BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-010A08
ChromosomeX (Build37)
Map Location 48,188,441 - 48,321,591
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2610018G03Rik
Upstream geneOlfr1322, LOC100040344, Olfr1323, EG665816, Olfr1324, LOC100041788, 6720401G13Rik
Downstream geneLOC100040422, Rap2c, LOC385355, Mbnl3, LOC665866, LOC385356, Hs6st2, Usp26, LOC100040479, LOC665888
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-010A08.bB6Ng01-010A08.g
ACCDH845809DH845810
length1,0501,120
definitionDH845809|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010A08, 5' end.DH845810|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010A08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(48,188,441 - 48,189,496)(48,320,469 - 48,321,591)
sequence
gaattctcctgggagaaagcaaacttcttatatgtcttagtattctcagt
gtttagtgcagcccctggcttggtgttcaagaagaacaaagtgaagaaaa
caggcaaggttgtgtgaacttaggcagaagatagggtcaaagtgagagtg
caaatacatgtcatctgcttcttagtaacaactccatcttaatcaactat
aggattctcatggcagatgttattacatagcacatggactcttaaaaaat
ccaagtagacttggggaaaaagttgtagaataggagatttggttgttttc
agtgttgagtttctgtccctcagatacttctcggtatctctgataatagc
ccttcagtgagtgcctgccattactgtactcttttcacgattgcttacat
atagttgtaacaaaaccatgaaagtttttctaagccagttgaaggttggt
aattttacacaactgcctttcttagagatcctggcaacaacttccttctc
ctcactgtgagctgatggcatagtcacttcctatttggtctcaactgcca
gggtttttttggtctgtttttaactgccacctttgactagaactgttcac
atgagaagcctatgaattaaagaacaagtagccaattcagagggggaaaa
tatcacccagaacggcagttgaacatcacttcatggtgacacatgaaaag
gctctcctgtgactaaaggctacaaccccaggatcaaagaggctacccga
tcttattacaaagacctcagtttccccaattaattctctcaagaaatgcc
tttcaatgttcttccacagaagtctctccactacccttgtggcaagacaa
aactgtcattatggagtgacccatggagcaaccagtgtttctcttggcac
aaggagagcggtgagggctcctgtacaggcatctgcactctacagcatga
ttctgtcacctaagagggaggggtagccaattggaacagggaagaggcca
cttctacttaggttcagcatctgtgcttgaagtgatcagaacacattggg

gaattcatatttgctgtgatatgtgaagggctgagctaagagccctcaac
tgctccagtgtattcctggcatgtgcaaccttaaattagaggggctaaat
aaagctgtggcctgccctttctgaaagtttgccagccactgatacagatt
gtgtagggcatggggcctcatctggtctgatctcggacagacactcagac
ttgctttctggctcaaatctctgccatcagccctcattttagtcatgtat
ctcattttcgaagccataagggtccagggaccttcagggagcgtggattt
agtcctcatgctaagggctttctccagtagagaatgaattattgattcct
tattccacatagcctgccccacactgttcttttttcttttgcatagccca
gtaattttcatggcttgtaaaggtgccctttgactcttgaacaacatctg
aagccttccttgagtttagcatcagtaaacactccagacctcccaggcag
ctcaaagtcatgctccacatcaccttgtttggaaacatcaccatctgctg
gatttctgtgcttgtgctctcaaagacttgcctgtgttctgccaattgag
ggcatccgggacttgctacttctgctgtgcactaacttggaggtgggtat
ttgaggaagccagagctgcagggtgggtgggcaaataagatggaatctgc
tatgcctggagttcctgagatgaaatggcacagagtcggttgactccatg
gtgttgagttggctgccgacaggagcacactatgctccctaaatttcttc
atctaatgttattaaacttggggtcacagcctgtgcctcaagtcaggtct
gtctggccacacatcctcccgaagcccattaaaagagccaaatttatggg
agaaaagcaggaagaggaggtttattcgatgtggtgctttacactgagaa
aactgccaaaggatcttgcacccccgacttgtactctcatgcccatcttt
aggatcctgagtaaaataagtttacccatcctagaataccacatcttagt
atctccggtcagatctacatatggtcctgcccacagatgtaccatcattt
cctgggcttcatattttgtc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_48188441_48189496
seq2: B6Ng01-010A08.b_47_1096

seq1  GAATTCTCCTGGGAGAAAGCAAACTTCTTATATGTCTTAGTATTCTCAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTGGGAGAAAGCAAACTTCTTATATGTCTTAGTATTCTCAGT  50

seq1  GTTTAGTGCAGCCCCTGGCTTGGTGTTCAAGAAGAACAAAGTGAAGAAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAGTGCAGCCCCTGGCTTGGTGTTCAAGAAGAACAAAGTGAAGAAAA  100

seq1  CAGGCAAGGTTGTGTGAACTTAGGCAGAAGATAGGGTCAAAGTGAGAGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCAAGGTTGTGTGAACTTAGGCAGAAGATAGGGTCAAAGTGAGAGTG  150

