BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-123M07.T7 (MSMg01no123_m07.b1) | MSMg01-123M07.TJ (MSMg01no123_m07.g1) |
ACC | AG333290 | AG333291 |
length | 1,268 | 1,263 |
length of high quality (start - end) | 336 (121 - 456) | 598 (127 - 724) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_m07.b1 PHD_FILE: MSMg01no123_m07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:33:56 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_m07.g1 PHD_FILE: MSMg01no123_m07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:33:57 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (146,266,767 - 146,267,102) | (146,141,929 - 146,142,526) |
---|
sequence | CCCCCGCGACACTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGA
ATTCCAGCCCTATCTGAGTTCCTTTCCTGACTTCCTTAAGTAATGAACAG
TGATGGGCGTGCCCTTAACAGTTAAACTCCTATTCTCTCCTACTTGCTTT
TGATCATGGTGCTTATGGCAATTGAAACCCTGACTAAGAGGATACAGAAA
GTCAAGTTTCATTGCTGCCTGGAGAAACCACACATTTGAGAGAGAAGGTG
ATGGGAAAGGAAGCACTTTATTGGCAACGAGGTGACAAGTTGGAAGATGA
GGACTCTTGTGTGTCTTAGAAAAAGAAGAAGCCATGTTGAGGGGTTGCAG
GTATAAGACTCCATAGATACTGATTTTGGGTATGGGCATAGTGGGTAGGC
TTTTTATTTTGGCAGGAATGATACTATTTCTGAATTTTGGTTAGTTTGCT
TTTCTGTCTCACCCACCGCTGTTATCCATAAAAGGTTCTGGATTCGTTCT
GCAAATTTAAAGAGAAGTTGCTGACTAAATAGCATTATGTCCCATGCCAT
TTTATGTCCTTTCCCCAGGAATAGCTAACTCGGCAGTTACAAAAGTGTAT
AGCAGGCATGTTTCACCCCAGGGTAGCCAAAGGCAGCTGTCCCTGGAGAA
GCAGGAAAGATAGCTGAAAGAACAACTTTCCCTGAGCAAGACAGTGAAGT
GAAGCTTTTCACAGAGCAAAGAGTTTAACCCACTAGGTGACTTCAGCCAG
AGCTTTCCTCTGTATCAAAGGTGGTGGGAGACCTGCAGTTGACTGCCCAG
CTGTGTGACCCCTCAACTTATTGATTAATCTAGCCCTGAAGCCCGACTAA
ATTAATTAGATTTTTTCTCTCTGTAGCATTACTATATATTCCATTTGCTA
TGCATCCCGGCAAATTGATAGTTTATTAAAACCCTTTCCTGCTTTCCAAA
TTTAATTTTTAATTAATGACATTTCCTTTTTGGCCCTTGCTTCCCCCTAA
TCCCCCTCTTAATTATCTTCTTTTCCACCCCCCCCCCTCCCCATGTTCCT
TTTTACAATTCCCATTTTCTTTTTTCAACTGTACTTTCCTTCTTTAAAAG
GTAAATTTCCCCCTTTCTCGTTTATTTCCTTGCAATTTATTTTCTCTACA
TCGCGTGCACCTCCACTAAAATTTCTCTTCCCTTCCTTATATCCACACTC
GTTGGAAAGCTTTCCTGTATATATATCCCCACTTCTCTCCTTCTTATTCT
CTAAACCTATCTTATGCA
| TTTTAAAAGATGCGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTCAGTTTTCTCTCTAAGGAAGATAGAC
GCCTTCAAAAGACCCTTTAGGGAACTGGAGAATACGTCTAACCTACATTT
GCGTGTATATGGTATGCTTGTGGATGTAGGCACATATGTATATGTATGTA
TATATATGCAGGTAGAGGAGACCAGAGAACAACACTGGTTGTCTTGCTCT
ATGCATGACAAATATACTTAAAAGTACCCAATAGTGGTAACATAAATTCA
TGAAGACCTGAATAAATTCAAAGTACAATCTTCATGGGCTGGAAGTTTTT
ATACTTGTTAAGATGTCAATTCTTCTGAAATCAAAATTTAGATTCTAACA
CAAACTCTTTTTTCATACAGAAATGGAAAGACAGAAATTAGCTATGACAA
TTATGAGATGATTTATACTGAGTTTGAGGAATAAATATAAAATTACAGTA
ATTAAGATATTAAAACATTAATATCAGGATAGATAAATTGACAGATGAAA
ATATACAGCCCAAGAATAGAAGCACATATTATGGCAACTGTTCCACAGTA
AGGCAGGACATTTCTGGGGAAAGGAAGTTTGTTCCGATAAAGACTCTGGA
ACAAAGGGAGAGGGGTAAGAAAAAATGAAACCTGATCTCTATTTCATCAC
