAAATTCCTAGGCAAATGGATGGACCTGGAGGGTATCATCCTG
AGTGAGGTAACCCAATCACAAAGGAACTCACACAATATGTACTCACTGAT
AAGTGGATATTAGCCCAGAAATTTAGGATACCCAAGATATAAGATACAAT
TTGCTAAACGCATGAAACTCAAGAAGAACGAAGACCAAAGTGTGGACACT
TTGCCCCTTCTTAGAATTGGGAACAAAACACCCATGGAAGGAGTTACAGA
GACAAAGCTTGGAAGCTGTGTCAAAAGGATGGACCATCTAGAGCCTGCCA
TATCCAGGGTTCCCTCCCATAATCAGTTTCCAAACACTGACACCATTGCA
TATACCAACAAGATTTTGCTGAAAGGACCCAAAAATAGCTGTGTCCTTGT
GAGACTATGCCCGGGCCCTACCAAACCCCAAAACTGTTTTGCTCAAAAAA
AAAAAAAAGAATTAATTTTCCTTCCCTCTTCCTTCCTCCTCCTTCCTTCC
TCCTTCCTTCTCCCTCCTCCTTCCTTCTTCCCTCCTTCCTCCTTCCTTCC
TTCCTTCCTTCCCTCCTTCCTTCCTTCATCCTTCCTTCTTTCCTTCTTCC
TTCATTCCTTCTTCCCTTCCTCTTTCCTTTCCCCCTTCTTTCCTCCCTTC
TTTCTTCCTTCCAG
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 7 7 7 8 8 11 3 0 0 0 0 0 3 9 9 9 7 6 6 8 8 9 10 10 10 8 8 8 8 13 15 18 24 15 14 8 8 8 19 21 37 23 30 30 33 36 42 43 43 30
22 22 27 28 57 27 26 15 10 10 20 23 34 35 32 32 33 36 33 33 33 37 32 27 12 13 13 9 9 9 19 22 39 39 40 39 29 28 22 31 36 35 47 47 57 57 57 57 57 47
37 36 34 34 35 35 33 32 37 31 31 31 29 28 22 22 16 12 12 12 22 20 28 32 23 25 28 25 22 19 32 41 57 43 57 48 48 48 44 59 48 48 40 37 37 37 24 24 13 11
11 13 22 26 37 37 33 39 37 33 33 31 28 34 32 42 42 43 43 43 50 50 50 53 53 48 44 42 36 39 39 43 47 59 59 57 57 48 48 48 48 48 48 54 57 48 48 36 36 39
39 43 38 32 41 37 37 48 48 68 48 48 42 46 43 48 59 68 68 68 44 48 37 37 37 43 43 59 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 57 57 68 68 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 45 45 45
45 52 57 57 59 59 57 52 52 52 52 52 52 57 57 43 43 52 52 57 52 52 52 44 44 35 43 39 44 44 52 44 38 32 17 17 20 32 44 44 52 54 57 57 57 57 57 57 57 43
43 31 28 31 43 43 52 52 52 59 52 52 52 52 59 59 59 59 59 43 35 35 43 43 43 41 43 43 43 42 42 35 42 42 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57
59 59 57 44 32 28 20 17 17 24 30 24 19 12 30 32 46 47 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 57 59 57 57 43 43 43 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48
47 59 43 41 41 59 28 25 12 12 11 11 15 15 16 18 23 30 31 31 25 20 20 23 28 28 41 48 48 47 43 36 39 35 30 32 32 23 23 23 23 23 28 28 35 25 26 13 12 12
18 18 20 23 21 20 23 23 32 33 34 30 39 30 39 39 43 48 37 40 25 25 19 22 17 17 24 32 42 30 30 17 17 23 28 22 17 17 29 30 47 47 43 30 29 18 18 17 30 26
43 40 43 39 39 36 39 39 42 42 36 33 37 37 37 28 34 28 24 14 23 23 32 19 22 34 28 25 21 12 12 24 21 21 28 28 34 20 19 19 24 24 19 15 19 19 32 23 34 20
20 15 23 14 15 14 26 28 46 46 43 43 41 37 42 39 32 32 31 37 37 44 44 44 37 37 35 35 35 39 40 44 36 28 26 26 26 33 40 42 37 37 37 46 46 48 48 46 42 43
42 42 35 42 42 47 44 43 47 37 29 23 24 19 23 19 19 12 19 19 16 12 14 27 22 28 25 23 28 23 23 28 20 26 19 15 15 15 24 16 16 11 11 11 12 12 18 21 11 11
11 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 9 9 12 15 11 8 8 8 8 8 8 12 11 15 15 20 18 28 28 19 14 10 10 10 10 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9
11 11 11 9 10 10 10 9 9 10 12 11 10 8 8 6 6 8 8 8 10 12 10 10 10 11 13 10 10 13 10 11 8 8 11 11 11 11 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8
8 6 6 8 10 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 10 10 12 12 11 12 10
10 8 8 9 9 10 10 10 8 8 6 6 8 10 10 9 8 8 11 11 10 10 9 11 10 9 9 9 12 11 12 12 11 11 10 10 8 10 6 6 8 8 8 10 10 10 8 8 7 7
10 8 8 8 8 8 8 8 12 8 10 7 7 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 10 8 10 6 6 8 8 12 11 11 10 10 13 10 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8
8 10 10 10 11 8 8 9 9 9 11 10 10 8 8 9 9 9 9 9 9 8 8 8 9 8 10 15 12 12 12 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 8 7 8
8 8 10 8 10 8 7 7 9 10 10 9 9 9 9 9 8 8 11 8 8 10 10 10 9 10 10 11 13 15 21 13 13 11 11 11 11 18 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8
