BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-350L04.T7 (MSMg01no350_l04.b1) | MSMg01-350L04.TJ (MSMg01no350_l04.g1) |
ACC | AG462248 | AG462249 |
length | 779 | 754 |
length of high quality (start - end) | 170 (52 - 221) | 395 (87 - 481) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no350_l04.b1 PHD_FILE: MSMg01no350_l04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:42:42 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no350_l04.g1 PHD_FILE: MSMg01no350_l04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:42:42 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CAACCACTTTTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCCAGAG
GATCCGCGGAATTCTTTGTTCTGCTCTGAGCCCCATTTTTTAATGGGGTT
GTTTGATTTTCTGAAGTCCACCTTCTTGAGTTCTTTATATATGTTGGATA
TTAGTCCCCTATCTGATTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGGT
GGTGGTCTCTTTGTCTTATTGACGGGGTCGTTTGCCTTGCGGAGACTTTG
GACGTTTCATTACGTCCCATGTGGCAATTGTCGGTCTTACAGCACGAGCG
GGTGCTGTTCGGTTCAGGAAGTTTTGCCCTGTGTCTGTATCGTCAAGGGG
TTTCCCCACTTTCCGCTCTATAAGCTTACGTGTCTCTGGTTTTATGTGAA
GCTCTTTGATCCATTTATATTTGACCCCCCCCCCCTGATATTATTCTGTT
ATCGATTCCCCTCCTTCTATCTGATTATAACCCGTTGCTTTCCTCTCCAC
TTGTTGTTAATTGCTGTATTTTTTTCCCCTGGCTCGCCTTTAGTTCCCCT
CGTCTATTCTTCTACCTTCATATCCTTTTTCGTCCTTCTTTTCTTGTTTT
TTTATGCTATTTACTCCTCATTACTTTGTATTTATCTCTCCTCCTTATAC
TTGCCGCCCTTATTTCTTTACCCTTTCTTCCTACCCCCTCCTCTATTTAT
TCTCGCTCTTCTCTTCCCCTTTTCCCGTCTGTTCTACTTTCTTTTACTTT
TCCTTTCCTATTACCTTTCTTTCCATTTG
| NNNNNNNNNCCTATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACATGGTGAACGGA
CTCCTGAAAGTTGTGTGCCTACACACACACACACACACACACACACACAC
AGACATACATGCATGCTCTCACACATGCATGCTCACACACACATAATAAA
TAAATGTGCAAAAAGAGTTATATTTTAAAAGAGTTATTTGATACATATAA
TTTTTCCATTTCTTAAAGAGGAAGGCAAATTTGAATAATGAGATAAACAT
GCTTATTTAGTTTTCCATAAAGAATTAAATGCTTGCTGACTATTTGATAT
GGTAGGACATAGACCATCTTCATTTTCTCCCCCCTCCCAAAATATACTAC
TGTTGTGTGTGTGAAGCTCTGATGTATTATGAGTGTGGGTATAATGTGTG
TCAGTGCATTATTAAAGGACATCTTTCAGAAGTTAGTTCTCTCCTTCAAG
TATGGTTTCTGGATATTGAACTTAATTTGTCCGGCTCTGCCCACGAATCC
TATGTATTTATAAATCCATAACCCTGATAGGTCTTAAGACAGTAGAATTT
CCCCCTCCTGTCTAAATTAATTTTTATATCATCACTTTAGTTCATATATA
CTGTTATTTTTTAACATTTCCTCTCTTACTATAAATATAATTTAAGTTCT
TTTCACAACCATCTTACCCCGCCTTTTTTTTACTAATATCCCATATCTCA
CCTC
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 8 6 6 6 8 9 9 8 8 8 12 12 21 34 43 39 37 37 32 23 23 27 30 33 33 37 42 37 41 48 48 30 28 19 19 18 21 23 12 12 10 10 10 13 16 18 18
18 24 24 26 28 47 48 48 35 30 31 31 31 31 59 59 59 29 19 8 8 8 8 8 8 8 21 27 46 46 40 43 43 48 48 48 48 59 53 57 53 53 47 47 47 50 57 59 59 59
59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 53 53 54 48 48 48 48 54 54 48 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 47 47 57 57 57 57 57 68
68 68 57 57 44 44 46 48 57 57 57 54 54 47 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 27 21 10 11 11 21 21 59 57 57 54 48 27 27 11 11 11 23 15 15 15
34 34 48 48 25 25 11 15 18 32 34 26 18 18 30 30 29 41 14 12 12 25 10 8 8 8 8 17 8 10 10 9 10 9 19 11 13 10 19 13 8 8 9 11 11 30 30 57 57 19
