BAC Information

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BAC

Clone NameMSMg01-300M07
Chromosome2 (Build37)
Map Location 55,078,362 - 55,115,074
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC666913, LOC626563, LOC100041792, LOC100042878, Galnt13
Downstream geneLOC666936, Kcnj3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameMSMg01-300M07.T7 (MSMg01no300_m07.b1)MSMg01-300M07.TJ (MSMg01no300_m07.g1)
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length of high quality
(start - end)
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definitionCHROMAT_FILE: MSMg01no300_m07.b1 PHD_FILE: MSMg01no300_m07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:37:59 2005CHROMAT_FILE: MSMg01no300_m07.g1 PHD_FILE: MSMg01no300_m07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:38:00 2005
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
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sequence
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GAATATAATTACCAGAGGAAGTTATTCATGAAATATATATATATATATAT
ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT
ATATATATATATGTATACATATATATACAGATATATATATATGGATATCA
GAATGAATATTCATTAATATATTTTTATTCACTAAAATTATTTTAAAACA
CTGGCTTTTTTTTTTCATCTCCCCCCCCCCGACTTAGGCTTCTCCCCCCA
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quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
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         (701 letters)



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Lambda     K      H
    1.37    0.711     1.31 

Gapped
Lambda     K      H
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Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
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MSMg01no300_m07.g1 PHD_FILE: MSMg01no300_m07.g1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Tue May 17 21:38:00 2005
         (205 letters)



>mm_chr2_55114766_55115370
          Length = 605

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 Strand = Plus / Minus

                                                                       
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Query: 189 t 189
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Query: 199 t 199
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Sbjct: 200 t 200



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Query: 201 t 201
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Sbjct: 200 t 200



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 Strand = Plus / Plus

                                                                       
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Query: 203 t 203
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Sbjct: 200 t 200



 Score =  101 bits (52), Expect = 4e-26
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Query: 145 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtatacatatatata 204
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Sbjct: 140 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 199


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