BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-475D24.T7 (MSMg01no475_d24.b1) | MSMg01-475D24.TJ (MSMg01no475_d24.g1) |
ACC | AG557120 | AG557121 |
length | 1,999 | 760 |
length of high quality (start - end) | --- | 355 (87 - 441) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no475_d24.b1 PHD_FILE: MSMg01no475_d24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:53:58 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no475_d24.g1 PHD_FILE: MSMg01no475_d24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:53:58 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GATACATATACCCGCGCGCATCTCGCTGTCTCGCCCCCATAGCGCCACGC
AATATCCTATGCGCACAAATATCTCTTATAGTTGTTGTCCTGTCCTTATA
TCGCGCAACGCACTCGGTCTCTCCTCTCGGCACACTCACTCATTCTCCTG
GTAGATAGCATGACCGATTATGTGCGCGCAGCGACGGTTCTGTCGCAGTC
ACACACCTCTACATATTGTATAGATTATACATCGTATAATCATCATAGAG
ACAGCGTGATAACGCATGGACCGACACTAACACGATACGTATCGCGATGG
CGCGTACAGACTATCGAGGCGATACTATCGGAGCTCGTAGATAGGCATCT
ACTCACGCCCGCAGAACACGCGANATGTGAGTCGGATTACATCTCACGAT
TAGCTGCGCCTACGATTTATACTCACTGTATATACTCGACCGCGATACTC
CCATGGACCCATAATAGCTTGACTTCATACTATTACAACTGTACCTACCA
GAGCAGTGGTATGGTATGAGTATGCACTGGATAGAGCATGACGCCAATGT
GGATGCTCGCTGGATGTCTCCTATATTATTATCAATATAAGACATGTGCA
TACTATGAAGATATCTTACAACGCACGCTGCCCCGAGACCAACAGAGCCG
ACGTATGATATATATATACATCGGCCAGATGGATGAGAGCACAACAACAT
GCGAGTGCGANATAGCACTGTGCGATGTTGCTGCGTACGGCTATAGATAC
TGCGGTTAGACGACCAGCTCACACGTGTAGACTATTCTACTAATCGTCAC
GATCCCACAGCACGCTACACGCTCATCGCACCGCGAGNGAGANTAGTATA
TGTGGATTCACCGATGNACCATGTGCGCGTCTCGTCTCATGCCGTCCGCA
AGTCACACTATGCTGATCGATCCGAGCGCACACACAGCGCACATATTCNA
CGACTCACTACATAGACGATCGTGCTGTACTGTCTGATTACACACCATGA
TGTACTNCNCGATACTACTGGATGATGATACTACGAGATCAGTGATACTG
ATATCGTTTATCNCGCACGCAGCTGACTCTGAACGCTTAGCCTACTATAA
ATAACATCATGATATATATTGTNGCTANATGTGTATAGTGGGTGATCGAG
AGCATACACACAGGATGGTCGGTANGTTAGTATGTGCAGCGCCTATGACG
TGAGAATATATAGATATGATTNATATAGACATCGATATCGTNGACGACGA
CATTATCACAGNATGAGCGTGTGGATCAATCGAACCAACATGCAGCACAC
GATGNGTACAGACACATAGCTTGATAGCATCGACGCGGCGCTAGCGACAC
AGCGTACTNGNGATACACACACAGCACCAGCAGATGGCGAGNTACTAGGT
GGTTAGTACTCTGCTCGACGCACATCACGACGTATATACTACTACATNCN
AGTGCACGTANAGACGCTACGCCACGCATCAGCGATCATGATCNATATAT
ACATTGTCGTGAGTACTGTATATGTCGACACGTAGCGTCTGGTCGACTCA
TGCACTCTATGCATCNGTCGCTACGGATACGGATATATATGTATATAACG
CATCGATATGNGCCATAACCGCAGATGTGCTATGACTCACGTACGCGTAG
ATCANTACAGTAGCCGATCCGATANAGTGTNAGAGTGTCAATANGACAAA
ATGTCGACGTCGCACATATNTCGAGATANCGAGTCGGTCGAAGACCGCAG
CGATAGATAGACGACTGTCGCAGACATATCGCGNCGAATGNGNACGATAT
CTCTCATCTNATCCGATATCGTATGTACTGATGTGTGATCAGATAATACA
GCGATATAGACATGCTGACGACACGACAGNTCGATATCGTGNTNCATACG
CGNCNACACTACAAATATGAACGACGCGTGTTCGTCAGTGTAGATGCGTG
TGTACTCNCACCTAGCGATACGACAATCGTACTATCTCACGCACTNCTN
| NTTCCTTCGAATATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACTTATGCACAG
TGACTCTTACTCTTTGAGCCATTTCTCCAGCCCTACTGTTGTACCTATTA