22 9 12 9 10 23 34 54 42 40 26 21 23 20 20 20 30 27 27 11 12 11 11 11 10 17 17 19 8 8 8 19 10 11 11 27 34 32 32 20 15 15 10 8 8 8 8 10 8 8
8 10 10 19 24 43 42 21 21 11 11 11 21 27 11 11 11 22 11 11 11 21 27 16 11 11 11 18 11 12 10 10 8 8 8 8 11 17 19 13 8 8 8 12 15 10 15 9 9 9
9 23 23 48 48 48 48 59 48 48 28 21 8 8 8 8 21 23 48 39 40 24 21 12 12 11 17 10 10 10 10 12 19 28 28 43 43 32 34 25 25 29 33 39 39 37 32 32 18 17
10 11 11 10 10 11 18 18 16 23 23 27 25 14 9 9 8 8 8 15 19 14 15 17 19 19 22 11 11 9 9 8 8 6 8 6 6 8 10 11 10 8 8 8 8 8 10 13 13 9
9 10 10 8 8 8 8 8 13 10 8 8 8 8 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 12 9 10 8 6 10 6 6 8 8 12 11 8 8 10 10 10 8 11 11
15 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 12 12 10 10 13 13 16 11 11 12 13 11 10 10 10 10 8 8 11 10 10 6 8 8 8 12 12 14 13 13 10
10 10 10 10 10 8 8 8 8 10 12 12 10 10 11 12 8 9 10 8 8 6 6 8 8 9 9 10 10 10 9 8 8 8 10 11 16 11 11 8 10 8 8 8 8 8 11 8 9 9
9 10 10 9 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 12 9 10 11 8 8 8 8 8 10 11 12 10 11 11 11 10 9 9 8 8 8 8 8 8 10 7 6 8 8 6 6 6 6
10 6 6 6 6 8 7 8 12 8 9 9 9 9 9 9 10 8 8 11 15 18 13 11 8 8 8 8 8 8 9 11 11 11 16 16 14 14 10 10 11 10 10 8 9 10 12 12 11 8
10 8 8 8 8 8 10 13 15 11 11 8 8 8 11 11 11 8 8 8 8 11 12 12 12 6 6 8 8 8 8 8 8 13 10 9 9 9 13 8 8 8 10 10 8 8 8 8 14 22
19 13 13 10 11 8 8 8 8 9 8 8 8 8 11 13 18 11 9 12 11 9 11 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 7 11 11 11 11 9 10 13 32 32 15 15 11 11 11 19 17 37 32 33 33 32 37 32 30 39 39 37 34 29 24 16 17 24 19 21 26 35
35 35 50 50 57 57 57 53 43 43 48 48 48 57 57 59 57 68 68 57 57 21 23 12 15 22 32 32 46 46 50 50 50 42 50 50 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 51 51 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 57 68
68 68 50 51 51 57 57 68 57 57 57 68 68 68 68 68 59 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 57 57 57 57 57 59 59 57 59
57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 59 57 59 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
59 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 59 54 54 59 59 46 57 43 42 35 35 35 30 32 41 59 59 59 47 59 59 48 59 57 57 48 48 48
46 39 59 47 48 48 46 46 46 43 41 21 18 9 9 9 9 10 20 28 28 39 37 37 28 17 16 10 16 15 13 16 11 10 8 8 8 8 11 15 33 33 23 22 15 18 16 19 18 19
28 20 26 15 18 15 15 19 17 23 9 9 9 10 10 14 18 22 20 20 25 25 15 12 8 8 8 8 8 13 8 8 8 10 13 12 11 11 11 13 14 13 8 8 8 8 10 10 12 11
11 10 10 8 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 10 10 9 11 14 14 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 15 8 8 9 9 9 9 11 8 8 8 8 8 8 17 13 8 8
8 10 18 13 10 8 10 10 12 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 13 6 8 8 8 9 8 8 8 8 8 6 8 8 8 10 11 10 12 9 9 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8
8 9 11 9 12 10 12 9 9 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 8 8 12 10 8 8 10 10 11 12 12 12 10 10 10 11 14 14 8 8 7 7 8 8 6 6
12 8 10 11 11 11 10 9 9 7 8 8 8 10 9 9 9 10 11 9 9 7 11 10 11 11 10 8 6 6 8 12 10 10 11 11 14 11 13 8 8 6 6 8 8 10 8 10 10 10
10 10 10 9 |