BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-189L08.T7 (MSMg01no189_l08.b1) | MSMg01-189L08.TJ (MSMg01no189_l08.g1) |
ACC | AG380300 | AG380301 |
length | 777 | 748 |
length of high quality (start - end) | 65 (6 - 70) | 287 (88 - 374) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no189_l08.b1 PHD_FILE: MSMg01no189_l08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:05:45 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no189_l08.g1 PHD_FILE: MSMg01no189_l08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:05:45 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTGAGAGGTGGGGTGGATAGGATC
TATGTATATGTTATGGATTCGCCATACATCTTTCACCTTTGTCTCAAACG
CTAACCACCGGTATAATCCTTGCTTCCCCATTCGCTCGCATTTCTCTCAC
GATACGTCCTATTCCCTATGTCATCTACTTCTTTACAGCTAATCTCCTAT
TTACTAGACATAATCCTCATTTATCCCTCCTACGCTATCCACTCCGCATC
TTATATGCCCCACCAATGAACCGACCCAAAGTTTACTCGTTCTTACATAG
ATCTATATGCTCCCGCCCACAAAAGTACCATTTTTTTTCTCCCCCCCCCC
CCCCCACCTTAATACAGCGTTCCACTCCTTTACTTCGCCCTCATCCCTTT
CAATTAAAAATAATTAATTCGGTCGGTCGTCCGTGCTTACCATTATTTAC
CCATGGTGTTTGCCCTCCTTCCAATACTTCCTCATCTCGATTCCTTTGCT
TTAACTTTGTTGTGTCCTGACCTATTAATTTTCGAGCCACTTTATTATTT
TTACCGACATTGATGCTATTTTTACACCCCCTGTTTTCGTCGTAACCGAC
TTTTTCTTACGTGCATAACCATTATATTCTAGTGACTATACTAACACACC
ATAATAATAAATTCCTTATCACTTTTGTCCACAACATAATAACATTATTA
AACATTTGTAAACTATCCAAATTTTGTAAAAGTAATCTTCGTGTAAACAC
CTTGTTTTTATCTTTTTTATACAATAT
| CCCCAAATACTCTATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTGCATAGCATGA
ACCACTGGGTATTCAAATTTCACTATGAAAACTCATTCTTTCAGTTGTTG
GGGCTTTGCTGAAAGACTGGAGTTTTGTTCTTCAAAAAGTTGGCAAACCC
TAAAGATATGTTTCTCTGTACAAATTGGTCCCTGAAGTAACAATTCATGG
ATTTGTTCTTTCCTTCCTTGTGAAGCTCAGACAAGGCCTAAAGCTCTTAA
ATGTTTTCTTTGCACTGCCTATCTACTACAGAATTTGGCAACAGTAACTT
GATGAGAGATGTCGGTGGAGCGTGTTTTTTCCCCCCGCCCTGCAGAACCC
TGAAGCCATTTAGACAACACACTTGTGCACAAGCTGCCTCACCCCCTGCT
CCTTCTACTGAGCTCTAAAGCCCTTCCCAGACATGAATTCAGCCACAGTG
TTCCTAACTACTTCACTGTCCTGTGGCCATCTGCCATTCTGCCATTTGAA
CGTGCAGTATACCTACTGTGGGAGGAAGTGAGTGGGGATCCTGTGTACAA
GGATTTTGACAAAGGTGGTTTTAATATGTAGTGCACTTGGAATGAGCTTC
TGTACACAGATATGAATCAGGAAAGCTATTGGGTTCATTGACTGTGCATT
CTCTGAAGCAATAAAGAGGTGTAAGTGGACTAGAACGCAGAGACCCAG
|
quality values | Open.Hide. 6 8 6 6 13 15 20 20 33 40 40 43 33 33 33 28 28 30 39 47 47 37 36 36 36 36 37 47 47 42 48 42 43 33 33 28 33 37 32 32 32 42 42 48 42 47 48 43 43 36
36 32 37 28 28 37 43 30 30 17 17 17 24 28 28 37 19 18 11 13 10 10 10 13 13 12 10 6 6 8 8 10 9 8 8 8 8 10 13 10 8 8 8 8 9 9 9 12 12 12
12 13 10 10 10 10 8 8 6 6 6 6 8 11 8 8 8 8 8 8 15 10 14 14 14 13 11 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8 10 9 10 10 9 8 8 8
8 8 8 7 7 8 10 10 10 9 12 9 10 10 10 10 16 15 11 11 8 10 8 8 8 8 8 8 8 12 8 12 8 8 8 8 8 8 10 12 12 11 11 11 11 11 10 10 10 10
10 10 11 12 11 11 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 21 28 12 12 12 12 12 12 12 21 12 11 11 13 14 16 16 24 18 14 12 7 6 8 6 10 10 8 8 8 8
8 8 9 12 13 12 15 15 12 12 11 11 11 9 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 11 11 11 11 12 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 10 9 9 8 8 8 8 9 9
9 9 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 12 12 12 11 8 8 6 6 8 8 8 8 9 10 10 10 19 22 23 11 11 11 10 13 18 20 18 21 13 13 13 13
