BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-211I24.T7 (MSMg01no211_i24.b1) | MSMg01-211I24.TJ (MSMg01no211_i24.g1) |
ACC | AG393233 | AG393234 |
length | 1,207 | 1,236 |
length of high quality (start - end) | 416 (29 - 444) | 358 (73 - 430) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no211_i24.b1 PHD_FILE: MSMg01no211_i24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:36:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no211_i24.g1 PHD_FILE: MSMg01no211_i24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:36:50 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNCCCTCACTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATT
CCAGAGCAGCCAAAAGAATCAGAGACATACCAGTGTTATAAATCCCACAA
AACCATGAAGCTAATAGCCATAATGTACTCGTAGAACCTTGCAGGTCCCA
TGTCTGCTGCCTCAGTCCTTGTTAATCCATATGAGCAATTCTTAGTTGAT
TTGGTGAGTCATGCTCTCTTGGTGTCTCCCATTCTGTGACTCCTACAATC
TTTTCTTCCCTTCTTCCTTGGTGTTCTCTGATTTCCGAGGGGAGAGAACT
AATAAAGACCACCAATTTAGATCCCCTTTCTAGATATTTTTTGGCTCTGC
TTCTCTGTACTGGTGGCCAGAAGAAGCGTCTCTGATAAAGACTGGATTTA
GCACTGATCTATGAGTACTGTAAAATATCATTAAGAATTACTTCTTTTTT
TTGTCCCCCCCCCCGAACAGNAGTGCTTTTTTCTTCAAAAATTGTCTCTG
AACTATTCAGTCTCCAGTTTCCGGTTAATGGGTGAATTTTTTATTCACTG
TTGGAGGTTGTTGTGTAGCTTATTCTGCACACTGCTTGCAAACTATCCCA
TTAAAGCTCTATCAGATTTATTAAATTACTGTCATTGAAGAATTTAAATC
CAGGAGAGTATGCTAAACCTGTCTGAGCTGTTTGAACTAACTCTGCATGT
TGTAGCTATGTGATTGGCACATATTCTCAAACTTCACATCATGATGACCA
CATATCCAGTATGTTAGTCAATGTGGACTTGTGCAGGAGGTGGTAAATCA
TAGGGAAAGATTGCATGGCTGTGAAGAGCAAAGAAAAGGGTAATTGGAAA
ACATTCTGGGATGTCCATGGCCAAATCTCTTTGACCATGTCTCATCTTGT
ATTAAATAAAGGGTAGAGGGCTTCATGTAGCACCCATAACCTACCCAGCA
GAGACTAAAATCCTGTATCACTAATCCATAGGAACCATTCCACTTTTACA
TAGCCAAAAGTACTGGATCCAGCCAAATGGATCCCCACCCCTACCTGTTT
AATCCCCCAAATGTTTCAGGCAAACTTGGCAAGGTGCCCCAAATAAATAA
ATCCTTTGAATCTCTTTGAAAAAAGCCCCCCAATAAAATCTCTTTGACCG
GGGTTGATTTTATAAATCAGGTCTGAAAATGTTCCTTTTATCACCCACGC
AACTAAA
| NNTTCTAGATGCGAGNCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTGAGAGAATGGGAAAATTAAATCAAA
GAATCAAAATTTCATTTCAGTATTCCAAAAAATTGTACGTTTGTGTATAA
TTGCTAATTGGATTTTTGTAATTAGGTAACTGGGTTATTTTTACCTAATT
ACATTTTCATGTATTTTACAATTTCTATGTTATAAAAATTAACAATATGA
TTTTAATATGATATTAAATAAAACTAGCAGGTAATAAAATATATAAACAC
ATTAAATTCCATTAACTATTAATCCCACCTCTTCTAGGGGAACATGAAAA
GCAGCATCATTTTACCTGAAACAACATAACAAGTGACACTAAGTGAATTT
TTCAAGGCAAGAGTGAAAAGTTTCTGTATAAGACCATGGGGCACCTTATT
TTTTTTCCCACCCCCCAAGGAATCTCCGATCCCTTTAAAAAAAGAAGGGG
TCNGAATACCCCTCCATTGCTTATGGAAAATCAAACTGGTATAACCACTT
TGGTAATCAATTTGGTGGTTTCTCAAAAAACTGAAAATAGTTTTACCCCC
AAACCCAGCTATACTACTCCTGGAAATATACCCAAAAAATGCCCCAATTA
TATCACAAGATCCTCAACTATGCTCAAAGCAGCTATTTTCGTAATAGCCA
