BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-123M23.T7 (MSMg01no123_m23.b1) | MSMg01-123M23.TJ (MSMg01no123_m23.g1) |
ACC | AG333322 | AG333323 |
length | 1,248 | 1,240 |
length of high quality (start - end) | 327 (132 - 458) | 278 (124 - 401) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_m23.b1 PHD_FILE: MSMg01no123_m23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:34:02 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_m23.g1 PHD_FILE: MSMg01no123_m23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:34:02 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | ATCTTTNNNNTCTCACTTCGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCG
CGGAATTCACTGAAAGTGAATTCCTCATTTTGGACAGAAGCGGTAAGCGA
CCAGACTGCAGAGCACTCTTTTAAGGAACCATTTTCTTTCCTAAACCTCT
TACTGATAGCTTCTTTTTATATTTTGATCCAGATGTTTTCTGCTGGCATG
CAGTTGCCCACACTAGATGAAATCAATAAAAAGGAATTATCTATTAAGGA
AGCTCTCAATTATAAATTCAATGATCAGGACATTGAGGAGGTAAGAAGCC
TGAATCTCAGAGGCTGGCTGTTCTTTAAGATCCAGTTTGGAAAAGGTCAG
ATTTGTCATTTTCTGCAGTCTGAGAAATTAAATTATTGTTCTCTTGTTAT
TGATACTTTATTCTGCTTTCCCTATATAGTATCATCTACAGTGAAACTAC
ATAGATTCTTTTTTTTATCCCCACCCCGTATTCCCCTAGGCTTGGTCCTT
CAAAAAGTTTCTTTCTCCAAAACGTTTTGATAGACTTCTTAGACCTCTGT
TGTCTTGGACTGTGGCCAGCCTCACAGTTCTGTGCCTTTGTGCTGCTGCT
GCTGCTGCTGCTGCTTGGGGCGCATGCTCCTTCAGACTGCCCCAGCATCT
CCATGGCCCAGGAAAGCAGCATGGTGTCCCTTGGAATTTGCTCACCCTCT
GTGGTGTGACACTGCTACAGGACAAGCAGTCCCCTTTAACTGGTAGCTTA
CCTCCAAAATGGTCTCATTTATCCTGTCTACCATCGTATTTCCCAAATAC
CTCATTGCTGATGTCTCTTCCCCGGTGTCAAATGTTAAACATAATGAAAG
GTTCAAAAAAGCCCCACCCAATCTTTGCTTATGAAAAAACACTTCCCCTG
CTTTAACTGAAAAGGTCATTATTTTCCTCTTTTCCAGGTACTGGTTGATA
TTGTCTCCACTCTTTTAAAATTTATCTAACCTTTTCTTTCTTAATGTTTA
TGAATTTTCTATATTCCATCCTACCCTTTATGGTGGGTCTTTTCAATCTC
CTCGTTATACATTTTTTCTAATACCCTCTCTTTTTTGGTGTTGCCTTTGT
AAACAACCCCTCTTAGGTGGGAACTTGTTCCCTTTTCTTATTAATCTAAG
TTATTCTCTTTTCTTACATTCACTATCCCNATTTCTCGCTCATCTCCTTC
TTCTCTTAACAACTAAAATATTTTTCATCTTCTTACTTCTCTCTCTTA
| ACCCCCAACTGATGCGTAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTAAAAGCCCTGCCTTCCTCTGCCTCCTG
AATGCTGGGATTTAAAAAATCCGCCACCATTCTCAACTCTGGGATCCAAA
TTTAAACAACTCCCCACTCAACAGCTATTCCTGGCTTTCTAGTAGAACTC
AAGCTCAAAATCTACAACTAAATCTCAGTACTCAAGAGGGAAAGGTAGGA
GAATCATTCCAGGTTTAAGACCAGCTTTGGTCTAACAGCCTTGGTCTATA
CAGAGAAGCCAGCTAAGAATACATAGCAAGACATTATCGTTTTTTAAAAA
CTATAGTAATAAGACTGAGTGTGGCAGTACCTTTCCGCCCTTCAACCATT
TCTTATTTGCAGGGAGAATGAGTGACACAGAGAGACAAAGAGGGAGAAAG
ATATTTTTTTAGGCCGACTTTTAATTTGGCGACCTTATACCTAAAAAAGA
TCCCCACTTGTACTCAGCTCCAGCCTGGAAGAATGCCCCANAGGNCACGA
ATACAATACCGTGCCTTCTGGATTCATTCAGACATGAATAACAGGGCTAT
CTGTTTGAAGTCCAATGATAATATGCAAGGGTCACCCAGGTGGTACTGGT
TTTGAAGGCATGAAGGGGTCACACAAAACAGCTGAGGCTCGTCATTGTGA
