BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-323B17.T7 (MSMg01no323_b17.b1) | MSMg01-323B17.TJ (MSMg01no323_b17.g1) |
ACC | AG441620 | AG441621 |
length | 1,239 | 1,270 |
length of high quality (start - end) | 279 (132 - 410) | 655 (137 - 791) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_b17.b1 PHD_FILE: MSMg01no323_b17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:06:17 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_b17.g1 PHD_FILE: MSMg01no323_b17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:06:18 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (59,436,476 - 59,436,754) | (59,596,619 - 59,597,273) |
---|
sequence | NCCAGCCTNNNNNNAACCAGTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCACTTTGTAGNTGAGGCCCGTAAAAAACTCTTCGTNNTA
NTTTCATCTCAAGGGGTGGCTTTATAGACGTGTTCCACCACCACTCATGG
CTCGTGCCTCGATCCTTTTCAATTAATGTTTACAGCCGATGTCTAAGAAT
AATGAAAATGTTTGCCAGTCCCAGTTAATAATTGACAAGTTTCCTGCAGA
CTTTGCTATAACTAAATTTCAAAACAGTAACTAGGAACCTCTTTGCGCAG
TGTTAAGACAGTTGATGCCATTACATCATGAGATCATGATGTTATTAAAG
GGACTTTTTAGAAAAAATAAAAGGCAATCTTTTCCAGGTATGTTTCCTGC
AGGGATGTGGTGATTTATTCAGCTCAGGACTGCATTGGGCTGCAGATGAC
AGAAGCCGGCGATAAAAGCATAGCCGGGTGGGGTCCCTTTTCCTTAGGTA
AGAAGTCTGGGATCCTGGTGTGGTACAGCGCGCATGTCATCCCAGGACCT
GGGAAGGGGTGGCAGGATACAGAGTTCTAGGCCAGCTTGGACTAGCTATT
GACTCAGTCTTAAAAATAACAGAATGTCTGGAGGTGGGCAGTTCACTGTG
AAGGAGAACAAGGGGCCTTTCTGTGTTCCTTTTCTGTCAGAGTCTACCGC
TTTCCTGGAAACCTCTCACTGTGGAGCCACTGGACGCTATGCCTGTAAGG
AAGCCGGAGGTAGGAGGTGTTTTGAGGCGGCTCCTTTGTTTGTTTTGTTT
GTTCTTTAACATAGGCTTTATTTTTTTTGACCCTGTGGTCCTATACCTTT
TTTTTTTTTTTTCCACCGTCCCTTACTTCTATTTTTATTTTATCTAAAGT
CTGCTTTTTACTTTTTTTTCCATCAAATGAAACCAGTCTTTTTATCTCCT
AAATCATCCTCGTTATAAAATAAACACTGTTTCTTCATTTCTGAATACTC
TTTGTTTTATCAAGTTAACCTTTTTATACCCTTCTTTCAAGTTACTTATA
AACTCTTTTTCCCAATTCTCCCCCATTTTCTCTGTCCCTTTCCTCTTCTT
CCCTAATAATTCAACATCACAACGTTCCATCTATTCGTACCTCATCTCTT
CATTTCCACTTAAACACCTCTATTTTTCTCCCATTCTTTTCATCTCTTAT
ATACATATCATACACATTTACTAATCAACCTATTATCTT
| NCCAACTCTNNNNNAAATCATGGTTAGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCCTAAAGCCCCCCAAGNTAT
ACAGAGAAACCCTGTNTCAACCTTAAACACCCCCCGCAAACTATTAATGC
ATCTATTGAACGCCACAAGCATTAACATATGGTATACGTATACTTTGACT
TANAAGTGTGTGGGGTGTGATACATTGACTTTTATGGCAAAAAGAAAAGA
GGCTTCAATCAGTTTGCATTTTCTTTTCTTTGTCCCTAATCCAAAGCCCC
CTCTATAGAAAAATCACAGATGTTTAACTTTTAAAAAGCTTTCCAAAGTC
ACCATGTGCTCTTAAGTGAGTTTGTCTAGTGAAAGTCTCCGATTCTCAGC
CAAAGCCTGCTCTTTTTTATTCTGGAGGGGTAATGTGTTTGTATAAAACA
AAAACAAAACAAAAAACCTAGGTCAACTGGCTGGCATTGCATGTCTCCCA
AACCCAGCGAGGTCAGAATTCAGAGGATACAAGACCCAAGCCTCAAACAC
TGCAAATACACCCAACTCAACTATTTCTGCCACTTGTATACAATTTCAAG
AATTCACATTAGCTAAACAAATCTCTGTCAATTGCCCAAGGGGAAAAAAA
CCTCCCAAATACATTTGATTCAGTGAAGCATTTTTGCAAGAGACTCTCAG
GTTTCTTTCAGAAATGGAGAATGCTACTTACTATGCATAGTCTTTAGGGA
AAGATGCAGACATCATGGAAAAGGTACTCTTACCAGTCGCACTGGGCTCT
GAGGGCTTGGACCCTTCTCCGAACGGGATCATAACTGGATCTCCCGGCAC
CCTGGGGCTTTCCACATACTTGGGCTTCCCTGACGGGACCTGCGGAGGGG
AAGATCTGAATGTAGCTAAATTTTTCCAAATGCCAACAGAGCTTCAAAAC
ATACATGTGTGTCCTTACCAGGACCCCAACCCGCTTAAGGCTGGCCCCTT
CCCCCCTTGAAAACCCGGGCTGTCAGTTCAAAGCAAACCCAAAAATGTCC
CGTCTTGGCCTGCCAACGAAAACCAGGGCGAGCTCCCCTTTGAAAAAACG
TAAATTCTGGATCGAAACCCAAACCCCCTTCCCTCTGGCTGAGATTTTCG
GGGGGGGCCCTTATTGGGGGAAAAAAGTGGGTTTTTTACGGTTCTAAACC
CAACAAAGGGTGAAAACGCGGTTTTTCTAGGAAAGGGAAATTTCCTTCCC
TTGGAAACAAAAATTTTTTT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 11 9 9 9 9 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 7 7 8 8 9 12 10 8 8 8 8 8 8 15 17 9 8 8 10 12 15 18 21 36 28 20 24 24 28 31 33
