BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-388C11.T7 (MSMg01no388_c11.b1) | MSMg01-388C11.TJ (MSMg01no388_c11.g1) |
ACC | AG490716 | AG490717 |
length | 1,447 | 752 |
length of high quality (start - end) | --- | 578 (79 - 656) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no388_c11.b1 PHD_FILE: MSMg01no388_c11.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:31:25 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no388_c11.g1 PHD_FILE: MSMg01no388_c11.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:31:25 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CTCTAATGAAATCAGNCTGGCTGGACAGATGTCCGCATCGNGAGGAGTGC
GCTCTGGGAGCGGCCCTGCTTCTTCACTACCTTCAGGGTATACTATCATC
ACACTGTGCGACGCGCTCTCTCGCGCACTCCGATCAGAGACGCGCGCGAC
GCAAGCATGTTGCGCTGCGACGACGGCGAGTATATACCCACAGCCTACAT
GGTGGCTGGAACATAGTAATACAACTAACCACACACAACACACAGACACA
CCCAGCACATACTCTAAATAAAATTATCATGTAATAGAAAATATTACTGA
ATGTAACGGCGTGTCTCGCTAGATGCGATTTAGTTGTTGAGGAGCCCGCG
CGACACAGAGACACAGCACTCACTACTTGTTAGCCGTGCTAACATCCATG
CTACAGAGTGTGCGACGCTTTGGTTGTGCACGCATGGCTCTCTGTCGCTC
TCGCGCATACTCGCACCACACGCAGCGACCCACCCGCGGCACATCACGAC
CTCCTTCTCGCTTCCGTGATNCTCGTCCTGACGGTATGACACGTAATAGC
AGGGAGTGTCTATCTCACATGCGGCCGTACCTCCCACCGCTGCTGTCGCG
CGTTCATATGACGTAACTCGTGTCCAGCGTCGTGTCCTACTCCACTNACC
ACACNGATCAAATAAACCTACCAAGTCGTAGACAGCTAACAACACACAAC
CGCGATCGAGTGTGATTTACGTCACATGTGTCGAGACTGAGCGAGGGCAG
TATAACACCGTGCATCCGATATACGCCAACNCGAACATCGATAGAGCGTA
TCGTAGAGTCTCCATTCACTTACGTCACCACGCAGCCTCTATACACTCGC
TGCACTGCCCTGAGTGTGCGATAATACTCACAGATCGCTCTGACACTAGA
CGATAAGTAAAGCGACAGATACGACTGAGGATTCTAATATATACTCCTTT
ACTGACTCTCAGGCCGATCTCAACAGTAAGACACTCATCATGTAATGACG
CTGCTAGAGGCACGTACCATCATCACTCTCCTACACCTCTAGATCAACAC
ATACTACACCAAGCGAGAGTAGCAGGTGCCGAGTCAGTGATATATCTCAG
TACGACTTCTCGGATCATACCACTAGCCACAAGCGTCGCCGCGATCATGT
CGCGGTGTATTACAGACCTGAGCGTACGATGCAGATTCATAATCTGATCC
GTAACACCGATCAAGACGCGCATAATGCATCGTAGCGGTATTATATTACA
ATAGAGAAGTGTTATACATTCACGCGATAGAGCGAAGTTGTGTTAACGAG
TTACGTGTCTTACTTACCTGCGATAGGAGNACANGCGCCTATGCACATAN
ANATCGTCAGAGTCACATGATTGTCTAGACGCGAGCAGTGTGAGTAGTCG
ATATGCATCGAGCGTGACTCGTTGCTATGACGCTGTGCGCGGCCACC
| CCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATTGACTTCTAAGATGAATAGA
CATTAACCTCAGAAAGGAGAAAATAGTCAGGGAAATGTAGTTTTTTTGAT
GGAAAACCACAGCTTATGCCTGCAGAGAATTAGGAGTGAGCATGAAGCTG
TCGAAGAACTAAGAAGAAAAATAATTCAATTGGAAGAGTTTAGCACCAGC
ATGGGTTCTCAAAGGCAATTGCTTGCCAGTGAAGGACACAAAAGGAGATT
GAATCACTTCAGCACTTACACTATTTCAACAACAACAACAACAACAACAA
CAAAAAGGCAGAGTGGGGAGATGATTGGAGACTGCACTATGGGTTTCTGT
GAAACAAAAAAATAAAATTTAGTTGTTGTGAATACTTGCTTAATGATCAT
GGGAGAAACATGAAAAGTCTAGAACTATTTTAGAGGTAGAAACAATAACA
TATAGTGAAAATTTGAAACTTCAATTGGGGAGGTGGGGTTTGACGGCATA
AAGTGATAATTTCTGATGAAAGCTAAAAGGTATATTATCCTTCCTTTTAC
TCCAGNGATACATCATCCAGCTACACACACACACACACACACACACAGGT
TTAATATTTTAGCCTGTGATAGGTGACAACATAGATTTGAAAGCCCTGAG
TATTCCCCATTGCTTGCTGAGTTATATCTAAGGATATTATTTTTTTCGAT
TT