GAGGCCATGTAAGGCTATTGTTGAAGGTGCCGCTTCCCTTGCAATTGAAG
GTCCAGGACTGAAGGGGTCATGCATCGTTTTTGTAGATCCCCGTACCATG
AGATGACCCCCCAAAGCACCTTCACCATTGTAGTACATGCTATCTGCATC
CTATAATTATGTACCTTGTTGTTACAAATGACATTGCCTGGTAAAAATGA
CCCCATTCCCTTGCACGTACCCTACAAAAATTCTCGAATTGTAACCCCCC
ATCTTTGATCCTCTTTTACAATTGACCTTTCTGCTTTTTGAATTGTGACT
GGTGACCCTGGAAAATTTTCCCCCCCTTTGATTCCAACAACTTCGTCTTT
ACCTGTATACCCCATACCCTTTATAAAACCTTTTTACTTCTTCAAAAAAC
ACCTCTTTTCATTTTTCCTACAACTATGCCATCTATTTCTAATTCAATAC
TCTTATCACTTTTTACACATCTCAGTCTACCGTCACTCGTCGGTCACAAT
TCTTTCCAAGTCTACTTCTAACAACCTCTCCTGGTACTAA
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 3 0 0 0 0 3 7 7 9 9 9 9 9 8 8 13 13 14 8 6 6 8 8 13 17 9 8 8 11 13 17 24 28 36 28 21 24 23 24 24 33 37 37 36 39
34 34 34 43 43 42 57 35 35 35 35 35 35 35 31 31 31 31 30 33 30 23 10 6 6 6 6 6 8 10 11 10 9 9 9 9 10 12 26 30 33 31 31 31 31 36 53 48 48 43
43 34 32 36 36 36 33 37 37 41 42 36 25 19 8 6 6 6 6 7 8 10 9 9 9 10 11 12 11 11 12 12 24 28 39 41 37 39 44 31 36 36 36 36 35 50 50 50 50 50
50 50 50 50 47 47 53 47 43 43 42 48 48 53 53 42 42 42 42 42 42 50 50 68 68 68 68 57 57 54 54 57 57 57 57 68 57 57 57 54 46 46 36 36 27 36 44 57 57 57
44 43 43 43 57 44 57 44 43 43 57 44 43 44 35 35 50 59 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 54 54 54 57 57 59 59 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 54 52 52 57
52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 52 52 52 57 52 54 54 57 57 57 52 52 52 52 52
52 52 52 52 52 52 38 38 32 35 43 50 57 59 59 54 54 54 57 59 59 59 59 57 57 57 57 48 48 43 47 42 44 43 43 43 47 43 35 35 42 59 59 57 57 57 59 44 43 43
46 57 57 57 54 54 54 57 57 59 59 59 59 59 57 57 48 42 42 37 42 42 37 35 35 42 43 48 48 48 48 48 48 57 57 48 47 43 43 43 43 47 59 59 59 48 57 48 57 57
48 48 47 47 39 39 28 30 14 8 8 6 6 6 10 23 25 41 46 50 59 59 59 59 59 59 59 47 35 35 35 47 59 59 48 59 43 43 43 43 37 43 43 47 43 39 39 37 59 43
59 43 37 34 19 23 22 15 12 11 12 19 27 11 11 11 11 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 19 28 46 44 44 43 39 39 39 23 23 19 21 19 13 13 14 17 23 13 10
10 11 11 13 13 8 8 8 10 10 23 28 32 34 47 47 43 48 43 43 37 43 43 59 44 57 57 48 48 57 48 40 36 25 34 34 48 48 37 34 28 17 17 28 28 48 39 39 30 30
44 44 54 46 44 42 35 35 37 44 57 40 40 57 44 43 43 42 42 43 43 44 43 37 35 35 40 37 28 19 24 24 23 23 22 28 43 40 37 28 28 37 40 43 48 43 43 43 43 48
48 43 43 43 43 43 47 47 47 41 41 41 30 19 13 9 9 10 14 24 32 32 32 34 28 28 32 37 39 43 34 28 24 14 14 14 34 34 43 32 32 32 28 20 28 28 32 31 39 36
