BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-009A15
ChromosomeX (Build37)
Map Location 159,635,640 - 159,750,308
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040610
Upstream geneReps2, LOC654358, LOC100041557, LOC667630, Rbbp7, 4932441K18Rik, LOC671250, Syap1, LOC100041607, Ctps2, S100g
Downstream geneEG637051, Grpr, 1700045I19Rik, Ap1s2, Zrsr2, Car5b, Siah1b, Tmem27, Ace2, Bmx, Pir
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-009A15.bB6Ng01-009A15.g
ACCDH845094DH845095
length1,119488
definitionDH845094|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-009A15, 5' end.DH845095|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-009A15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(159,635,640 - 159,636,754)(159,749,815 - 159,750,308)
sequence
gaattcccagaaattctctgcctcagttttcccagggctgggattacaag
tttgtgacactacatctgggaagctcttactttggtttgcgatttttgtt
tccaggattagggtttgaaccctaacctcatgtacaccaggcagcagtct
ctcactgtactatgatatattacttgtcttatacaaatattcttgatatg
agatttgccaaaatactgcttctgatccagaagcaactagtactctactt
ttgttcaagttcctctatggcagccttctcaacctgtgggttgtgattac
cttggaggagggggtgtcaacgatcagatttcctgcatatcagatatgct
gcaaatccgtagcataattacagctataaagaacaaaagtacttttatgg
taggagatcaccacaacatgaggacttgtattaaaggtttacagcattag
gatggttgagaaccactgctctatggtaaaaggtagggacagggcctgag
aattgacctcaagggtccttccctgggagtagggacagtggattcagaaa
catcagcataagaaaaatttcaaaactagcctcagggtcttgtggtagct
tttcccatgagttgggaaccatttttcttactgtgaatcaggtctggcct
tgggatgggatggaaatgacacaactcagttccagacttgggtattaagg
tcatgagatttttgcttgggatagtgtcttgggatacaatgaccagtgta
tgaaggaaaccaggtagtgccactggatatggccttactgttggctatca
attgccaaatgtaagtatgacacttaccttagactgtgggtcataaagcc
aaacagaatgactgagagtcacaaaaatagaatttggcaacagtgatagt
tgtctgaatgttcaatgaccaaagagtgattccaaagcaaggatcagaat
gattcaaaatcaattgtgtaatgattcaaggtcttttgtggcaatgccca
tgttgtcacacagctttactgcaggtttgggatcctttgcctgttggttg
tgcttgtgttttattagaagcaggtcctccctaattgggcactgtctggc
ctggacatacactgggtgg
tagaggatgtgatctgtaagttgaaagaatgagttgaaagaatgattgga
gtctgacatgggccaccaacgattgatgtgacaccactagcactgtcatt
ttttgacaccaccagcctggcactcttctgcccacagaatgcattctggg
gcttcttcttttctcatcagttatctcaaggcaacacagttgggggcgag
gggttgtggtttgtttggttgttgatgtttttgaacaggtttagtgaggc
agctccttgccacagaagcatggggacctgctcttggatcctcaaacttt
actgggatcctaagaacatacataaatctggataaaaatacagtaaccca
tatgttcgtaatcctagcactcctaaggtaaaaatgtgatgcagagacag
caacatccacagaaatatgcaagcctagcaacaaacaataatagaccctg
tttcaaacaagatggaaggaaaggaccagcgcccaact
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_159635640_159636754
seq2: B6Ng01-009A15.b_48_1166

seq1  GAATTCCCAGAAATTCTCTGCCTCAGTCTTCCCAGGGCTGGGATTACAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAGAAATTCTCTGCCTCAGTTTTCCCAGGGCTGGGATTACAAG  50

seq1  TTTGTGACACTACATCTGGGAAGCTCTTACTTTGGTTTGCGATTTTTGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGACACTACATCTGGGAAGCTCTTACTTTGGTTTGCGATTTTTGTT  100

seq1  TCCAGGATTAGGGTTTGAACCCTAACCTCATGTACACCAGGCAGCAGTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGATTAGGGTTTGAACCCTAACCTCATGTACACCAGGCAGCAGTCT  150

seq1  CTCACTGTACTATGATATATTACTTGTCTTATACAAATATTCTTGATATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTGTACTATGATATATTACTTGTCTTATACAAATATTCTTGATATG  200

seq1  AGATTTGCCAAAATACTGCTTCTGATCCAGAAGCAACTAGTACTCTACTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTGCCAAAATACTGCTTCTGATCCAGAAGCAACTAGTACTCTACTT  250

seq1  TTGTTCAAGTTCCTCTATGGCAGCCTTCTCAACCTGTGGGTTGTGATTAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCAAGTTCCTCTATGGCAGCCTTCTCAACCTGTGGGTTGTGATTAC  300

seq1  CTTGGAGGAGGGGGTGTCAACGATCAGATTTCCTGCATATCAGATATGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGAGGAGGGGGTGTCAACGATCAGATTTCCTGCATATCAGATATGCT  350

seq1  GCAAATCCGTAGCATAATTACAGCTATAAAGAACAAAAGTACTTTTATGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAATCCGTAGCATAATTACAGCTATAAAGAACAAAAGTACTTTTATGG  400

seq1  TAGGAGATCACCACAACATGAGGACTTGTATTAAAGGTTTACAGCATTAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAGATCACCACAACATGAGGACTTGTATTAAAGGTTTACAGCATTAG  450

seq1  GATGGTTGAGAACCACTGCTCTATGGTAAAAGGTAGGGACAGGGCCTGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTTGAGAACCACTGCTCTATGGTAAAAGGTAGGGACAGGGCCTGAG  500

