BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-313I02.T7 (MSMg01no313_i02.b1) | MSMg01-313I02.TJ (MSMg01no313_i02.g1) |
ACC | AG435413 | AG435414 |
length | 1,259 | 1,246 |
length of high quality (start - end) | 761 (55 - 815) | 421 (475 - 895) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_i02.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_i02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:16 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_i02.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_i02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:16 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCCCTTTTTTNNNNNNATCAATGGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXCGCGGAATTCTTGGTTCAGTTCTGACCCTTATTTTTTAATGGGGTT
ATTTGATTTTATGGAGTCCACCTTCTTGAGTTCTTTATATATATTGGATA
TTAGTCCCCTATCTGATTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTT
GGTGGTCTTTTTGTCTTCTTGAGGGTGTCTTTTGCCTTGCAGAGGCTTTG
CAACTTTATGAGGTCCCATTTATCGATTCTCGATCTTACAGCACAAGCCA
TTGCTGTTCTATTTAGAAATTTTTCCCCTGTACCCATATCTTTGAGGCTT
TTCCCTACTTTCTCCACTATAAGTTTTAGTGTCTCTGGTTTTATGTGGAG
TTCCTTAATCCACTTAGATTTGACCTTTGTACAAGGAGATAGAAATGGAT
CAATTCGCATTCTTCTACATGATAACAGCCAGTTGTGCCAGCACCATTTG
TTGAAAATGCTGTCTTTTTTTCCACTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTCAA
AGATCAAGTGACCATAGGTGTGTGGGTTCATCTCTGGGTCTTCCATTCTG
TTCCATTGATCTACTTGTCTGTCACTATACCAGTACCATGCAGTTTTTAT
CACAGTTGCTCTGTAGTACATCTTTAGGTCGGGCAAGGTGATTCCACCAG
AGGTTCTTTTATCCTTGAGAAGAGTTTTTGCAATCCTAGGCTTTTTGTTA
TTCCAGATGAATCTGCCGATTGCCCTTTCTAATTCGTTGAAGAATTGAGT
TGGAATTTTGGGTATTGGGGACTTTTGGGATAGCAATGGGAAATGTTAAT
GAGGAAAATACCTAATAAAAAATGTTAAAAACAAGAAATACTATGCTCTC
ATTCTGAAGGGAAGGATGCTATTTAGGAAGAATGGGAGGTAAGTCTGTTT
ACTTGTAAGGTTTGAGGAAGGGTTTTCCAAAGGAAATCCCGTGGTTTTCC
TGAAAACTTCTACCTTCTAATATCCTTAACCGACAATTTTGCGGAACTTG
GATACATAAAAACATTTTATTTCCTTTTCCTAACAACCTCCTCTTATCCA
TCCTTTTTCTCTTTTCACTAACTCTCTATTTCCTACTTATCTTTTTTTCT
CCTTCTAAATCTCTTCTTTCTCCTCTCTTCTCATTATCCTCTCTTCTTTA
TTCTTTCGTCCACTTCTCTCTCTTATTACTTTTTCTTTACTACTTCTCTT
TCCTATTTC
| NAATAACANNNNNAATAGATGGNATGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTGATGTCATAAAAAGCAG
AGCTACTTAAATTGGATGATTAAATAAAAATGACCTGAACATTGTAAATA
TTCACAGATCACATCATTGACGTGTAATGTGCCGTTAAATGTTGTCAAAT
TAACGGGGAAATTACATGTGTGAGAAGTAGGATGAATAAAAAGAAGACAT
TTAAAGATACATGGTCCTTCAAGTGAAAATTCCTAACATATATTACTGAG
ATGATTCACCAACCAGACAGCGGAACTAGGGGAATGAAATGTAAAATAAA
ATTCAGGGTGGGAAGGAAGCTGGTTAAAAACAACTCATTTTCAAACACCA
TAAATAGCAGTTAACTTTAAGATACCAGTCATTCTTAGGGTGTTTTGTTT
TATCTGGAGGAAACTTAAACATGGAATTTTTAGAAATACGTAATAGATAT
TGCCTCTCATTTCTTAAAATCTGTCTTTGGGCTAGTTCCAAATATTAATC
ATATGTCAATTTGACAGGAAAAATTATCAATTTTAGTTTACATATGGTCA
GTTTCTCTTGCTAAGTTGTATGTTGCTGGACTCATTCTAAATGTTTGGAT
TTCTTTGGAATGTATACATGCTACTCAAAAAGAAACAATAGTGTATGAGG
TATGCGCAATGTCTCTACTTTCCTGTGTCTAGCTGTTGTATTTTGTTAAT
AGTCATTTGCATTATTAACTTGTATCTAATTTGAATTTAATACATAATCC
AGATACCTCCAAATGACGTACAGTTTAATTACTTAGAGTTAAATACAGAT
GTTTAGTTAAGCTGCATTTAGATTTGACCTTTCATAGTTTTAACAAGTAT
TTGGAAAATATTAAATAAAAATCATTATTTTTTACCCCATATTCTTTTCA
TTCATCTATTTTTCTCATCACAAATTGGAAGTACCATACTACCTAAGCCG
