BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-048B10
ChromosomeX (Build37)
Map Location 55,769,435 - 55,913,496
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC631581
Upstream geneAldoa-ps, EG666441, LOC666447, Zic3
Downstream geneLOC631621, 4930550L24Rik, Fgf13
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-048B10.bB6Ng01-048B10.g
ACCDH872755DH872756
length1,0211,023
definitionDH872755|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-048B10, 5' end.DH872756|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-048B10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(55,769,435 - 55,770,472)(55,912,528 - 55,913,496)
sequence
gaattctttttgctttttacatagtctgtattgcggttcactctgggggt
caactagcattgtaggaatccatgttctccttggatgtcaataccttgaa
gggagaatgttttgctaactctttcacccctctaatcaatcaatccatca
gcaaatatttgtgtgcctactctgagtcaggcagcaaagcttacacacag
taggggctctagtggtgtttataggctcagcatagcgcctagaagtggaa
gttgattctctgatgtaaatcttcaggagacgattcatgtcaacattagc
gtgactgatgagaccataggctaagcattgttgtgaccaccattcctgtg
actttctgtgagaagtcctggattgccaagcagatattcaagacaaatca
acaaacctagaaaatgctggtcatctctgagtgaagcagagtcatgcaga
gtgtaatgattctttcaagtctctggcttaggacaactaagattaggctc
caagagaaaggttctggtcttagttctatagttgcattggtatcatctac
aaagtgacaacatatcagtaaaggaacaagggagatcacacttggaattt
ggtcctctttttttttttctcttcatctatgcagttgttaacccccatat
gatattaagcaccatgataaattgaatatttaatatctgcatttcttgat
cagcatcccactatttttctattgacggtattatttattttgtagtttag
gagattgcagttcatggagtgaaagtgttctgctaagtaccttcatgaaa
acgggacatatctgtaaacctgtcacttgtgtccaaatgctatgaatcct
tttactcttatctagccatcaaacttctattaaaaacagtgagtatgtgt
gactaaagactacattttaggtctcttgcaatgttcttctataaaccttg
ttatatcctttgatgtcttgcatataagacggatattaggtcagatgtaa
cactatcagatcccacactag
gaattctttcattgtgtaagtccttaaatctcgaaataaaatgtcacaga
atgtagagagcaccaagtgtcttgattctgtgcggaagttttataagctt
acttgctgcagctgatgtctcacatgcgatggaagctctgaccaacacat
tcctctgtaaacattgaaacgcaaaaggtggaattacaaaacggctgatt
agtaggcttgacattacaaatcatggagtctatagtataatagggtgaag
atggggatttttctaaattaacatgttttaaatgtaccaattccttgggc
acaatatcataacttttgatagctctatagagtggtatttcggaggaact
gctcatctatattgtccaggctgcctcaaatacccagacttaaacaatct
acttgcctcacatcattttaagtatctcagattacagttatgtgtcacag
ctcctgaccacagtgacttttttagagagcaacattgtgagatgtgagag
gttacttgacttgcccaaagcccccgctttatgtataatcagttccattt
ttaacaatattttgtaaatgtactctattttctttttttttaatttttta
ttaggtatttagctcatttacatttccaatgctataccaaaagtccccca
tacccacccaccccgactcccctacccacacactacccctttttggccct
ggcgttcccctgtactggggcatataaagtttgcgtgtccaatgggcctc
tcttgccagtggtggccgactaggccatcttttgatagatatgcagctag
agtcaagagctccggggtactggttagttcataatgttgttccactaata
ggggttgcagatccctttagcctccttggctactttctctagctcctcca
tggggagccctgtgatccattccattagctgacttgtaagcatccacttc
tgtgtttgctaaggcccagcaatagtctcacagagacagctacatctggg
atccttcagataaatcttgctag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_55769435_55770472
seq2: B6Ng01-048B10.b_47_1067

seq1  GAATTCTTTTTGCTTTTTACATAGTCTGTATTGCGGTTCACTCTGGGGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTTGCTTTTTACATAGTCTGTATTGCGGTTCACTCTGGGGGT  50

seq1  CAACTAGCATTGTAGGAATCCATGTTCTCCTTGGATGTCAATACCTTGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTAGCATTGTAGGAATCCATGTTCTCCTTGGATGTCAATACCTTGAA  100

seq1  GGGAGAATGTTTTGCTAACTCTTTCACCCCTCTAATCAATCAATCCATCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGAATGTTTTGCTAACTCTTTCACCCCTCTAATCAATCAATCCATCA  150

