BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-161N11.T7 (MSMg01no161_n11.b1) | MSMg01-161N11.TJ (MSMg01no161_n11.g1) |
ACC | AG361142 | AG361143 |
length | 1,276 | 1,205 |
length of high quality (start - end) | 427 (31 - 457) | 384 (70 - 453) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_n11.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_n11.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:54 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_n11.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_n11.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:55 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNGGTGCACTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAAT
TCTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAAACACCTGAAAAAATGTTCA
ACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCCCAACAACCCTGAGATTCCA
CCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGAT
GCTGGCGTGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGAG
TGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAA
ATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATAT
ATCCAGAAGATGCCCCAACTGGCAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTC
ATATTTTTCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATGCC
CCTCTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCGAAAATGTGGTACATCTACACAAAGA
AGAAGTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAA
TGTATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACATTCACAAAG
AAACTCACACAATATGTACTCACTAATAAGTGGATATTAGCCCCAAACCT
AGGATACTCAAGATATAAGATATAATTTGCTAAACACATGAAACTCAAGA
AGAATGAAGACTGAAGTGTGGACACTATGCCCCTCCTTAGATTTGGGAAC
AAAACACCCATGGAAGGAGTTACAGAGACAAAGTTTGTAGCTGAGATGAA
AGGATGGACCATGTATAGACTGCCATATCCAGGGATCCACCCCTTAATCA
GCATCCATACGCTGACACCATTGCTTACTCTATCAAGATTTTATTGGAAG
GACCCAAATGTTTCTGGTTCTTGTAAAAATATTTCGGGCCCTTACTACAC
AAAATGTATTGCTCCTCTCCTCTTAAAGTGTGGTTTTTTCGCTTCCCCTT
GGCTAAGCTATAATAATTACTCCCTTTCTTTTATGTACTGTTACTCTCTT
TTTTGGAATTCTCTTTTTTTTTATCATCTTTCCGTAATTTTTGTATTTTT
TCGTTTTTTTTATAAATAACTCTTGTCTCTCTCTCCTTTATTAAATTCTC
TTTCATGTGTTATATATTTTTTATCCTCTTATTCTTTCTTTTTATTACAT
CTTCTTTGATCTTATTCTTATTCTATTCTATACTATTTCATTCTCATCTA
TTTCATATCTCTTTTTCCACCTTCTT
| NNNTTATGATGGAGCCGGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXTAAGTGATCATTACAGAGGTCAACTAATTTG
GGAAGGCTGTGTTAAGGCAAGTCATTGCCGGGGCAAGATAAATTCTTTAC
CTCAAGCATTGCAAGATGACAGCTCTGCAATGAAAGATGAGCTGAAAAGA
GAAAAGCAAAACAAAATTGTCTAAGGGTGTGTTATGCAATGAAAAAGTAA
GGAGAAATGAACACCATGAACCCAAATAGAATGTTTAGTTTTATGCTTAG
TTTTAGTAAATAATAGAAAGTGTTCAAGATCTGTGGATTGCCAAAATGGA
CTGATTTACAGGTAATGAACTGGGCTGGTGGGAAACGTAGCCAGGCTTGT
TTGTTTATACTCATCTCGGCTTCTCTCCATCTCCCTCCCTGCTGTTGATG
TTTTTTTTCCCCCCCCCCCTAGGGNCTTATTACCTACTTAAAGAAAAGAC
GAGTCAGATAATGACCTTTCGTGGATTCTATGGCTTGTATTAAGGGAGAG
AAATTCTAGTTTCTATGACAGACTTTACAGGAATGCCAGGAAGGAGGGTG
GGAGAAAAAAAAATAGAGACAATCCTTTTCAGGCCTAAAAATAGTTATCT
CTTGACATCTCTGGGGCATCACTTCCAGAACCATCTGTCTATCCCTCCAA
ATGCTATACACTGTGTAGGTCAGGTCTTTATTATAAAATGCCATATACTC
ATGAACATCTTCCTATGTACTGTAAACCACCTCCAGACTATTTATAGTTA
CCCATTAAATATTATTCTCCATGTTATTATGACTTTCTTTTATTTTCCTG
TGTATGCAACTATTTAAATAAAACTCTGTAATTTCCTGGTAATTACAAGT
TTTATTCTTAATAATTAATTCGTTTTTCACTCCATTAATTTCTTTTTTTT
TTTTTTTCTTTATTCTTCCTTTATTTTATTCCTTCTTTCTATTACTTTTA
TTATTCTTTATTCCTCTCTCTTTTTTTCTTTTCAATTCTTTTTTTCTTTA
TTATCTTACTTTTATTTTTTTATATCTTTTCCTATCTCTTCTCTTATATC
TCATTATTTCATTTATTCTTTCTCCCTTTTTATTTTTTTTTTTTATTCTT
TTTTATCCAATTTTACCTTTTTATTTTTCGATATCTCTCTCTTTCACTCA