CAAGTACTTTTCCCAAAAAGGGGGTCCTAATAAATAAAATCCACAACCTT
GTATGGAAAATTTATGCCCCCACCTCAGAAAAAAAAAAAAATCAAACCCC
CGGAATCCTTTTTACCCGTCCCAAATGTTTCCTTTGAAAAACCCACCCAA
GGCCCCAAAAAACCTTTTTTTTTTAGAGGGACTCAAAACCCCCCTCTGCG
TTTTTTAAAAGGGAAAAGGTGTTCTCTCTTTTTTGAAAAAAAAATA
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 7 8 7 8 3 0 0 0 0 0 0 3 10 6 6 8 6 8 8 11 12 10 8 8 8 8 8 8 19 19 10 15 15 18 15 18 16 26 26 35 30 28 28 28 30
33 33 33 33 33 41 37 37 37 32 28 31 37 37 37 37 37 37 33 33 31 31 31 31 37 37 28 32 20 14 14 10 6 9 9 12 12 37 27 30 30 28 33 33 48 53 53 38 42 42
42 53 53 59 59 59 59 50 47 47 47 47 47 68 47 47 42 29 20 16 18 22 31 43 36 47 47 50 50 50 43 43 37 37 37 37 39 39 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
62 68 68 68 62 62 43 43 23 43 29 35 43 39 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 68 68 68 68 68 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57
48 48 59 59 68 68 68 59 59 57 59 59 57 57 57 57 57 57 44 44 43 48 48 44 44 54 48 48 48 57 48 48 59 57 57 57 68 68 48 48 43 43 37 37 30 31 28 31 28 37
33 43 39 57 48 48 48 59 59 47 46 46 46 46 46 30 34 37 35 31 31 39 41 41 34 37 43 59 59 59 41 29 29 30 32 32 34 34 40 40 41 46 59 59 59 59 44 37 37 44
41 41 47 41 39 39 36 39 39 36 36 39 41 39 41 31 31 39 39 39 39 37 31 31 39 59 59 41 41 41 41 48 41 47 41 41 41 43 39 36 26 32 26 30 30 31 39 39 38 32
36 34 19 21 11 11 12 27 27 37 37 30 19 16 17 15 9 12 17 19 10 10 10 23 21 32 30 15 15 10 17 11 12 14 17 15 24 20 25 25 22 19 19 25 28 24 30 14 14 11
18 10 12 12 16 27 36 31 29 18 15 14 16 15 18 29 28 28 28 28 23 23 24 16 10 10 8 8 8 19 17 15 15 10 19 8 8 8 10 19 30 39 40 39 37 28 24 26 26 15
16 15 12 16 16 20 21 17 22 22 24 15 20 15 24 16 18 15 28 10 9 8 8 8 8 9 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 13 9 9 12 15 16 17 19
21 16 14 17 11 11 14 13 24 32 15 9 8 8 8 8 11 11 10 10 12 12 24 12 9 9 10 9 10 10 8 8 10 8 8 10 18 11 11 10 10 9 9 9 9 10 10 12 12 9
9 9 12 12 23 12 14 14 16 13 10 9 9 9 9 9 9 10 10 13 11 13 14 10 10 10 10 10 8 8 6 6 6 8 9 10 10 10 13 10 10 9 11 11 8 8 8 8 8 8
10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 13 10 9 9 9 10 11 15 15 12 12 11 12 12 21 17 12 11 10 8 8 8 8 9 9 9 10 9 10 9 8 8 6 6 6 9 10 12 9 10
10 14 14 10 10 13 13 13 7 7 8 8 11 8 8 8 8 10 8 8 8 6 7 8 8 8 8 8 11 8 9 8 13 10 12 7 7 8 8 8 8 9 11 8 13 9 10 10 14 12
19 10 8 8 8 10 18 18 21 12 14 14 17 17 12 13 8 8 6 6 6 8 8 8 7 7 10 10 8 8 8 6 6 8 8 21 21 26 12 12 8 8 8 8 13 9 9 8 10 9
8 8 8 12 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 11 8 8 17 8 8 9 14 17 12 11 9 9 8 10 8 10 13 13 13 10 8 9 15 11 10 9 8 8 12 10 9 9 10
10 15 21 10 10 8 8 7 7 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 8 7 3 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 8 13 6 6 6 6 9 8 13 7 6 6 6 8 7 10 15 15 13 8 9 9 21 17 19
10 14 22 28 35 35 36 37 37 37 37 37 37 37 42 53 53 53 53 48 53 48 43 37 30 24 17 17 15 10 8 8 8 15 19 31 31 33 31 31 37 47 47 53 59 59 59 47 35 35