GAAACAGGAAACAACCTAGATGTCCCTCACCTAAAGAACTGATTAACAAA
AACAGGCCCATCTATACAATGGAATACTACTCATCATTTAAAACAAGAGG
CATGAAATTTTGCAGGCAATTGGATTGAATTATAAAATTATTTATCCTGA
ATGAAGTACCTCAAAAGGAAAAAGATACCCTGCCCATGTACTCACATATA
ATTCGGCATTAGCCTTGAAAAACGGGATATTCCTATTACAAGCTACAGAA
CCAAAGAAAATTATGAAATAAGGAAAACCCCAGGTAATTCCCCTTCAAAA
GGGAAAACAATAAGATTCTTTTGAAGCCATACCGAAAACACATAATTTAA
ATGGCCAAAAGTAATTGAAAAAGGGCAACAAGGTTATGAAAAATTAAGTT
AGGAAATAAGGGGTAATGCTCATATTTCTCTCTTTATCNTCTCTTCACTC
TTTAACCACTTTCCTCCCCCTCTCTTTCGTATTCATTCCTTACACTTTTT
TACTATTTTCCTCTTCTACTTCACTTCCTACTTTCC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 8 8 8 12 10 11 11 14 12 10 8 8 10 15 10 10 10 12 12 12 15 19 42 37 31 33 33 28 28 42 43 43 32 25 25 29 29 43 39 29 21
16 19 19 27 21 29 21 21 20 25 28 30 42 32 32 23 22 28 24 18 14 15 15 32 32 46 54 48 57 47 41 41 41 41 48 48 48 48 40 38 23 22 25 36 32 27 27 20 32 32
35 35 35 43 43 47 57 50 52 50 41 50 50 50 50 50 38 38 20 25 25 42 42 50 52 52 57 57 37 37 32 32 17 17 21 32 43 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57
57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 43 33 33 29 29 43 39 57 57 57 46 46 47 57 57 47 47 47 57 57 57 43 44 31 43 43 52 62 62 62 62 52 52 43 43 44 62 62
62 62 45 45 43 43 43 39 39 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 39 62 57 52 57 57 59 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 57 57 57 43 35 43 43 57 57
57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 43 36 38 38 54 54 57 57 57 59 59 59 59 59 54 54 57 52 52 52 50 50 43 43 27 29 33 35 38 38 43 50 50
57 57 43 43 29 29 33 43 43 48 50 50 43 43 43 44 32 32 17 17 28 41 34 57 48 48 48 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 59 43 47 39 59 59 57 57 57 57 57
48 47 47 47 59 59 59 46 43 43 43 59 42 48 48 59 48 40 37 19 19 17 30 30 40 37 32 32 28 35 37 37 39 39 37 43 43 40 37 34 23 26 19 12 11 11 10 10 10 11
11 21 23 37 43 43 48 57 57 59 59 47 47 35 39 40 41 37 37 28 28 28 28 35 47 43 44 48 48 48 43 34 48 48 48 48 41 41 47 47 34 22 10 9 6 7 7 8 9 9
13 8 9 9 8 8 9 22 27 29 22 12 10 9 9 11 21 25 27 3 0 3 11 11 11 11 11 12 15 16 13 10 10 10 10 11 10 12 12 15 10 10 11 12 12 12 24 30 34 39
44 48 53 53 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 42 39 39 41 43 43 43 43 43 43 47 47 59 57 48 42 42 42 47 47 50 57 54 54 54 59 59 47 39 39 43 43
42 59 57 47 47 47 46 48 48 48 48 59 44 43 42 42 37 37 44 57 59 59 59 59 57 57 54 54 57 57 59 54 59 48 48 46 47 59 47 59 37 41 41 33 43 43 43 48 48 48
47 59 48 59 59 59 43 48 48 48 59 59 48 43 43 40 32 32 39 39 37 39 31 32 34 23 28 28 32 32 20 20 20 28 28 39 30 25 17 30 32 34 32 40 37 28 28 30 40 40
