BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-143J18.T7 (MSMg01no143_j18.b1) | MSMg01-143J18.TJ (MSMg01no143_j18.g1) |
ACC | AG347910 | AG347911 |
length | 707 | 740 |
length of high quality (start - end) | 662 (43 - 704) | 48 (67 - 114) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no143_j18.b1 PHD_FILE: MSMg01no143_j18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:04:13 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no143_j18.g1 PHD_FILE: MSMg01no143_j18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:04:13 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCTCTGATTGTCGTCCTTTGATCTCTACATGTGAATAATAACATATGTGT
GCACACACTCCAACACGAATCACACATATATGAACACACACAATAATAAA
TTTTGGAAAACAAAAAACAGCAGGTGTGGTGGTGCATACCTTTAATCCCA
GCACTTGGGAGGAAGAGGTAGACAGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGG
TCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGTGAGGAGCCCTGAGAAACCCTGTCTC
AAAAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAGAGTCAAGGC
AGGAAGATTAGAAATTCAAGGTCATCCTAGGCTACATAGAAGGTTTAAGG
CTAGCCTGGGTGGCCACCCGGGAGGCTGGAGAGATAACATCTGAAGTGCT
TGCTACACAGGCATGAGGGTCTGCGGTGGATCCTCAGCACCTACATCAAA
AGGTGGCCTGTGTCAAGTGCCTGTAATCCCAGAGGCAGGGCAGAGCTCGG
AGTATCACTGGGACTTGCTGGTCTGCTAGCCTCACCTACAAACCAACTAG
CCCTCAGTCCCAGGGAGAGACCTGATCTCAAACATACAAGGTGTGGACAG
GCCTGGAAAAAATGTCTCACTGGTTAGGGGCACCTGCTGTTCTTGCAGCA
CCCACAA
| ACATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXCAGGATTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAC
AAATCCGCCTGTCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCATGCGCCA
CCACACCCGGCCACCTAGTAGAATTCTTAAAAATTACTGCGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTCCGTCTCCCCCCACCTGCTCTGACCCCTACCCTGACCCCC
CTTCTCTACCTCTCTTCCTTCCCTCCCTCTCGTTTCGCTGATACTTATCG
TGTACCCCTCGTCCCCCTTTTTTTTCTACCCCCTGTCACGCATCTCCTTC
CCATTTTTCCCTTTTTTTCTCCCCATCTCCCCCCGACATCCTCCCCTATT
AATCTCCCGATTTTTTCCCCCCCCTATTTAATAAATATCCTACCTCCCTA
CTCTCTTCTACTTCCTTCTCCCTCCCCTCCCCCCCCTCTCCTTCTGCCCC
TTTCCCCTCTTCTTTCCCTCCCCCCTCTCTATCCTCCCCTACCCCTTCCC
CCCCCCATTACCCCCATTTCTCCCCTCTTCTTCCCTTTTCCTCCCCTCCC
ACCCCCTCCATTTTTCCCCCTATCCCCCCTTCTTTCCCTTTCTTTTTCCT
CTATCTTCCCTTCCCCCCATCTTCCCCTTCTTCCTCTTCTTCCTTTTCGA
CCCTTCCCCCCCCCCCGCCTCTCTCTTCTCTTTCCCTCTC
|
quality values | Open.Hide. 6 8 6 6 8 9 19 30 25 20 18 18 15 15 19 10 10 10 19 19 39 39 25 21 10 10 10 19 18 12 12 12 9 9 9 12 12 15 13 18 20 24 26 32 37 44 36 31 31 33
33 33 41 41 22 21 8 7 7 8 8 8 7 9 10 21 30 47 37 37 39 44 44 53 53 36 36 36 36 36 42 53 53 53 53 57 57 57 57 50 50 50 50 42 42 68 68 68 68 68
68 51 51 68 68 68 50 68 50 50 50 50 50 50 57 68 68 68 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 68 68 68 51 51 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68
68 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 57
57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 68 57 57 57 57 57 57 52 43 43 35 33 35 32 32 32 35 35 43 50 57 57 43 43 44 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57
