BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-176D08.T7 (MSMg01no176_d08.b1) | MSMg01-176D08.TJ (MSMg01no176_d08.g1) |
ACC | AG370971 | AG370972 |
length | 1,262 | 1,259 |
length of high quality (start - end) | 425 (29 - 453) | 661 (125 - 785) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_d08.b1 PHD_FILE: MSMg01no176_d08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:47:41 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_d08.g1 PHD_FILE: MSMg01no176_d08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:47:41 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNGGTGCTTTCGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATT
CTACTGCAATGCCTAAACTCTACTGAACTACATTCATTAAACTGCCCTCC
ACTCCTGACTCTCTTGGCACTGCACTTAAGTAGACTCACTTTCCTGTCTC
TTCTCTGAGAGTTGGGCTTTTCCTGTCTCTGATTTGTTCTGTGAGATCTT
TCTCTGATTTATCCCTTTGCCCATCAGATGTCACTTTCAAATATGGCTGC
TTCCTTCTACAAAATAAATTTACTTTCACTGTTTAGGATTAAAAATATGT
ACTAAGGGTGTGTCTGAAACCAGTAACAGGGATTAAATGTGTGACACCCC
ATCCAAGAGAAGCCATGTTGCTACATTAAAAGTCCTCTACAACTATTTAT
TTTGAAACAACAAAATAATTGTAATAATAAAAATACATGGAAACCTTGAA
TTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCTGTGTATGCAAACATTTTGAAGAAATTGT
TTTAAGTAAATTATTATGAATAAAGGAAAATTTGAGCCTATTATAACTGT
TCTACAGTAATAGCATATAGAGATTAATTACCAAAAGAAATAACAAAAAC
ATATTTATTAAAATTCAATAAAAACTCACATTGTCAAAACACTATCATTT
TAGTTTGTATGAAAAATAATAATACTTAGCAAATTAATACAAGGTTGACA
TTTCAAACATGATCCTTAGATATGATTATAATATTAAAATGAAAAAATAA
ATAAGTGGAATAATAATAACCTGAATAATAATAAACTGAATAATTCCTAT
GCTTGTGATCAAATTTTAAGCAGTATACTTTTGGATGAATATGAAGAAAA
CTATGAAGTTTTCTGTGAATTTAATAACATCACCTTTTATATTTTGAGGG
CTAAAATATGTATACAATTATTTACAGAGTTAAAAGCCAAAGAAGTTTTA
CACATCAAACATAAACCAGCAGATTGCTTTGTTGTATATTAAATGTTTAT
TTGAATTGCCTGAATAAAAAATTTGTTATTCATGCTTCCCATAGGTTGGG
GGATTTTTATCCAAGAAAATTGGCGGTTCCTTTCCCTGTAATCCACAAAT
TACATGTGGTTCCGTATCTTTTCCCCTCACAAATTTTTTAAAGTCCCAAA
AATTTTCAAGGGGTACTTTTTCCAACCGGGGGGGTTTGACTCTTTGCCTT
TGTGCCAAAATACTCCTCTCTGGTTATCCAAACACTTCTCTTATGAAAAA
TTATTCTTTCCC
| CCCCNTTATCAAGTGTAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTATAAGTCCCCTAGGACTTACCACAACAC
TTTATTTCACCCTTCAAAATACTTGACACTATTGGTATGACAGATTCTGG
ATGGCAAGAAATCAAGAAAACACAAACAAGATGGAAAAACAAACTTCAGG
ACATTGAAGCAGAAAAGGTTAAAAAAAAAGAATATGGACTTTCTTATGTA
TCCTGCAGCATTAAGAATTTCACTGTCTGTTCCACACTTTGTCTCTGGAT
CTTCTCCCATGGGTACTTTGATCCCTCTTCTAAGAAGGACCAAAGAATCC
ACACTGTGGTCTTCCTTCTTAAACCTCATATAGTCCGGGAATTGTAGGCT
GGTTATTCAGAACTTCTGGGCTAATATCCGCTTATCAGTGAGTGCATACC
ATGTGTGCTCTTTTGTGATTGGGTTACCTCACTCAGGTTGATAGTCTTTA
GGTTCATCCATTTGCCTAAGTTTTCTTTACTTTTTTTGTTTGTTTGTTTG
TTTGTTTTTTAATATTTTATTTTATTTTAATTAGGTATTTTCTTCATTTA
CATTTCCAAAGCTATCCCAAAAGCCCCCCATACCCTCCCCCATTCCCCTA
CCCACGCACTCCCACTTCTTGGCCCTGGTGTTCCCCTGTACTGAGGCATA
TAAAGTTTGCAAGACCAATGAGCCTCTCTTTCCACTGATGGCCAACTAGG
CTATCTTCTGCTACATATGCAGCTAGAGACATGAGCTCCGGGGCTACTGG
TTAGNTTATATTGTTGTTCCCCCTAAAGGGTTGCAAACCCCTTTAACTCC
TTGGGTACTTTCTCTAGCTCCTCCATTGGGGGCCCCGTGATCCATCCAAT
AGCTGACTGTGAGCATCCCCTTCTGTGTTTGCTAGGGCCCAGCACAGCCT
CGCCAGAGACAGCTATATCAGGGTCCTTTCCACAAAATTTTGCTAGCGTG
TGCAATGAAAGGGGTCCTCTTTTTGGAGGCTGATTTGGGAATGGATTCCC
CGTTATTAAAGCCCCCAAAAAGGTCCATCCTTTTCGCCCCGCTTCAAATC
TTTTCCCTGAAAACCCCTTCCCGGGGGCGTCGGTCCCCCATTCCTCTTTT
TTTTTAAATTTCAAATTCTTTTAAATACGATATTCTCCCCCAAAAAATCT
TTATTGGTACTCTCAAAAAATCCCCTATCCTCTCCCCTATTTTTCTTATC
CCTCCTTCC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 7 8 10 10 10 12 17 16 15 14 13 12 8 8 8 11 12 9 8 8 10 12 10 19 21 42 47 40 40 40 42 42 42 42 42 48 48 57 57 48 68 68 48 51
