BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-489D21.T7 (MSMg01no489_d21.b1) | MSMg01-489D21.TJ (MSMg01no489_d21.g1) |
ACC | AG567771 | AG567772 |
length | 1,476 | 765 |
length of high quality (start - end) | --- | 585 (74 - 658) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no489_d21.b1 PHD_FILE: MSMg01no489_d21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:12:24 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no489_d21.g1 PHD_FILE: MSMg01no489_d21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:12:24 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | ACTACGAAACTAAATACAATCCTATTCTACACATGTCTTTTATCGCCTTT
TTTGCNCGCTGTGCGTACGCGTGCTTATTGAACGNACGGATATTACCACT
ATCGTTCGCCGCCTAGGGTCAGCGTGTCGTTCTGTAGCAGCCACGCCGGC
GAAACGAAAAGACAGGAAGAGCGACTGGGCGAGGTGTGAAGGGGTGTGGC
GGGCTTTAACTTAGTGTCCTCTGCGCCGGCGCTCACAGTGCGCCCTGAAC
GCGTGCGCGAAACCTTAATCAATACGCTATCAAGGTGCATAGAGGATGGC
ATTCAGAGGATTATACACCGCAAGAACCAACATGAGTACCATCGCACCAC
GGTGGTGTCTCGTCGGCATGGCCCGTCGCGGATATACAGGCGGCGAATAT
AGAGAAAACAAGATATACAAACAAGAATCGAACCGCGCCTCTCTCATCAC
ACCTAAGGTCACCGCAGAATATACAACTAGGCGAGTAGTGTATGTTGTAA
ATAAGCCGGCAGTGATTCTGACGCCAGGCAGTATTTTGTTATTCTATGCC
GGCTCAAGACACACGTATGTCTCATAGCTCCATGAATCTTCTGTTTATTT
CATATGCTATAGTGTGAGAAGAATGAAAGCCTGCGCAGAGCTATGCAGGA
GCGAGTTTGGTNTAGTCACGCTACCGGCGGATACGTGTTATGGTTACGCC
AACGATGCGCTGATATTGGCGTGTACCGCACGCGATGATNTTAACAATAA
ACATACTATAGATGCATCTCTGCGCACGACATATGNAACTGTACGTCGGG
CGCGTTGTATGTATNATGAGCGGTGTCGTATAGGAATCGCTAGAGCCTAT
AGACGATAGTCGGTGNTACGACTTTTACCGTCCGCCGGCACATGAGAGAC
TACTGTCTCGCTCGCTTAGGAAGTCGCGCGCGCGCGGTATTATGTCAATA
TCCGATATAGTCAGACCGTGAGGAGGTGTCTAATAGCTCTAGCGACTCGA
CGCGAGAATGAATGGTGTTCTCTGACTCACGAGAGCTACTAGAGAATAGT
AGTATATGATGACAAATCTACATTAACGCGCATAGAGTATATTGCGAACG
AGTGATGAATGGCGTTGTATAGCCGCACATAGTATAGACACGATACTACT
TACACCACCACCATCGACACAGTAATAGCGAGATGGCGGAGGCGAAGATG
TGATGGTATATCAATCTCGCAACATATGCGCGGCGCACGTATTATATCAT
GAACAGCCACCGCTTCTGAATTATATATTGCATCTCCCGACCGAGTCTGC
TCACAGTCTTTTCGCTCACACCTTGTCCATCTTGTTGTTGTGTGTTCCGC
GCGTGATCACGGCCCGTATAATATATTACACTCCGCCGACGCTCCGCGAT
CTATGACCGGCGGCGCGCCATATATATTATAGTCAGCGTGTTCGACGCGA
GCGAACAATTAGTCGATATATATAAG
| CGATGCTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCTAATCCTGTAAAGGGTCTCTGTCAT
TACTGCTGAACGGTCTGAAAGTATCAGCATTACAAAGAGCTCACCCAGTA
GAACATTTCTTGGTTAGATTTAAGTGTGTGTGTATATGTGATGTGGGAAG
TTTGGTACCTGAGTTCTGTCTTAGGTAGGTATCCCTGACTGTGGAGAACA
AAAGAGAAGAGATCATTTCTTTGTGCCCGTGGCGTCTGCTACATTCCAGC
GGACTTTGTGTAAGTAGTGTGGTTTGTTTTGACCCCCAAAGTGGTCTATA
TATGTGTAGGAAAAGGAGCCTTATGATGTGAGGCGGAGCAGCCATGGTGG
CTAAACCATGTGACTTTAATGGTAAAGGCTACAACCCTTGGAGGCCGTGC
TGAGAATCAGCTGAATGTGTTGAGCCCAAATTCAGATCTGGAGGACGCCT
GTTATAAGCAGGTGTTCTGATGGAGCAGAGGAGAGCCAAGGGATGGGCGC
TGACTTTTATTGTTTAGTTCTTTAAGAAGACAATACTGTCTTGAAGCTAT
GTTTGAAAGAACAGTGATTTGTGTACTTGTCAATGGTTCCCATCAGCACC
ATGTGGCCCCGGATTAGGGAGCACTAAGGCTCCATATTTGAGGAAACCAC
CTGGGAGAATCAGAGATGTTGTCATAGTAACCATACCATCCATCCNAGCT
CTGTGCTGCTATTAN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 11 10 8 9 8 12 11 11 11 8 10 10 13 10 10 10 9 9 11 12 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 10
10 11 11 11 3 0 3 10 10 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 11 11 3 0 3 7 7 8 9 11 11 8 10 7 7 8 8 10 10
8 8 8 8 8 15 11 10 10 11 11 14 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 11 9 9 9 9 9 9 10 10 10 15 12 8 8 6 6 10 10 8 8 6 6 7 7 8 8
8 8 9 10 10 10 10 8 8 6 6 6 6 6 7 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 7 7 7 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8
6 10 6 6 8 8 12 12 15 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 11 11 11 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 6 6 6 6 10 11 11 11 10
10 10 8 8 8 10 8 9 9 10 10 9 9 11 10 10 10 8 8 6 6 8 6 8 8 8 10 13 13 14 10 10 6 7 6 6 9 10 10 10 10 16 13 11 12 10 10 10 11 9
11 11 11 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 16 12 12 12 12 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6
8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 6 9 9 9 9 14 8 8 8 8 8 8 11 11 12 12 11 10 15 15 15 10 10 9 9 8 8 6 6 8 6 6 10 6 8 6 10 8 8 8
8 8 8 10 10 7 7 6 6 8 8 18 9 9 9 9 7 8 8 9 8 8 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 7 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6
6 8 8 11 11 6 6 6 6 6 7 8 10 10 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 10 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 11 8 8
6 6 6 6 8 8 6 6 8 6 6 8 8 10 10 10 10 9 9 9 9 9 12 9 9 10 8 8 6 6 6 10 15 13 9 9 12 9 9 13 11 13 10 8 8 8 8 6 6 8
8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 17 9 9 9 11 11 11 11 11 11 11 11 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10
6 6 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 11 10 10 10 13 11 10 11 11 11 10 10 7 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6
6 9 9 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 10 9 8 8 8 8 10 8 11 10 10 12 6 9 7 7 8 8 11 11 12 8 8 8 10 10 8 10 10 15 19 10 10 8 8 8 6
6 8 10 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 9 8 8 8 10 9 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6 3 0 3 8 8 9 13 10 9 8 8 8
10 10 10 8 9 9 9 15 10 6 8 6 7 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 9 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6
6 8 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 16 3 0 3 11 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 7 10 8 8 8 8 8 10 11 12 11 12 10 9 8 8 8 8 10 8 8
6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 3 0 3 8 8 10 8 8 12 10 10 12 11 11 11 10 8 10 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 9
9 9 9 10 10 15 11 8 8 8 8 10 10 10 10 10 11 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 9 12 9 8 8 8
8 8 8 10 10 10 8 12 8 8 8 6 6 6 8 6 12 13 10 13 13 10 9 9 9 9 9 9 9 10 13 18 12 12 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 6 7 10 7 7 8
8 9 9 9 9 6 6 8 8 8 8 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 8 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 8 8 8 8 9 9 11 11 11 8 10 6 6 6 8
8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 12 11 8 8 8 8 6 6 6 8 8 6 6 8 8 6 6 10 8 10 10 8 9 10 8 8 8 8 6 6 6 8 8 11 8
10 8 8 6 6 8 10 10 8 8 6 8 6 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 8 7 6 8 6 10 10 11 13 13 11 11 11 11 8 6 6 6
8 8 9 9 12 12 10 9 9 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 11 10 14 9 11 8 8 8 8 8 6 8 10 10 10 9 9 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 9
9 8 12 7 9 10 8 8 8 10 8 6 6 9 9 8 8 8 6 6 7 8 8 7 7 7 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 12 15 13 7 7 8 13 10 11 8 8
8 8 8 8 8 8 8 9 6 7 7 7 10 8 9 10 9 6 6 8 6 7 6 8 8 10 8 8 8 8 8 7 7 7 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 9 10 8 8
10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 9 9 9 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 6 8 6 7 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8
8 7 6 6 6 8 8 9 9 8 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 12 13 16 11 10 10 10 10 13 7 6 9 7 10 10 8 8 6 6 8 8 6 7 7 10 6 7
7 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 7 7 8 8 10 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
10 8 8 11 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 7 8 11 8 8 8 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 6 6 8 17 17 44 39 39 47 47 50 50 44 44 44 39 37 37 30 25 12 9 9 11 12 11 11 12 12 18 18 28 32 34 48 41 36 36 38 38
50 50 59 59 59 50 50 27 21 9 15 9 10 9 12 15 23 16 25 28 28 28 28 48 48 48 50 53 53 53 53 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59
68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57
48 48 48 48 48 48 59 59 54 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 59 59 57 53 53 50 50 50 59 41 37 24 24 10 8 8 8 8 8 11 23 27 59 37 37 39 44 50 53 53 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
57 57 57 68 68 68 68 59 59 54 54 57 57 54 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 54 47 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 59 59 52 57 52 57 57 57 59 68 68 59 57 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 47 43 46 44 59 59 59 59 59 54 48 48 48 48 54 54 57 57
57 57 54 54 46 47 43 59 43 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 36 32 23 20 24 24 37 37 40 40 39 41 41 41 36 36 39 39 39 39 41 59 59 59 59
43 43 43 43 43 57 44 50 48 43 43 36 36 32 43 43 50 43 43 47 42 54 44 44 54 48 48 32 32 23 28 28 39 40 57 57 57 48 48 48 57 57 47 47 39 39 39 47 47 47
47 47 47 59 41 37 37 41 39 31 31 34 34 28 34 34 34 34 43 43 43 48 48 48 48 48 59 59 48 46 46 46 41 47 39 35 31 31 30 30 30 30 22 25 19 25 25 34 34 40
39 37 36 27 22 24 24 18 24 21 18 18 16 12 11 10 11 12 23 15 18 18 30 30 24 19 16 19 16 24 25 26 19 19 20 31 28 34 22 22 17 18 18 30 31 27 26 20 19 19
17 21 25 21 18 13 11 11 12 13 10 9 9 10 11 11 13 9 9 9 10 16 12 12 12 10 10 16 14 15 18 22 28 23 23 18 18 23 22 25 14 14 10 16 3 0 3 17 18 23
23 23 20 20 20 23 23 14 9 8 8 8 8 3 0 |