BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-182D02.T7 (MSMg01no182_d02.b1) | MSMg01-182D02.TJ (MSMg01no182_d02.g1) |
ACC | AG375145 | AG375146 |
length | 713 | 800 |
length of high quality (start - end) | 462 (75 - 536) | 159 (68 - 226) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no182_d02.b1 PHD_FILE: MSMg01no182_d02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:55:52 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no182_d02.g1 PHD_FILE: MSMg01no182_d02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:55:52 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CAATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATTCATTCTGCCTAACTACACACTTG
AACGTGTTAGCCTACATGTCCCCACACCCCACACTACCCTTTCACCCCGT
GGATTTGATTTGTTTTCATTATATTTTGTGTGTTCCCTGAGTATGTGTGT
GGTGTGCATGTGTGTGTGTATACATGCTCATTGGTATGTGGCATATATAG
GTGTGTGTGGATAGAGGGCAGAAGTTAAGTTTCTATCTTCGTTGATCTTC
TGGTATACTGAGGCACGGTTTCTCACTTGACCCAAGGGATGCCCCTGAGG
CATCTCCTCAGCTTTTGACTTGTTTTTAGATTCTATGTGCAGCCAGACAG
TCACTGTGTAGTGATGGAACGCTGTCTAGCTGTGGTCCTGTAAGATGAAG
TTGACTGGAAAGCATTACAGGTAGCCTTATACTGGCTATGTGACCTCCTG
TGAGTCTTGTGTTTACCCTGTTTCTTGTATTGAGAGGCCACATTGTGACC
TACATCATCTACATTTGCGTGAAGGACACTTTATGGTGTCTTCACAACTG
TGAAAAGCCTAACATTCTTGTTTTTACAATGCACTCTTACCTTTTATGTA
CCACGCCGACTGTTATTGTTCCATTGTCCACCCTTTCTTTTTCTCCCACT
CTTCTGCCTCTCC
| TCAATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCG
GAATTCAAATATCACTTTTTGCAGATGATATGATAGTATATATAAGTGAC
CCTAAAAATTCCACCAGAGAACTCCTAAACCTGATGAACAGCTTCGGTGA
AGTAGCTGGATATAAAATTAACTCAAACAAGTCAATGGCCTTTCTCTACA
CAAAGAATAAACAGGCTGAGAAAGNAAACTTAAGTGGTAAATACATACAT
CTCCCTTTCCTCAATAGGCCACCAATAATATTAAAATTATCCTTTCCTNC
GGAAAGAAAAACGACATGTTCTTCGACAATACATTCCGTGTTTATAATAT
TTATATAAATCTATGAGTAAAATACCCGCACACCCCCCAAATTATTACTG
CCCTACCAGTATAAATACATTAACACCTTTCCTAAAAAATTTTACCTTCT
TTTTATCTAACCCATGCTTCCATAATAAAATATTATATCTCCATTATATC
ATTACCTCCTAACATCAACCCACAAATTTATACGCCCCGTCCACCAAACC
AACCCAACAAAACAACTGAACTACCAAGATACATACTATCCCCCTATATA
TATCACGCCCCCCATAACTATTACTTCCCTTCTTCAATTTTTCTCCCCCA
CTTATTTATATCTCTTCTATTTTCGTCACCGCCCTTATTATATTTCATAA
AAACCACGTATCTTCATACCTATTTTACTTTAAACCTAAACCCCAACCCC
CCCCCTCTCATATATATCCACTCTTCAGTTTCTTTTTTCTCATGTAAAAT
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 9 9 9 9 17 17 33 33 33 48 47 50 57 50 50 57 57 53 53 41 41 37 37 37 37 25 23 8 6 6 8 8 6 9 9 17 18 18 30 26 34 41 41 33 36 36
36 36 36 48 48 53 50 30 33 13 13 17 10 13 10 12 12 18 15 23 29 30 33 33 33 31 36 36 36 36 36 57 57 57 57 57 59 59 57 57 48 48 48 48 53 50 50 43 57 57
68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 57 57 57 57 46 57 47 54 48 57 48 48 48 48 57 57 57 57 57 68 68 68 57 59 59 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
46 46 46 46 46 48 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59
59 59 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 62 62 62 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 52 52 52 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 59
68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 52 52 52 57 52 57 57 57 57 44 44 43 43 43 50 50 50 57 50 50 57 50 44 44 44 42 48 48 48 48 44 48 57 57 57
47 47 47 57 57 59 57 57 44 43 37 37 43 59 59 57 57 54 54 54 57 59 59 59 54 42 42 30 30 30 42 43 59 59 59 47 43 43 39 42 24 24 20 20 23 32 32 43 33 33