18 19 21 21 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 9 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 8 8 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8
8 8 8 8 9 9 13 10 10 8 6 6 6 6 8 8 10 10 12 9 9 10 10 7 7 8 8 15 10 10 9 9 9 9 9 9 10 8 8 9 9 8 10 10 12 12 9 8 10 8
8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 11 9 8 8 8 8 8 9 9 8 10 6 6 8 6 9 9 9 9 14 15 15 11 11 11 9 8 10 8 8 8 10 12 13 10 13 10 10 10 11
11 8 8 10 8 8 8 12 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 11 8 10 6 6 8 8 10 10 10 13 13 10 10 10
10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 18 15 10 10 10 8 8 8 8 8 6 11 8 8 8 6 8 15 13 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 6 8 6 6
8 8 10 10 9 9 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 8 8 10 9 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 9 10 14 9
11 10 10 10 17 13 10 9 9 9 13 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 15 14 15 15 11 11 11 11 10 10 10 10 10 12 9 9 6 8 6 6 8 8 10 10 8 8
8 8 8 6 6 7 6 8 8 9 9 10 8 8 7 7 6 6 6 8 6 6 10 11 6 6 8 8 12 12 11 11 8 10 8 8 8 8 16 17 19 10 9 8 8 8 8 8 8 10
9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 9 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 9 9 9 9 7 7 6 8 9 11 9 9 9 9 12 10 10 10 10 12 13 26 31 32 37 37 37 37 37 41 50 50 53 53 53 53 53 53 57 57 48 43 36 25 25 25 28 28 28 32
22 28 28 42 32 40 25 25 29 43 42 50 50 50 50 50 59 59 47 57 57 57 29 36 36 36 41 41 44 57 57 48 50 50 50 50 50 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
50 50 50 50 50 50 59 59 57 57 57 50 50 50 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68
68 62 62 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 68 59 59 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57
57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 59 68 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59
57 59 57 59 59 68 68 68 68 68 59 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 59 59 59 47 43 43 43 43 59 59 59 68 59 59 59 59 57 57
57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 50 57 57 48 48 37 28 23 15 12 12 11 12 12 15 15 20 21 30 18 20 11 9 10 8 8 8 8 8 8 8 9 12 12 26 30 41 50 50
50 53 53 53 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 48 48 37 31 24 18 15 13 14 18 18 17 18 18 23 28 32 44 44 57 59
59 59 59 57 57 57 57 54 48 57 48 48 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57
59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 57 59 59 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 57 59 59 59 57 54 54 54 54 54 57 59 68 59 59 57 54 48 59 59 43 43 39 42 43 48 59 48 48 48 48 57 57 57 48
47 47 47 47 47 50 48 44 37 36 36 37 37 59 41 41 41 41 36 37 39 39 39 41 40 41 40 37 37 39 39 36 35 39 39 48 43 44 59 57 57 57 59 59 57 57 43 43 43 57
37 37 23 23 20 31 32 40 40 47 47 47 59 44 37 31 30 26 17 15 27 26 30 37 37 39 37 37 32 29 18 22 28 23 29 32 41 47 41 41 41 37 37 30 30 30 37 37 47 36
47 41 41 41 34 26 25 30 28 31 25 35 37 39 35 32 32 29 28 30 30 32 37 28 34 28 24 24 33 23 22 11 11 11 21 18 19 19 11 11 9 12 8 9 9 10 10 9 |