| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-130M06.T7 (MSMg01no130_m06.b1) | MSMg01-130M06.TJ (MSMg01no130_m06.g1) |
|---|
| ACC | AG338436 | AG338437 |
|---|
| length | 705 | 1,187 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 320 (44 - 363) | 788 (123 - 910) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no130_m06.b1 PHD_FILE: MSMg01no130_m06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:44:43 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no130_m06.g1 PHD_FILE: MSMg01no130_m06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:44:44 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TTCCTATGAAATATACTCATCAAGTAAGCCTTCCAATCTTCTGTTGTGTA
ATCATCTCAGTATGCTAAACTTCCCGAACATTTAATTTCTTTTATTTACA
TTCCAGTTGTTGCCTCTGGCTCGCTGCCTCCACCCCTGATCCATAGATCC
TCATCCCATTTCTCCCCCCTGTTGACTCCAAAAGGGTGCTTCCCTCACCC
CATCAGGACTCCTCCTTGCCTGGAGCCTCAACTCTCTCAAGGGTTAAGCA
CATCTTCTCCCACTGTGGCCAGATTATTCAGACCTCTGCTATATATGTAC
CAGGAGCCTCTTTTTTTCCACCCCCGCTCCCGGCTGGNGGATCAGTCTCT
GGGAGCTCCCAGGGCCACAGGATAAATAAAAAAGCTGGCCTTCCTATGTA
GTCACTCTCCCTTTCAGTTTCTTCAAACCTTCCCCTAATTCCCTGACTTC
AGTTCAATGGTTGGATGTAAGCATCTGCCTCTGTCTTAGTCAGCTGCTGG
AAGGGCCTCTCAGAGAACAGCCATGCCAGGATCACGTCATCACCTGTTAA
GCACATCCCAGTATCAGCAATACTGCCATGTCTTGTTGCCCTACCCACCC
CCATGACATGTATCCCAATCTGGGTGGGTCACTGGCACATCTTTTTCTCA
GTCTC
| NCCGTCCTTTNNNAATGATGTGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAAAGATATACAAAGCCTGGTC
AGATGAGTTTCACTCCTTCATCTTCTCCCCTGTGGTCTTTTTTCAGTAAT
CTGACTAAGAGATGAATGTGTGAGAAGATAGTAAAACAAATTTTACATCC
AAGGCTACAGACAGGATGATCAAGCACATAGCTTTAGTAAAATAAATTTT
CTCACCCCCCCACCCACATATCCAAATAGTCAGCAGGATCCTTAGTCCCT
TAACTCAGATTAAAAGATTGATTCTGTAATCTTTTCTCTATCTCCAGGAC
TCTGCCATTGCCTTTGCTTATAATCTTGGATCATCAATTTTGGTTGTCGA
CTTGTTTTGATTATGTGCAATTAAAATATTGTTCAAGCATAAACAGGTTT
GCTGATGAGAGTGTTTCCAGAAATGATTATTATGTAGGTCAGTAAAACAA
GGAAGAAATGATCACCCTGAATGTGAATAGCAGTGTCTAAAAAGCTAGGG
ATCTGGATAAAAGAAAAATCAAAAGAGTTAATTTTGCTCTTTCATGCAGG
TTCCATTGTTTTAGGGTAGTCATAGTTTTGTAATTTTAATGGGCCAAAGA
CATCAGACATCCATACTTTTCAGACATTGAATGTAGATTTGCACTTATCA
TCTTCCTAGTGTCTACAAACCTTCAGGCTCATACTGGAATTTTACCATTG
ACTTGTCCTAAGGCTTCCAGAGTATTGAACTGAATAAATACTGGTTTTGC
CAGTTTTCCAGCATGCAGATGGCCATACTGGAATCATGCAGCCTCGGTTC
ATATAAGCCAATCTCAAATCCATTTTACAGTTTATATATATATGTGTGTG
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTAAATATGACATACCAATTTATT
GATATACAAATATGTGTCATTAATTTTTTTCCTCCCAAAAAAACTACCTC
CCATATTCTTTAAATTCCTATGACGCCCAGTTTCTTTGTTATTCTTTCGA
AAATTTAACCTCTCTCCACCTTTTTTAATGGTTGAGTGGGATTTCCGGTA
CAAAAAAATAAATTTCTCTCCACTTTGTTTTCTATATAATCCTTTCTAAG
AGGGTTTAAAATTTCCGTGATAAACCCACTATGTTTA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 7 10 6 6 9 14 9 22 28 27 20 19 24 22 22 30 21 15 8 8 8 16 16 23 19 10 10 10 22 21 25 16 11 11 12 12 15 26 19 15 8 11 12 17 23 32 34 26 30 35
29 36 31 48 41 41 39 41 23 21 9 9 9 13 10 11 11 15 19 27 30 31 35 36 53 47 39 39 30 39 39 33 33 33 33 33 33 43 48 48 42 42 40 40 40 47 50 50 50 50
57 57 50 50 57 50 42 42 42 38 38 47 47 37 41 34 34 25 25 25 21 24 15 21 14 14 19 21 30 30 33 33 50 50 50 53 53 53 53 53 50 50 50 50 53 53 53 53 53 50
50 50 50 50 50 50 50 54 54 54 54 54 57 68 68 57 57 68 57 57 54 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 50 50 51 50 50 68 68 68 68 68 68 57 44 57
57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 54 54 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 59 52 52 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 59 59 59 59 57 57 68 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 46 44 43 47 47 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 57
57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 32 27 18 13 10 10 10 10 10 11 15 15 15 15 28 32 43 57 59 59 59 59 48 48 48 59 48 46 46 46 46 48 47
