BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-276D02.T7 (MSMg01no276_d02.b1) | MSMg01-276D02.TJ (MSMg01no276_d02.g1) |
ACC | AG414444 | AG414445 |
length | 718 | 747 |
length of high quality (start - end) | 293 (71 - 363) | 291 (77 - 367) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no276_d02.b1 PHD_FILE: MSMg01no276_d02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:16:05 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no276_d02.g1 PHD_FILE: MSMg01no276_d02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:16:05 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGACCGCGGA
ATTCTTGATCTTTGCACAAAACTTCTTGAATGCTGGTAGTGCACACCTCT
TTCATCATGCTGTGTTTTGTCCCTTACTGGGGAGGGGTTCAAACAAGGGC
CTCATACACACTAGAGCAGGTACTCTACACTTGCCAGACATCCACAGCCT
GCAGTCTTGTTTCTTGAGAAAGCAGAAAATCTCTGTTGCCATGTTTCTCT
GGGCCACTCACTCTTCACTGTGCATTCTGACCTCTCCCCAAACTGTTCCG
CTGAAATTGCTCCCCCACACCATTGTCACAGATAACCTCCTAATAGCCAG
TGCTTGTCTTCTTGTTTGGCGCCATCCCACACTGTGACCACGGTCAACTC
TTGGAATTTCCTTCTCAGGCCCAGACCAATTATTCAGCAGTACTGAGCAT
CCACCAAGAGTACAGGAAACAATGAGAAATGTTAGAATCCTAATAACAAT
AATATCCTTATTTACTGAGCAAGCACCAACTGGCAGCCTCTCCTTTACCT
CTCTCCATCAGTGCATGTCTCTTGCTATCTTTTGTTTCCCTTAGGACATT
CTTCACATCTCTTTTCTTCTCTACTGATTCCTCTTGGACTATCTCATCAA
CATCCATAATCTACACCAGGTCAGCTCTCAAATATACACCCTATCACAAT
TATCCATTATCTCTGTCN
| CGATGACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATGCCTGATATTAAATCTGATCAA
AATCCCATGGCTTGTCCTAGTGGATATCAAACCACCAGTGTATTGCTAAA
TGATTCTATTGATAAATGGATGTCTAAATATTTATGACTGTATTCATCCA
TAAGTGCTGCCATCAGAGAAGCTTTCTTCTGCATTGGGTAGCTGTCAACA
CAGAGACTCATAGTTGGTTAAGTGTCTTAGTGGTCAGCATTAAATAGAAA
ATCTCTATCAGCTCGGCAACCCCTAAAGGATAAGGGAACACCGTGGAAGT
GGGACAGAAAGAATAAAGAGCTGGATTTCTGCGACATGCTTTTTTCTGTG
ACACTGGATTGACCAACTCATAGCACAGTCTGCATAAGACCTGCACAAGG
TCAAGCTAGTTAAAATTACAGCTCCTGAGACCCCACCCTAGCTGGAGAGT
TATCAGCAACTGGTGGCTGCTGGGGGAGGGATAGTCACTTTTGTGTGTGC
TTCCCGTTGTCTGTCCGTTTATTTTCCTTCTCCTTCTCTCCTTTTTCTCT
CTTGTTTACTTCATTTGATTCCTTCCTACTTTTTCCTTTCCCTCCACCCT
TTTGCTCCCTTGTCATTGCTTATACTATTTTCCCACTATGCCTCCCTCTT
TTTTCCCCCTCCCGTGCCCCCCACATCTATATTTTTCCCCCCTTTCN
|
quality values | Open.Hide. 8 10 8 8 8 10 12 30 44 44 37 37 37 31 31 30 23 23 22 28 28 30 44 48 28 28 24 20 20 19 19 9 6 6 8 6 6 6 8 8 6 6 6 8 22 21 47 47 33 33
33 33 44 37 59 42 37 25 21 11 11 11 6 6 6 6 8 6 8 9 12 21 22 36 36 46 46 48 50 53 53 53 53 57 57 59 59 59 59 57 57 53 50 50 50 43 43 57 57 57
47 50 50 50 50 50 53 53 53 59 59 59 59 59 59 41 34 23 15 11 11 12 11 11 11 20 27 32 47 50 39 41 44 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 53 53 57 57 57
57 59 59 59 59 59 54 54 57 57 57 48 57 57 68 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 59 59 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 59 57 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 54 47 44 37 28 28 37 39 42 33 33 37 37 43 43 57 57 57 57 57 48 48 57 48 48 53 53 53 57 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 46 41 23 23 12 9 9 9 9 10 21 18 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 12 28 22 33 37 37 47 47 57 57 57 48 48 53 53 57 57 59 59