43 33 29 34 34 36 38 38 36 39 41 50 50 41 28 28 22 18 18 11 11 11 18 20 22 30 37 37 37 32 28 24 31 18 18 18 29 30 34 46 42 33 33 33 36 36 50 53 53 53
39 43 30 30 30 40 40 57 57 48 48 48 48 48 57 48 48 53 47 47 47 42 36 42 42 36 36 50 57 57 50 53 50 33 33 33 33 25 24 10 12 10 10 10 15 18 23 32 32 37
19 15 10 10 10 13 16 30 36 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 68 54 54 54 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 44 44 37 37 48
57 57 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 57 57 57 48 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 59 59 59 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 57 54 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 48 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
68 68 68 68 59 59 28 28 20 20 20 32 32 54 54 54 59 44 57 54 54 54 54 54 57 57 57 57 57 54 57 59 59 57 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 50 50 39 30 21 12 15 12 14 14 12 15 12 18 24 24 21 13 12 12 22 22 37 39 30 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 43 43 23 27 18 24
22 25 25 21 24 23 31 40 47 48 57 57 59 59 59 59 68 59 59 59 68 59 59 54 54 59 59 59 59 59 54 54 59 54 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 59 59 59 57 54 57 59
59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 59 59 59 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 57 48 48 48 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 59 68 57 57 57 57 54
57 54 57 57 54 54 54 57 57 57 46 46 43 43 43 57 57 59 59 59 59 59 57 59 48 48 48 48 43 43 43 43 43 44 43 59 59 43 43 43 41 41 41 59 59 59 43 37 34 39
37 34 34 25 34 34 46 46 48 46 46 46 43 41 41 39 37 37 38 39 39 39 43 39 39 43 41 37 37 37 39 37 37 32 37 37 37 39 41 41 43 59 41 41 41 37 37 41 39 47
24 24 14 28 28 47 37 36 31 31 31 31 37 37 39 41 40 39 39 39 39 41 41 37 37 37 31 32 32 29 32 39 23 23 11 11 11 23 20 37 36 36 37 39 43 37 30 30 32 37
29 32 26 29 22 28 24 32 32 28 32 23 34 34 43 39 41 25 25 11 11 11 29 21 35 35 35 32 32 37 32 32 33 19 19 13 24 18 31 32 29 29 29 30 23 13 24 11 11 16
19 17 11 11 11 12 12 13 14 22 33 28 21 20 19 15 13 10 10 10 15 17 14 20 20 32 31 31 31 39 39 31 27 32 13 13 11 10 15 19 30 19 15 10 10 10 14 15 15 15
10 12 10 10 12 14 15 20 32 28 39 28 28 13 12 12 12 10 10 10 11 10 10 26 16 17 13 12 9 9 10 11 10 12 11 11 11 13 15 11 10 9 8 13 8 8 10 8 8 10
9 11 13 18 12 12 14 12 11 15 15 13 10 11 9 11 11 10 6 6 6 7 7 6 8 10 8 10 9 9 11 11 11 13 13 10 10 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 9 8 8
9 10 9 10 10 10 10 8 8 8 10 8 10 10 10 13 11 11 11 11 9 9 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 13 16 29 28 28 23 22 14 11 9 9 9 9 9 16 19 18 13
13 12 12 11 11 10 11 12 12 13 17 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 16 15 10 10 10 10 10 10 13 10 10 10 11 11 11 11 13 16 20 14 12 12 11 11 8 11 8 8 8
8 8 8 9 8 9 16 24 22 15 17 10 10 9 8 11 16 32 32 18 19 16 10 10 9 9 9 11 11 10 10 8 8 8 8 9 8 10 8 8 12 16 12 11 11 11 7 6 6 8
8 8 9 10 10 8 8 10 13 12 9 9 9 9 9 8 11 11 10 9 9 9 9 9 9 10 9 9 9 12 14 14 11 10 9 9 14 21 17 12 9 8 10 8 8 8 |