BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-052I10
ChromosomeX (Build37)
Map Location 126,363,423 - 126,486,541
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDiap2
Upstream geneLOC100040550, LOC100040562, LOC100040570, LOC669120
Downstream geneLOC100040092, LOC665773
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-052I10.bB6Ng01-052I10.g
ACCDH875855DH875856
length1,182447
definitionDH875855|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-052I10, 5' end.DH875856|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-052I10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(126,485,356 - 126,486,541)(126,363,423 - 126,363,875)
sequence
gaattcaaagcttaaattatcaaactatcctaaattcaataaataattat
ttaaagagctataatatattactagtaaatacccatttttgtggatcaaa
tatacaatatccaaagaggaaaatgaaaaaatttaaactcttatcagctg
tgctatttaattttataaattacaatgtattagagatgctttacataata
taccctagaaagtaattctcatagaaaacatgagacggatgttactatta
tctttcttactcacatggaggatttgaggctttcagctaatacataactt
atataaggtgaaaaagaaaacaatatttctaagtggctatattttaacac
aaatagaaaacaattcaagaacattccagttatcgtaaaaactccacaca
tagatttacacaatcaaagcttctagggctgtttaagatgatgaaattta
tctgttgcatcatagttgataaattaagaagatctaccattatagctaca
cattaagtataaaagcctagaaataaattaacaatatgttgttctataat
aagtaagagttatcaaaatgcataatgaaatgaaaataaatataacaaaa
tgagaaaatgatgcttggtttggagtacattctatcccatatacacccac
gaactaaccatgaactaatatagagagcatctcatcatccaaattaataa
tttttctttcccttttctgtctaccaaggtgcaaatgtacattcaaacac
atgcaagtgaatgtgcacaagttcacatatattaacaatagagaactcta
ccattaaatacaggatttttttttccattttttattaggtatttaactca
tttacatttccaatgctataccaaaagtcccccatatccacccaccccca
ctcccctgcccacccactccccctttttggccctggtattcccctgtact
ggggcatataaagtttgcaagtccaatgggctctctttccagtgatggcc
gactaggccatcttttgataaatattgcagctagagtcagagctccgggg
gtactggttagctcatatgtttgttccacctatagggttgcagatccttt
agctcctggctacttctctagcttctccaatgggagcccatgatccatcc
attaccgaactgtgagcctccactcttgtgtt
tttgcttctgttttggaagctgtgtgctacttgttttggattattgctgg
gctttgaacaaaaagtaaaacaacaacagaaacctccaatgtgtcaagtt
aacattgacacatttattttaaagagacattaaaatagttaaggattttg
tatagattctttctatgaagtgaaaaatgacaaaatgtcttctattacct
atctgaaagtatcaaaggatttagagtcaggcagagggagaactgaatga
tggctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtctgtg
taggttctcaataattgtgtgtgtgtgtgtgtgtaggttctaaataagtg
tggtagaacattgtgaaccaaaatagtttttattgtttagtaacacattg
cttaaaacagatttagaaacagttaaaatgattgatttgatttcatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_126485356_126486541
seq2: B6Ng01-052I10.b_45_1226 (reverse)

seq1  AACACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTAATGGATGGATCATAGGGCTC  50
      ||||||  |||||| |||||||||  | ||||||||||||||| ||||||
seq2  AACACAAGAGTGGAGGCTCACAGTTCGGTAATGGATGGATCAT-GGGCTC  49

seq1  CCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTAGCCAAGGAGCTAAAGGGATCTGCAAC  100
      ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||
seq2  CCATTGGAGAAGCTAGAG-AAGTAGCC-AGGAGCTAAA-GGATCTGCAAC  96

seq1  CCTATAGGTGGAACAACATTATGAGCTAACCAGTA-CCCCGGAGCTCTTG  149
      ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||
seq2  CCTATAGGTGGAACAAACATATGAGCTAACCAGTACCCCCGGAGCTC-TG  145

seq1  ACTCTAGCTGC-ATATATATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGGA  198
      ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTAGCTGCAATATTTATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGGA  195

seq1  AAGAGAGGCCCATTGGACTTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAA  248
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGA-GCCCATTGGACTTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAA  244

seq1  TACCAGGGCCAAAAAGGGGGAGTGGGTGGGCAGGGGAGTGGGGGTGGGTG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAGGGCCAAAAAGGGGGAGTGGGTGGGCAGGGGAGTGGGGGTGGGTG  294

seq1  GATATGGGGGACTTTTGGTATAGCATTGGAAATGTAAATGAGTTAAATAC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATGGGGGACTTTTGGTATAGCATTGGAAATGTAAATGAGTTAAATAC  344

seq1  CTAATAAAAAATGGAAAAAAAAATCCTGTATTTAATGGTAGAGTTCTCTA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATAAAAAATGGAAAAAAAAATCCTGTATTTAATGGTAGAGTTCTCTA  394

seq1  TTGTTAATATATGTGAACTTGTGCACATTCACTTGCATGTGTTTGAATGT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTAATATATGTGAACTTGTGCACATTCACTTGCATGTGTTTGAATGT  444