50 50 47 50 41 47 47 47 47 47 48 48 46 48 37 27 22 15 22 15 15 15 15 18 32 24 28 36 38 38 40 48 50 50 41 46 50 50 50 68 57 57 57 57 54 50 57 57 57 57
57 57 68 68 68 57 57 57 52 52 57 52 50 37 36 24 32 30 37 46 50 47 40 40 30 37 37 32 43 43 57 43 43 35 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 47 43 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 68 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 59 59 59 57 52 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 52
52 52 57 52 57 57 50 48 48 48 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 47 43 43 43 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 44 59 35 24 24
12 12 12 16 11 12 23 30 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 59 59 43 43 37 43 37 43 41 47 43 57 59 50 50 50 59 59 46 30 30 10 10
10 11 15 21 20 24 20 13 8 8 8 8 8 11 20 24 16 15 10 10 12 19 18 34 41 50 50 43 59 28 22 10 9 9 9 10 17 30 36 22 15 8 8 8 8 8 11 11 11 11
15 15 12 12 15 24 33 41 53 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 59 48 48 48 59 59 57 57 57 57 68 68 68 59 59 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 59 57 46 46 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 54 54 57 54 48 57 48 48 48 57 57 47 43 43 47 47 48 48 54
54 54 57 57 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 47 43 43 46 47 59 59 59 59 59 59 59 59 54 54 57 59 59 59 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 48 57 57
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 41 41 44 41 41 47 42 36 37 28 28 28 41 41 48 48 48 40 40 41 41 39 39 41 32 32 43 59 41 41 41 43 43 50 50 50 59 59 50
46 43 43 41 41 32 32 43 43 44 47 43 46 46 48 32 32 29 25 14 21 21 35 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 46 43 43 40 40
59 47 39 39 39 39 37 32 37 37 39 32 31 41 41 41 37 32 27 26 26 30 41 31 35 43 41 37 41 32 34 34 25 16 13 13 19 28 24 28 32 28 23 28 28 22 31 32 39 35
30 30 36 37 46 40 37 25 25 22 22 18 20 26 31 37 37 31 31 39 28 28 28 33 33 33 40 46 41 44 43 34 30 24 28 31 27 19 25 27 32 37 34 30 31 35 16 21 18 23
23 34 34 41 43 37 34 19 10 9 9 9 17 21 30 25 18 12 11 11 10 15 10 12 14 12 12 10 9 9 9 12 10 17 17 13 16 9 12 10 12 11 25 19 22 19 17 15 10 10
11 12 14 14 15 15 21 22 19 19 12 12 10 13 14 20 16 20 12 19 16 25 12 12 10 11 11 13 19 23 22 22 28 25 19 25 15 13 17 11 11 11 13 10 9 8 11 11 8 8
9 9 9 12 12 16 13 18 12 12 12 13 16 16 19 21 22 22 22 18 15 11 11 20 23 24 28 24 26 18 17 8 9 8 8 8 10 11 14 16 23 22 18 16 12 10 10 10 15 15
14 13 12 19 10 10 11 12 11 15 15 18 6 6 6 6 9 15 11 9 13 10 10 10 10 11 19 25 22 21 11 9 9 9 10 11 8 10 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8
10 11 10 10 10 29 15 9 9 6 8 8 9 9 10 13 21 20 20 20 15 10 10 10 10 10 9 12 10 12 12 26 21 21 18 14 15 14 13 13 8 8 6 6 6 6 8 10 10 9
8 8 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 12 12 11 11 8 8 8 10 12 12 12 17 17 17 14 14 6 7 6 6 8 7 11 10 12 13 16
14 12 23 23 7 7 6 6 6 7 12 8 8 6 6 8 6 9 11 8 6 6 6 6 7 8 15 11 11 13 23 19 18 12 13 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 9 14 9
11 11 11 13 11 11 11 10 10 10 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 13 6 6 6 6 6 7 10 9 10 11 21 18 17 10 9 9 9 9 9 13 13 8 7 7 8 8 9 9
8 8 8 7 7 7 6 10 8 9 9 9 | Open.Hide. 6 6 7 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 15 15 6 6 6 10 19 12 13 8 8 9 3 0 3 17 19 17 8 8 13 19 21 28 22 22 24 28 30 35 36 37 37
37 37 34 34 36 38 57 53 53 50 50 47 59 42 28 21 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 12 11 10 10 11 15 11 19 25 33 33 33 33 33 53 50 59 57 57 57 53 53 53
36 33 33 50 50 37 37 25 25 11 14 16 24 15 14 14 18 25 22 15 15 15 15 16 17 23 25 35 36 38 38 38 42 37 43 43 42 43 47 57 57 48 48 48 48 48 42 42 42 48
48 48 48 48 48 48 48 54 54 59 57 57 54 54 54 54 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 48 48 48 48 57 57 48 48 48 57 57 57 44 43 37 43 43
50 50 57 57 57 57 68 68 59 59 57 57 57 59 52 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 54 54 57 57 57 68 68 57 59 57 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 52 52 52 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 54 54
54 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 44 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 43 43 46 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57
57 57 54 48 59 48 57 54 54 47 57 57 57 57 59 59 59 54 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 59 59 57 57 48 48 57 57 57 48 48 48 57 48 59 59 59 59 59 59 59 26
25 11 11 10 11 12 20 12 11 12 16 30 41 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 41 36 36 43 43 54 54 59 59 68 59 59 59 57
57 57 57 54 44 44 37 41 35 41 42 59 44 42 30 30 30 37 37 36 42 33 42 42 59 59 59 59 59 54 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 50 48 44 57 57 57 52
57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 59 57 59 57 57 59 57 52 52 52 57 52
52 57 59 57 59 59 59 59 68 59 59 57 52 52 57 59 59 59 59 57 52 52 52 57 57 57 59 59 59 57 57 59 59 57 57 57 52 57 57 59 59 68 59 59 68 59 59 59 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 52 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 54 57 57 57 59 59 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 54 54 59 59 59 59 57 57 54 57 57 57 59 59 57 57 57 47 47 47 43 42 42 44 44 54 54 54 54 57
57 43 43 43 40 43 48 57 57 57 57 42 42 36 39 32 36 39 33 33 17 17 14 28 28 47 43 43 43 44 34 43 36 36 33 33 33 32 30 29 25 29 30 27 27 30 34 28 32 34
24 19 29 29 29 29 37 35 35 39 39 40 43 43 47 47 43 43 37 32 37 37 39 47 39 43 37 37 36 37 33 22 25 18 24 23 25 23 18 16 12 21 24 20 26 30 37 30 25 28
32 23 18 3 0 3 23 19 20 10 10 10 18 12 13 14 9 9 8 8 8 8 8 11 9 9 9 10 13 24 24 13 13 8 8 8 11 11 18 34 37 23 19 15 11 8 8 9 18 19
22 22 17 14 11 11 11 23 23 30 21 13 12 10 10 10 10 10 9 11 11 14 12 15 23 20 18 20 18 32 23 23 12 9 8 8 8 13 12 13 12 10 9 10 12 25 15 11 8 8
8 8 10 10 15 15 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 7 7 9 12 19 20 22 24 20 29 26 22 22 11 9 9 10 9 8 8 8 8 19 13 8 8 8 8 8 8 10 8 8 12
8 8 8 8 8 9 10 10 11 12 13 12 9 9 9 8 8 9 10 12 12 14 13 9 9 9 12 14 8 9 9 10 12 14 15 15 13 10 12 11 17 17 11 11 11 9 7 7 8 8
8 9 9 10 10 13 13 10 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 9 8 8 9 9 10 10 10 10 10 10 10 9 6 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 9 10 15
11 11 12 20 18 15 15 9 9 9 9 9 12 12 12 11 11 12 11 11 8 8 6 8 12 11 10 12 12 14 14 19 9 10 9 9 9 10 9 9 9 9 9 9 10 10 6 8 6 6
8 10 13 14 14 16 12 12 11 11 12 13 12 12 18 17 10 8 8 8 12 14 16 16 15 15 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 11 7 6 6 6 7 14 18
30 25 17 16 17 14 14 12 11 10 10 9 10 9 12 12 11 11 11 15 13 8 8 8 6 7 10 6 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 10 6 6 8 10 13 10 10 8 7 6
8 8 11 10 11 8 8 8 8 6 6 6 7 8 9 10 12 26 28 18 18 9 8 8 11 10 12 10 8 6 6 7 7 13 10 8 8 15 8 8 10 10 7 7 6 8 8 6 6 8
10 6 7 7 8 8 10 10 10 |