57 57 57 57 50 59 59 48 38 41 24 20 13 8 8 6 6 8 13 26 12 30 30 41 47 50 59 59 59 59 59 50 50 50 50 50 53 57 53 53 57 59 57 57 59 57 57 57 57 57
57 59 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 54 54 54 54 54 54 57 59 59 59 57 57
59 59 57 68 68 54 54 54 57 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 50 50 50 57 48 48 48 48 40 40 46 41 43 43 36 28 25 31 37 37 39 46 47 59 59 48 48
48 50 48 57 59 57 57 57 48 48 44 44 37 37 37 41 47 44 44 41 41 43 43 41 41 41 41 41 41 37 37 41 41 41 41 46 43 41 43 43 37 37 37 40 40 41 59 59 41 41
37 37 43 59 59 36 41 28 28 37 37 44 44 37 40 40 39 37 37 27 25 25 31 32 41 47 39 59 41 31 31 37 37 41 39 39 41 41 37 32 31 35 36 36 31 36 41 41 41 44
41 37 31 39 31 16 18 14 14 14 14 18 37 30 37 37 39 39 39 37 35 28 25 37 30 32 32 34 36 39 39 39 39 39 40 39 27 23 19 15 15 19 17 22 15 15 28 28 37 30
25 25 16 20 11 11 11 | Open.Hide. 6 6 6 7 10 10 19 10 9 9 10 11 20 17 13 28 23 14 11 11 19 19 11 13 11 9 9 9 9 9 9 9 15 12 18 15 22 17 27 28 29 25 24 14 19 19 27 27 30 37
37 37 37 37 30 26 19 13 11 8 8 6 6 6 10 15 18 20 28 33 33 33 43 43 37 38 38 50 35 29 24 14 11 24 32 44 44 57 57 48 57 48 48 47 57 39 25 21 11 11
11 25 27 50 42 42 36 36 22 21 16 11 11 11 11 15 27 30 17 17 15 28 21 30 28 28 24 22 29 20 28 21 31 24 27 24 32 35 31 31 28 31 26 29 27 30 23 20 20 28
31 29 26 22 17 17 25 24 24 13 15 15 19 19 24 21 15 11 12 12 12 12 17 17 24 22 32 29 25 17 13 13 18 23 23 13 10 9 9 9 9 9 14 14 10 11 11 15 13 14
16 21 26 26 10 9 9 12 12 9 11 11 12 8 8 6 9 11 10 12 12 9 9 9 10 10 12 10 10 10 8 8 8 8 13 13 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 13 9 9 10 12 13 10 10 10 8 15 13 16 14 19 20 10 10 6 6 6 10 8 11 11 9 8 8 8 15 10 12 10 14 8 9 10 10 12 13 13 12 15 12 11 8
6 6 6 6 6 10 8 8 10 9 9 9 14 14 18 10 18 12 18 15 11 10 9 15 8 6 6 6 6 6 8 15 10 16 13 10 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 13 9 9
10 11 12 12 25 16 16 13 10 9 9 10 12 13 17 12 10 10 8 8 12 15 10 8 8 8 6 6 6 12 21 18 19 11 11 11 11 11 9 11 8 11 10 12 10 10 10 10 10 8
8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 11 13 12 14 14 18 26 27 26 9 8 6 6 8 8 8 8 10 6 6 8 8 9 10 10 10 15 10 10 13 11 10 11 9 8 8 8
8 8 8 10 10 10 10 10 10 8 9 9 9 12 11 15 15 13 11 7 7 8 6 6 6 8 10 9 9 9 9 9 14 14 11 11 10 10 10 8 8 8 10 8 8 8 6 10 8 9
9 9 10 20 21 22 10 10 9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 12 12 14 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 16 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8
12 9 13 13 18 10 10 10 13 10 11 12 10 10 10 11 11 13 13 19 19 13 12 12 10 9 9 9 9 9 18 18 18 19 15 15 12 9 10 12 8 8 8 8 8 8 8 10 19 12
11 8 11 11 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 12 9 10 10 9 9 8 8 8 8 8 17 17 13 13 8 8 7 7 8 13 13 13 8 8 8 11 14 14 13 13 13 10 10 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 10 11 14 8 9 9 10 10 8 8 8 15 17 17 12 10 10 10 13 14 10 10 10 8 8 8 8 8 9 9 10 12 15 15 8 8 8 6
6 10 8 16 14 15 15 15 19 21 16 16 22 11 13 8 6 6 6 6 8 8 8 10 7 6 8 8 13 8 8 8 13 13 23 11 8 8 6 6 |