seq1  CAAATACATGTCATCTGCTTCTTAGTAACAACTCCATCTTAATCAACTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATACATGTCATCTGCTTCTTAGTAACAACTCCATCTTAATCAACTAT  200

seq1  AGGATTCTCATGGCAGATGTTATTACATAGCACATGGACTCTTAAAAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATTCTCATGGCAGATGTTATTACATAGCACATGGACTCTTAAAAAAT  250

seq1  CCAAGTAGACTTGGGGAAAAAGTTGTAGAATAGGAGATTTGGTTGTTTTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTAGACTTGGGGAAAAAGTTGTAGAATAGGAGATTTGGTTGTTTTC  300

seq1  AGTGTTGAGTTTCTGTCCCTCAGATACTTCTCGGTATCTCTGATAATAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTGAGTTTCTGTCCCTCAGATACTTCTCGGTATCTCTGATAATAGC  350

seq1  CCTTCAGTGAGTGCCTGCCATTACTGTACTCTTTTCACGATTGCTTACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCAGTGAGTGCCTGCCATTACTGTACTCTTTTCACGATTGCTTACAT  400

seq1  ATAGTTGTAACAAAACCATGAAAGTTTTTCTAAGCCAGTTGAAGGTTGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTTGTAACAAAACCATGAAAGTTTTTCTAAGCCAGTTGAAGGTTGGT  450

seq1  AATTTTACACAACTGCCTTTCTTAGAGATCCTGGCAACAACTTCCTTCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTACACAACTGCCTTTCTTAGAGATCCTGGCAACAACTTCCTTCTC  500

seq1  CTCACTGTGAGCTGATGGCATAGTCACTTCCTATTTGGTCTCAACTGCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACTGTGAGCTGATGGCATAGTCACTTCCTATTTGGTCTCAACTGCCA  550

seq1  GGGTTTTTTTGGTCTGTTTTTAACTGCCACCTTTGACTAGAACTGTTCAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTTTTTTGGTCTGTTTTTAACTGCCACCTTTGACTAGAACTGTTCAC  600

seq1  ATGAGAAGCCTATGAATTAAAGAACAAGTAGCCAATTCAGAGGGGGAAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGAAGCCTATGAATTAAAGAACAAGTAGCCAATTCAGAGGGGGAAAA  650

seq1  TATCACCCAGAACGGCAGTTGAACATCACTTCATGGTGACACATGAAAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCACCCAGAACGGCAGTTGAACATCACTTCATGGTGACACATGAAAAG  700

seq1  GCTCTCCTGTGACTAAAGGCTACAACCCCAGGATCAAAGAGGCTACCCGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCCTGTGACTAAAGGCTACAACCCCAGGATCAAAGAGGCTACCCGA  750

seq1  TCTTATTACAAAGACCTCAGTTTCCCCAATTAATTCTCTCAAGAAATGCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTATTACAAAGACCTCAGTTTCCCCAATTAATTCTCTCAAGAAATGCC  800

seq1  TTTCAATGTTCTTCCACAGAAGTCTCTCCACTACCCTTGTGGCAAGACAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAATGTTCTTCCACAGAAGTCTCTCCACTACCCTTGTGGCAAGACAA  850

seq1  AACTGTCATTATGGAGTGACCCATGGAGCAACCAGTGTTTCTCTTGGCAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGTCATTATGGAGTGACCCATGGAGCAACCAGTGTTTCTCTTGGCAC  900

seq1  AAGGAGAGCGGTGAGGGCTCCTGTACAGGCATCTGCCACTCTACAGCATG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AAGGAGAGCGGTGAGGGCTCCTGTACAGGCATCTG-CACTCTACAGCATG  949

seq1  ATTCTGTCACCTAAGAGGGAGGGGTAGCCAAATTGGAACCAGGGAAGGAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |
seq2  ATTCTGTCACCTAAGAGGGAGGGGTAGCC-AATTGGAA-CAGGGAAGAGG  997

seq1  CCAC-TCTACCTTAGGTTTCAGGCATCTGTGCTTGAAGTGATCCAGACCA  1049
      |||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||
seq2  CCACTTCTA-CTTAGG-TTCA-GCATCTGTGCTTGAAGTGAT-CAGAACA  1043

seq1  CATTGCG  1056
      ||||| |
seq2  CATTGGG  1050

seq1: chrX_48320469_48321591
seq2: B6Ng01-010A08.g_67_1186 (reverse)

seq1  GACAAAA-CTGAAGCCCAGGGAATGATGGGTCACTGGCTGGCAGGACAAT  49
      |||||||  ||||||||||| ||||||||  ||   |  |||||||| ||
seq2  GACAAAATATGAAGCCCAGGAAATGATGGTACATCTGTGGGCAGGACCAT  50

seq1  ATGTAGATCTTGACC-GAGATTACTTAGATGTGTGTA-TCTAGGATGTGT  97
      ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||| ||||||||| ||
seq2  ATGTAGATC-TGACCGGAGA-TACTAAGATGTG-GTATTCTAGGATGGGT  97