CTCAT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 7 9 7 9 12 10 16 16 14 14 10 10 8 8 8 15 18 8 8 8 8 14 10 19 19 37 33 32 33 33 36 36 48 48 47 42 54 50 48 43 43 47 47
68 50 50 50 50 47 50 50 50 50 50 50 50 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 50 50 50 50 51 51 48 48 43 47 46 48 48 48 48 54 57
54 54 57 57 57 53 53 53 53 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 50 53 50 59 59 59 30 30 15 17 12 12 13 15 15 30 31 59 50 50 50 50 53 50 57 50 53 53 57 57 50
50 50 50 50 50 57 57 53 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 47 50 50 51 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
59 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 57 57 54 54 54 59 59
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 42 42 41 37 37 48 48 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68
68 68 59 59 59 59 59 54 54 68 68 68 68 68 59 59 57 48 48 47 59 59 68 68 68 53 53 53 53 53 53 53 53 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 25
19 9 10 8 9 9 8 8 9 9 17 33 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 48 48 48 48 48 53 57 57 57 59 59 57 50 50 50 50 50 59 46
28 28 15 15 15 19 17 21 24 19 16 15 15 15 15 20 31 34 19 18 18 9 9 6 8 6 8 18 28 39 41 41 37 34 23 23 14 13 13 26 19 19 22 13 11 10 10 8 8 8
10 8 8 8 8 8 8 11 20 23 30 43 59 48 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 48 48 48 59 59 59 57 57 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 59
59 57 57 57 48 48 48 57 57 68 50 50 50 41 41 41 57 44 44 44 43 43 47 57 57 57 57 54 54 54 57 48 44 39 35 35 42 42 42 48 57 44 42 30 30 30 37 37 48 57
57 57 46 46 43 43 43 36 44 39 48 48 57 57 57 48 43 43 33 37 30 33 33 43 43 48 59 59 46 43 43 43 41 34 30 30 26 27 19 28 37 36 59 41 41 41 41 34 37 41
39 37 37 37 37 37 34 28 20 20 23 27 16 16 16 26 30 36 36 25 33 33 43 43 50 39 39 39 39 37 28 37 24 32 32 39 35 35 33 29 24 25 27 24 26 19 16 17 29 30
37 37 31 35 39 39 37 23 20 11 16 16 25 18 24 27 22 28 24 21 22 19 19 11 11 12 19 22 20 19 30 32 32 30 30 30 21 21 15 12 16 11 11 11 12 12 25 25 39 37
32 23 26 23 20 20 18 20 16 18 14 13 13 25 23 22 15 14 9 9 9 10 9 12 21 21 22 22 22 22 22 18 18 19 15 15 10 10 10 10 10 10 17 9 9 9 10 10 10 21
21 23 29 32 32 22 18 18 15 13 18 15 10 8 8 8 8 8 10 23 29 23 15 12 9 9 10 9 17 11 11 12 21 16 15 13 10 9 9 8 15 17 14 12 12 13 11 13 9 9
10 9 9 9 14 15 9 9 9 20 15 19 10 10 9 9 11 8 8 8 8 13 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 11 8 8 9 9 9 10 9 8 8 9 8 8
8 10 17 13 10 10 9 9 14 20 15 12 11 14 10 9 9 9 9 12 12 12 10 10 10 10 12 11 9 9 8 8 8 6 6 10 10 13 12 10 8 8 8 6 8 6 6 6 6 10
13 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 12 9 9 6 8 8 6 6 8 10 10 12 10 12 12 12 12 10 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8
8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 7 9 12 10 18 13 12 12 12 8 8 8 8 6 6 6 6 11 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 17
13 12 12 15 11 11 11 10 10 9 9 7 7 7 8 8 8 15 15 10 15 12 8 8 8 8 8 6 6 10 7 6 8 8 8 8 8 8 9 10 11 8 8 8 8 8 10 15 12 8
8 8 6 6 7 7 12 22 12 12 8 9 8 8 8 10 9 8 8 9 10 13 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 17 15 10 10 9 10 7 7 8 8 8 9 9 21 13 12 9 9
9 9 12 10 10 9 8 7 7 8 8 9 9 13 8 8 8 10 10 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 11 13 10 9 9 10 6 6 6 6 8 8 9 9 9 10
10 13 9 9 10 10 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 10 9 8 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 15 9 8 8 8 10 10 15 10 9 9 10 12 10