TCATCAGCTCTTGAATAGCAACTTTTGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTGCC
ACCAGTTATCATTGTTTCAGTTTGAATCTGATGTCTTCAACACGCTCATG
TTTTGAATGTTTGGTTCTCAGCTCTTGGTGCTGTTTGGGGAGTCCGTGAA
ACCTAGCTAGCAAAAGTGACTGGAGACAAGCCTTTGAATGTTTCCATGGC
CTCTCCCTTTCTCCTCACTTCCTGGTCTGTGAGGTGAAAGCTTGTCACAC
CATCTACTTCAGGACTGCTGCTCTACTGTGCCTTCCCTGGTATGCAGTGT
TCAGCAGACTTTCCGAGATAAACCCGGAGCCCACAAAAAAGATTCTTTAA
GTTGTTTTTATATGCGCGTGAGGCCCTGGCTAAAACCCTTCTGACTGGTT
CCTGGGGCTCAAAATTGGGAGTTTCCCTGGCTACATCTTACAATCTGTGC
TTTTCTCTTGTCCATCCACTCTTCTCCCGATTTCTTTATTCCTCTCTTCC
CCCCCCCTTTCCTTCCCCTTTTCCCCTATTCCGTCTCCATTTTCCCTCCC
CTTCTTTTTTCCCCCCTCCCCCTTTTTTTTCCTTTCCCCCCCTTTCTCCC
CCTTCCCTTG
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 9 9 9 8 8 8 8 10 10 10 8 6 6 6 6 6 8 8 6 8 10 10 10 10 10 11 9
9 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 9 8 8 8 7 7 6 8 11 10 9 8 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 7 7 7 11
10 8 8 8 8 8 8 9 9 12 10 10 10 10 10 8 6 6 6 6 6 6 8 7 8 8 11 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 6 8 6 9 10 10 11 13 12 9 8 8
8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 6 6 6 9 7 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 9 9 10 10 8 8 8 8 10 10 12 7 6 8 8 6 6 6 6 10 10 9 9 10 16
11 13 13 13 10 7 6 6 6 6 8 6 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 19 17 12 10 10 10 11 11 9 8 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 7 9 9
11 12 11 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 8 10 10 10 10 10 8 9 8 8 8 8 11 11 10 10 10 19 9 8 8 8 8 8 8 8 8 11 9 9 8 8 10 8 8 8 8
8 10 13 8 8 6 6 6 6 6 8 10 10 8 9 9 9 9 8 8 8 8 6 8 7 7 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 7 6 8 8 10 8 8
8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 7 7 8 8 3 0 3 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 13 11 10 10 6 6 6 6 6
6 10 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 10 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 9 8 8 8 8 6 6 6 6 8 7 9 10 7 7 8 8
8 8 7 7 10 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 14 15 18 16 11 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 10 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6
8 8 8 8 8 13 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 6
6 6 6 8 6 9 9 10 12 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 12 8 7 6 6 8 8 8 9 9 9 10 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6
8 6 9 9 8 12 12 11 10 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 8 6 6 8 10 10 12 10 8 6 6 6 8 8
6 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 9 10 9 8 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 10 7 9 11 10 10 11
9 18 12 9 9 7 7 8 8 3 0 3 6 8 6 6 6 8 8 10 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 10 10 12 10 10 9 9 9 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 10