seq1  ACATTTGCACCTTGGTAGACAGAAAAGGGAAAGAAAAATTATTAATTTGG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTGCACCTTGGTAGACAGAAAAGGGAAAGAAAAATTATTAATTTGG  494

seq1  ATGATGAGATGCTCTCTATATTAGTTCATGGTTAGTTCGTGGGTGTATAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATGAGATGCTCTCTATATTAGTTCATGGTTAGTTCGTGGGTGTATAT  544

seq1  GGGATAGAATGTACTCCAAACCAAGCATCATTTTCTCATTTTGTTATATT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATAGAATGTACTCCAAACCAAGCATCATTTTCTCATTTTGTTATATT  594

seq1  TATTTTCATTTCATTATGCATTTTGATAACTCTTACTTATTATAGAACAA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTCATTTCATTATGCATTTTGATAACTCTTACTTATTATAGAACAA  644

seq1  CATATTGTTAATTTATTTCTAGGCTTTTATACTTAATGTGTAGCTATAAT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATTGTTAATTTATTTCTAGGCTTTTATACTTAATGTGTAGCTATAAT  694

seq1  GGTAGATCTTCTTAATTTATCAACTATGATGCAACAGATAAATTTCATCA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGATCTTCTTAATTTATCAACTATGATGCAACAGATAAATTTCATCA  744

seq1  TCTTAAACAGCCCTAGAAGCTTTGATTGTGTAAATCTATGTGTGGAGTTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAAACAGCCCTAGAAGCTTTGATTGTGTAAATCTATGTGTGGAGTTT  794

seq1  TTACGATAACTGGAATGTTCTTGAATTGTTTTCTATTTGTGTTAAAATAT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACGATAACTGGAATGTTCTTGAATTGTTTTCTATTTGTGTTAAAATAT  844

seq1  AGCCACTTAGAAATATTGTTTTCTTTTTCACCTTATATAAGTTATGTATT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCACTTAGAAATATTGTTTTCTTTTTCACCTTATATAAGTTATGTATT  894

seq1  AGCTGAAAGCCTCAAATCCTCCATGTGAGTAAGAAAGATAATAGTAACAT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAAAGCCTCAAATCCTCCATGTGAGTAAGAAAGATAATAGTAACAT  944

seq1  CCGTCTCATGTTTTCTATGAGAATTACTTTCTAGGGTATATTATGTAAAG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTCTCATGTTTTCTATGAGAATTACTTTCTAGGGTATATTATGTAAAG  994

seq1  CATCTCTAATACATTGTAATTTATAAAATTAAATAGCACAGCTGATAAGA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCTAATACATTGTAATTTATAAAATTAAATAGCACAGCTGATAAGA  1044

seq1  GTTTAAATTTTTTCATTTTCCTCTTTGGATATTGTATATTTGATCCACAA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAAATTTTTTCATTTTCCTCTTTGGATATTGTATATTTGATCCACAA  1094

seq1  AAATGGGTATTTACTAGTAATATATTATAGCTCTTTAAATAATTATTTAT  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGGTATTTACTAGTAATATATTATAGCTCTTTAAATAATTATTTAT  1144

seq1  TGAATTTAGGATAGTTTGATAATTTAAGCTTTGAATTC  1186
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTTAGGATAGTTTGATAATTTAAGCTTTGAATTC  1182

seq1: chrX_126363423_126363875
seq2: B6Ng01-052I10.g_66_518

seq1  GAATTCTTTGCTTCTGTTTTGGAAGCTGTGTGCTACTTGTTTTGGATTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGCTTCTGTTTTGGAAGCTGTGTGCTACTTGTTTTGGATTAT  50

seq1  TGCTGGGCTTTGAACAAAAAGTAAAACAACAACAGAAACCTCCAATGTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGGCTTTGAACAAAAAGTAAAACAACAACAGAAACCTCCAATGTGT  100

seq1  CAAGTTAACATTGACACATTTATTTTAAAGAGACATTAAAATAGTTAAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTAACATTGACACATTTATTTTAAAGAGACATTAAAATAGTTAAGG  150

seq1  ATTTTGTATAGATTCTTTCTATGAAGTGAAAAATGACAAAATGTCTTCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGTATAGATTCTTTCTATGAAGTGAAAAATGACAAAATGTCTTCTA  200

seq1  TTACCTATCTGAAAGTATCAAAGGATTTAGAGTCAGGCAGAGGGAGAACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCTATCTGAAAGTATCAAAGGATTTAGAGTCAGGCAGAGGGAGAACT  250

seq1  GAATGATGGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGATGGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTG  300

seq1  TCTGTGTAGGTTCTCAATAATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGTTCTAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGTAGGTTCTCAATAATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGTTCTAAA  350

seq1  TAAGTGTGGTAGAACATTGTGAACCAAAATAGTTTTTATTGTTTAGTAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGTGGTAGAACATTGTGAACCAAAATAGTTTTTATTGTTTAGTAAC  400

seq1  ACATTGCATAAAACAGATTTAGAAACAGTTAAAATGATTGATTTGATTTC  450
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGCTTAAAACAGATTTAGAAACAGTTAAAATGATTGATTTGATTTC  450

seq1  ATT  453
      |||
seq2  ATT  453