BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-061M11
ChromosomeX (Build37)
Map Location 126,920,530 - 127,029,846
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040092
Upstream geneLOC100040570, LOC669120, Diap2
Downstream geneLOC665773, LOC665799, LOC670449
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-061M11.bB6Ng01-061M11.g
ACCDH882364DH882365
length739859
definitionDH882364|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-061M11, 5' end.DH882365|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-061M11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(126,920,530 - 126,921,081)(127,028,988 - 127,029,846)
sequence
gaattcctgactcttgaaatggtaataaatattctatttgctaggtgtat
ttatttttttttccattttttattaggtatttagctcatttacatttcca
atgctataccaaaagtcccccttacccacccacccccactcccctaccca
cccactccccccctttggccctggcgttcccctgtaccggggcacacaaa
gtctgcgtgtccaatgggcctctctttccagtgatggccgactaggccat
cttttgatacatatgcagctagagtcaagagctcaggggtactggttagt
tcataatgttgttccacctatagggttgaagatccctttagctccttggg
tattttctctagctcctccattgggagccctgtgatccatccattagctg
actgtgagcatccacttctgtgtttgctaggccccggcatagtctcacaa
gagacagctacatctgggtcctttcgataaaatcttgctagtatatgcaa
tggtgtcagcgtttggatgctgattatggggtggatccctggatatggca
gtctctacatggtccatcctttcatctcagctccaaactttgtttctgta
actccttccatgggtgttttgttcccacttctaaggaggggcatagtgtc
cacacttcagtcttcatttttcttgagtttcatgtgtttaggaaattgta
tactatacccagccaaactctcaattatcatagagggag
gaattcctgttgtatgtattcagacatttctatacatattaactaaacct
gacagtgtagcttgtgggatatatctctcctcacttatatggtacaaatg
aaacagtgacactcgatgtcgagtctgcctagctggtgtcactaaagcaa
ggtgtccgcagggacagttctaccaggttattaagcgagtgttggccaag
gcagaaaatgtattagaagtttcagctacactaatcggtggggaataaag
ttattatccttctcctagacctattgtctcacaggctgagcatggtcctt
ttatagctcgactttacctttcagattggacccttctgcttttaattttc
ttttgccaggatgaagcccaatatcaacatacctcccgtatcttcaaaat
tggtctttagaggtgagccctgtatacttctcttccattatcattcaaat
cttcatcaccttgtaataagtctttgttttctacatattgaattatatgc
caattcccaccctatagaatcattttctctgtcagttctgttgattagca
ttacagctagccttcactcatttctcttgtaaatgtgcagctgttattcc
ttaaaatgcatggacttagtagctcaatggtaaaaagtccactcaccaca
cctctcttagtctatcaattgtcacatccacgcaatgaaaacatttggtt
tgcgggctagtcagctccatatataaaggttctcatcaccaaactggcca
agctgagctcaatctccaggaaccacatagtggaatgacagaactgactc
ctacaagctgtcctctgatctttacatgtatgctgtggcgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chrX_126920530_126921081
seq2: B6Ng01-061M11.b_48_599

seq1  GAATTCCTGACTCTTGAAATGGTAATAAATATTCTATTTGCTAGGTGTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGACTCTTGAAATGGTAATAAATATTCTATTTGCTAGGTGTAT  50

seq1  TTATTTTTTTTTCCATTTTTTATTAGGTATTTAGCTCATTTACATTTCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTTTTTTCCATTTTTTATTAGGTATTTAGCTCATTTACATTTCCA  100

seq1  ATGCTATACCAAAAGTCCCCCTTACCCACCCACCCCCACTCCCCTACCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTATACCAAAAGTCCCCCTTACCCACCCACCCCCACTCCCCTACCCA  150

seq1  CCCACTCCCCCCCTTTGGCCCTGGCGTTCCCCTGTACCGGGGCACACAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACTCCCCCCCTTTGGCCCTGGCGTTCCCCTGTACCGGGGCACACAAA  200

seq1  GTCTGCGTGTCCAATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGGCCGACTAGGCCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGCGTGTCCAATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATGGCCGACTAGGCCAT  250

seq1  CTTTTGATACATATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCAGGGGTACTGGTTAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGATACATATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCAGGGGTACTGGTTAGT  300

seq1  TCATAATGTTGTTCCACCTATAGGGTTGAAGATCCCTTTAGCTCCTTGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAATGTTGTTCCACCTATAGGGTTGAAGATCCCTTTAGCTCCTTGGG  350

seq1  TATTTTCTCTAGCTCCTCCATTGGGAGCCCTGTGATCCATCCATTAGCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTCTCTAGCTCCTCCATTGGGAGCCCTGTGATCCATCCATTAGCTG  400