10 9 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 7 6 6 6 6 6 6 8 10 9 10 10 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 12 8 8 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 6 8
8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 6 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 9 9 9 8 10 7 6 6 6 6 6 6 3 0 3 8 8 3 0 3 8 8 6 6 10 8
8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 3 0 3 6 6 8 8 7 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 6 6 6 8 6 9 9 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 9 10 8 8 8 6 8 6 7 8 9 9 9 6 6 6 6 8 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 3 0 3
8 8 8 6 7 8 8 6 8 6 6 8 6 9 9 10 6 6 6 6 6 6 6 10 8 8 8 6 6 8 8 9 10 13 10 8 7 9 9 7 10 8 10 6 6 7 6 6 6 8
8 7 6 6 6 3 0 3 0 3 9 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 10 10 9 9 10 11 6 7 8 6 6 6 6 6 6 7
6 8 8 8 8 8 9 8 10 10 10 3 0 3 8 7 7 7 10 6 6 6 8 8 9 10 10 11 6 6 6 6 6 8 10 10 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 6 6 6 7
6 6 8 10 10 13 8 10 8 7 7 8 8 10 10 9 8 8 6 6 6 3 0 3 9 9 3 0 3 11 11 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8
6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 12 9 8 8 8 8 6 6 6 6 8 11 11 3 0 3 8 6 8 7 6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6
6 6 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 6 6 6 3 0 3 9 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 7 7 7 6 6 6 3 0 3 8 8 6 6 6 6 6
6 6 6 6 6 9 6 8 6 6 3 0 3 6 6 6 11 10 11 8 8 6 6 7 6 6 6 7 7 7 8 15 11 9 9 7 7 8 6 6 6 6 11 8 8 8 8 9 10 13
10 9 9 3 0 3 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 11 9 9 8 8 8 8 13 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 7 6
6 6 8 8 6 6 6 3 0 3 0 3 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 7 6 6 6 6 6 6 8 9 3 0 3 8 6 8 10 7 7 8
6 6 6 7 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 7 7 8 8 8 8 8 8 8 6 11 6 9 9 9 11 10 12 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 7 3 0 3 0
3 6 8 8 6 6 6 6 9 3 0 3 10 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 12 8 8 6 6 6 6 8 8 3 0 3 9 9 7 8 7
8 8 6 6 6 6 8 6 7 10 9 6 6 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 10 10 12 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 9 9 10 11 8 8 8 8 8
10 10 11 11 11 12 11 11 10 9 9 9 10 9 3 0 3 7 8 8 8 8 10 9 9 12 10 6 6 6 6 6 8 10 11 12 23 26 15 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8
6 6 8 8 8 9 9 6 6 3 0 3 6 7 6 7 6 6 6 8 8 8 8 9 9 13 9 6 6 6 6 6 6 6 6 8 11 17 14 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6
8 8 8 3 0 3 8 8 8 10 10 11 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 3 0 3 8 8 8 3 0 3 10 8 7 7 6 8 6 6 6 6 3 0 3 8 8 9 10 10
8 8 8 8 8 10 7 7 6 6 6 6 11 10 10 10 10 10 3 0 3 8 8 8 6 6 6 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8
8 8 6 6 7 7 11 10 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 8 7 7 7 6 8 6 6 8 8 10 3 0 3 10 9 9 11 3 0 3 0 3 6 6 6 11 8 9
9 9 9 10 10 9 9 9 3 0 3 7 7 8 8 7 8 9 13 10 13 12 12 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 10 8 6 6 6 8 8 11 11 9 9 9 8 8
8 8 8 8 8 7 7 7 8 6 6 6 8 9 11 8 8 8 6 6 6 8 8 6 8 8 8 8 3 0 3 9 9 9 8 6 6 6 6 6 3 0 3 0 3 9 10 10 13 12
10 3 0 3 0 3 10 8 8 6 6 6 6 7 6 6 8 6 8 8 8 7 8 6 8 6 6 6 7 8 6 8 8 8 8 7 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 9 10 8
8 6 6 6 8 8 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 11 10 10 11 10 8 8 8 10 10 17 13 3 0 3 3 0 | Open.Hide. 0 3 10 8 10 8 6 6 6 6 6 7 6 8 8 11 8 8 6 6 6 6 6 10 23 9 9 9 9 9 11 31 37 37 37 34 27 15 9 9 9 10 9 9 10 10 21 21 39 39
37 37 37 37 37 37 37 41 41 59 59 59 53 57 35 29 12 18 9 9 9 18 20 23 14 32 28 33 33 37 40 40 47 57 68 54 54 54 54 54 54 59 68 68 68 54 54 54 54 50
50 50 51 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50
50 50 50 50 50 50 57 57 57 68 68 68 51 51 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52
52 52 43 43 35 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 52 57 57 57 57 62 62 62 52 52 52 52 52 45 52 52 62 62 39 39 39 57 57 57 57 57 57 57 57 57 45
45 45 59 59 57 57 44 44 35 35 35 41 41 57 44 44 43 43 43 35 35 43 47 43 52 38 38 38 44 33 43 43 52 52 52 57 57 52 50 50 43 43 43 50 59 54 54 54 57 57
57 57 50 50 35 35 35 59 50 52 52 57 57 57 57 52 43 43 50 50 57 57 57 50 43 43 37 37 37 43 42 35 42 42 59 57 57 40 40 28 28 28 44 44 57 57 57 57 46 57
44 44 37 48 48 59 59 59 59 59 48 47 47 43 43 43 43 43 48 48 54 54 59 59 43 43 31 34 23 23 23 16 16 12 22 19 40 40 48 48 48 32 32 16 16 16 21 19 28 28
39 39 43 47 39 41 41 37 34 37 30 24 24 32 26 32 23 23 23 23 23 28 37 37 41 30 30 17 17 17 18 18 30 21 28 23 23 18 23 11 11 11 17 16 12 13 12 21 14 8
8 11 9 13 8 15 15 12 18 18 23 15 10 10 13 12 11 10 10 10 10 10 10 9 9 15 19 12 14 15 9 9 9 9 9 9 12 12 8 8 8 10 12 15 15 10 11 10 10 9
9 10 10 10 8 9 9 9 10 8 8 6 6 6 8 9 12 11 8 8 8 8 8 8 9 8 10 12 10 10 10 10 9 7 7 8 8 8 9 11 11 10 9 8 8 8 8 8 8 9
8 10 8 8 9 9 10 10 10 10 10 10 10 10 10 13 8 8 9 9 9 8 10 10 10 14 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 11 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 11
11 17 21 18 15 12 10 9 9 9 9 13 12 11 11 9 8 8 8 8 8 10 10 11 12 11 11 8 9 9 8 10 8 13 13 15 8 8 8 11 9 11 8 8 8 10 16 14 14 10
9 11 9 8 10 10 10 10 18 18 11 7 8 6 6 8 8 13 13 10 8 8 8 8 10 15 8 9 8 10 11 9 9 9 10 10 10 11 11 9 10 8 8 10 10 13 13 13 13 12
10 19 15 10 10 10 17 11 14 9 9 8 12 8 9 11 10 13 13 15 10 10 10 17 15 24 25 19 12 12 16 13 8 8 12 15 20 19 18 11 11 15 13 24 15 16 12 12 11 22
15 21 13 13 10 8 8 8 6 6 |