BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-298N21.T7 (MSMg01no298_n21.b1) | MSMg01-298N21.TJ (MSMg01no298_n21.g1) |
ACC | AG425798 | AG425799 |
length | 768 | 732 |
length of high quality (start - end) | 691 (47 - 737) | 40 (237 - 276) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no298_n21.b1 PHD_FILE: MSMg01no298_n21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:35:38 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no298_n21.g1 PHD_FILE: MSMg01no298_n21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:35:38 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCAGAGAGAGCGCGG
AATTCTGTGCAGTTGCCGACAAGTGGATAAGTGGAACACATAAAGTGGGG
GTACCAGAGCTGCCCAGGCCCTTTGTTATACCAGCACTAAGACCATGCCC
CTGCTCGCAATGCCTGCTCCCCCAGGATGGCTTTATAAAACCAGTACAGC
ACCAGGCTGGAGTTCAGACATAGTAAGCTTAGCATGGACTATCCCACAGG
CCTGAACAAGGCCACTTTGAGTATCAACATTGGCAGTATCACAGCCATAG
CCTGGGACCTCACCTCCTGAAATGCCCTCAACTTGATGCTAACAGAGACT
TAAATCCACCAGTCCTGATGAATGTGCCTTTCATACGCCCTGCCTCAATC
CCAGCATTGTTACATCTGCCTTGACCAACCTGGCATATATGCAAGGAGGT
TTAAGCTCCTGCGAGGACTGCAAAGGACTGGGAGTTTGAGAGAAATGTAG
GCTGAGAGAGCTGAGGCAGGTCCGTTCCATCTCTGCTGTACTCATCCCAG
CCTAGTTCATTATCCATTGTCTCCGATCTGCCCCTCGAGGAAATAATTTG
GTCTAAATAATCTCACAATAGGGCTCCAGAATAAAGTTTTTAAAAGACTA
GCTGCATTACACCATGTACTCCAATTCAACTGGAGATTAAACAAGAGAGA
AAGGAGACAGAGTCCCCCAGATCCAAGTCTCCTATCTTCAGATATGTTTT
ATGGAGAACTTATGTTAA
| GAAAGGTTGNCNACCCNGCNNGAANNANAGCAGGTTGACNGGACGCGCGG
ANCNNNCCAGAACNNNNANCANGAAGGGGAGGNGGACCNGGTCAAACCAN
AANNCNGCANCCAACGAGAAGAACAGGNGGNNNCGGCCCNCGAGCCCGCC
NANACAGCGGACCACACCGAGGGANNCCCGAANACNAAACCAACCCCGCA
NNCCCGGAANAAAACCCACCCGGCCTTTTTTGATGATTGCTTTAATGTGA
TCTTGGATTCGGTTAGCGAGAATTTCATTGAGGACCCTTGCTTTAGTCGT
TTAAGAGAAACCGGGCCGAAGCCCCCCACCCTTGTTGGACCCCCCCGCCC
CCAGGNANCAGAGNAANAGGGGCCCCACAAAAAGAGNCGGGCACAGCACA
CACCACCCCCACCCCGNGAAAAAGCCCCGCGCAGAACNGGAACCAGACCC
CCCCCGAAGGCCCGACAGAACCCCGCACNAAACCCGCCAGGCCCCGGGCC
CCCCCGGGCCGGCACACAACCNACAACCGCCCCCANNACACCAGGGGACA
CGGGACCGCCCAAAAGGCCACACCGACCCCGAACCAACCCCGGCACCCGC
AAACCGCCCAGAAACCAGCCCAAACCGCCCATTTTTTTCTTTTTTGCAGA
CCATAGCCTTTTGTATAAGGATCTGATGCCGCTCCGCATTTCTTCCCGCC
CTGTTGTCCCGTCCCCCCCTCTCGCTCCGATT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 7 7 9 15 23 39 41 37 37 37 31 31 37 39 30 26 24 37 32 33 39 35 20 20 24 20 20 22 25 14 17 16 12 12 9 7 7 10 8 8 8 8 11 12 27 25 31
31 31 31 31 31 50 42 33 25 25 12 11 11 14 10 10 9 9 9 15 18 24 28 32 37 37 37 41 47 36 53 53 53 53 50 50 50 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 68 68 68
68 68 68 47 47 47 47 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 43 41 44 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 59 57 57 57 68 68 68 68 68 57
59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 59 68 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57
57 57 59 57 57 59 59 57 57 68 68 68 57 57 59 52 52 57 57 57 68 59 59 57 57 59 59 59 59 59 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62
68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 52 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68