6 8 8 8 8 8 10 13 10 10 8 9 8 8 6 7 8 10 10 9 7 8 8 8 7 7 9 10 13 14 12 9 9 7 8 8 8 8 8 8 10 10 7 7 8 6 6 8 8 8
10 15 9 8 10 10 8 8 6 8 8 8 10 3 0 3 7 8 8 8 7 6 8 8 9 9 15 13 14 10 13 12 12 11 8 9 9 9 9 10 16 17 10 10 10 9 9 8 10 10
15 14 15 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 7 8 6 6 7 6 8 8 8 6 6 8 8 7 7 8 10 12 12 8 8 7 7 8 8 9 8 8 7 7 8 6 6 8
10 8 8 8 8 8 15 19 8 8 8 8 6 6 8 7 6 8 8 8 9 8 8 6 6 6 6 6 6 9 9 9 8 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 10 9
9 9 9 9 10 10 10 15 15 9 9 9 8 8 8 6 6 7 7 11 10 10 9 8 8 6 6 6 6 6 6 7 11 15 8 8 9 9 9 12 8 8 8 8 8 8 12 12 9 9
14 15 13 8 9 8 8 6 6 | Open.Hide. 0 3 6 8 8 8 6 8 9 3 0 0 0 0 0 3 6 6 6 7 7 9 7 6 6 6 6 13 6 6 6 7 9 8 10 8 8 9 8 11 9 12 13 13 8 9 9 22 15 20
15 18 24 28 28 35 35 37 37 37 37 28 36 38 38 53 53 53 44 44 39 50 47 37 23 13 9 9 9 9 10 12 16 11 16 16 19 19 16 16 18 29 29 35 53 36 36 50 50 50
50 43 42 42 34 36 36 44 53 44 44 50 33 33 30 27 17 9 10 10 10 10 10 13 29 28 31 25 25 25 25 28 28 39 34 36 37 42 47 43 42 42 40 44 43 50 59 59 59 68
68 43 43 30 30 30 42 43 39 32 35 44 44 43 43 43 48 47 48 48 48 48 48 50 57 57 57 43 41 41 48 57 47 47 48 59 59 57 57 57 57 37 37 43 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 50 50 43 43 43 59 59 68 59 59 43 52 52 57 57 57 57 57 57 59 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68
68 68 68 68 68 62 62 44 43 39 39 35 39 39 39 44 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 43 35 35 28 20 16 24 35 44 44 62 62 62 43 43 27 35 35 43 44 62 62 62 62 62 62 62 62 57 59 59 59 43 43 43 43 43
57 57 57 43 43 41 35 35 43 47 57 57 57 57 57 43 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 52 57 59 59 59 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 44
44 28 33 33 44 44 59 59 68 59 59 52 52 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 57 57 47 43 43 57 57 47 54 57 59 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 46 46 46 46 43 57 57 54 54 54 57 57 68 68 54 54 57 57 59 43 43 43 43 43 59 57 57 57 57 57 43 43 43 43 43 47 46 57 57 48 48
48 57 48 48 48 48 47 47 47 27 25 11 11 11 20 23 37 37 39 40 40 41 39 39 37 36 43 43 43 48 28 30 13 13 13 28 28 23 23 18 30 30 32 23 31 31 20 28 28 37
36 25 25 12 12 12 18 20 30 37 37 39 39 39 23 18 25 20 21 15 24 24 32 37 37 30 29 29 37 37 37 41 41 34 34 27 31 31 47 59 43 41 32 29 25 30 24 24 25 34
30 37 37 31 35 37 41 32 32 41 30 32 18 11 11 11 11 14 19 30 30 14 15 12 16 16 10 13 10 11 11 21 15 28 28 24 24 27 29 29 22 19 19 17 16 18 15 18 20 28
21 22 11 12 12 25 25 20 9 8 8 6 6 6 15 19 18 19 19 29 29 37 39 27 25 22 18 19 16 12 12 12 19 25 22 12 12 12 18 11 10 14 15 11 11 17 11 11 11 18
18 19 19 11 12 12 8 8 8 15 10 11 9 10 13 17 13 12 17 22 17 17 13 11 10 8 8 8 13 22 12 10 10 10 10 11 11 20 19 22 10 10 9 9 9 9 14 10 10 12
12 10 8 8 8 8 8 8 11 8 8 10 13 21 15 15 13 8 8 8 10 9 9 10 13 15 15 15 23 13 13 11 9 9 10 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 11 11 11 10 11
11 8 8 8 10 10 12 14 14 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 10 10 14 11 10 11 11
14 19 22 37 34 14 9 9 9 9 9 10 15 16 27 23 14 9 9 10 13 15 21 10 9 9 9 10 10 11 16 14 15 13 10 9 14 15 20 21 25 22 25 26 31 17 13 7 8 8
8 8 9 9 11 15 19 10 10 8 12 12 10 10 10 10 14 10 10 10 14 14 12 11 9 15 12 11 10 9 9 9 9 14 12 30 23 15 14 9 9 8 8 11 15 16 16 14 15 16
11 11 14 16 12 14 14 21 21 18 21 12 11 12 12 15 12 15 12 19 12 12 11 9 7 7 8 8 9 13 11 13 11 12 12 11 11 13 21 14 8 10 8 9 9 9 10 10 12 9
17 19 8 6 6 11 8 10 9 11 10 16 11 12 12 22 17 10 8 8 8 8 8 11 12 15 10 10 10 10 10 19 19 18 18 15 15 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 13 12
15 10 12 8 8 8 8 8 12 10 12 9 9 9 |
|---|