59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 50 50 50 50 50 39 39 26 28 19 15 12 10 8 8 8 8 8 9 18 18 18 24 30 34 59 59 57 48 57 57 57 57 48 46 46 47
47 48 57 43 54 54 54 54 57 59 59 68 68 68 57 57 44 44 37 37 37 42 44 59 48 48 48 57 57 57 57 57 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 54 54 30
41 17 17 17 34 41 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 57 39 37 37 36 37 37 46 46 43 41 41 41 37 37 43 44 44 47 47 50 50 50 50 48 48 43
47 43 36 35 43 43 57 57 57 46 43 43 47 47 48 59 48 48 48 59 48 48 41 33 33 33 33 32 32 37 37 39 39 39 41 40 41 41 42 41 39 43 41 32 31 35 37 39 41 41
47 37 41 37 39 39 47 48 48 48 48 28 25 13 13 13 27 27 46 43 43 43 41 40 40 39 39 39 39 37 37 37 25 24 24 18 18 32 32 32 37 37 37 50 59 59 59 46 43 28
27 15 15 21 24 24 34 34 30 16 16 20 15 13 9 9 9 17 12 16 12 17 19 20 24 19 17 32 21 20 20 25 30 37 37 37 32 32 32 30 19 17 8 8 8 13 15 19 36 34
30 33 33 28 24 28 28 28 28 37 40 37 29 26 15 15 3 0 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 10 9 9 23 16 26 27 28 37 37 37 47 41 48 44 47 47 47 37 37 39 47 47 39 25 18 8 6 6 6 6 6 6 6 7 10 15 15 23 22 26 37 37 33
36 36 36 36 33 41 37 37 47 27 27 11 9 11 11 11 13 22 15 12 10 15 19 19 28 33 37 39 50 57 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 53 68 53 50 50 48 50
50 57 57 50 50 43 43 37 37 57 57 57 57 59 59 59 59 59 48 46 37 21 15 11 9 9 9 9 14 14 29 37 37 37 37 41 50 53 53 53 57 53 53 53 53 59 59 57 53 53
47 47 47 47 47 47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 52 52 52 57 57 57 57 68 68 68 59 59 52 52 52 54 54 57 59 54 59 57 59 59 57 57 57 48 44 44 50 50 50 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 48 54 59 59 59
68 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 48 44 39 30 30 31 31 32 32 28 30 40 43 59 68 59 59 48 43 39 39 40 40 46 46 46 46
57 43 48 48 57 57 50 59 59 59 50 41 41 30 21 15 12 12 12 12 12 12 24 24 18 23 23 30 28 24 14 11 10 10 10 10 24 30 47 47 50 57 59 59 59 59 59 59 59 54
54 54 57 57 53 57 42 44 42 42 48 59 59 59 59 59 57 54 54 57 57 57 57 54 57 57 57 46 46 43 57 42 44 43 32 32 18 18 31 32 57 57 57 57 57 57 57 44 46 43
44 43 43 43 57 57 57 50 50 50 48 50 50 57 57 57 50 43 43 37 50 44 59 57 47 40 40 28 28 28 36 44 46 43 43 44 47 41 32 17 17 27 30 27 28 24 23 25 40 40
57 57 34 32 14 14 14 30 34 46 57 37 41 27 27 27 41 41 39 34 28 18 13 13 13 28 18 24 17 22 24 30 29 23 23 23 31 31 43 43 57 48 48 43 34 26 16 10 10 14
10 10 7 7 7 6 8 8 8 8 10 10 9 9 10 10 10 9 9 9 9 9 9 11 11 11 12 16 10 12 8 10 8 8 8 8 8 8 8 12 10 10 10 10 10 8 8 8 12 9
8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 11 13 8 11 11 10 12 10 10 8 8 10 18 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 7 8 9 11 16 11 11
11 11 10 10 10 11 12 10 10 10 8 8 8 8 9 10 8 11 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 9 9 11 10 10 10 8 11 8 8 8 8 8 8 8 11 12 15
13 9 9 12 12 16 13 12 11 11 11 17 9 9 9 9 9 9 9 12 15 12 11 11 11 8 10 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 12 8 8 11 10 13 10 3 0 |