68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 44 43 35 23 23 23 29 39 43 43 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 62 62 52 52 52 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57
57 57 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 59 45 52 52 57 57 57 57 59 59 68 59 57 57 57 57 57 52 45 52 52 57 57 59 57 57 52 52 52 57 57 57 57 52 43 43 32 32
42 44 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 68 68 57 57 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 59 59 54 54 44 44 42 42 48 57 59 68 68 68 68 57 57 54 54 54 59 59 59 48 48 48 48 59 54 54 54 59 59 59 57 57 57 59 59 59 47 43 43 34 34 34 34 37 43
46 43 43 43 39 48 48 43 43 36 36 32 26 24 12 11 11 19 22 13 13 19 24 37 37 41 43 41 41 37 37 41 41 41 39 39 36 36 32 24 20 19 15 24 19 28 30 30 30 33
31 34 33 34 39 36 36 39 39 37 41 37 37 41 41 34 34 23 28 22 19 18 25 25 30 34 28 28 31 37 37 39 39 25 21 19 20 18 24 22 19 19 19 19 24 23 24 28 28 28
32 28 20 20 14 12 19 15 19 19 28 28 32 34 34 39 34 32 23 28 23 32 31 35 35 31 39 39 41 37 31 24 28 22 17 14 19 15 14 19 20 15 15 12 18 10 12 16 21 16
28 30 28 26 19 17 17 26 26 37 39 37 41 19 23 10 10 10 | Open.Hide. 9 9 12 9 7 6 6 6 3 0 3 0 3 6 7 3 0 3 3 0 0 3 21 3 0 0 3 0 3 9 9 9 9 7 7 3 3 3 3 0 3 9 6 6 6 6 6 6 8 11
3 0 3 0 0 0 3 17 14 18 15 23 3 0 0 0 0 3 0 3 3 0 3 10 7 9 9 9 6 6 6 3 0 3 15 9 9 3 0 3 6 6 6 9 9 9 9 9 3 0
3 3 0 0 3 0 3 19 3 0 3 21 19 30 30 37 19 9 9 9 9 9 9 9 7 7 3 0 3 3 0 0 0 3 6 7 7 7 3 0 3 8 13 9 9 9 10 9 9 3
0 3 0 3 11 11 12 8 8 10 9 9 9 9 19 11 8 8 8 7 9 7 7 3 0 0 3 9 8 7 7 3 0 3 3 0 3 23 23 21 21 10 10 9 21 13 14 10 13 3
0 0 3 8 8 9 13 15 3 0 3 23 23 15 9 9 7 7 6 9 9 11 11 9 9 14 14 19 12 12 9 9 9 13 19 21 20 20 20 32 34 28 24 19 15 15 13 28 19 37
37 43 43 48 48 48 48 44 34 30 22 17 17 19 28 30 36 43 43 43 44 39 23 22 11 11 11 12 19 28 21 17 12 10 10 12 15 19 12 16 10 9 8 6 3 3 3 3 3 6
6 8 12 21 28 28 28 8 12 6 6 6 6 9 9 9 11 11 19 10 10 10 12 10 12 8 8 7 8 7 7 9 12 12 12 12 9 9 9 6 6 9 9 8 8 6 6 6 8 9
10 10 10 12 3 0 3 0 3 25 23 20 3 0 3 3 0 3 7 7 7 7 6 9 9 8 10 10 14 13 11 14 11 9 12 3 0 3 9 9 10 9 9 9 12 11 11 11 9 9
9 9 11 14 18 13 11 11 8 12 8 8 8 19 15 3 0 3 23 23 21 18 11 11 11 18 21 10 10 11 11 11 9 9 11 16 3 0 3 15 12 11 11 12 12 20 8 6 6 9
8 14 9 9 9 10 13 13 18 9 7 7 13 15 15 15 12 12 10 23 9 10 11 11 11 12 23 3 0 3 23 23 37 37 37 21 17 11 9 9 9 11 12 11 11 11 25 21 10 10
7 7 6 6 6 6 7 7 8 11 9 13 9 10 10 10 9 9 9 9 3 0 3 6 6 14 15 16 15 9 6 6 6 7 3 0 0 3 7 7 7 9 9 18 12 12 12 11 11 11
12 12 19 17 10 8 8 6 8 7 9 9 12 16 11 10 7 9 6 6 6 6 6 6 10 9 9 9 15 10 8 8 6 6 6 12 12 13 8 8 8 8 8 8 8 10 9 7 6 6
6 6 12 9 9 9 9 9 13 10 14 8 12 6 6 6 6 6 6 6 6 9 9 9 12 11 10 8 7 7 6 6 7 7 11 17 14 8 8 8 11 12 15 17 15 9 9 7 7 10
8 8 8 11 12 12 12 12 13 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 12 13 13 15 15 10 11 12 16 12 12 11 12 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 14
13 13 20 21 14 9 9 9 9 9 11 9 9 11 13 19 12 8 8 8 12 12 9 10 10 10 10 13 10 10 13 11 |