seq1  AATTGACCTCAAGGGTCCTTCCCTGGGAGTAGGGACAGTGGATTCAGAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGACCTCAAGGGTCCTTCCCTGGGAGTAGGGACAGTGGATTCAGAAA  550

seq1  CATCAGCATAAGAAAAATTTCAAAACTAGCCTCAGGGTCTTGTGGTAGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGCATAAGAAAAATTTCAAAACTAGCCTCAGGGTCTTGTGGTAGCT  600

seq1  TTTCCCATGAGTTGGGAACCATTTTTCTTACTGTGAATCAGGTCTGGCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCATGAGTTGGGAACCATTTTTCTTACTGTGAATCAGGTCTGGCCT  650

seq1  TGGGATGGGATGGAAATGACACAACTCAGTTCCAGACTTGGGTATTAAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATGGGATGGAAATGACACAACTCAGTTCCAGACTTGGGTATTAAGG  700

seq1  TCATGAGATTTTTGCTTGGGATAGTGTCTTGGGATACAATGACCAGTGTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGAGATTTTTGCTTGGGATAGTGTCTTGGGATACAATGACCAGTGTA  750

seq1  TGAAGGAAACCAGGTAGTGCCACTGGATATGGCCTTACTGTTGGCTATCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGGAAACCAGGTAGTGCCACTGGATATGGCCTTACTGTTGGCTATCA  800

seq1  ATTGCCAAATGTAAGTATGACACTTACCTTAGACTGTGGGTCATAAAGCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCCAAATGTAAGTATGACACTTACCTTAGACTGTGGGTCATAAAGCC  850

seq1  AAACAGAATGACTGAGAGTCACAAAAATAGAA-TTGGCAACAGTGATAAG  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
seq2  AAACAGAATGACTGAGAGTCACAAAAATAGAATTTGGCAACAGTGAT-AG  899

seq1  TTGTCTGAATGTTCAATGACCAAAGAGTGATTCCAAAGCAAGGACCAAGA  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
seq2  TTGTCTGAATGTTCAATGACCAAAGAGTGATTCCAAAGCAAGGATC-AGA  948

seq1  ATGAATTCAAAATCAAATGTGTAATGAATCCAAGGTC-TTTGTGGCAATG  998
      ||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||
seq2  ATG-ATTCAAAATCAATTGTGTAATG-ATTCAAGGTCTTTTGTGGCAATG  996

seq1  CCCATGTTGTCACACAGCTTTACTGCAGGTTTGG--TTCTTTGCTTGTTT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| 
seq2  CCCATGTTGTCACACAGCTTTACTGCAGGTTTGGGATCCTTTGCCTGTTG  1046

seq1  GTTTGGTTTGTGTTTT-TTTGAAGCAGGTTCTCACTA--TTGGCACTGTC  1093
      |||  | ||||||||| || ||||||||| ||| |||  | |||||||||
seq2  GTTGTGCTTGTGTTTTATTAGAAGCAGGTCCTCCCTAATTGGGCACTGTC  1096

seq1  TGGCCTGGACAT-CACTGTGTGG  1115
      |||||||||||| ||||| ||||
seq2  TGGCCTGGACATACACTGGGTGG  1119

seq1: chrX_159749815_159750308
seq2: B6Ng01-009A15.g_70_563 (reverse)

seq1  AGTTGGGCGCTGGTCCTTTCCTTCCATCTTGTTTGAAACAGGGTCTATTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGGGCGCTGGTCCTTTCCTTCCATCTTGTTTGAAACAGGGTCTATTA  50

seq1  TTGTTTGTTGCTAGGCTTGCATATTTCTGTGGATGTTGCTGTCTCTGCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTGTTGCTAGGCTTGCATATTTCTGTGGATGTTGCTGTCTCTGCAT  100

seq1  CACATTTTTACCTTAGGAGTGCTAGGATTACGAACATATGGGTTACTGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTTTTACCTTAGGAGTGCTAGGATTACGAACATATGGGTTACTGTA  150

seq1  TTTTTATCCAGATTTATGTATGTTCTTAGGATCCCAGTAAAGTTTGAGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTATCCAGATTTATGTATGTTCTTAGGATCCCAGTAAAGTTTGAGGA  200

seq1  TCCAAGAGCAGGTCCCCATGCTTCTGTGGCAAGGAGCTGCCTCACTAAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAGAGCAGGTCCCCATGCTTCTGTGGCAAGGAGCTGCCTCACTAAAC  250

seq1  CTGTTCAAAAACATCAACAACCAAACAAACCACAACCCCTCGCCCCCAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCAAAAACATCAACAACCAAACAAACCACAACCCCTCGCCCCCAAC  300

seq1  TGTGTTGCCTTGAGATAACTGATGAGAAAAGAAGAAGCCCCAGAATGCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTGCCTTGAGATAACTGATGAGAAAAGAAGAAGCCCCAGAATGCAT  350

seq1  TCTGTGGGCAGAAGAGTGCCAGGCTGGTGGTGTCAAAAAATGACAGTGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGGGCAGAAGAGTGCCAGGCTGGTGGTGTCAAAAAATGACAGTGCT  400

seq1  AGTGGTGTCACATCAATCGTTGGTGGCCCATGTCAGACTCCAATCATTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTGTCACATCAATCGTTGGTGGCCCATGTCAGACTCCAATCATTCT  450

seq1  TTCAACTCATTCTTTCAACTTACAGATCACATCCTCTAGAATTC  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACTCATTCTTTCAACTTACAGATCACATCCTCTAGAATTC  494