47 43 43 48 46 46 41 31 18 18 11 11 11 17 19 20 12 12 11 11 11 11 10 15 9 9 9 15 16 16 12 9 9 11 23 23 3 0 3 27 22 36 32 34 32 33 35 47 47 47
47 41 41 43 34 34 39 39 37 37 31 19 10 10 8 8 10 11 11 12 16 12 12 12 15 11 11 11 16 17 16 13 14 12 12 12 16 23 28 33 32 34 37 30 30 19 21 13 13 13
13 18 23 34 37 46 46 47 47 46 46 43 43 39 39 30 30 28 37 32 32 35 37 33 35 39 39 41 41 41 41 37 37 41 37 37 30 30 30 30 30 30 39 39 39 35 35 30 34 32
28 24 24 18 24 14 20 20 23 20 20 20 20 32 23 28 23 31 29 20 20 20 28 28 37 37 35 31 29 36 28 25 18 15 11 19 19 10 10 13 24 28 25 25 16 11 11 21 15 14
14 14 12 12 11 11 13 26 26 19 16 11 12 12 13 15 26 26 24 22 20 20 28 28 28 28 23 23 22 22 16 15 10 10 10 10 19 22 25 25 12 12 11 9 8 8 8 8 8 15
22 15 10 10 10 15 14 9 10 9 9 9 14 15 15 13 13 13 13 10 10 8 8 8 13 11 9 10 10 10 10 17 20 17 18 12 14 14 11 9 9 9 9 10 11 8 8 8 8 13
13 8 8 8 11 8 8 9 10 9 9 9 14 13 14 11 13 8 8 6 6 8 6 11 11 11 11 11 11 11 10 10 13 7 6 6 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 9 9 9 9
9 9 10 10 10 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 10 9 9 9 3 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 10 10 13 8 7 9 8 11 10 17 16 19 9 10 10 22 19 24 22 22
28 35 35 35 36 37 37 36 36 36 36 38 36 36 33 41 37 50 42 41 25 27 9 9 9 17 8 9 7 6 6 6 9 12 10 15 10 8 8 22 23 59 53 53 50 50 36 38 36 36
36 50 50 50 41 41 39 31 31 30 23 23 10 11 13 17 10 8 8 8 8 11 15 25 29 33 33 31 31 33 36 36 36 36 26 27 12 27 27 57 47 47 53 53 53 53 53 50 50 50
57 57 57 43 47 43 51 43 54 57 59 59 68 57 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 48 57 43 40 40 46 59 57 57 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 57 57 68 57 57 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62
62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
39 39 27 23 23 35 43 44 62 52 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 52 52 52
52 52 62 62 62 62 62 39 43 43 39 24 29 29 29 35 35 43 43 52 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62
62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 68 68
68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 68 68 59 57 57 57 57
57 57 57 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59
54 57 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 48 48 57 48 48 48 48 48 50 50 59 59 59 59 39 39 34 28 30 32 37 37 37 50 50 50 50 50 47 47 47
41 41 42 59 47 47 47 43 37 32 31 31 31 34 43 39 39 40 39 34 28 25 25 34 34 59 43 41 37 44 44 44 41 41 44 59 59 47 47 59 41 39 28 28 27 27 30 32 32 31
30 37 37 27 26 22 22 22 22 32 37 37 37 37 37 37 39 39 30 39 29 29 29 31 37 39 41 39 39 31 36 36 37 41 41 41 41 39 40 41 37 32 29 34 35 29 26 29 27 32
37 39 37 32 29 30 34 31 31 39 41 34 34 21 18 16 26 25 30 37 36 41 41 59 59 59 37 27 24 16 16 17 28 23 30 30 37 33 39 39 43 37 47 34 47 39 43 39 37 33
33 33 37 43 59 59 43 35 14 14 14 24 25 32 23 19 11 11 11 23 19 16 16 15 12 12 17 28 29 33 21 13 9 9 10 13 16 17 19 16 18 18 10 10 9 9 9 19 10 8
8 8 8 8 8 6 6 15 15 13 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 10 8 8 8 19 22 23 15 9 10 8 11 11 11 8 8 9 10 10 15 15 12 9 9 8 8 10 10 10 10
8 8 8 8 8 8 9 11 8 8 8 8 9 8 8 10 8 8 10 9 9 11 11 11 11 11 11 10 11 10 11 10 10 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10
10 18 11 6 8 6 6 12 8 10 8 6 6 8 8 10 10 10 9 9 12 19 16 9 12 11 11 10 10 11 10 10 10 10 10 10 11 11 8 8 8 8 8 10 10 10 12 16 16 12
13 12 24 23 37 34 28 18 13 12 12 12 10 10 6 6 8 8 8 8 6 7 7 10 15 10 11 11 10 14 8 8 8 8 8 8 8 8 13 6 6 6 6 8 8 13 13 8 8 8
11 10 10 12 15 19 15 15 13 12 12 15 20 14 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 |
|---|