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 9 9 12 10 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 17 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 10 9 9 9 9 9 9 3 0 3 8 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 6 8 8 11 16 8 11 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 10 10 9 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8
8 6 6 8 6 6 6 6 8 9 6 6 8 8 8 10 8 7 9 9 10 10 10 10 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8
11 11 9 9 9 6 6 6 7 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 10 12 9 9 8 8 8 10 15 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 9 6 6 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 14 8 8 8
8 8 8 8 8 12 8 10 9 7 7 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 10 8
8 8 7 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 7 7 8 8 10 13 12 12 12 8 8 8 8 11 11 11 11 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 8 8 9 9 8
8 8 10 11 11 8 8 7 7 9 8 8 8 8 8 8 6 8 11 6 6 6 6 8 6 9 6 7 7 8 8 8 6 6 6 6 8 13 10 8 8 6 6 10 10 10 8 8 8 10
9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 9 9 8 8 8 8 8 6 6 6 8 13 10 10 15 12 12 8 6 8 6 7 10 10 8
8 8 8 9 9 9 10 10 8 8 9 8 6 6 6 7 10 9 8 12 8 8 8 8 6 6 6 6 8 7 7 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 8 6 6 7 7 6 10 10 11
10 13 12 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 9 7 3 0 3 10 10 10 8 8 6 6 6 8 8 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6
7 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 13 10 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 12 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 13
11 8 8 8 8 8 7 7 7 8 8 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 10 10 8 11 8 8 10 10 11 8 6 6 6 6 10 15 17 17 11 8 8 11 8 10 3 0 3 6 8
6 7 8 3 0 3 6 8 8 8 8 10 10 11 11 9 9 12 7 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 6 8 6 6 8 8 9 8 8 8 8 6 8 6 7 7 8 12 8 9 9
10 10 10 10 7 6 6 8 10 10 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 13 10 8 8 8 10 11 19 13 8 8 8 8 8 8 6 7 6
7 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 12 11 10 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 6 6 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6
8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 6 7 10 10 8 8 10 6 6 6 6 8 10 8 8 6 6 8 6 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8
8 8 10 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8
8 8 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9
9 8 8 8 8 7 7 9 11 12 12 12 8 6 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 9 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 8 8 10 8 8 8 10 10
7 7 7 8 8 8 8 8 10 12 12 11 10 10 8 9 9 10 10 8 8 8 6 8 6 6 8 10 11 8 8 8 6 6 6 6 10 11 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8
11 11 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8 10 9 8 10 10 8 8 8 8 10 8 10 10 13 8 7 7 7 8 8 8 8 10 9 14 10 8 8 6 6 6 6
6 7 7 12 8 11 12 13 13 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 10 8 10 10 10 10 12 12 15 15 12 12 12 11 11 11 10
13 9 9 9 8 8 8 8 11 9 9 10 8 8 8 10 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8
10 10 10 8 8 8 8 10 8 10 10 10 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 6 8 8 8 8 8 10 10 8 13 6 6 8 10 8 8
8 8 8 7 7 8 8 8 9 7 8 8 8 11 12 10 10 10 10 10 12 9 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 8 8 8 11 8 6 6 6 8 6 6 6 6 8 7 8 8 8
8 8 8 6 7 8 8 8 11 8 8 8 8 8 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 3 0 3 8 3 0 3 6 7 6 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 3 0
3 0 3 10 8 8 6 6 6 6 8 10 10 12 6 6 8 8 6 6 6 6 6 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 9 9 8 7 7 7 8 8 10 8 8 8 8 12
8 11 10 10 10 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 7 6 6 8 10 10 8 8 8 8 10 10 13 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 | Open.Hide. 6 6 7 7 10 12 8 8 8 8 8 21 23 30 27 28 32 29 27 39 29 30 34 34 34 39 23 21 14 24 23 15 11 11 9 10 9 9 10 10 14 14 10 11 11 15 23 28 34 47
37 32 32 20 20 18 27 34 37 25 15 9 6 6 6 6 6 6 13 15 15 12 11 11 17 20 27 14 14 14 27 34 47 46 47 47 37 34 28 34 36 53 53 53 53 53 53 47 43 37
28 28 28 43 43 34 28 23 25 16 13 13 34 34 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 41 29 36 22 22 22 40 44 51 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50
57 57 57 57 57 46 46 43 43 37 43 43 57 50 50 57 57 57 50 54 57 50 57 57 57 57 50 50 50 51 51 51 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57
52 52 43 50 59 57 57 57 57 57 52 57 57 57 59 59 68 68 51 68 51 51 51 50 50 50 37 35 35 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 48 44 57 46 48 48 48 57
57 57 57 48 44 44 46 57 57 46 43 43 59 59 68 68 68 68 59 59 59 68 59 59 59 46 43 43 48 48 57 68 68 54 57 57 48 48 48 48 48 57 59 59 59 57 57 57 57 57
57 57 57 48 48 48 48 47 47 39 39 39 37 48 50 47 37 27 26 15 12 12 11 12 11 12 12 15 21 32 36 47 47 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48
48 48 57 57 68 59 59 59 57 57 54 54 57 59 57 54 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 48 48 59 59 59 59 68 68 59 59 57 57 57 57 59
59 59 57 57 54 54 54 57 59 68 68 68 68 57 50 43 41 43 32 32 17 18 19 24 43 44 59 59 59 68 68 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 54 54 47
57 57 59 68 68 57 57 57 54 54 47 57 59 59 59 59 59 48 44 57 44 48 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 44 43 43 43 43 48 59 48 48 48
48 59 59 59 57 57 59 59 57 57 50 50 50 50 59 59 59 47 41 26 25 14 14 14 26 31 43 47 47 47 59 48 48 48 48 57 57 57 57 57 59 59 43 32 28 24 32 32 46 59
57 57 54 54 54 54 54 54 54 48 43 42 43 37 37 40 40 47 47 47 50 47 47 47 43 43 43 31 39 36 36 30 30 30 39 39 39 39 31 31 35 37 36 34 41 41 41 41 44 32
24 24 11 11 3 0 3 20 17 22 19 19 22 24 30 37 37 37 37 32 35 22 27 12 15 15 30 30 39 41 47 41 37 19 18 12 12 11 22 30 47 47 47 47 47 41 32 31 28 27
28 27 18 15 11 11 16 21 19 14 9 9 9 10 14 11 11 10 9 9 8 8 8 10 13 19 14 12 12 12 12 12 11 15 8 13 10 9 13 8 8 8 10 14 15 14 14 16 13 12
9 9 9 9 16 19 21 10 8 8 8 8 8 8 15 24 12 12 12 17 10 10 12 15 11 8 6 6 6 8 8 8 9 10 11 14 18 21 28 28 28 16 13 19 10 9 8 10 10 17
13 12 |