ACACAAAAATCTGAGCTGGATTGTTAACAGAAACATTAATACTAGTACTA
AAAAGGAGCGGACGAGATGGCTCAGTAGGGAAGGGCACTTGCTGCCCTGA
CTGATGGCCAGCGTTGATTTCCACAGCACACCTGCAGAAGGGTGAACTGA
TCTTTACAAGCTCCCCCTGACCTCCATGATTGTGCCATGTCCTGCGCTAG
ATTCATAAAGCATTCTTGACCCTGCTTAATACATCCCAGGAAAATCCGTT
GAGTGTCCATTAAAATTAATGCATGAAATGATGAAAGCAATCTGTTCATT
TCCTACCAATGCTTTAAAATAAGTGTTTCCTGACTTTTCAATTCTATTTT
TAAAAATTCCTTACCTATCAAATAAAAAAAACTTTCTGTTCCCTGAAAAA
ATGTCTTACCTTTTAAAAAAATTGAATGTTTCTTCCAATGGTCCCAACTT
TATTCCCACCCAACCCTGTGGTCTTCCACCCCCTCCGTCAGGAACTCCGA
TGCCTTCTTCTTGGGGGTTTCGTAACCATTCCCCGTGCTCCTTCCTTAAA
TATATAAACTACT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 7 7 7 6 6 6 9 6 6 6 6 6 6 16 18 30 28 10 10 8 8 8 13 19 10 8 8 12 12 16 24 26 42 37 33 33 33 37 37 47 50 50 48 43 47 42 47 47
43 47 42 36 32 32 30 35 36 36 41 41 37 37 42 37 23 23 11 11 12 18 12 12 11 12 12 14 17 24 32 39 37 41 36 36 38 36 38 38 38 42 42 53 57 57 57 53 36 36
35 35 31 33 39 50 33 21 18 9 9 8 8 10 8 9 8 11 10 10 15 19 28 30 33 36 44 57 53 53 53 53 53 53 53 53 53 47 47 48 47 47 48 48 57 57 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 54 44 59 35 35 42 48 51 68 54 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 57 50 47 42 42 32 32 47 59 57 57 57 57 54 54 57 57 59 57
57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 54 54 59 59 59 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 54 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 59
59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 52 52 52 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 54 54 57 57 59 59 59 59 59 59 59 54 59 59 59
59 59 59 59 57 59 59 59 54 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 59 59 57 41 41 27 27 28 41 37 44 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57
57 57 59 59 59 48 48 48 57 46 57 48 43 43 43 43 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 46 43 57 57 48 57 57 43 43 43 59 59 48 48 48 48 48 48 48 39 39 39 39
37 27 25 9 9 9 9 9 19 25 39 39 43 47 59 59 57 48 47 47 47 47 47 47 48 48 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 59 48 48 39 43 43 43 48 48
59 59 32 32 18 19 13 11 11 9 9 9 13 9 9 12 12 11 11 15 12 12 25 31 59 59 48 48 48 59 59 43 43 43 43 43 43 59 34 28 12 12 11 12 18 14 18 20 28 32
28 28 28 39 42 59 59 59 59 57 57 57 57 48 48 48 48 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 42 42 42 42 48 48 57 59 59 59 54 57 57 57 68 57 57 47 47 47 47 44
44 43 43 43 50 50 54 54 54 57 59 59 68 68 59 59 57 57 57 54 57 50 50 37 38 43 50 59 59 57 57 43 37 37 52 52 52 43 43 37 43 43 52 52 52 52 52 52 52 57
52 43 43 27 27 20 21 21 44 44 57 57 57 52 52 52 52 43 43 42 42 52 43 43 43 27 27 29 33 32 32 22 22 17 24 32 37 46 59 44 43 44 36 44 32 43 43 30 30 18