10 9 10 10 9 9 9 9 10 9 9 9 15 10 11 8 8 6 6 8 6 8 8 10 10 9 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 9 10 9 9 7 11 8 8 8 15 9 8 9 8 12 12 19 19 21 9 10 10 21 21 33 36 36 36 38 36 36 36 37 37 37 47 47
47 47 40 57 57 59 59 59 59 59 57 57 54 57 46 46 46 47 47 48 42 41 41 41 41 48 48 54 48 57 57 57 47 47 48 46 57 39 33 33 32 32 37 46 46 47 54 48 42 42
42 42 47 57 44 46 37 35 23 30 30 42 42 46 50 50 59 59 54 50 50 50 46 36 38 24 24 16 12 12 12 24 32 43 50 43 52 52 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57
52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 39 39 43 43 52 57 57 57 52 52 47 57 57 57 57 57 45 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 59 59 57 57 57
59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 41 43 43 62 62 62 62 62 41 41 41 43 43 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 59 59 59 59 57 59 57 57
57 59 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 52 43 43 42 42 35 59 43 52 52 52 59 57 57 57 54 57 52 57 43 43 37 50
50 57 57 57 52 57 57 57 57 57 59 57 57 57 54 57 57 50 50 43 43 43 44 44 47 57 48 48 47 47 42 42 35 42 42 42 42 42 42 43 47 59 59 59 57 42 39 35 36 36
24 24 24 36 43 54 57 57 54 48 48 48 47 47 43 43 48 46 43 43 39 33 42 32 35 39 34 39 34 43 36 36 36 43 43 57 39 39 35 47 47 47 47 48 43 34 32 32 32 25
30 12 12 11 15 18 30 34 47 59 59 48 48 48 48 57 57 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 43 43 40 37 37 40 40 40 34 25 26 12
13 11 11 11 11 13 12 12 12 12 16 16 31 37 34 22 19 15 10 10 10 12 27 3 0 3 23 23 31 34 28 28 32 30 30 28 28 18 16 12 9 8 8 8 12 10 14 15 11 11
11 12 11 20 24 39 39 46 43 43 48 48 43 44 43 48 48 59 43 59 35 35 35 43 42 43 43 48 48 43 47 43 42 42 22 27 12 12 12 25 32 43 59 57 46 46 32 32 18 19
11 13 13 27 27 47 57 57 48 57 48 57 57 54 54 48 47 59 32 32 18 18 20 41 44 57 47 43 46 57 59 59 59 57 57 57 43 43 35 35 35 43 43 43 43 43 43 37 24 24
20 28 20 28 28 42 42 44 43 39 39 35 28 28 32 28 23 28 28 20 20 15 23 18 19 10 10 10 13 10 23 24 36 36 25 23 21 14 14 14 23 23 30 28 28 28 26 23 18 16
16 21 16 23 14 10 10 10 13 8 8 8 19 11 10 13 11 12 15 13 13 19 26 30 30 35 37 36 31 31 29 29 32 37 25 22 13 13 12 21 18 28 28 28 31 28 28 28 31 14
14 12 19 19 24 22 21 21 19 24 24 21 8 8 8 8 8 13 10 8 8 10 10 16 20 16 21 11 11 10 8 8 6 6 8 10 12 15 15 9 9 9 10 9 9 10 10 10 10 8
6 6 10 15 14 16 16 9 9 10 19 24 11 11 11 12 9 8 8 10 8 9 17 21 25 19 18 11 11 10 17 10 9 9 9 8 8 10 8 10 7 9 12 10 10 8 8 8 6 6
8 6 7 8 8 8 8 8 10 6 6 8 13 8 8 8 8 8 8 11 15 11 11 9 9 9 11 11 10 8 8 7 6 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 12 10 8 6 6 8
8 12 11 11 8 8 8 8 8 8 9 9 11 14 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 18 16 13 15 17 13 10 8 10 11 10 12 12 16 18 13 14 17 13 13 10 10
8 8 10 8 8 8 8 9 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 13 10 13 13
16 13 18 16 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 9 8 10 8 8 8 8 11 8 8 8 6 6 8 8 9 10 11 8 8 7 7 8 8 8 8 8 12 12 8 8 8
8 6 6 8 8 10 10 9 9 9 11 9 11 9 9 12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 12 11 10 8 6 6 8 8 12 13 9 9 9 9 10 10 10 9 9 9 9 10 10
8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 8 8 8 10 8 8 9 9 8 8 10 10 8 8 10 10 8 8 10 11 12 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 8 8 8
8 8 12 10 10 10 13 12 8 8 8 8 8 9 10 9 9 9 8 8 8 9 9 9 11 11 8 8 8 6 6 6 6 8 8 19 14 11 11 12 16 19 19 14 14 8 12 6 6 8
8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 11 9 9 9 12 11 12 8 8 8 8 9 8 9 8 8 7 7 8 8 12 9 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8
9 8 8 8 8 |