48 48 57 48 48 48 48 57 48 48 59 59 48 48 48 37 37 30 37 32 28 20 20 24 28 16 22 28 32 37 37 41 31 30 20 20 19 30 30 39 41 40 40 43 39 37 43 43 48 48
48 36 37 24 29 11 24 24 47 39 43 43 48 43 28 23 11 11 11 23 25 48 42 43 43 37 29 21 29 30 41 47 57 57 41 41 24 20 13 12 14 28 34 44 57 44 42 39 29 29
37 40 43 57 57 57 43 43 43 43 43 32 41 32 32 23 34 34 34 28 32 32 26 25 25 26 32 30 28 31 22 22 25 28 25 32 28 19 19 18 19 12 10 11 12 21 28 37 32 24
19 11 11 16 21 18 23 24 27 27 30 30 30 36 36 20 20 11 11 11 21 17 20 23 10 10 10 22 12 15 14 20 21 25 27 25 25 24 22 10 14 8 8 8 10 11 12 13 19 17
17 16 19 14 13 13 13 10 11 10 10 15 12 12 12 19 22 32 26 16 16 14 14 12 16 15 21 21 32 34 39 37 37 28 31 28 22 22 26 26 11 13 15 17 17 23 13 19 20 13
13 22 25 26 26 24 23 19 16 18 17 21 12 12 10 11 9 10 10 11 13 10 19 11 12 11 10 10 10 10 9 10 10 16 11 11 11 22 22 18 18 13 14 9 11 10 13 11 13 8
8 9 9 9 15 12 10 9 8 8 11 8 8 13 15 13 12 16 12 8 8 8 6 6 6 6 6 10 15 14 10 10 8 9 8 8 8 8 8 8 9 10 10 18 27 26 26 19 15 10
10 9 9 9 9 10 11 11 12 11 12 12 16 11 10 9 10 12 9 8 11 11 12 14 12 15 13 11 10 9 10 9 10 11 15 14 18 14 14 16 10 10 9 10 10 13 22 15 15 11
8 8 8 8 8 10 8 10 10 8 8 10 10 9 9 10 9 9 9 11 12 12 12 11 10 10 10 10 10 8 8 9 9 8 8 11 13 14 19 16 10 10 9 9 9 8 8 8 8 9
14 12 12 9 9 9 9 9 10 8 8 6 6 6 6 9 8 9 9 9 15 10 16 12 9 9 9 10 12 10 9 9 9 10 9 13 19 23 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 10 10
8 8 8 8 8 8 10 10 10 15 10 10 8 10 8 8 8 6 6 6 6 6 9 11 11 11 6 8 8 6 6 6 6 8 13 10 8 12 9 6 8 6 8 8 11 8 8 8 8 8
8 9 9 9 15 15 12 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 8 3 0 3 7 7 9 9 11 10 13 7 8 8 6 8 7 10 14 16 15 15 9 10 10 32 26 31 14 24 14 19 17 23 33 33 30
34 29 29 28 32 21 30 26 35 39 43 42 32 24 24 17 19 23 31 24 42 37 39 39 28 26 14 14 14 22 24 19 18 12 18 18 23 44 36 44 37 33 28 28 24 25 28 27 24 14
14 14 32 32 39 43 43 43 42 39 36 36 20 20 20 43 32 24 28 12 12 12 28 28 46 50 52 57 57 59 43 43 21 30 14 18 18 43 36 44 23 23 13 19 12 15 17 32 27 43
32 38 26 32 32 32 38 19 28 14 16 16 38 41 59 34 34 15 21 21 36 24 39 24 38 24 27 18 26 18 21 18 28 28 12 22 22 44 44 57 35 35 35 43 35 35 31 43 33 43
43 22 33 33 43 35 38 27 15 15 12 24 24 44 43 52 52 52 52 62 44 44 35 35 31 39 31 35 26 43 43 52 52 57 57 57 57 57 43 43 35 35 33 44 35 35 39 39 39 43
57 57 52 43 43 35 35 35 39 39 33 33 33 39 43 43 43 37 38 42 59 52 43 36 43 29 32 35 43 43 42 42 35 42 42 52 59 52 52 52 52 52 52 43 44 27 27 27 23 23