33 33 33 37 33 32 32 32 26 28 37 33 33 33 31 28 25 24 19 18 3 0 3 23 19 15 12 7 9 7 7 7 8 12 12 10 10 10 10 17 11 18 21 21 21 3 0 0 3 3
0 3 25 25 39 33 33 33 33 33 33 50 42 41 28 21 13 9 9 9 12 12 12 11 11 8 8 8 8 10 12 22 23 30 33 44 44 53 53 59 59 53 53 53 53 50 50 53 53 53
53 53 53 53 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 43 43 43 48 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 50 47 42 42 43 43 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 47 54 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
48 57 48 48 48 43 34 34 16 16 9 9 9 9 9 9 12 13 17 21 29 41 59 50 34 30 17 17 29 41 39 48 48 59 47 43 39 30 30 30 42 40 33 28 28 25 43 43 54 54
42 42 35 35 30 30 23 22 11 11 11 18 26 30 28 28 23 23 23 19 32 21 24 24 26 24 18 22 30 40 44 44 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 59 59 59 59 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 44 23 23 23 44 34 59 46 46 39 46 57 57 57
59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 48 57 57 57 57 48 59 47 43 43 59 47 54 54 59 59 57 57 54 54 57 57 68 68 34 34 19 23 33 43
43 50 50 50 57 59 59 59 57 59 59 59 59 50 50 50 47 47 47 29 23 15 10 11 13 22 25 47 47 46 46 48 50 59 59 59 59 48 48 48 43 57 43 47 47 57 48 48 48 43
43 43 43 54 54 21 21 12 10 10 21 34 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 40 39 39 44 44 53 53 59 59 48 43 43 59 32 34 19 19 13 14 15 23 27 16 12 12 11 25
27 41 41 39 28 25 13 13 25 25 32 31 31 37 41 47 47 47 41 39 39 39 30 30 25 28 24 31 37 37 37 27 27 30 32 37 37 47 47 41 43 31 31 39 39 28 33 28 36 28
34 23 23 23 34 34 39 30 20 17 12 12 11 11 12 11 10 10 11 11 10 11 9 9 9 14 11 11 8 8 8 8 8 9 12 17 24 35 31 31 28 20 18 19 17 14 12 12 9 12
10 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 15 15 10 13 16 21 19 10 10 9 10 9 8 8 11 11 11 13 9 10 10 10 14 21 24 19 18 9 9 9 10 8 8 9 12
13 16 27 22 22 19 22 19 14 18 19 10 8 6 6 8 8 6 6 6 8 7 10 10 10 10 12 10 10 9 9 9 11 11 10 10 10 9 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8
8 8 10 10 10 12 13 10 9 9 9 9 12 12 15 14 13 12 9 8 8 8 10 10 10 10 13 13 10 12 10 13 10 8 8 10 8 10 10 17 14 12 10 10 10 8 8 8 8 12
11 9 9 9 9 9 11 16 11 9 9 9 10 10 9 9 9 16 10 10 10 15 15 10 9 8 8 8 8 8 8 8 10 14 8 8 8 11 10 8 8 6 6 8 6 6 8 6 6 8
8 13 11 9 10 10 11 18 8 8 10 10 9 9 10 12 10 10 13 10 15 15 15 15 10 8 8 6 6 8 8 10 9 10 13 16 10 8 8 8 8 10 11 12 12 8 8 6 6 8
8 10 15 11 8 10 9 10 13 10 10 13 10 10 10 10 15 22 16 11 11 11 11 12 12 12 18 12 15 12 12 15 12 12 12 12 12 11 11 11 10 12 10 10 9 9 13 7 6 8
6 6 10 8 8 8 10 10 6 6 8 8 10 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 8 8 7 8 12 8 9 8 8 6 6 8 8 8 10 10 13 9 9 9 10
9 9 9 9 9 10 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 10 16 16 13 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 19 11 8 10 8 8 8 8 12 8
9 9 9 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 7 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 9 11 11 11 11 11 11 11 10 8 8 12 8 6 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 7 6 3 0 0 0 0 0 3 9 7 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 11 6 6 6 7 11 10 12 13 8 8 9 8 10 12 19 19 17 8 9 9 10 15
17 10 15 19 28 28 28 28 29 33 33 29 29 35 38 38 53 53 50 50 50 50 47 47 23 21 9 9 9 10 8 7 7 8 9 8 11 11 13 14 18 12 12 11 11 3 0 3 21 21
