BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-124D19.T7 (MSMg01no124_d19.b1) | MSMg01-124D19.TJ (MSMg01no124_d19.g1) |
ACC | AG333641 | AG333642 |
length | 1,244 | 1,293 |
length of high quality (start - end) | 333 (117 - 449) | 332 (120 - 451) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_d19.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_d19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:04 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_d19.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_d19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:04 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | ATTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCTCACCT
GAGAAATTCCCCATTAAAATAGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAATATCCT
TACCCTTCAGGGACATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACA
CCAGTCAGAATGGCAAAGATCAAAAATCCAGGTGACAGCAGATGCTGGCG
AGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGAAAGC
TTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGTGGTTCCTCAGAAAATTGGAC
ATAGTACTACTGGAGGATCCCGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGA
AGAACTACCAACCGGTAAAGACACATGCTCCACTATGTTCATAGTTTTCT
TATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATGGCCCCCAACAGAG
GAATGCATACAGAAAATGTGGTACATTTACACAAAGGAGTACTACTCAGC
TATTAAAAAGAATGAGTTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATGGACCTGG
AGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACCCAATCACAAAAGAACTCATACAAT
ATGTACTCACTGATATGTAGATATTAGCCCAGAAACTTAGAATACCCAAT
GGATATGATATAATTTCCTAAATGCATGAAACTCAGGAAGAACGCAGACC
AATGTGTGGACACTTTGCCCCTTCTTAGAATTGGGGAAAAAACTACCATG
GCAAGGAGTTACAGATACTAAGTTTGCAACCTGTGAGAAGGATGGCATCA
TCTATAAACTGCCATATCCAGGGGATCTACCTCAAAACCCGCCCTCCAAC
GCTGACCCCATTCGCCTCCCTTACAAGATTTTGCTGAAAGGACCCATAAA
CTTTCTGGCCCCTTGCGATAACTAGCCGTCTCCCAACAAACTCTCAATTG
GATGCCTCCCACTCCTCCTTTTCGCTGTATCACAGGACTCCCCATGGGAG
TAGTCTTAAAAAATAACCCCATGTAGTTGAAGTGACCTCTGCATCCTCAC
GTGCGGGCACTATCATTTCTACCCACCCTTAACCCCCTCGAATCTTCCGT
TCCCCCCCTTCCTTTGTATTCTATAATGTGGCCTCTATTGTGCTCCTTCA
AGCGTAATTAAATAGCCCTTCATACCCTCCTCTACTTTTTAAGTCCTCTA
GGTTCATTTCTCTGCGGTTTCTTTCTCTCGTGCACACTATATAC
| TTTTAACATGCGTAGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTGGAACCAATTTCAAAGTCATATTATGGAG
AAAGAGACCTTTAAGGAGTCATTTATCAGAGTAGNAAATGCTTTTCCAGC
CACACACCAAATACTCAGAGATGGGAACAGCCCCCATTATTCTCCAACTG
CTCTCAATTTTGTTTTATTATGGCTATAAAAACACCTGTCCTTTCTGTTT
TAAGTAAGAACTACCAGGGATGATGCTAAGGGCAACATGCCTTTTCAAGA
CCAGGGGGAAATTTTCTTCTGCATATATGCTTTGTTTGTTTGTTTGTTTT
GTCTTTTATGGTAACTGAAAATAAGAGAACTTTTGCTGCCAGTTCCATGT
TTATTCTATCAGTTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCTT
TTTTTTCTTCCCCCCTTCCTTCCTTCCTTCTTCTAAAAAAAAGGGGTTGG
