BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-188L03.T7 (MSMg01no188_l03.b1) | MSMg01-188L03.TJ (MSMg01no188_l03.g1) |
ACC | AG379631 | AG379632 |
length | 740 | 729 |
length of high quality (start - end) | 674 (62 - 735) | 239 (130 - 368) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no188_l03.b1 PHD_FILE: MSMg01no188_l03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:04:26 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no188_l03.g1 PHD_FILE: MSMg01no188_l03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:04:26 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TTCCCCCNNNNAAAATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXCGCGGAATTCTCAACTGAGGAATTCCAAATGACTGAGAA
GCACCTAAAGTAATGTTCAAAATCAACAGGGAATGCCGGGTGGTGGTGGC
ACATGCCTTTAATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGACAGGCGGATTTCTGA
GTTCAAGGCCAGCCTGCTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCACGACTA
TACAGAAAAACACTGTCTCAAAAAAACAAAAACAAAATAATAATAATAAT
TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAACAGGGAAATACAAATC
AAAACAAGCCTGAGATTCCACCTCATATCAGTCATAATGGCTAACATGAA
AAACTCAGGTGACAGCAGGTTCTGGCAAGGTTGTGGAAAAAGAGGAACAC
TCCTCAGTTGCTGATAGGATTGCAAGCTGGTACAACCACTCTGGAAATCA
GTTTGGTGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCTCAGGATCCAAC
AATACCACTCCTGGGCATATACCCAGAAGATGCTCCATCATGTAATAAGG
ACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGC
TGGAAAGTACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTG
GTGCATTTACACAATGGAGTATTACCCAGCTATTAAAAAG
| TCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTGAGATGGAACTGGTAAATTAC
TTGACTGCTGCGAGTTTTCTTCATACGCCCCACATTGTAGAACGGTGCAC
ACAGGCGCTGTGGAAGTTTATAAAGCCAAAACAACCAATGGATAGTAAAG
AGGGATCTGAACCACAGAGCGCTTCTCCCCAGTCGAAAGAACAGCAGGGA
GATGCCAGAGGCTCTCCAAAGCAGGACTTACCTTGTATTCATCCATCTGA
AGACAGTATGGATATGGAGGACAGTGATATTCAGATTGTTAAGGTAGAAT
CTATTGGGGATGTATCTTATGATAGAAGCCAAACAGATGAGAACCAGTAC
ATTTCTTCTGAACCCACTGCTTTGCACTCATCAGAGCCCCAGCACTCCCT
GATAAACTCAACTGTGGAAAACAGAGTTAATGAACTAGACCAGAGCCATC
TCCACAATTACGCCCTCTCTTACACAGGCAATGATGACATCATCATGACC
TCTAAAGATGTCTTTTGGGCCTAATATTCGAGGGGTAGACAAAGGTTTAT
AGTGTCATCACCAGTGCCCAAAGTGTACCAGGGTATTCCGTCACCTGAAG
AACTAGGCCCATCATTTAAAAATGCACAACATGTTTATGTGCCTACTCTG
CGGCAAATATTTTCCACCATAAAGTGTAA
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 7 7 7 3 0 0 0 0 3 6 6 6 13 17 17 12 15 11 9 9 10 19 31 44 43 30 24 24 28 30 30 26 24 30 32 33 41 59 33 33 33 33 36 36 57 57 57
50 50 50 50 50 50 42 42 24 30 30 42 43 57 57 40 40 40 40 41 47 54 54 54 54 50 68 68 68 68 48 48 43 43 50 50 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 51 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 50 50 46 46 46 46 50 50 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 57 57 57
68 68 68 68 68 57 57 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 32 32 14 20 13 13 13 29 29 38 38 23 24 24 10 10 11 24 24 23 26
35 35 43 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57
57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 50 50 39 59 47 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 53 50
68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 53 53 53 50 50 50 57 57 57 43 43 43 57 59 59 59 59 48 48 48 59 47 47 47 47 44 44 44 37 37
41 41 41 41 46 46 43 59 37 47 39 47 47 47 57 57 48 48 48 48 40 40 40 39 39 41 41 31 31 39 39 39 39 42 41 41 48 48 48 48 43 43 43 43 43 48 41 41 41 39
39 37 37 32 32 37 37 37 37 37 37 37 36 36 37 39 41 37 37 41 43 59 39 32 35 35 37 37 39 39 32 29 29 37 32 32 37 34 34 28 28 28 22 22 28 27 30 30 30 25
25 32 37 37 39 37 41 37 37 30 30 30 28 22 29 26 28 32 32 41 41 41 23 21 18 18 15 18 30 37 32 37 16 9 9 9 9 9 18 9 | Open.Hide. 6 6 7 7 10 9 9 8 8 7 7 9 9 13 13 31 31 43 39 39 41 41 39 39 39 39 39 44 44 39 41 42 39 37 32 37 33 28 29 28 28 28 36 29 47 42 47 47 43 42
48 42 42 48 48 68 68 68 68 68 57 42 36 36 36 41 41 37 36 37 24 42 41 41 43 50 59 68 57 57 50 50 41 42 42 42 48 50 50 50 53 57 68 50 50 53 53 53 50 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 53 53 50 50 50 59 59 47 30 25 16 10 10 10 9 10 10 10 10 15 23 34 37 37 50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57
57 57 53 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 50 50 50 51 50 68 68 68 68 68 68
68 68 50 50 47 50 50 50 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 57 57
57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 54 54 54 48 48 44 44 36 40 37 43 39 43 43 43 43 43 48 59 59 54 54 48 48 57 59 59 59 59 57 59 59
57 57 57 59 59 59 59 48 48 48 43 39 34 22 15 9 9 9 9 10 11 11 16 12 12 14 13 13 12 12 12 12 12 13 13 15 21 25 30 37 37 30 37 37 43 39 39 30 30 35
37 37 59 44 57 57 57 57 57 43 43 43 43 43 48 48 48 59 59 43 43 43 39 37 47 37 39 37 37 41 34 28 17 13 13 19 19 31 32 30 34 34 43 47 47 43 48 48 48 46
46 43 43 43 43 48 43 32 23 14 14 14 23 30 43 39 39 39 39 40 40 43 43 43 37 37 37 37 37 37 37 33 28 25 28 28 28 28 30 37 37 39 37 28 27 25 24 29 33 37
37 37 28 31 28 28 28 37 37 47 43 48 48 47 47 43 47 42 33 33 28 22 17 26 28 23 23 28 22 17 17 17 13 18 21 28 20 16 16 9 9 9 13 25 11 15 15 23 30 39
39 33 33 24 24 25 25 28 28 28 30 30 33 47 33 34 30 28 28 9 9 10 12 12 14 24 28 25 18 11 10 10 8 8 8 10 9 10 10 12 16 17 19 19 14 17 10 13 8 8
8 10 13 12 8 8 8 8 10 10 13 19 20 15 18 13 18 18 22 22 19 16 12 11 11 13 16 14 14 14 14 17 21 14 14 17 17 15 25 32 33 35 36 28 21 24 13 12 10 8
10 18 17 10 8 8 8 10 14 11 9 9 10 8 8 8 8 9 10 15 15 15 21 14 18 19 13 13 10 10 9 9 15 13 9 9 9 10 8 8 10 10 12 9 9 10 19 19 18 11
10 10 10 10 10 9 8 8 8 10 17 22 15 13 6 6 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 |