37 37 37 50 50 50 44 39 37 33 25 23 19 18 3 0 3 21 11 10 9 9 9 10 13 16 16 17 18 17 17 17 14 14 12 13 12 27 27 37 39 41 44 53 48 48 48 48 48 57
57 50 53 53 53 50 50 57 57 59 48 48 48 48 48 54 54 57 57 57 50 48 48 47 48 48 48 48 48 47 50 53 53 53 50 50 50 53 53 53 37 37 37 37 40 40 46 43 39 25
25 3 0 3 27 27 44 47 47 50 50 50 50 53 50 57 57 48 48 48 57 50 48 48 57 57 59 59 59 59 53 50 68 57 57 57 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
57 57 48 48 57 57 57 57 59 57 57 57 57 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59
59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 57 57 54 54 54 57 59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 47 47 43 43 43 59 47 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 54 57 48 48 48 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 48 57 57 59 57 57 57 48 48
48 59 59 59 59 59 37 37 21 21 11 12 12 14 12 12 14 16 26 28 59 59 59 47 48 48 48 48 57 59 57 57 57 57 48 57 59 59 59 59 59 48 48 48 59 54 54 54 59 59
68 68 59 68 68 59 59 42 40 32 30 30 34 41 24 21 18 12 12 12 21 25 36 30 32 32 39 42 41 42 42 44 59 59 57 57 59 59 57 54 54 57 59 59 57 59 59 59 59 59
59 50 57 57 57 47 47 47 50 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 57 57 52 43 37 57 57 57 57 57 52 57 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57
57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 59 57 59 59 68 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68
57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 50 43 43 57 57 59 68 59 59 57 59 47 57 48 47 47 47 59 57 57 57 54 57 57 48 46 44 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57
57 54 57 48 50 47 47 47 50 59 59 54 54 54 57 54 54 54 48 43 43 43 43 43 47 59 48 47 47 47 47 50 53 59 59 59 59 57 43 43 37 37 28 34 34 39 34 36 34 41
41 36 36 39 39 39 34 25 16 11 15 14 27 27 37 29 29 32 37 41 27 28 25 25 28 34 34 59 57 48 48 48 47 47 47 47 42 48 37 37 28 28 37 41 41 46 41 44 37 19
12 12 15 19 29 47 25 25 11 11 11 18 19 25 28 31 28 36 39 39 39 43 36 31 33 28 25 19 28 31 41 31 48 36 33 33 26 21 12 13 18 21 21 20 19 17 15 15 24 25
30 17 17 17 17 15 19 23 18 19 22 30 16 16 10 10 10 15 15 10 10 8 8 8 9 13 19 19 23 21 16 18 16 17 12 12 12 16 15 16 15 15 15 21 17 20 12 14 13 11
10 10 13 13 13 15 15 17 11 16 14 11 10 10 15 24 17 19 19 32 28 28 23 28 12 8 8 8 8 9 12 21 21 19 15 10 10 10 11 14 19 19 10 8 8 8 8 8 8 8
8 10 11 11 18 10 10 8 8 8 8 9 9 9 11 10 13 12 10 10 10 22 21 14 11 10 9 10 8 8 8 10 10 10 8 10 12 15 10 10 10 10 10 19 10 14 9 9 9 8
8 8 11 11 11 17 11 9 9 8 8 12 8 8 8 11 10 10 10 10 8 8 8 10 8 10 8 8 10 10 10 6 8 8 8 11 11 12 15 10 9 9 10 10 10 10 9 9 8 8
8 8 10 10 12 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 9 9 9 10 10 10 9 9 13 9 9 9 11 13 13 8 8 8 10 11 8 9 9 9 10 13 25 15 16 10 10 10 10 10 10
8 8 6 6 6 8 9 11 14 12 15 15 13 10 10 10 16 19 24 11 12 10 8 8 8 10 8 14 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 12 8 8 7 9 9 14 17 18 12 12 18
18 12 11 10 10 8 8 10 10 10 9 9 9 17 13 22 16 12 10 10 9 9 9 9 10 13 10 10 10 8 8 8 11 10 10 10 10 9 9 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 9 8 8 8 8 11 8 8 8 8 10 8 8 8 10 13 10 10 10 10 16 17 20 18 10 6 6 6 7 6 8 10 15 14 12 10 10 9 9 10 8 6 6 6 8 6 9 8 8
6 6 6 6 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 10 9 14 13 11 9 9 11 12 11 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 9
9 9 9 13 17 12 8 8 8 8 8 8 8 12 10 13 6 6 8 6 |