ATATCATGAAGTTCTGAGATATCTTCTTTTCTCAGGAAAATGACCAGCAC
AGGATTTCTGTGAACTCTTCTGTATTTTGTATTTCCTCTATTATCTGAGC
CTTTTATCATCATTCTGCCTTGATTTGTGATAGTAATTCCACTTCTACCT
TTGATGCTTCTCCCAAGTATGTGTGATGAATTACATGGTTTCTTAGTTAT
TCTTTGTGGTTTCTATGTTATACCATTTTAATGTCATATAATTTTTTTAT
GCTCTTTGAAACGTTACACATATTATGTAAATCATCTCGGCTCTCTCATT
GGTTTTTATATATTTAATCTGCTTATTGTTGATAACCTTTTCCCCTTAAT
ATTTTTCCTTTGTGTTAGTATCCTAATTTTATTATCTTATTTCTATTTTC
TATGCTCTTTGTTATAATATACTCTTCTTTTTTCATTCATTTCTTAAAAA
TTATTTTCTCTATTGGATAATTCTGATTGTTATTATTATTTGTTAATTAA
AATTAATCTTTATTTATATTCTACTTTTCTATATACTTATCTCCTTCTTT
ATTTTCGTTCTCATTTTGATATCTCTCTCTCTTGGTTGTAAAATCTCTGT
TATTTTCTCAGTTTATGTTTTCTTTTCTTATTAATTCTATAGTTATTTGG
TTTTTCTGAGATCCCACTTATCATTGGATCCTATATTATACTGTATCTCT
TTTATTACAATCTATATCCCGTTCTTTCTCTATTCCTCTCTCATATGTAA
CTTTATTATACTCTTTACTACACTCTTCCTCTCCTCATCATCC
|
quality values | Open.Hide.10 10 10 10 10 10 10 24 19 17 10 8 8 13 12 15 13 8 8 8 11 15 23 36 34 34 36 36 36 36 33 33 37 37 30 28 28 28 25 24 24 28 40 33 30 28 28 29 28 33
33 33 33 21 19 10 9 9 9 10 12 12 10 9 10 10 9 9 11 10 11 11 12 11 18 22 30 22 22 22 36 31 38 39 47 43 39 39 30 30 30 37 37 44 39 37 37 37 25 22
12 12 12 12 16 12 12 12 11 12 10 13 10 10 10 10 18 21 30 36 50 50 36 36 37 39 30 43 43 59 43 36 42 42 42 37 37 39 43 43 48 48 42 48 46 42 34 34 43 43
39 37 28 22 22 20 18 23 28 33 30 30 17 17 17 25 30 34 35 39 35 39 25 23 11 11 11 12 11 12 12 27 27 37 27 25 14 13 13 18 19 28 34 37 43 37 37 28 30 30
39 39 43 43 43 43 43 43 43 33 39 32 37 37 39 43 41 43 39 39 41 43 43 43 43 47 43 43 43 43 43 47 43 47 39 32 30 28 28 28 32 42 42 42 43 57 57 57 43 43
43 43 39 43 43 57 57 43 44 44 42 43 43 43 43 44 43 48 50 48 44 43 43 43 43 33 43 43 33 33 33 35 35 32 43 43 32 27 15 15 20 32 36 41 38 38 43 43 43 50
42 42 29 43 43 57 43 52 52 52 52 52 57 52 52 52 42 42 41 43 43 43 39 35 35 35 44 57 43 52 45 52 52 43 43 42 44 43 35 35 39 57 44 47 43 43 28 43 43 43
31 28 31 43 43 57 57 57 43 35 35 35 38 38 33 33 33 38 43 43 43 43 43 43 50 50 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 52 50 43 32 41 27 24 13 12 12 12 12 14 14
24 24 20 32 32 29 29 29 30 27 20 20 28 31 32 35 35 35 35 42 35 37 37 42 42 46 42 42 32 37 32 36 28 32 39 32 32 35 37 37 47 34 30 14 14 14 13 13 13 13
13 15 18 15 12 12 12 15 15 12 18 18 28 28 33 29 35 35 29 24 17 12 12 12 21 30 37 34 34 32 21 15 10 8 7 7 8 8 23 23 28 28 28 36 33 32 28 25 25 28
33 34 39 37 30 30 23 23 23 23 22 30 20 20 17 30 22 30 33 32 40 40 30 26 26 30 36 39 41 36 23 31 31 28 20 19 21 24 22 23 23 37 37 41 37 37 25 24 15 19
21 31 21 26 22 28 28 22 22 21 21 21 26 21 13 11 11 16 18 19 23 32 32 37 37 28 28 17 12 12 15 13 16 17 13 15 16 16 16 18 18 20 18 28 21 21 18 23 23 28