seq1  AAACTTTAATTTTACTACAGGATCCTAAAGATGGGCATGAGAGTACAAGT  147
      ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTT--ATTTTACT-CAGGATCCTAAAGATGGGCATGAGAGTACAAGT  144

seq1  GGGGGTTGCAAGATCCCTTTGGCAGTTTTCTCAGTGT-AAGCACCACATC  196
       |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CGGGGGTGCAAGAT-CCTTTGGCAGTTTTCTCAGTGTAAAGCACCACATC  193

seq1  GAATAAACCTCCTCTTCCTGCTTTTCTCCCAT-AATTTGGCTCTTTTAAT  245
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GAATAAACCTCCTCTTCCTGCTTTTCTCCCATAAATTTGGCTCTTTTAAT  243

seq1  TGGCTTCGGGAGGATGTGTGGCCAGACAGACCTGACTTGAGGCACAGGCT  295
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTTCGGGAGGATGTGTGGCCAGACAGACCTGACTTGAGGCACAGGCT  293

seq1  GTGACCCCAAGTTTAATAACATTAGATGAAGAAATTTAGGGGAGCATAGT  345
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GTGACCCCAAGTTTAATAACATTAGATGAAGAAATTTA-GGGAGCATAGT  342

seq1  GTGCTCCTGTCGGCAGCCAACTCAACACCATGGAGTCAACCGACTCTGTG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTCCTGTCGGCAGCCAACTCAACACCATGGAGTCAACCGACTCTGTG  392

seq1  CCATTTCATCTCAGGAACTCCAGGCATAGCAGATTCCATCTTATTTGCCC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTCATCTCAGGAACTCCAGGCATAGCAGATTCCATCTTATTTGCCC  442

seq1  ACCCACCCTGCAGCTCTGGCTTCCTCAAATACCCACCTCCAAGTTAGTGC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCACCCTGCAGCTCTGGCTTCCTCAAATACCCACCTCCAAGTTAGTGC  492

seq1  ACAGCAGAAGTAGCAAGTCCCGGATGCCCTCAATTGGCAGAACACAGGCA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCAGAAGTAGCAAGTCCCGGATGCCCTCAATTGGCAGAACACAGGCA  542

seq1  AGTCTTTGAGAGCACAAGCACAGAAATCCAGCAGATGGTGATGTTTCCAA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTTGAGAGCACAAGCACAGAAATCCAGCAGATGGTGATGTTTCCAA  592

seq1  ACAAGGTGATGTGGAGCATGACTTTGAGCTGCCTGGGAGGTCTGGAGTGT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGGTGATGTGGAGCATGACTTTGAGCTGCCTGGGAGGTCTGGAGTGT  642

seq1  TTACTGATGCTAAACTCAAGGAAGGCTTCAGATGTTGTTCAAGAGTCAAA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTGATGCTAAACTCAAGGAAGGCTTCAGATGTTGTTCAAGAGTCAAA  692

seq1  GGGCACCTTTACAAGCCATGAAAATTACTGGGCTATGCAAAAGAAAAAAG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCACCTTTACAAGCCATGAAAATTACTGGGCTATGCAAAAGAAAAAAG  742

seq1  AACAGTGTGGGGCAGGCTATGTGGAATAAGGAATCAATAATTCATTCTCT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGTGTGGGGCAGGCTATGTGGAATAAGGAATCAATAATTCATTCTCT  792

seq1  ACTGGAGAAAGCCCTTAGCATGAGGACTAAATCCACGCTCCCTGAAGGTC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGAGAAAGCCCTTAGCATGAGGACTAAATCCACGCTCCCTGAAGGTC  842

seq1  CCTGGACCCTTATGGCTTCGAAAATGAGATACATGACTAAAATGAGGGCT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGACCCTTATGGCTTCGAAAATGAGATACATGACTAAAATGAGGGCT  892

seq1  GATGGCAGAGATTTGAGCCAGAAAGCAAGTCTGAGTGTCTGTCCGAGATC  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGCAGAGATTTGAGCCAGAAAGCAAGTCTGAGTGTCTGTCCGAGATC  942

seq1  AGACCAGATGAGGCCCCATGCCCTACACAATCTGTATCAGTGGCTGGCAA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCAGATGAGGCCCCATGCCCTACACAATCTGTATCAGTGGCTGGCAA  992

seq1  ACTTTCAGAAAGGGCAGGCCACAGCTTTATTTAGCCCCTCTAATTTAAGG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCAGAAAGGGCAGGCCACAGCTTTATTTAGCCCCTCTAATTTAAGG  1042

seq1  TTGCACATGCCAGGAATACACTGGAGCAGTTGAGGGCTCTTAGCTCAGCC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCACATGCCAGGAATACACTGGAGCAGTTGAGGGCTCTTAGCTCAGCC  1092

seq1  CTTCACATATCACAGCAAATATGAATTC  1123
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCACATATCACAGCAAATATGAATTC  1120