BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-495I19.T7 (MSMg01no495_i19.b1) | MSMg01-495I19.TJ (MSMg01no495_i19.g1) |
ACC | AG572567 | AG572568 |
length | 701 | 742 |
length of high quality (start - end) | 633 (64 - 696) | 477 (75 - 551) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no495_i19.b1 PHD_FILE: MSMg01no495_i19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:20:38 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no495_i19.g1 PHD_FILE: MSMg01no495_i19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:20:39 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCCAACTTTNTNNTATCAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXCGCGGAATTCTCACCTGTGCAATACCGAATGGCTGAGAAA
CACCTGAAAAAATGTTCAGGATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAA
AACAACTCTGAGATTCTATCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGACCAAAA
ATTCAGGTGACAGCAGATGCAGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTC
CTCCATTGTTGGTGGGATTGCAAGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGT
CTGGTGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCAGAGGATCCCGCAA
TACCTCTCCTGGGCATATATCTAGAAGATGTCCCAACTGGTAAGAAGGAC
TCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGA
ACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAAAAAAGTAACACAATCA
CAAAAGAACTCAAATGATATGTACTCACTGATAAGAAACTTAGGATACCT
GAGATATAAGATACAATTTGCAAAACACATGAAACTGAAGAAGAACAAAG
ACCAAAGTGTGGACACTTTGCCCCTTCTTAGAATTGGGAACAAAACACCC
ATGGAAGGAGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGCTGAGACAAAAGGATGGAC
C
| CCCGATGAAGTGTGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCTTCTACCAGCATGGGGTCCCAGCC
CCCTCCCCCCACCCACTCATGCATGAATACACATGTGCACTTCTCCAGGA
CAAAATATCCTTTGGAGTATAATTATTCTCTGGAAATGACATTTCACTTG
ACTTCCCAACAGGATTATGGAAATGTATCTTTTTGTGAATCTATTTAGCT
GGTGCTTCGAGCCACAGTTTGAATCTCATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTG
TTTTTTGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCAC
TCTGTAGACCAGGCTGTTCTTTAACTCGGAGATCATCCTGCCCCTGTCTC
CGGAGTGCTCAGACTAAAGGTGTGCACCACTACAGCCTGGCTAGTGTATG
AATTTAACCTAACATAGTACCCCATGCTTTGGTTTTGTTTTTGCCATTTT
TTGTGTTGTTACTCTCTTTCCTGGGTTTGATCTTTCTTTCTGAACAACAA
CCCTTTAAGGTCCAGTTAGTCTTCCAGCTTTCCTATAAATGAGTTAAGAA
GAGGTCTATTTCCTTGGTAGCAACCAATGAGCAAATATAGCGGTTTGGGG
GACAAATTTTCCCTCCTTATAACTTGGTTAATTGGTTGTAAATCTCTTAG
ATGCTCTCCGTTTTGTTCATGATTAAAATGTTCTTTATTTCC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 8 8 6 6 3 0 3 0 0 3 9 9 9 9 8 9 9 10 10 19 25 35 35 39 31 31 39 39 25 24 25 32 25 30 39 32 33 33 33 31 31 21 27 11 9 7
7 8 7 7 9 8 8 8 10 11 14 23 23 23 24 24 30 30 31 30 33 33 30 21 19 9 9 9 9 7 9 9 16 17 20 33 30 30 30 29 39 39 43 47 47 47 50 43 43 47
50 50 50 47 53 53 50 50 68 42 42 40 40 41 41 41 42 50 50 50 50 50 50 50 59 68 50 50 47 47 47 42 42 41 47 47 57 46 48 46 50 50 50 57 57 57 57 57 54 54
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 38 42 41 50 50 50 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57 68 57 59 57 57 54 54 54 57 57 57 59 50 50
50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 39 39 14 18 39 29 29 23 23 27 29 43 44 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62
62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57
68 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 57 57 57 57 57 52 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59
57 57 57 59 59 57 57 68 57 57 57 54 54 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 54 54 57 57 54 54
57 54 54 54 32 32 20 20 20 41 41 54 54 54 54 48 48 57 57 48 48 48 48 48 48 48 48 48 47 48 57 57 43 43 43 43 37 37 37 39 59 43 41 37 39 41 41 41 41 41
37 39 37 37 37 37 37 37 35 32 28 36 39 41 41 41 47 47 59 48 48 48 59 48 46 46 46 34 34 28 28 30 34 29 34 43 41 41 39 39 39 41 41 39 39 36 35 31 36 35
41 35 34 29 29 29 29 22 23 18 16 16 24 28 30 30 39 29 24 22 22 27 28 12 10 10 17 11 24 41 43 47 37 29 17 17 15 19 18 26 34 35 22 19 22 22 15 11 15 10
10 | Open.Hide. 6 6 6 6 6 11 10 10 10 9 11 6 6 6 8 7 16 37 31 37 37 37 37 37 37 32 32 44 44 25 23 11 9 9 6 6 6 6 6 6 10 13 12 20 15 15 22 22 11 11
10 26 26 50 42 41 34 25 18 9 9 9 9 9 9 11 12 18 12 11 13 16 18 20 39 41 39 39 44 48 53 53 53 50 50 53 59 57 57 57 57 57 57 47 50 47 47 47 42 54
59 59 59 59 54 54 54 48 48 47 48 48 48 54 48 48 41 39 39 39 39 44 47 57 48 50 50 50 50 50 57 57 23 23 12 12 11 27 27 57 57 57 68 57 57 57 50 41 41 41
50 50 57 57 57 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 54 54 52 57 57 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 59 59 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 54 54 59 59 59 59 59 44 44 42 48 43 48 48 59 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57
57 57 53 59 59 59 59 47 47 41 41 41 41 39 41 43 59 30 30 28 31 31 28 28 21 21 28 28 48 57 50 57 57 57 57 40 47 35 39 37 40 34 30 28 34 32 42 35 35 35
35 34 37 37 37 23 23 23 44 44 44 40 40 24 21 11 9 9 17 19 42 35 35 35 38 44 44 42 33 33 33 42 47 57 57 57 48 48 48 57 48 48 44 44 35 33 32 44 44 57
43 43 43 37 37 35 35 35 26 32 13 13 32 34 59 59 59 59 44 44 35 35 37 44 44 57 57 57 57 57 37 30 24 17 17 19 30 30 23 23 23 26 34 37 39 39 28 28 31 29
29 28 36 31 28 28 28 34 39 43 43 43 43 40 37 30 30 43 37 44 57 48 43 43 41 43 43 47 47 47 47 47 43 34 27 18 15 15 21 24 34 37 37 37 37 37 37 39 43 48
39 42 34 33 33 33 37 43 39 41 39 37 30 29 27 24 22 20 34 31 28 28 33 34 39 48 59 59 59 48 48 48 48 30 27 14 14 14 26 30 43 39 32 31 27 24 15 12 13 13
17 16 21 19 22 10 13 13 15 13 13 13 23 23 16 12 11 12 12 12 12 12 26 26 37 39 37 37 21 17 17 15 17 10 11 11 16 21 23 23 23 13 13 10 13 13 10 12 13 13
12 13 13 12 21 25 16 15 15 30 18 12 10 15 10 9 8 10 11 11 15 21 21 15 10 8 8 6 7 8 10 11 11 11 13 10 10 8 8 8 8 9 9 9 19 14 22 14 14 17
16 16 17 20 19 18 18 20 20 18 22 12 12 12 12 10 10 10 14 18 16 11 11 11 18 19 11 14 9 8 8 10 8 8 12 8 6 6 6 11 7 16 12 11 11 10 10 10 9 9
10 12 13 13 12 9 9 9 10 10 13 10 9 9 10 13 13 12 12 11 11 8 8 8 8 10 12 12 10 10 13 10 10 8 8 6 7 8 10 19 15 15 |