27 27 44 44 43 43 35 43 43 32 32 32 43 27 23 23 28 36 32 35 29 35 35 32 38 32 32 32 32 41 41 41 41 27 27 27 13 13 13 12 12 32 28 30 30 39 39 44 42 48
41 39 36 32 30 28 28 26 26 26 43 40 48 43 43 36 32 31 28 32 34 43 39 39 30 30 30 32 32 32 23 23 14 14 14 28 24 28 28 32 32 32 20 15 21 20 18 17 17 24
28 25 26 23 28 28 37 28 25 15 15 17 24 24 32 39 43 43 40 39 39 32 32 30 30 25 30 30 28 25 11 11 11 23 23 19 18 12 18 18 23 21 21 26 22 15 10 8 8 8
9 11 11 11 15 12 8 8 7 7 6 10 16 19 13 11 11 11 21 21 30 24 22 13 13 11 9 9 9 9 8 8 8 8 10 8 10 10 11 12 12 15 11 9 11 11 8 8 8 9
13 3 0 3 22 23 37 47 34 47 46 46 43 43 32 32 23 28 23 32 23 30 30 26 24 20 20 15 34 23 30 30 41 41 30 23 19 15 19 19 17 30 29 40 37 23 23 23 28 28
23 15 18 18 18 19 19 28 34 34 39 34 25 19 12 12 12 23 25 15 18 20 18 18 24 18 25 34 34 35 32 31 33 28 41 34 24 24 20 28 28 34 28 28 35 39 47 40 48 43
48 43 43 43 42 27 25 12 12 12 25 21 32 30 32 30 32 32 32 21 21 13 15 18 30 24 30 30 32 32 37 41 30 30 44 44 44 39 35 35 35 42 42 32 31 20 20 20 27 25
18 18 18 27 29 29 29 14 14 14 19 15 21 21 18 24 13 17 19 25 31 26 26 26 26 37 36 39 33 26 19 12 12 12 23 28 40 32 30 18 21 13 12 10 10 9 9 10 17 16
19 15 18 18 22 25 23 32 27 27 25 30 24 24 17 16 16 11 11 11 19 15 15 15 22 19 13 10 9 11 11 14 25 18 13 12 12 10 10 10 16 17 31 24 18 19 24 25 23 19
10 10 10 16 16 14 8 8 8 8 11 15 15 24 24 16 11 9 8 8 9 10 11 17 16 19 21 16 18 12 11 11 11 11 11 11 12 22 21 22 21 9 9 10 13 8 8 10 13 13
22 17 17 17 15 16 15 17 16 18 12 10 10 11 11 13 10 13 10 10 10 10 13 10 10 10 10 10 9 13 9 8 8 8 14 10 9 13 10 10 11 15 13 22 17 17 22 22 19 19
22 14 13 11 11 12 12 13 9 8 8 8 8 8 8 13 14 16 24 23 15 12 10 11 10 10 10 9 9 9 8 6 6 7 8 8 9 9 10 10 10 13 9 8 8 8 8 8 10 10
15 10 10 13 13 16 19 16 10 10 6 6 6 6 9 9 10 15 15 18 12 12 9 9 9 9 10 10 8 10 10 12 10 10 11 11 9 10 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 6 8
8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 7 12 12 11 9 9 9 9 10 12 12 20 18 10 13 10 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 11 10 11
11 13 9 9 9 9 9 9 12 10 10 10 9 9 9 9 9 9 12 12 15 10 12 9 9 9 10 10 6 6 6 7 8 6 10 15 10 10 10 10 10 11 12 12 11 13 13 13 15 10
10 10 8 7 7 9 9 9 13 11 9 9 9 8 8 11 11 11 17 24 25 19 16 8 8 8 6 8 8 8 8 8 10 10 12 10 10 10 10 13 9 10 8 8 10 8 8 8 8 8
8 8 8 10 7 6 6 6 6 6 8 8 9 9 8 13 7 6 6 6 10 8 9 9 8 8 8 10 8 8 10 8 8 11 11 11 11 3 0 3 6 7 8 8 10 8 8 8 8 8
10 8 6 6 8 6 8 8 8 8 9 10 8 8 6 7 10 9 9 12 12 12 7 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 21 13 13 9 9
9 9 8 8 7 9 11 10 10 10 10 10 10 11 10 12 8 6 6 8 15 10 7 6 8 8 8 6 6 6 8 17 12 12 11 11 |