BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-448L04.T7 (MSMg01no448_l04.b1) | MSMg01-448L04.TJ (MSMg01no448_l04.g1) |
ACC | AG536849 | AG536850 |
length | 773 | 769 |
length of high quality (start - end) | 363 (70 - 432) | 240 (79 - 318) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no448_l04.b1 PHD_FILE: MSMg01no448_l04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:18:03 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no448_l04.g1 PHD_FILE: MSMg01no448_l04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:18:04 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTACAGAATACGCGGAATTC
TCTTGAGGTTATCAAAAATCCTGGACACTTGCAGAGGAGTGCTGAGCTGA
TATGCTGCCATCCGAAGTCTGCACAGTCTCATCAGCCCTGGGGTCAGATG
AATTACTGACTTCGTGATTCCCATCAAAAGTGTCGCGGGCAGGGGTGGCC
TGAATTGCTGCATCCTGCATTTTCGTCTTCTCCACACCTGGTTGATTCAA
TTTTTGATCTGGTCCTGGTGATGCTGTTAGATGATTTTCCCTCGAACTTT
TAACACTGTCCATTCTTTATGCTGGAGAGCCTGACAATCTATCAGTTTCC
ATGTCGCTGGCTTTCTTCAGAGCTTCGCCTTCGCCTTCTATGGTGGTTTC
CATTTTCCCCGGTCTGCTTTTCACATAATCTGTGCTTGTGGCACAGACCA
TGATTTCATTTTGAACTACTGAGAGGAAAAACTAATACCGCCAAGAATGT
ATTTTAAAATGAAGAAATCATTTTCTCTCTGTGTGTCACCTATCTATATA
TGGATAATTTGAGTGCTACAATCCTTTTTCAGCCTATTAACACCCCGTTA
TTTATTTGATTCACAAATTTATCAATGTCGTGCGCCTTCCGCATTATATT
GCCTTTTTGTACTAACCCTTCCCAAATCTTACACGGTTTTCCTTTTCTCA
ACTTTTCTACCTGGCCTCTAACTCTTCGAGTTGCGATTTTTTAAGAAACT
CCCGCTTCGCTGGCCTTCATCTA
| AAAACCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCAGGGAGCTGCTCGTTCTCAG
GTTCCGCTGGAATCCTGAAGAAGTTGGTTCTAATGTCAGCAAAGGAGTTC
AGCAGCAGCAGGGTAAATGAAGTTGCCAGTCAGAGTGGAGGTAAAGAGCT
AAGAAAAAGTCTCCTTCCACCATGTTCTTTTGTCTGGGCTGGCACCAGCA
GGTTTTGCCCATATTTAGGGTGGATCTTCCTGCTTCATATAGTCTTACCA
AGAAAATCCCTCACAGGTGTATATCCAGCAACCTGGATTTTCATCGACTC
AAGATGCAGTCAAGTTGACAGCTGAGATTAGCCATCACACAATTTTATTA
AACCACAACACACACTGAGCTCCTTCTCCCTTGTGGAGGTATATTTTATC
ATATGCGAGGTATCAGTTAGTCTCTTACAGCGACATGTAAAGTGACTGTT
ACCCTGACACTTTTCTCCATTGAACGAATCACTCTGTACCTTTTTACTCT
TTCTGTTCTCCTGTCTCCTCAGGTCTAAATCGCGCCTTCCCAACTTCTCG
TCTATCCCTTTATAACATTTATTTTTTTTTTCCGCTTCCCCTCTGCGGGC
CCCGTATTTATCATTTCTACTCTTACCCAATTATTATCTTTTGTTTTTCC
CTTGCCCACCCTTAACTTATTTTTTTTTTCCGCTACACATTACTTTTTTC
ATTCTCTTTATCTCCTTTT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 14 21 23 17 14 11 11 11 17 9 9 9 19 19 42 48 27 21 10 9 9 22 19 23 9 9 9 9 9 9 9 7 7 9 9 9 9 12 12 12 21 21 30 30 37 33
59 59 59 41 27 23 9 6 6 6 6 6 6 6 6 8 12 15 16 16 19 28 28 34 34 37 44 44 53 53 53 53 53 53 42 50 50 50 53 50 50 50 57 57 57 57 57 50 50 68
51 47 47 68 68 68 50 50 42 44 26 29 22 21 18 14 30 34 37 37 32 44 44 54 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 51
50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 68 57 50 50 50 50 50 50 38 38 15 15 11 27 27 68 57 57 54 54 54 59 59 59 59 57 57 57 52 57 57 59 59 52 52 52 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 57 57 59 59 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 59 59 68 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 44 42 42 28 38 32 22 25 33
36 44 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 48 59 59 59 59 32 28 40 37 39 39 47 59 59 59 59 46 46 48 57 57 68 68 57 59 54 48 57 57 57 50 50 50 50 57 57 59
59 57 57 48 57 43 43 46 37 37 37 24 29 12 12 8 13 6 6 6 6 9 9 11 18 25 28 36 39 39 43 48 43 43 40 43 43 57 59 59 59 59 48 48 48 48 48 59 59 59
57 43 43 35 35 25 27 15 15 13 18 26 44 47 54 47 44 44 43 43 46 43 43 43 48 48 54 54 57 57 57 57 48 48 48 43 43 39 39 28 34 34 18 18 13 21 21 34 33 32
32 35 37 47 47 43 43 37 39 41 37 30 30 20 15 9 9 10 19 21 36 36 36 35 35 37 31 28 22 22 22 26 31 20 20 15 24 18 23 23 28 23 25 25 25 25 31 34 37 30
22 23 22 14 15 12 11 11 11 16 12 29 24 18 18 28 28 33 31 28 24 18 13 13 14 12 10 9 9 9 8 8 9 9 8 8 9 9 11 11 11 10 10 10 8 8 10 15 17 15
20 12 9 9 16 11 14 19 23 15 15 13 10 10 9 9 9 6 11 6 6 6 6 9 8 8 10 10 10 10 16 12 14 14 10 9 9 13 10 15 16 16 21 13 14 10 19 12 10 10
8 8 10 11 11 16 10 12 11 9 10 9 11 11 11 11 12 9 8 8 8 10 10 10 10 11 18 19 14 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 12 12 10 10 9 9 9 8 8 8
8 7 6 6 6 10 8 8 11 8 8 8 6 6 6 7 6 10 12 10 15 15 13 9 9 10 12 8 8 6 6 8 8 8 8 9 8 8 7 8 8 10 8 8 10 10 10 10 8 8
8 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 15 12 24 15 13 13 11 8 6 6 6 8 8 8 7 7 7 7 7 10 12 10 10 8 8 8 8 8 8 11 10 10 8 8
8 6 6 7 12 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 12 13 12 16 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 16 15 14 11 10 10 8 8 11 14 10 11 11
15 17 11 9 10 10 10 8 8 10 10 10 12 12 11 10 8 9 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 6 7 15 15 15 11 9 9 13 13 22 30 23 16 9 10 10 21 21 33 33 33 37 37 39 34 34 31 23 12 9 9 8 7 6 9 9 9 12 21 17 19 12 16
30 32 26 14 14 17 27 23 36 29 16 9 9 6 6 6 6 6 6 9 17 12 10 13 23 27 33 33 33 36 36 35 35 38 36 36 37 57 59 57 57 57 57 57 59 50 50 48 48 48
48 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 50 50 42 48 37 32 24 19 19 28 32 39 39 44 44 57 57 68 68 48 57 44 44 37 42 35 35 35 43 42 43 47 57 57 57 57 57 57 57
48 47 47 47 50 50 54 57 57 50 50 43 44 23 28 28 44 44 57 57 57 57 54 57 57 59 57 57 57 43 42 33 33 33 44 43 52 52 37 52 43 50 39 43 43 57 57 54 54 52
57 52 52 57 52 52 52 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 52 50 48 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 50 43 37 43 36 36 33 29 29 40 44 57 44 44 20 22
20 28 33 44 44 59 54 54 57 57 68 57 57 57 57 57 54 54 54 48 57 48 48 48 57 48 57 54 54 54 57 54 54 46 43 36 43 43 43 47 35 35 35 39 43 57 57 57 57 57
57 57 48 48 48 48 48 48 48 43 40 40 40 30 21 10 10 10 10 9 9 9 11 9 18 11 12 12 19 19 28 32 34 34 23 23 23 31 34 36 48 39 39 24 28 21 23 18 34 15
20 20 28 32 28 28 13 13 12 23 12 11 11 12 18 22 28 28 14 12 12 15 19 20 18 18 16 19 17 11 12 16 15 28 28 30 28 28 23 23 24 25 25 34 34 43 43 30 26 14
13 13 12 13 13 11 11 11 12 12 19 19 22 16 14 23 29 17 17 17 20 41 41 46 57 41 40 25 25 25 29 32 31 30 30 30 32 39 39 43 39 39 36 36 43 37 35 26 26 15
15 15 19 17 11 11 11 11 13 15 24 24 17 15 15 12 12 12 11 12 12 18 25 32 28 19 10 10 10 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 13 11 11 11 11 11 12 11 10
10 10 8 8 10 8 8 8 8 8 10 18 13 8 8 8 8 6 6 6 8 13 9 9 9 13 10 9 8 8 8 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 13 9 8 8 8 8 8 12 15
8 8 8 8 8 8 15 10 11 10 13 10 9 9 8 10 10 10 11 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 21 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 9 12 11 11 11 16 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 6 8 8 10 19 19 15 15 8 8 6 6 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 12 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 12 8 8 8 8 13 15 24 17 10 8
7 6 8 8 10 9 9 12 10 9 9 11 9 9 10 8 8 8 8 8 10 10 16 18 17 23 21 28 10 10 8 8 8 6 6 6 6 6 9 8 8 7 7 7 13 18 11 10 10 9
8 8 8 13 9 9 8 12 6 6 6 7 10 7 10 8 8 8 8 |