15 15 15 15 20 28 32 37 37 42 42 43 43 46 43 47 32 36 25 25 25 21 21 11 11 13 23 29 36 48 48 48 32 32 20 20 20 32 32 43 39 37 32 28 28 28 32 30 33 29
33 36 30 30 30 39 36 36 33 28 26 23 20 20 23 22 17 17 17 24 24 28 28 28 39 39 43 37 32 28 22 22 25 22 22 12 12 13 10 16 16 17 22 16 12 19 18 24 19 22
22 22 22 37 37 37 37 36 36 39 39 18 19 10 10 10 12 16 14 12 11 17 10 11 13 18 11 11 11 10 10 22 26 32 24 18 12 10 10 10 12 9 10 16 15 15 16 10 10 10
10 10 10 11 12 10 10 8 8 8 8 6 7 6 8 8 8 8 8 10 9 10 10 21 21 26 19 14 12 12 16 9 9 8 8 8 8 9 12 10 10 8 8 8 10 10 10 19 11 9
8 8 8 8 8 9 10 12 12 12 21 21 26 26 16 19 15 19 13 14 8 8 8 19 8 8 9 15 16 13 16 11 9 9 19 14 9 9 11 9 8 8 8 10 10 10 16 16 14 12
12 13 12 13 10 13 11 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 6 7 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 19 13 17 13 9 9 8 8 9
13 10 13 11 11 11 17 23 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8 8 10 10 9 10 9 10 11 13 13 11 11 11 12 11 10 10 10 9 9 11 11 12 12 11 8 8 8 8 8
8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 9 10 10 10 10 14 22 25 11 9 9 9 9 10 10 11 16 10 15 14 8 8 6 6 8 6 9 9 10 10 10 9 9 8 12
11 11 17 11 11 9 9 9 10 10 9 10 21 21 11 13 10 10 11 19 19 22 19 10 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 12 12 12 11 11 15 8 8
6 6 8 8 10 13 13 10 11 11 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 8 9 8 8 8 6 6 10 8 6 6 6 8 8 8 15 7 7 7 15 11 8 9 9 11 8 8 6 6
8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 9 6 6 6 6 8 8 10 10 10 10 10 8 10 11 10 10 8 8 8 8 8
8 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 9 8 8 8 8 9 9 13 12 12 6 7 6 6 8 8 14 16 15 13 7 6 8 8 10 11 8 8 8 8 10 8 7
7 10 8 10 9 10 9 9 9 8 8 8 9 9 10 9 9 9 | Open.Hide. 7 7 7 7 6 6 6 11 9 8 7 7 6 8 8 8 8 8 9 7 9 9 14 12 14 7 8 8 8 8 10 9 18 19 20 20 16 21 21 30 29 29 15 15 24 29 35 35 42 42
37 37 37 34 28 32 32 43 43 50 50 50 50 50 42 34 23 15 9 12 11 16 12 9 9 9 11 11 12 10 6 6 6 8 15 15 22 26 30 33 50 50 53 53 53 53 53 50 50 57
57 48 48 41 44 39 50 41 27 15 10 10 10 9 9 13 17 18 19 22 17 18 14 14 12 15 12 22 30 39 39 50 53 47 47 43 47 48 48 50 53 50 68 50 53 50 68 41 34 20
10 10 10 20 24 46 48 68 68 68 54 57 57 57 57 57 50 50 50 48 57 47 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50
57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 68 57 57 59 59 59 52 52 50 50 43 43 57 57 57 59 59 57 57 54 59 57 57 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 52 52
52 44 50 59 59 59 59 59 59 59 54 57 57 68 68 57 57 57 54 54 54 57 57 68 68 57 57 54 57 59 59 57 43 43 42 59 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59
59 57 57 57 59 59 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 47 47 47 54 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59
59 41 34 18 22 15 12 9 8 8 8 8 27 25 41 59 47 48 48 59 48 57 48 48 48 48 48 48 59 57 57 46 43 43 46 59 59 59 59 54 54 54 59 57 57 68 68 68 68 59
59 46 48 37 37 28 18 18 23 21 35 32 44 44 32 24 24 18 18 16 11 12 12 24 32 44 44 48 48 48 59 59 44 42 42 41 42 41 35 33 33 33 43 43 50 43 43 43 44 44
50 50 50 44 43 43 52 57 57 59 59 52 52 52 52 52 52 52 59 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 54 54 54 59 59 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 43 39 39
43 57 57 57 43 35 35 43 34 34 20 20 20 38 38 57 57 52 57 43 43 42 42 43 43 52 57 59 57 59 59 59 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 43 52 57 57
52 54 54 57 52 52 52 52 52 52 57 57 57 59 59 50 41 39 39 43 44 44 52 52 52 43 43 43 50 50 47 48 57 57 43 43 43 44 43 50 43 39 35 42 42 43 44 47 44 44
42 42 35 42 42 43 43 37 37 39 43 40 37 28 28 28 40 37 44 46 44 44 48 48 48 54 54 54 54 54 54 54 54 54 48 48 40 43 43 47 47 54 59 59 47 47 35 37 37 39
47 39 39 35 39 39 46 34 39 32 39 28 28 13 13 13 28 26 37 37 21 17 8 8 8 13 15 18 20 24 24 23 23 20 20 20 34 31 37 30 37 32 32 20 23 23 34 34 40 37
30 30 30 37 32 31 22 18 18 13 13 14 18 20 16 18 18 15 9 10 10 12 15 10 14 26 26 31 30 19 17 14 11 12 14 22 28 28 19 19 11 11 11 16 19 24 34 34 35 30
37 34 39 39 39 26 26 19 19 20 11 10 8 6 8 8 19 16 16 15 16 10 10 10 10 10 10 10 13 24 19 22 19 23 16 11 11 11 11 12 17 14 10 13 10 11 11 13 19 24
22 22 19 26 15 12 10 10 10 10 11 11 14 16 10 10 10 15 19 14 14 14 17 12 11 10 10 22 10 10 10 13 13 13 17 13 13 8 7 7 7 8 11 15 11 11 11 12 11 8
8 8 8 8 12 9 10 9 8 8 8 10 9 11 11 15 13 16 12 11 11 11 12 12 10 9 9 10 10 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 15 12 14 12 10 8 8 8 7
9 11 10 10 10 10 10 13 10 9 10 9 12 12 13 13 20 14 12 12 9 9 10 10 20 18 15 16 14 13 10 10 10 9 9 10 10 10 10 8 8 8 10 8 9 10 9 10 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 13 8 8 10 10 10 10 12 12 10 10 11 10 8 10 8 8 9 8 10 10 8 8 8 8 8 8 11 9 8 11 8 8 8 12 9 10
10 10 12 15 23 11 9 12 10 16 10 17 8 8 10 9 9 9 10 8 8 10 10 10 10 11 12 13 15 13 11 11 11 12 11 10 10 9 9 7 8 9 9 9 9 10 11 15 10 10
7 6 8 8 6 6 6 6 11 15 11 8 8 8 8 8 8 14 24 20 20 18 16 10 10 10 11 11 6 6 6 6 10 8 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8
8 10 10 10 10 13 9 11 8 8 8 8 8 8 9 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 15 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 11 11 10 10
10 9 9 7 7 8 8 8 8 8 10 10 16 12 12 28 23 12 10 10 8 8 8 8 9 9 9 6 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 12 12 15 10 8
6 6 6 6 9 6 8 8 8 8 8 8 8 |