25 28 28 32 37 37 36 31 34 31 36 39 47 34 30 18 8 8 6 6 10 11 22 32 32 30 31 23 20 23 23 41 41 43 43 40 43 47 59 48 43 43 36 36 36 43 37 37 23 23
23 23 34 29 37 30 30 18 18 22 26 26 26 19 19 19 19 28 31 31 28 19 18 11 11 11 19 19 34 34 40 37 37 30 30 30 39 39 39 39 35 35 39 39 43 48 59 37 37 30
28 22 20 11 11 11 23 16 23 23 34 34 39 43 43 43 43 43 59 59 59 59 59 59 39 40 35 35 30 30 24 28 20 31 18 28 20 20 22 23 11 11 12 25 21 24 28 23 25 25
30 28 23 15 15 13 12 15 19 18 17 11 11 11 10 15 10 10 10 15 19 18 17 17 19 26 19 19 11 11 11 16 18 18 11 11 11 11 11 15 10 14 18 12 12 9 9 10 10 12
16 12 12 12 15 12 19 11 12 11 11 10 10 10 9 12 11 15 22 22 19 16 16 10 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 11 11 15 19 15 12 12 12 19 22 9 9 9 8 8 8
8 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 6 11 8 10 10 15 10 12 9 8 8 8 8 11 12 17 25 25 24 12 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 11 13
16 10 9 9 8 8 8 10 10 8 9 10 10 | Open.Hide. 8 10 8 8 8 8 13 9 29 40 31 23 23 19 14 14 28 32 30 32 28 32 39 40 41 59 30 29 31 30 20 15 18 8 8 8 8 10 10 28 28 28 29 31 31 31 36 59 57 57
36 36 21 21 10 8 11 19 21 15 15 11 11 11 11 11 12 24 22 26 26 32 32 37 37 36 36 36 36 36 38 53 50 50 50 50 57 57 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 57 59 59 57 54 54 54 68 50 50 50 42 29 24 19 15 15 12 11 12 12 18 15 34 34 59 59 59 57 48 47 47 50 50 50 57 57 54 54 54 57 57 57 57 46 43 43 43 46
44 48 48 43 42 35 42 39 57 47 47 50 47 47 47 47 47 47 47 47 48 57 57 57 48 48 48 57 48 54 48 59 54 54 54 46 46 43 43 46 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57
53 50 50 48 47 47 47 47 47 47 48 48 48 48 48 48 39 41 36 36 36 23 10 3 0 3 9 11 10 9 9 8 8 8 8 8 11 11 9 9 9 9 12 13 6 6 8 10 6 6
6 6 8 8 9 11 11 11 16 13 14 17 15 23 19 14 9 9 9 10 14 17 16 11 10 15 10 8 8 8 10 8 8 9 9 13 10 9 9 9 9 14 10 10 9 8 8 3 0 3
8 8 8 7 8 6 6 8 10 10 8 8 6 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 10 10 11 12 12 9 8 8 8 8 8 10 8
8 9 10 10 10 10 13 9 10 11 11 8 8 8 6 6 8 8 8 12 10 10 10 9 6 8 8 8 8 8 10 9 9 9 8 8 8 6 6 8 8 9 11 11 12 8 8 8 8 8
8 8 8 11 9 13 11 9 9 9 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 11 10 9 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 11 11 11 9 9 9 9
9 11 10 10 6 6 6 7 8 8 11 10 10 10 10 9 9 10 10 8 9 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 10 8 8 10 12 12 10 10 10 12 10 10 9 17 10 10 10 12
16 13 12 10 8 8 8 13 15 15 11 11 12 10 9 9 8 8 8 8 6 7 6 8 8 8 8 8 8 12 11 11 10 10 10 18 18 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9
9 10 10 11 10 14 10 10 10 10 8 8 10 10 7 6 8 8 9 10 8 8 8 8 10 8 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 9 9 9 10 13 10 10 9 9 9 9 9
8 9 8 10 10 8 8 8 10 16 10 12 11 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 19 15 14 16 15 11 9 8 8 8 12 12 10 11 14 10 10 12 16 16 10 10 6
6 8 8 9 13 8 8 6 6 10 8 10 13 15 12 15 13 13 12 12 13 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 16 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
10 9 9 10 10 10 10 8 8 8 9 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 12 11 12 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 12 13 12 12 16 12 12 8 8 8 8 10 8 9 9 10
10 9 10 12 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 8 11 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 8 14 9 13 10 8 8 9 9 10 10 12 12 12
|