seq1  GCAAATATTTGTGTGCCTACTCTGAGTCAGGCAGCAAAGCTTACACACAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAATATTTGTGTGCCTACTCTGAGTCAGGCAGCAAAGCTTACACACAG  200

seq1  TAGGGGCTCTAGTGGTGTTTATAGGCTCAGCATAGCGCCTAGAAGTGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGGCTCTAGTGGTGTTTATAGGCTCAGCATAGCGCCTAGAAGTGGAA  250

seq1  GTTGATTCTCTGATGTAAATCTTCAGGAGACGATTCATGTCAACATTAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGATTCTCTGATGTAAATCTTCAGGAGACGATTCATGTCAACATTAGC  300

seq1  GTGACTGATGAGACCATAGGCTAAGCATTGTTGTGACCACCATTCCTGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACTGATGAGACCATAGGCTAAGCATTGTTGTGACCACCATTCCTGTG  350

seq1  ACTTTCTGTGAGAAGTCCTGGATTGCCAAGCAGATATTCAAGACAAATCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCTGTGAGAAGTCCTGGATTGCCAAGCAGATATTCAAGACAAATCA  400

seq1  ACAAACCTAGAAAATGCTGGTCATCTCTGAGTGAAGCAGAGTCATGCAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACCTAGAAAATGCTGGTCATCTCTGAGTGAAGCAGAGTCATGCAGA  450

seq1  GTGTAATGATTCTTTCAAGTCTCTGGCTTAGGACAACTAAGATTAGGCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTAATGATTCTTTCAAGTCTCTGGCTTAGGACAACTAAGATTAGGCTC  500

seq1  CAAGAGAAAGGTTCTGGTCTTAGTTCTATAGTTGCATTGGTATCATCTAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGAAAGGTTCTGGTCTTAGTTCTATAGTTGCATTGGTATCATCTAC  550

seq1  AAAGTGACAACATATCAGTAAAGGAACAAGGGAGATCACACTTGGAATTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGACAACATATCAGTAAAGGAACAAGGGAGATCACACTTGGAATTT  600

seq1  GGTCCTCTTTTTTTTTTTCTCTTCATCTATGCAGTTGTTAACCCCCATAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTCTTTTTTTTTTTCTCTTCATCTATGCAGTTGTTAACCCCCATAT  650

seq1  GATATTAAGCACCATGATAAATTGAATATTTAATATCTGCATTTCTTGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTAAGCACCATGATAAATTGAATATTTAATATCTGCATTTCTTGAT  700

seq1  CAGCATCCCACTATTTTTCTATTGACGGTATTATTTATTTTGTAGTTTAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATCCCACTATTTTTCTATTGACGGTATTATTTATTTTGTAGTTTAG  750

seq1  GAGATTGCAGTTCATGGAGTGAAAGTGTTCTGCTAAGTACCTTCATGAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATTGCAGTTCATGGAGTGAAAGTGTTCTGCTAAGTACCTTCATGAAA  800

seq1  ACGGGACATATCTGTAAACCTGTCACTTGTGTCCAAATGCTATGAATCCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGGACATATCTGTAAACCTGTCACTTGTGTCCAAATGCTATGAATCCT  850

seq1  TTTACTCTTATCTAGCCATCAAACTTCTATTAAAAACAGTGAGTATGTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTCTTATCTAGCCATCAAACTTCTATTAAAAACAGTGAGTATGTGT  900

seq1  GACTAAAGACTACATTTTAGGTCTCCTTGCAATTGTTCTTCTATTAAACC  950
      |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||
seq2  GACTAAAGACTACATTTTAGGTCT-CTTGCAA-TGTTCTTCTA-TAAACC  947

seq1  TTGTTTATATTCCTTTGATGTCCTTTGCATATTAAAGACGGGAATAATTA  1000
      ||| ||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||  || ||||
seq2  TTG-TTATA-TCCTTTGATGTC--TTGCATAT--AAGACGG--AT-ATTA  988

seq1  GGTCAGGATGTTAACAACTATCCAAGATCACACACTAG  1038
      ||||| |||| |||| ||||||  ||||| ||||||||
seq2  GGTCA-GATG-TAAC-ACTATC--AGATCCCACACTAG  1021

seq1: chrX_55912528_55913496
seq2: B6Ng01-048B10.g_117_1089 (reverse)