30 35 28 34 31 23 19 14 17 17 26 26 21 21 12 19 11 18 12 12 12 15 15 16 20 12 12 18 19 22 14 21 21 21 21 21 21 17 11 11 11 20 15 14 13 28 21 28 23 22
19 17 17 19 26 26 22 17 17 24 24 13 12 8 9 9 12 10 10 13 21 21 12 12 11 21 12 21 21 28 28 28 23 16 12 11 11 12 12 14 15 10 8 8 8 8 8 10 15 22
19 14 14 14 14 14 15 14 18 18 12 12 14 25 25 35 35 35 34 33 28 28 19 23 13 13 11 12 11 12 12 13 8 9 10 13 18 18 17 23 10 10 6 6 8 8 9 10 9 12
21 15 15 10 8 8 10 8 8 8 11 11 12 12 14 8 8 8 8 8 10 10 10 15 12 10 6 6 8 8 9 22 14 12 10 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 10
15 10 13 10 12 10 8 8 9 9 9 8 8 8 8 6 7 10 10 12 8 10 10 9 9 9 10 12 8 8 6 6 6 8 8 8 8 11 12 11 12 8 8 8 8 8 8 15 13 11
8 8 10 11 8 10 10 9 9 9 8 7 7 9 8 8 10 8 8 8 8 10 8 9 9 9 10 10 15 12 14 14 14 10 10 10 13 18 10 10 10 19 15 12 8 6 6 6 6 9
8 8 8 8 8 8 8 11 16 17 12 12 8 10 6 6 8 6 7 8 10 10 10 8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6
8 8 8 10 8 12 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 8 10 9 9 8 8 11 11 16 11 11 10 9 9 8 8 8 8 6 7 8 7 8 10 8 8 8 9 9 9
9 9 6 8 8 8 8 8 8 10 12 10 10 8 8 8 8 13 9 13 9 9 9 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 9 12
9 12 9 10 10 11 11 10 10 8 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 12 15 14 10 10 8 8 8 8 9 10 12 11 8 6 10 6 6 6 8 12 12 12 10 9 10 9 9
9 11 12 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 8 8 13 10 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 9 12 15 15 12 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6
8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 10 10 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 11 10 12 11 12 10 9 9 9 8 10 8 9 12 15 15 10 8 8 8 6 10 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 | Open.Hide. 7 7 7 6 7 7 7 8 10 9 6 6 6 6 15 8 6 6 6 13 17 20 23 22 16 8 8 3 0 3 19 19 19 10 10 13 22 23 29 16 16 21 29 35 36 36 37 50 43 37
37 30 30 33 39 43 46 59 47 47 47 37 27 18 10 10 9 9 10 13 12 12 11 12 10 15 17 25 30 29 28 24 31 31 28 28 47 42 47 47 48 48 43 48 43 43 39 39 39 41
41 43 47 27 21 8 7 8 8 8 12 12 12 12 12 12 13 13 19 15 21 24 34 32 37 34 30 25 25 34 34 23 23 3 0 3 23 23 37 37 37 37 30 30 37 37 37 33 34 25
25 25 25 32 33 43 43 43 47 48 48 47 47 47 39 39 39 37 28 28 24 32 32 34 34 59 59 27 22 12 11 12 12 10 10 10 13 15 24 28 30 39 39 37 30 30 30 28 32 33
37 28 37 37 43 43 43 43 46 43 43 48 48 54 57 57 57 43 46 37 29 26 22 30 22 32 32 46 39 43 43 43 39 37 43 43 48 57 54 54 54 57 57 57 57 44 43 43 39 44
42 42 35 35 35 37 35 42 33 42 42 57 43 42 42 42 43 43 43 43 50 50 43 44 43 29 31 43 32 36 29 27 23 38 32 35 35 43 50 52 52 52 52 43 43 32 32 20 32 20
20 20 27 27 27 33 33 33 35 43 43 59 50 50 50 48 48 48 42 42 42 42 43 57 44 47 44 44 43 43 47 57 57 47 47 32 32 20 20 20 41 41 41 41 41 27 18 18 24 24
27 41 44 48 44 47 47 47 32 28 13 13 13 24 28 37 43 43 43 36 43 32 32 23 20 20 21 21 20 20 23 41 37 43 41 39 43 43 37 36 37 30 21 20 12 12 12 11 12 12
14 12 12 17 24 37 37 31 28 28 31 28 35 35 32 32 33 33 35 39 39 46 37 37 28 28 32 37 39 39 43 39 43 39 48 48 48 48 43 39 39 30 32 28 28 24 20 20 22 17
12 10 10 9 10 9 10 10 10 10 11 10 12 15 22 28 15 13 11 18 20 22 19 23 23 20 20 32 28 24 28 13 12 8 8 8 8 12 19 18 13 9 9 9 12 13 10 9 10 10
22 15 22 20 22 31 18 23 15 12 9 9 10 13 12 19 11 11 11 12 14 12 10 10 14 18 23 37 12 12 8 8 8 8 12 15 12 12 11 12 15 20 15 11 12 11 8 8 8 8
8 8 10 19 13 15 10 17 17 10 10 11 11 8 8 12 12 19 12 10 10 9 12 11 16 12 12 12 11 11 11 12 20 10 12 13 19 12 12 6 6 8 8 13 15 15 19 10 10 10
8 8 9 8 10 10 13 16 11 11 11 11 10 15 12 12 10 8 6 6 8 8 9 10 8 10 6 6 8 10 15 10 10 10 13 9 8 8 8 8 6 6 8 7 7 10 8 10 8 12
15 10 10 9 10 8 8 8 10 10 15 15 15 10 8 8 8 8 10 10 13 8 8 8 8 10 8 6 6 8 8 9 8 8 6 6 8 8 10 9 10 9 8 8 8 8 7 12 10 8
10 7 7 8 8 11 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 15 11 12 11 8 8 8 6 6 6 8 10 8 8 8 16 19 19 10 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 8 8 10 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11
9 8 10 9 9 15 8 8 8 10 10 10 10 13 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 9 10 10 10 10 10 10 10 9 8 8 10 10 8 8 9 9 9 9 9 9 9 10 9 10
11 14 14 12 14 9 7 8 8 10 12 12 9 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 11 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 9 8 8 7 7 8 8 9 8 8
8 10 11 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 9 10 9 10 12 11 11 11 14 13 11 11 9 8 8 8 8 8 7 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 13
10 9 9 10 12 10 8 8 7 7 8 6 6 8 8 8 8 9 9 11 13 8 8 8 8 6 6 10 8 8 8 10 9 10 10 10 10 9 9 12 9 9 9 9 10 10 10 12 10 10
9 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 8 10 8 10 7 7 8 7 7 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 7 7 8 8 8 8 8 8 10 8
11 15 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 11 12 8 8 6 6 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 10 10 10 10 10 9 11 9 8 7 8 7 8 8
8 6 6 8 8 6 8 8 8 8 9 9 11 11 8 8 9 9 7 7 10 10 11 10 10 9 8 8 12 8 8 8 9 8 8 10 11 8 8 8 8 9 9 9 10 10 12 10 9 9
10 18 23 20 10 10 8 6 6 8 8 7 9 8 8 6 6 6 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 15 8 10 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 12 9 9
10 10 8 6 6 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 11 10 10 12 10 10 10 10 7 7 10 8 8 8 10 10 10 13 10 11 10 11 8 6 6 8 8 9 8 6
6 6 10 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 9 9 9 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 |