42 32 28 22 23 16 11 11 16 16 12 13 18 23 26 17 17 11 15 15 32 29 24 20 13 10 10 11 26 30 28 32 20 25 24 36 36 48 47 47 47 43 43 43 36 27 29 23 15 15
19 19 23 21 15 13 13 13 22 18 23 28 37 34 33 31 24 20 23 23 15 16 10 10 10 10 13 11 11 11 11 13 12 19 11 12 11 16 15 13 10 8 10 10 8 12 13 19 22 12
14 14 13 13 8 8 10 10 16 21 12 9 8 8 8 8 15 22 24 21 10 9 9 9 9 10 13 14 14 10 18 10 10 10 10 10 10 13 10 14 9 9 9 10 10 10 8 8 8 10
10 10 8 8 8 8 8 13 15 13 13 13 11 8 10 8 8 8 10 10 10 10 10 10 8 6 6 6 8 8 9 9 9 12 9 13 12 16 12 15 15 11 9 9 9 10 8 10 14 16
11 11 11 10 9 9 10 10 10 10 10 9 10 11 9 9 8 8 7 11 7 9 10 10 10 10 8 8 10 8 9 9 9 10 13 13 18 13 14 11 12 8 8 8 8 6 6 8 10 13
12 12 13 11 11 13 11 8 8 8 10 13 10 11 10 13 15 15 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 13 11 10 10 10 10 11 11 15 12 11 11 10 10 10 10 10 10
10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 10 7 9 8 10 8 10 9 9 10 10 10 8 8 8 8 10 8 13 9 8 10 13 13 18 13 10 10 10 13 8 8 10 10 13 10 10 10 10 10
9 10 10 11 15 15 10 8 8 6 6 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 11 11 11 11 10 12 9 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 10 10 8 7 6
8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 11 15 18 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 11 17 10 11 10
9 6 6 6 6 6 8 10 8 6 6 8 8 8 8 9 10 9 9 10 10 10 9 12 15 9 6 6 6 6 8 6 9 7 8 6 6 8 8 8 10 10 10 10 8 18 8 8 6 6
8 8 6 6 8 8 7 6 8 10 10 7 8 8 10 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 11 13 3 0 3 11 16 10 17 13 9 9 8 8 6 8 8 10 13 18 14 14 12 10
13 8 8 8 8 8 8 8 15 9 8 8 8 8 8 8 6 8 7 9 9 14 17 15 15 10 10 11 12 10 8 9 9 10 10 10 10 13 13 8 6 6 6 6 8 8 6 6 | Open.Hide. 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 7 10 9 9 8 8 8 6 13 11 9 9 9 13 16 16 17 17 9 9 3 0 3 17 19 19 10 10 16 17 19 29 17 24 24 30 30 32 36 36
36 36 29 29 28 33 37 41 42 42 41 39 23 21 3 0 3 11 9 11 9 8 8 8 7 8 9 10 10 10 10 15 12 30 30 37 39 33 41 36 36 38 36 42 47 38 36 36 30 30
35 31 37 37 37 37 27 25 11 9 11 12 13 15 13 11 12 10 10 8 8 8 8 12 22 24 36 37 37 41 36 36 48 37 37 37 43 47 47 47 47 47 48 48 48 48 48 48 48 57
48 68 53 54 54 54 48 46 41 39 43 46 46 42 36 30 30 37 37 30 32 39 39 47 47 47 50 48 57 54 48 43 42 39 35 35 37 38 46 47 47 42 42 35 35 35 44 26 32 24
17 17 32 24 24 32 43 43 57 44 43 35 32 32 43 43 46 41 41 50 41 52 52 57 52 50 41 41 38 36 50 52 52 37 44 44 35 35 33 42 42 52 43 43 33 35 43 43 43 43
43 37 43 43 43 43 43 57 43 52 52 57 52 52 52 43 43 39 39 39 43 43 43 33 32 35 44 44 43 38 21 14 24 14 32 32 43 32 32 20 24 24 27 24 35 35 43 44 57 57
57 54 52 52 52 52 52 38 38 27 32 20 27 21 32 32 32 42 41 41 42 35 32 32 32 42 42 42 37 37 44 44 48 47 47 43 43 44 43 43 43 47 47 54 57 57 46 46 43 43
43 46 41 41 28 23 23 28 36 36 39 37 31 31 36 36 36 37 37 43 43 39 39 30 30 30 33 33 30 42 42 57 57 57 57 47 47 43 46 46 47 59 43 41 37 37 37 37 25 25
18 18 18 12 12 11 12 15 18 18 18 28 30 37 30 33 36 43 39 39 32 28 28 28 32 23 19 19 12 12 12 12 12 22 25 24 24 30 33 33 33 32 23 23 31 31 43 40 30 28
13 10 8 10 8 9 14 8 11 11 12 11 8 10 8 8 8 10 19 21 34 34 37 37 30 23 23 12 12 11 12 15 19 12 12 12 10 10 10 10 10 10 12 16 30 28 18 15 15 12
12 12 19 13 17 10 10 12 12 22 28 37 28 25 24 18 30 32 43 43 48 28 28 13 12 10 10 8 6 6 6 8 6 9 12 22 22 19 18 3 0 3 27 3 0 3 6 7 11 19
23 37 37 33 27 25 13 8 8 8 8 10 13 28 23 28 28 23 23 32 31 28 33 33 32 32 30 28 21 13 15 15 12 12 14 27 24 25 17 21 21 21 18 19 24 23 23 23 23 25
18 18 13 21 21 37 34 34 21 21 13 14 12 13 14 16 16 14 16 17 21 19 13 13 8 8 8 11 11 15 19 15 12 15 16 18 23 17 12 12 11 11 11 21 19 15 15 12 12 12
17 26 26 21 17 14 14 14 14 19 17 26 24 20 19 19 17 12 12 12 15 15 22 18 19 19 16 14 11 10 8 8 15 18 11 11 10 10 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 12
11 11 13 11 13 13 16 16 15 15 15 15 19 19 24 24 23 20 15 11 10 12 10 8 8 10 10 15 9 10 8 8 8 12 12 13 10 10 15 12 10 9 9 8 8 8 10 13 13 13
10 10 10 13 11 11 8 10 8 8 8 8 12 12 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 8 8 10 10 10 15 12 9 9 9 9 9 9 10 8 8 6 6 8 8 8 10 11 11 13
8 8 8 8 8 10 10 15 14 13 13 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 10 10 10 11 13 10 9 9 9 9 10 15 10 9 9 8 8 6 6 8 8 10 8 8 11 10 8
10 8 9 9 8 6 8 6 6 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 9 10 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 11 13 10 8 8 10 8 11 10
12 16 11 10 10 9 9 8 8 8 12 10 8 8 6 6 6 8 9 11 10 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 10 9 9 12 11 8 8 8 8 10 9 8 15 7 6 8 8 9 13 12 13 10 10 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8
8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 9 9 9 11 12 13 13 11 12 14 11 11 11 19 11 10 10 10 10 11 10 10 10 11 11 11 13 8 8 8 8 8 8 14 12 8 8
10 11 11 11 8 8 8 8 11 12 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 10 11 16 13 14 14 16 15 19 11 16 11 11 11 8 8 8 10 6 6 8 8 9 9 15 15 10 10 9
8 8 8 8 10 14 12 8 9 11 19 11 11 12 12 10 10 8 8 6 6 8 6 8 6 6 6 6 8 8 9 8 8 6 6 8 13 7 6 6 8 8 8 9 13 15 9 9 9 8
8 8 12 8 8 7 7 10 7 8 8 8 8 10 6 6 8 8 6 6 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 10 8 9 9 8 8 8 8 8 8 11 9 9 11
11 15 8 8 6 6 8 8 8 10 10 6 6 8 8 8 11 14 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 7 7 10 6 8 6 8 6 6 8 8 6 |