| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-175M20.T7 (MSMg01no175_m20.b1) | MSMg01-175M20.TJ (MSMg01no175_m20.g1) |
|---|
| ACC | AG370686 | AG370687 |
|---|
| length | 737 | 716 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 315 (47 - 361) | 287 (430 - 716) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no175_m20.b1 PHD_FILE: MSMg01no175_m20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:46:58 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no175_m20.g1 PHD_FILE: MSMg01no175_m20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:46:58 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | TTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCG
GAATTCTCTGTTTATCTCAGTACCCCATTTTTTTCATTGTGTTGTTTAGT
TTTTGGTGTCTAGCCTCTTGACTTCTGTATATATTTTAGATATTAGCCCT
CTGTCGGATGTAGGGTTGGTGAAATTCTTTTCCAAGTCTGTAGGTGGTCA
TTTCTTCCTATTGACGGTGTCCCTTGCCTTACAGAAGCTTTTTAGTTTCA
TGAGGTACCATTTATTAATTGTTGAGCTTAGTTCCTGAACCATTGATCTT
CTGTTCAGGAAGTTGTCTCCTATACCAATGTGTTCAAGGCTATTCTCCTC
TTTCTTTTTTTTTCTTCCCCCCCCCCCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTT
CTTTCTTTCTTGCCCCCAATCAAACATTCTTTCTTTCTTTCTTTTTCTTT
CTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTCCTTCCCTCCC
TGCCTCTTATTATTATTTAATTCTCCTTTTTAACTTCTTCTTTTTTTACT
TTATTATTATAAATTAACCTACTTTATTTATTTTCTTTTTTCATTTCTCT
TTTTTTTTCTCTCTTCCCTTTTTTTTTCCTTTCTTTCTTCTATTTATTCT
ACTTCATCCCTTCTTGTCTCACTCTTTATTTTTATCTCCTTTTTTCGCCT
CTTATTGTTTATTTCTCTCCTCACCCTCACTTTCCCG
| CCGAATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAACATGCAGCCATACTTCTATTT
ACTTATTTTTATTGCTATTGTTGCACATACTAATTATGCACATTAATGGC
ATTCACTATGACATTTTCATACATGGAAATAGATCATATACTGTCTATCA
ATTTTGTCTTCCCATCCTTCTAGATTAGACCCCCTTGGCCCTCTATCCTT
TTTTCTCTGGAACCTCACCGTCCTCCCATTTCCTACTTACTTCTAATTGC
TTTCAGAACCTTTTAAAAAAGCTTGCCACATGTGACCAAAAGATGATGTA
TTTGTATTTTTTTGTTTGCCCTCACCCCCCGTAACGTAATGTCCTCAAGT
TCTATTTTCCTGACACCGCCAAGAGATTCAACATCTTTATGGATGAATAG
TACTCTAGAATTTTAAAACAACTTTGCTTTTATTTTAAAAAATATAAAAT
AAAATAACTCAACAGACATTAGGCAGTGATGTTTTTGTAGTATGTTTTAA
TTATTTTTTGTCATAATGATGGTGCTAGATTTGTTAAATAAAATAAGCAA
GATATCAAAAGATAAAAATTCTATATTCTCTATCATGTGGGGACAAATTT
TTTTCTTAAGATATTTGAAAATTGAATAGCAATAACTAGGAACTAGGAGG
CAGTCAGGCAGCAGAG
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 11 12 12 14 11 15 11 15 30 40 37 29 27 24 22 15 19 9 9 9 19 19 39 43 48 35 28 28 28 28 35 39 43 39 39 39 43 43 44 50 37 37 23 24 26 33 41 68 68
47 47 47 47 50 51 68 68 68 68 68 57 57 57 57 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 51 68 68 68 68 59 59 57 50 53 50 50 53
57 57 59 53 53 53 53 57 57 53 53 50 50 50 59 59 59 59 27 23 10 10 10 21 21 37 37 37 39 50 59 59 59 59 59 57 57 50 50 50 53 57 53 53 53 59 57 57 57 57
68 68 68 68 68 42 42 41 42 41 50 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 57 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 57 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 48 48 41 34 24 31 30 28 30 28 34 34 47 47 57 57 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 50 50 50 50 53 53 57 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 34 22 14 11 13 13 11 21 14 13 13 13 13 14 16 16 20 22 24 22 17 17 11 11 11 12 21 30 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50
50 50 50 50 50 39 37 28 21 11 8 8 8 9 11 10 8 8 7 7 9 9 10 10 10 10 11 12 14 18 24 28 35 37 43 43 39 39 37 37 39 39 39 39 39 43 43 43 48 48
59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 59 59 54 54 48 59 59 57 57 48 48 48 48 48 48 57 48 48 48 48 48 48 48 48 48 47 59 46 41 41 24 24
9 9 9 12 8 8 8 8 8 8 8 13 18 10 10 10 13 10 9 8 8 6 6 8 8 11 12 10 10 11 11 11 11 12 10 13 10 8 8 8 8 9 10 19 13 13 9 11 11 12
15 13 13 15 8 10 10 10 8 8 8 10 8 8 8 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 12 12 10 7 6 6 8 8 8 9 12 19 15 11 11 11 11 11 10 10 10 13 16 10 10
10 10 10 18 24 24 8 8 8 8 8 8 11 15 12 10 10 10 11 23 19 21 17 11 11 12 9 9 9 9 8 8 10 10 10 10 10 10 21 11 10 8 8 8 8 8 10 8 8 9
9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 11 10 13 10 12 8 8 8 8 8 10 9 9 9 11 13 12 9 11 8 8 8 6
6 8 8 10 10 6 6 6 8 9 11 10 10 10 8 8 8 10 8 9 10 10 9 9 10 8 12 8 8 8 8 11 10 10 10 9 9 | Open.Hide. 8 8 11 8 10 13 9 9 9 8 7 9 9 9 16 19 37 37 47 37 39 50 50 53 53 57 57 57 57 57 53 53 50 43 43 39 43 43 39 42 28 33 33 42 32 43 43 44 57 54
51 50 50 50 50 50 54 54 54 54 48 48 32 33 40 40 46 46 59 68 68 42 48 42 42 50 50 51 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 38 27 14 18 14 16 16 38 38 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 68 59 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 41 41 32 30 30 32 37 43 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 41 41 23 23 24 33 25 24 18 18 13 12 12 21 12 13 12 9 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 11 15 30 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 23 23 11 11 11 12 11 11 12 15 11 10 8 8 8 8 8 12 17 26 27 37 37 37 50 59 59 59 59 57 48 48 48 48 48 48 57 57 48
59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 59 59 59 59 59 68 68
68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 35 35 35 50 50 57 57 57 57 57 57 59 57 59 59 59 59 59 59 54 54 54 59 59 59 54 57 57 57 57
57 59 59 59 68 68 68 59 59 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 47 43 43 43 47 57
57 57 57 57 57 48 48 48 48 54 48 48 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 48 48 41 41 41 39 37 37 34 37 37 39 39 39 39 40 47 47 48 48 48
59 59 59 47 41 41 34 36 23 28 14 24 24 39 39 42 50 50 37 37 37 37 37 37 41 41 44 59 59 47 44 43 43 34 34 39 39 36 36 35 31 31 37 43 30 30 30 35 35 35
39 35 36 37 37 36 31 27 32 28 28 32 28 28 28 22 |
|---|