seq1  ACTGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGCCCCGGCATAGTCTCACAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGCCCCGGCATAGTCTCACAA  450

seq1  GAGACAGCTACATCTGGGTCCTTTCGATAAAATCTTGCTAGTATATGCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACAGCTACATCTGGGTCCTTTCGATAAAATCTTGCTAGTATATGCAA  500

seq1  TGGTGTCAGCGTTTGGATGCTGATTATGGGGTGGATCCCTGGATATGGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTCAGCGTTTGGATGCTGATTATGGGGTGGATCCCTGGATATGGCA  550

seq1  GT  552
      ||
seq2  GT  552

seq1: chrX_127028988_127029846
seq2: B6Ng01-061M11.g_74_932 (reverse)

seq1  ACACACACACACACACACACGCCACAGCATACATGTAAAGATCAGAGGAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACGCCACAGCATACATGTAAAGATCAGAGGAC  50

seq1  AGCTTGTAGGAGTCAGTTCTGTCATTCCACTATGTGGTTCCTGGGGATTG  100
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AGCTTGTAGGAGTCAGTTCTGTCATTCCACTATGTGGTTCCTGGAGATTG  100

seq1  AGCTCAGCTTGGCCAGTTTGGTGATGAGAACCTTTATATATGGAGCTGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCAGCTTGGCCAGTTTGGTGATGAGAACCTTTATATATGGAGCTGAC  150

seq1  TAGCCCGCAAACCAAATGTTTTCATTGCGTGGATGTGACAATTGATAGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCCGCAAACCAAATGTTTTCATTGCGTGGATGTGACAATTGATAGAC  200

seq1  TAAGAGAGGTGTGGTGAGTGGACTTTTTACCATTGAGCTACTAAGTCCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAGAGGTGTGGTGAGTGGACTTTTTACCATTGAGCTACTAAGTCCAT  250

seq1  GCATTTTAAGGAATAACAGCTGCACATTTACAAGAGAAATGAGTGAAGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTTTAAGGAATAACAGCTGCACATTTACAAGAGAAATGAGTGAAGGC  300

seq1  TAGCTGTAATGCTAATCAACAGAACTGACAGAGAAAATGATTCTATAGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTGTAATGCTAATCAACAGAACTGACAGAGAAAATGATTCTATAGGG  350

seq1  TGGGAATTGGCATATAATTCAATATGTAGAAAACAAAGACTTATTACAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAATTGGCATATAATTCAATATGTAGAAAACAAAGACTTATTACAAG  400

seq1  GTGATGAAGATTTGAATGATAATGGAAGAGAAGTATACAGGGCTCACCTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATGAAGATTTGAATGATAATGGAAGAGAAGTATACAGGGCTCACCTC  450

seq1  TAAAGACCAATTTTGAAGATACGGGAGGTATGTTGATATTGGGCTTCATC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGACCAATTTTGAAGATACGGGAGGTATGTTGATATTGGGCTTCATC  500

seq1  CTGGCAAAAGAAAATTAAAAGCAGAAGGGTCCAATCTGAAAGGTAAAGTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCAAAAGAAAATTAAAAGCAGAAGGGTCCAATCTGAAAGGTAAAGTC  550

seq1  GAGCTATAAAAGGACCATGCTCAGCCTGTGAGACAATAGGTCTAGGAGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTATAAAAGGACCATGCTCAGCCTGTGAGACAATAGGTCTAGGAGAA  600

seq1  GGATAATAACTTTATTCCCCACCGATTAGTGTAGCTGAAACTTCTAATAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATAATAACTTTATTCCCCACCGATTAGTGTAGCTGAAACTTCTAATAC  650

seq1  ATTTTCTGCCTTGGCCAACACTCGCTTAATAACCTGGTAGAACTGTCCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCTGCCTTGGCCAACACTCGCTTAATAACCTGGTAGAACTGTCCCT  700

seq1  GCGGACACCTTGCTTTAGTGACACCAGCTAGGCAGACTCGACATCGAGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGGACACCTTGCTTTAGTGACACCAGCTAGGCAGACTCGACATCGAGTG  750

seq1  TCACTGTTTCATTTGTACCATATAAGTGAGGAGAGATATATCCCACAAGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGTTTCATTTGTACCATATAAGTGAGGAGAGATATATCCCACAAGC  800

seq1  TACACTGTCAGGTTTAGTTAATATGTATAGAAATGTCTGAATACATACAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TACACTGTCAGGTTTAGTTAATATGTATAGAAATGTCTGAATACATACAA  850

seq1  CAGGAATTC  859
      |||||||||
seq2  CAGGAATTC  859