seq1  CTAGCAAGATTTTATTGAAAGGACCCAGATGTAGCTGTCTCTTGTGAGAC  50
      ||||||||||||   |||| |  |||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CTAGCAAGATTTATCTGAAGGATCCCAGATGTAGCTGTCTC-TGTGAGAC  49

seq1  TA-TGCCGGGGCCTAGCAAACACAGAAGTGGATGCTCAC-AGTCAGCTAA  98
      || ||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
seq2  TATTGCTGGGCCTTAGCAAACACAGAAGTGGATGCTTACAAGTCAGCTAA  99

seq1  TGG-ATGGATCACAGGGCTCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTAGCCAAG  147
      ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATGGATCACAGGGCTCCCCATGGAGGAGCTAGAGAAAGTAGCCAAG  149

seq1  GA-GCTAAAGGGATCTGCAA-CCCTATAGGTGGAACAACATTATGAACTA  195
      || ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCTAAAGGGATCTGCAACCCCTATTAGTGGAACAACATTATGAACTA  199

seq1  ACCAGTACCCCGGAGCTCTTGACTCTAGCTGCATATCTATCAAAAGATGG  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGTACCCCGGAGCTCTTGACTCTAGCTGCATATCTATCAAAAGATGG  249

seq1  CCTAGTCGGCCACCACTGGCAAGAGAGGCCCATTGGACACGCAAACTTTA  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGTCGGCCACCACTGGCAAGAGAGGCCCATTGGACACGCAAACTTTA  299

seq1  TATGCCCCAGTACAGGGGAACGCCAGGGCCAAAAAGGGGTAGTGTGTGGG  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCCCCAGTACAGGGGAACGCCAGGGCCAAAAAGGGGTAGTGTGTGGG  349

seq1  TAGGGGAGTCGGGGTGGGTGGGTATGGGGGACTTTTGGTATAGCATTGGA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGGAGTCGGGGTGGGTGGGTATGGGGGACTTTTGGTATAGCATTGGA  399

seq1  AATGTAAATGAGCTAAATACCTAATAAAAAATTAAAAAAAAAGAAAATAG  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTAAATGAGCTAAATACCTAATAAAAAATTAAAAAAAAAGAAAATAG  449

seq1  AGTACATTTACAAAATATTGTTAAAAATGGAACTGATTATACATAAAGCG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACATTTACAAAATATTGTTAAAAATGGAACTGATTATACATAAAGCG  499

seq1  GGGGCTTTGGGCAAGTCAAGTAACCTCTCACATCTCACAATGTTGCTCTC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCTTTGGGCAAGTCAAGTAACCTCTCACATCTCACAATGTTGCTCTC  549

seq1  TAAAAAAGTCACTGTGGTCAGGAGCTGTGACACATAACTGTAATCTGAGA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAAAGTCACTGTGGTCAGGAGCTGTGACACATAACTGTAATCTGAGA  599

seq1  TACTTAAAATGATGTGAGGCAAGTAGATTGTTTAAGTCTGGGTATTTGAG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTAAAATGATGTGAGGCAAGTAGATTGTTTAAGTCTGGGTATTTGAG  649

seq1  GCAGCCTGGACAATATAGATGAGCAGTTCCTCCGAAATACCACTCTATAG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCCTGGACAATATAGATGAGCAGTTCCTCCGAAATACCACTCTATAG  699

seq1  AGCTATCAAAAGTTATGATATTGTGCCCAAGGAATTGGTACATTTAAAAC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATCAAAAGTTATGATATTGTGCCCAAGGAATTGGTACATTTAAAAC  749

seq1  ATGTTAATTTAGAAAAATCCCCATCTTCACCCTATTATACTATAGACTCC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTAATTTAGAAAAATCCCCATCTTCACCCTATTATACTATAGACTCC  799

seq1  ATGATTTGTAATGTCAAGCCTACTAATCAGCCGTTTTGTAATTCCACCTT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTTGTAATGTCAAGCCTACTAATCAGCCGTTTTGTAATTCCACCTT  849

seq1  TTGCGTTTCAATGTTTACAGAGGAATGTGTTGGTCAGAGCTTCCATCGCA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCGTTTCAATGTTTACAGAGGAATGTGTTGGTCAGAGCTTCCATCGCA  899

seq1  TGTGAGACATCAGCTGCAGCAAGTAAGCTTATAAAACTTCCGCACAGAAT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGACATCAGCTGCAGCAAGTAAGCTTATAAAACTTCCGCACAGAAT  949

seq1  CAAGACACTTGGTGCTCTCTACAT  969
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACACTTGGTGCTCTCTACAT  973